Esta tese propõe o desenvolvimento de SMAs centrados em organizações de forma disciplinada, mesmo nos casos em que os modelos organizacionais de agentes utilizados não estejam incorporados aos métodos oferecidos pela Engenharia de Software Orientada a Agentes (AOSE). A fim de atingir tal objetivo, esta tese adota os princípios da Engenharia de Método Situational e propõe o Ateliê Medee, que permite a composição de métodos situacionais para SMAs usando fragmentos de método adequados à situação de cada projeto. Este ateliê oferece um repositório de fragmentos de método que contempla distintas fases de desenvolvimento de um projeto, tais como elucidação de requisitos, análise, design, e implementação, envolvendo os principais componentes de um SMA, como agentes, ambientes, interações e organizações. Tal repositório contém fragmentos extraídos de diversas abordagens para o desenvolvimento de SMAs, entre elas os métodos Gaia, Tropos, Ingenias, PASSI, e os modelos organizacionais MOISE+ e OperA. Além disso, esta tese mostra como tais métodos situationais podem contribuir no estabelecimento de um ciclo de melhoria do método de desenvolvimento para SMAs. Este ciclo aplica os princípios da Engenharia de Software a fim de prover um procedimento empírico para a adaptação, avaliação e melhoria de métodos situacionais para o desenvolvimento de SMAs centrados em organizações. Dessa forma, este ciclo contribui para uma utilização mais ampla de aplicações orientadas a agentes pela indústria.de software. Finalmente, esta tese apresenta um estudo de caso conduzido para investigar o uso do Ateliê Medee na composição de métodos situacionais para SMAs. Este estudo de caso envolveu o desenvolvimento de SMAs centrados em organizações para resolver o problema proposto pelo Torneio de Programação Multiagentes usando dois métodos situacionais distintos, compostos a partir de fragmentos de método extraídos de Tropos, Gaia e MOISE+. / This thesis proposes the development of organization centered MAS in a disciplined way, even though some agent organizational models are not currently incorporated into AOSE methods. In order to do that, this thesis proposes the Medee Framework for composing MAS situational methods out of method fragments according to a given project situation, by applying the principles proposed by Situational Method Engineering. Thus, it offers a method fragment repository that covers different development phases, like requirements, analysis, design, implementation, as well as the main components of a MAS application, such as agents, environments, interactions, and organizations. Such a repository has been sourced from several MAS development approaches, as such Gaia, Tropos, Ingenias, PASSI, MOISE, and OperA. Furthermore, this doctoral dissertation shows how such MAS situational methods could contribute to establish a method improvement cycle. Such a cycle applies principles of the Software Engineering discipline to provide an empirical procedure for tailoring, evaluating, and enhancing MAS situational methods. In this way, this cycle allows the continuous improvement of the Medee Method Repository, towards a steady and well founded path for MAS method maturation and, consequently, for a broader utilization of agent-oriented software development in the software industry. Finally, this dissertation presents a case study conducted to investigate the use of the Medee Framework for composing MAS situational methods, sourced mainly from Tropos, Gaia, and MOISE+. Moreover, these situational methods were used within an improvement cycle for MAS development methods. This case study, called the USP Farmer project, involved the development of organization centered MAS to solve the problem proposed by the Multiagent Programming Contest.

O estudo foi realizado em área localizada na Serra do Mar, no domínio da Mata Atlântica, na formação florestal denominada Floresta Ombrófila Densa Atlântica, no Município de Paraibuna, Estado de São Paulo, Brasil, entre as coordenadas geográficas 23o 31 21 e 23o 32 36 de Latitude Sul e 45o 39 33 e 45o 41 54 de Longitude Oeste e 1.136 m de altitude. Foram estudados 3 fragmentos de vegetação natural de 46,92 ha, 4,28 ha e 26,38 ha e uma área de plantio de eucalipto adjacente, com sub-bosque bem desenvolvido, sendo a vegetação dos fragmentos, mata ciliar em estágio médio de regeneração secundária. O fragmento de menor área constitui-se num corredor de vegetação natural, interligando os 2 fragmentos maiores. O principal objetivo foi analisar os grupos de aves afetados pela fragmentação florestal e avaliar os impactos causados pela fragmentação e o isolamento destas áreas e, utilizando a avifauna como indicador ecológico, analisar a efetividade do corredor na passagem de material genético entre os fragmentos. Os métodos utilizados para o registro da avifauna foram o de observações por pontos fixos e captura e recaptura com auxilio de redes instaladas no sub-bosque dos fragmentos e do plantio de eucalipto, além das observações qualitativas realizadas entre os levantamentos. Considerando-se os métodos utilizados e as 4 áreas estudadas, foi possível registrar, em 80 horas de observações e 2.502 horas rede, 135 espécies de aves, distribuídas em 33 famílias e 14 ordens, sendo as principais guildas a insetívora, onívora e granívora, todas ocupando o sub-bosque.Através dos dados dos levantamentos foram analisados parâmetros como número de espécies, abundância, freqüência de ocorrência, diversidade, eqüidade, similaridade, composição das espécies e guildas alimentares. A composição de espécies foi afetada pela fragmentação e redução da área de vegetação natural. A quantidade e diversidade de aves apresentou relação direta com o tamanho do fragmento e estrutura da vegetação, e inversa com o grau de isolamento. Não houve a constatação da passagem pelo corredor, de nenhum indivíduo da avifauna tipicamente florestal. O registro de grande quantidade de espécies comuns aos 2 fragmentos e corredor, de diversos grupos tróficos e distribuídas nos diferentes estratos da vegetação, demonstra a existência de uma dinâmica entre estes ambientes. O corredor está funcionando como uma efetiva área de hábitat, complementando a cadeia de reserva existente. A sua largura está diretamente ligada a efetividade, no entanto, a largura ideal é uma medida empírica, pois existem diversas variáveis que podem estar interferindo no fluxo das espécies pelo corredor, como área, grau de isolamento, estrutura e composição da vegetação, efeito de borda, tipo de vizinhança e pressões antrópicas. Os plantios de eucalipto, mesmo com o sub-bosque bem desenvolvido, formam uma barreira para diferentes espécies da avifauna, principalmente as florestais. / The study was carried out in an area located at \"Serra do Mar\", belonging to \"Mata Atlântica\" formation, also known as Atlantic Rain Forest, near the town of Paraibuna, State of São Paulo, Brazil (located at latitude 23o 31S to 23o 33S, longitude 45o 39W to 45o 42W and altitude of 944 to 1.136m). Three fragments of natural vegetation (sizes of 46.92 ha, 4.28 ha and 26.38 ha) and an adjacent area of eucalypts plantation were utilized for the surveys. In all situations the understorey was quite prominent and the vegetation of the gallery forest fragments were in a medium stage of secondary regeneration. The fragment of smaller size was formed by a corridor of natural vegetation, connecting the two larger fragments. The main objective of the study was to analyze the groups of birds that were affected by the forest fragmentation and, additionally, to evaluate the impacts caused by the fragmentation and the isolation degree of these areas, using birds as ecological indicator to analyze the corridor\'s effectiveness to the passage of genetic material among fragments. The methods used to register the avifauna specimens were the technique of observations per fixed points, the captures and recaptures supported by mist nets installed within the fragments understorey and within an eucalypts plantation and the qualitative studies accomplished among the surveys. Taking into account 80 hours of observations and 2.502 hours of mist net in all studied areas, it was possible to register a total of 135 species of birds, distributedover a range of 33 families and 14 orders. The main species were characterized as insecteating, omnivorous and grain-eating, all of them occupying the understorey level. Through the data of the surveys parameters, analyzed as avian species number, abundance, occurrence frequency, diversity, equity, similarity, species composition and feeding behaviour. The species composition was affected by the fragmentation and also by the reduction of the natural vegetation. The quantity and diversity of birds showed a direct relationship with the size of the fragment and structure of the vegetation and an inverse relationship with the isolation degree of the area. There was no evidence of passage of any typical forest avifauna individuals by the corridor. The registration of great quantity of common species to both fragments and corridor, of several trophic groups and distribution in the different strata of the vegetation, demonstrates the dynamics among these environments. The corridor is working as an effective habitat area, complementing the network of existent reserve. The width is directly attached to the corridor effectiveness, however, the ideal width is an empiric measure, because several variables can affect the species flux to the corridor, as area, isolation degree, structure and vegetation composition, edge effect, neighborhood type and anthropic pressures. The eucalypts plantations, even containing the understorey level quite prominent, form an effective barrier to different avifauna species, mainly over those ones that live in the core zone of the forest.

Made available in DSpace on 2015-04-11T13:56:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Francisco Clovis.pdf: 1525729 bytes, checksum: 09930249f9e42cc2c82a688c4467b761 (MD5) Previous issue date: 2012-05-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The study of the diversity of fruit flies (Diptera, Tephritidae) in an urban fragment of the Amazon forest is important to characterize the community of these insects in an area of Tropical rainforest preserved. The objective of this study was to determine the diversity, population fluctuation and faunal analysis of fruit flies in the forest fragment. The study was conducted in an area of 694 hectares in the northern and southern sectors of the Universidad Federal do Amazonas (UFAM) in Manaus, Amazonas, in the period from September 2010 to September 2011. A total of 80 McPhail traps were distributed in the two sectors and the captured material was checked weekly. It was captured 1274 adults of Anastrepha Schiner, 402 males and 630 females (sex ratio of 1.58 ♀: 1 ♂) in the Southern, while in Northern Sector were captured only 242, 128 males and 114 females (sex ratio of 0, 89 ♀: 1 ♂). It was identified 18 species of Anastrepha: A. atrigona Hendel, A. bahiensis Lima, A. binodosa Stone, A. coronilli Carrejo & González, A. distincta Greene, A. flavipennis Greene, A. fracture Stone, A. fraterculus (Wied.), A. furcata Lima, A. hendeliana Lima, A. leptozona Hendel, A. obliqua (Macquart), A. pseudanomala Norrbom, A. pulchra Stone, A. serpentina (Wied.), A. sodalis Stone, A. striata Schiner and A. turpiniae Stone. In addition, eight morphotypes of this kind, possibly new species, were captured. The highest population peak was observed in January 2011 with an average of 2.27 fly/trap.day. In the Southern sector, the dominant species were A. obliqua, A. distincta, A. leptozona, A. coronilli and A. bahiensis. Highlight for A. obliqua (33,93%) as super frenquent specie. A. obliqua (33,93%) was the overabundant specie. In the Northern sector, the dominant species were A. obliqua, A. coronilli, A. bahiensis, A. distincta and A. leptozona. A. leptozona was the specie frequent also (32,22%) and very abundant (32,22%). In the Northern Sector the indices wealth Shannon-Weaner and uniformity were higher than in Sector South. It is recorded for the first time A. fraterculus, A.pseudanomala and A. sodalis in the state of Amazonas. / O estudo da diversidade de moscas-das-frutas (Diptera, Tephritidae) em um fragmento urbano da Floresta Amazônica, é importante para se caracterizar a comunidade desses insetos em uma área de mata tropical preservada. O objetivo deste trabalho foi determinar a diversidade, a flutuação populacional e a análise faunística de moscas-das-frutas no fragmento florestal. O estudo foi realizado em uma área de 694 hectares nos setores Norte e Sul do Campus da Universidade Federal do Amazonas (UFAM) na cidade de Manaus, estado do Amazonas, no período de setembro de 2010 a setembro de 2011. Um total de 80 armadilhas tipo McPhail foram distribuídas nos dois setores e o material capturado foi verificado semanalmente. Foram capturados 1274 adultos de Anastrepha Schiner, sendo 402 machos e 630 fêmeas (razão sexual de 1,58♀:1♂), no Setor Sul enquanto no Setor Norte foram capturados apenas 242, 128 machos e 114 fêmeas (razão sexual de 0,89♀:1♂). Foram identificadas 18 espécies de Anastrepha: A. atrigona Hendel, A. bahiensis Lima, A. binodosa Stone, A. coronilli Carrejo & González, A. distincta Greene, A. flavipennis Greene, A. fractura Stone, A. fraterculus (Wied.), A. furcata Lima, A. hendeliana Lima, A. leptozona Hendel, A. obliqua (Macquart), A. pseudanomala Norrbom, A. pulchra Stone, A. serpentina (Wied.), A. sodalis Stone, A. striata Schiner e A. turpiniae Stone. Além disso, 8 morfotipos desse gênero, possivelmente espécies novas, foram capturados. O maior pico populacional foi observado em janeiro de 2011 com valor médio de 2,27 mosca/armadilha.dia. No setor Sul as espécies dominantes foram A. obliqua, A. distincta, A. leptozona, A. coronilli e A. bahiensis. Destaque para A. obliqua (33,93%) como espécie superfrequente. A. obliqua (33,93%) foi a espécie superabundante. No setor Norte as espécies dominantes foram A. obliqua, A. coronilli, A. bahiensis, A. distincta e A. leptozona. A. leptozona também foi a espécie frequente (32,22%) e a muito abundante (32,22%). No Setor Norte os índices de riqueza Shannon-Weaner e de uniformidade foram maiores que no Setor Sul. São registradas pela primeira vez A. fraterculus, A.pseudanomala e A. sodalis no Estado do Amazonas.

Os remanescentes de floresta estacional semidecídua no Estado de São Paulo sofreram e sofrem com o processo de fragmentação, principalmente causados pela expansão agrícola e urbana. São remanescentes muito alterados quanto à estrutura e função, mas de imensa importância para o conhecimento taxonômico e ecológico. A associação de estudos fitossociológicos e silvigenéticos permite diagnosticar a situação atual de um fragmento e predizer sua situação futura, além da relação com seu passado de distúrbios. A Fazenda Experimental Edgardia, pertencente à Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP, localiza-se nas cuestas basálticas. Com área total de 1200ha, possui os maiores remanescentes de floresta no município. Os fragmentos de estudo, Mata do Bexiguento (Área A) e Mata do Pomar Velho (Áreas B e C), possuem área aproximada de 303 e 53ha, respectivamente, e histórias de perturbação diferentes. A Área A sofreu exploração seletiva, a Área B é uma mata secundária com cerca de 35 anos e a Área C sofreu exploração seletiva e também passagem de fogo. O estudo foi feito através de amostragem sistemática estratificada, com parcelas permanentes e contíguas de 10 x 10m, totalizando 50 parcelas em cada área e 1,5ha amostrados. Todos os indivíduos com altura de caule >= 1,30 m foram marcados, identificados e medidos (altura total e DAP). Para o mapeamento das eco-unidades, em cada área foram demarcadas 11 linhas de 100m de comprimento, dispostas paralelamente entre si e eqüidistantes em 5 m. Todas as árvores dominantes cujas copas interceptavam as linhas de inventário foram marcadas e classificadas através de características arquiteturais, para determinação das eco-unidades. Na Área A as espécies dominantes foram Gallesia integrifolia, Astronium graveolens, Aspidosperma polyneuron e A. ramiflorum; na Área B as espécies foram Parapiptadenia rigida, Acacia polyphylla, Celtis iguanaea e Centrolobium tomentosum; na Área C elas foram Croton floribundus, Acacia polyphylla, Tabernaemontana catharinensis e Urera baccifera. As espécies que foram exploradas apresentam a distribuição diamétrica alterada, sem classes de diâmetros grandes ou com classes falhas; outras apenas ocorrem no sub-bosque (>= 1,30 m e DAP < 5 cm). O mosaico silvático da Área A possui maior proporção de eco-unidades maduras (37%), sendo a 2A de maior contribuição (26,4%). Na Área B as eco-unidades maduras têm maior proporção (34,6%) seguidas pelas eco-unidades em reorganização (31,3%). Na Área C a maior proporção amostrada foi de eco-unidades em reorganização (42,1%), enquanto que as eco-unidades maduras ocuparam 28,8% do mosaico. Os resultados indicam diferenças sucessionais em cada área amostrada, tanto pelas diferentes histórias de perturbação, quanto pelas características abióticas de cada área. Assim, a Área A apresenta-se mais conservada em relação à diversidade de espécies, maior altura do dossel, maiores diâmetros e maior proporção de eco-unidades maduras; a Área B é uma mata secundária ainda dominada por espécies comuns a fases sucessionais precoces, com mosaico silvático em alto dinamismo; e a Área C é uma mata altamente alterada quanto à sua estrutura e função, com grandes clareiras com alta colonização de trepadeiras e lianas, com tendência à degradação. São sugeridas alternativas de manejo para cada caso. / The seasonal semi deciduous forest fragments in São Paulo State suffered the fragmentation process mainly because agricultural and urban expansion. These remnants are very important for taxonomic and ecological studies, although they are much altered. By joining phytossociological and silvigenetic studies is possible a diagnosis of their present situation, as well as inferring about their past history and predicting their future development. The Edgardia Experimental farm, belonging to the São Paulo State University Campus, Botucatu, SP, Brazil, is located at the basaltic "cuestas". With a total surface of 1.200 ha, it preserves the biggest forest fragments of the municipality. Both fragments included in this study, Mata do Bexiguento (Site A) and Mata do Pomar Velho (Sites B and C), respectively with 303 and 53 ha of area each, have different perturbation histories. Site A was selectively logged until early 1980 decade; Site B is a 35 year-old secondary forest and Site C was also logged and burnt by forest fires. The study was made using the systematic stratified sampling, with contiguous permanent plots of 10 x 10 m, totaling 50 plots in each site and 1.5 ha of total sampling area. All individuals with height equal or over 1.30 m were marked, identified and measured (total height and DBH). For the eco-units mapping, the line intercept method was used, with 11 parallel and equidistant lines of 100 m each, distant 5 m one from the other. All dominant trees whose canopy intercepted one inventory line were marked and classified, as well as the canopy gaps were inventoried. At site A, the dominant species were Gallesia integrifolia, Astronium graveolens, Aspidosperma polyneuron e A. ramiflorum; at site B the species were Parapiptadenia rigida, Acacia polyphylla, Celtis iguanaea e Centrolobium tomentosum; at site C they were Croton floribundus, Acacia polyphylla, Tabernaemontana catharinensis e Urera baccifera. The species that were logged showed altered size class distribution: some bigger diameters were missing or there were some gaps in their size distribution. Other species were found only in the understory (>= 1.30 m height up to DAP < 5 cm). The silvatic mosaic of site A had a higher proportion of mature eco-units (37%), were in site B these ones were 34.6% of the area, while 31.3% were aggrading eco-units. In site C the highest proportion was for the aggrading eco-units (42.1%), while the mature ecounits represented only 28.8% of the forest mosaic. The results indicate successional differences among sites, due both to their different disturbance histories and also to the abiotic differences among these areas. Site A is the best conserved fragment, considering the species diversity, the taller forest canopy, larger tree diameters and highest proportion of mature eco-units. Site B is a secondary forest still dominated by species that area common in the early successional stages, with a very dynamic forest mosaic. Site C is a highly disturbed forest concerning its structure and function, with big canopy gaps and a strong lianas and vines colonization, tending to the degradation. Some management strategies are suggested for each case.

O estudo teve por objetivos caracterizar quantitativa e qualitativamente as principais classes taxonômicas da meso e macrofauna edáfica presentes em fragmentos de Floresta Estacional Semi Decidual (domínio de Mata Atlântica) e em diferentes modelos de reflorestamentos com espécies da Mata Atlântica. As áreas utilizadas pertencem à Faculdade de Ciências Agronômicas, UNESP, em Botucatu/SP. Os experimentos foram instalados em três solos usados intensivamente com exploração agrícola e pastagem: Nitossolo Vermelho (NV) textura argilosa, Argissolo Vermelho-Amarelo (PVA) Distrófico textura média e Latossolo Vermelho-Amarelo (LVA) Distrófico textura areia franca. O delineamento usado foi o de blocos casualizados, com três blocos e seis tratamentos. Um tratamento foi demarcado sobre floresta natural (Fragmento) e outros cinco tratamentos instalados sobre áreas revegetadas: testemunha, semeadura direta, sistema Taungya modificado, consorciação de espécies nativas de rápido crescimento com espécies comerciais para madeira e mistura de espécies nativas em modelos de plantio-restauração. As amostragens semestrais foram realizadas durante dois anos. A mesofauna foi extraída pelo método de Berleusse-Tüllgren modificado e a macrofauna pelo método dos monolitos. Os dados de densidade dos organismos foram analisados pelo teste de médias não-paramétrico de Friedman e pela análise multivariada de Agrupamento (Cluster Analysis). Nos tratamentos com cobertura vegetal mais densa e solo menos perturbado (Fragmento, Testemunha e Sem.Direta), foram verificadas as maiores densidades de organismos da meso e macrofauna edáfica. Houve uma relação direta entre a densidade de organismos e os atributos físicos e químicos dos solos; no solo mais úmido, de menor temperatura média, mais permeável, mais fértil e mais rico em matéria orgânica, NV, foram encontradas as maiores densidades de organismos da meso e macrofauna edáfica. Dentre as subordens de mesofauna, os oribatídeos foram encontrados com maior densidade em todos os solos e, os Astigmatas e Prostigmatas, em menores quantidades. Na macrofauna, o grupo das Oligochaetas foi o mais encontrado no NV, seguido do Formicidae; os grupos Isoptera, Coleoptera e Formicidae foram os mais encontrados no PVA e LVA. Independente do tipo de solo, a densidade de organismos da mesofauna edáfica foi maior no verão que no inverno. Para a macrofauna, as variações estacionais da densidade de organismos ocorreram somente no LVA, com 54% no verão, e foram influenciadas pelas condições físicas e químicas do solo. / The purposes of this study was to point out quantitaty and qualitivetely the main taxononomics classes of the meso and macrofauna soil, on fragments of Seasonal Semideciuos Tropical Forest (Atlantic Forest) and prototypes of Atlantic Fores reforestation programs, using native species. The reserched areas belong to Faculdade de Ciências Agronômicas, UNESP, located in Botucatu, SP, Brazil. The experiments took place in three different soil previously used heavily for agriculture and cattle: Alfisol clayey texture, Ultisol medium texture and Oxisol sandy texture. The experiment was marked by random blocks, with three replications and six treatments. One treatment was done over the natural forest followed by five other done over reforested lands: test, direct seeding, modified Taungya system, mix from native fast growing species with species used commercially and another mix from native species in restoration-planting model. The semestral samples were collectes for a period of two years. The Berleusse-Tüllgren modified method were used to extrat the mesofauna, and the Monolitos method to extract the macrofauna. The density data of the organisms were analyzed using the Friedman's non-parametric medias test as well as multivariate Cluster Analysis. On denser vegetation and less stressed soil (Fragment, Test and Direct Seeding), our treatment resulted on a higher density of organisms of meso and macrofauna. A relation between the density of organisms and the physical and quimical caracteristic of the soil was clearly defined: on a humid soil, low average temperature, permeable, higher degree of fertility and richer on organic matter, NV, it was detect the higher density of soil meso and macrofauna. Within the suborder of the mesofauna, the Oribatida could be found on higher density on all different types of soils and a smaller number in regards to the Astigmatas and Prostigmatas under the same circunstances. On the macrofauna, the Oligochaetas was found on higher density on the Alfisol, followed by Formicidae; the Isoptera, Coleoptera and Formicidae showes a bigger presence on the Ultisol and Oxisol. Independent of soil type, the density of soil mesofauna organisms was higher on the summer than the winter. For macrofauna, the density variation of organisms, based on the different climate seasons, ocurred only on the Oxisol, with a 54% in the summer, and had suffere the physical and quimical influence of the soil.

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A digoxina é um dos medicamentos indicados para o tratamento de falência cardíaca. Possui janela terapêutica estreita, sendo responsável por casos de intoxicação. O único antídoto disponível para a desintoxicação é o anticorpo policlonal DigiFab®, no formato Fab. O seu uso é eficaz, porém de custo elevado. Clones bacterianos produtores de fragmento Fab monoclonal anti-digoxina foram obtidos previamente pelo nosso grupo, pela técnica de phage display. Neste trabalho as variantes Fab dos 4 clones foram expressas em E.coli para estabelecer o método para a purificação. Com a obtenção dos fragmentos Fab purificados, foi caracterizada a sua afinidade ao antígeno e especificidade, em ensaios de inibição por digoxina, digitoxina, digoxigenina e ouabaina. Os parâmetros cinéticos da ligação dos fragmentos Fab dos 4 clones e do DigiFab® foram avaliados por SPR. Nas condições experimentais, não foram verificadas diferenças significativas entre os produtos dos 4 clones e o comercial, demonstrando o potencial dos fragmentos Fab monoclonais obtidos como antídoto à digoxina. / Digoxin is a medication indicated for heart failure treatment. Its therapeutic window is narrow, being responsible for intoxication cases. The only antidote available for the detoxification is a polyclonal antibody - DigiFab® in Fab format. Its use is effective, but costly. Bacterial clones producing anti-digoxin monoclonal Fab fragments were previously obtained by our group using phage display technology. In this work the Fab variants of the 4 clones were expressed in E.coli to establish the purification method. The purified fragments were characterized regarding the affinity to the antigen and the specificity through inhibition assays with digoxin, digitoxin, digoxigenin and ouabain. The binding kinetic parameters of Fab fragments of the 4 clones and the commercial product to Dig-BSA conjugate were assessed by SPR. Under the experimental conditions no significant differences were observed among the 4 clones and the commercial product, demonstrating the potential of monoclonal Fab fragments as an antidote to digoxin.

Embora o romance Em busca do tempo perdido seja incontestavelmente uma obra inacabada, não se trata, entretanto, de uma obra incompleta. Seu fechamento circular, promovido pelo diálogo entre o primeiro e último volumes, foi tema de grande parte da crítica proustiana. Com relação à sua composição, seu processo escritural passou por diversas mudanças e a construção, equiparada à execução de uma catedral, poderia igualmente ser caracterizada pela colagem, montagem ou costura dos fragmentos textuais esboçados nos setenta e cinco cadernos de rascunho. A busca pela unidade em meio a essa profusão de textos levou o escritor à atividade incessante de releitura e reescritura e, consequentemente, ao inacabamento da obra. O trabalho que ora apresentamos tem por objetivo o estudo dessa composição, a partir da leitura e análise dos cadernos 53 e 55, ambos consagrados à elaboração da história de Albertine. / Although the novel In Search of Lost Time is certainly unfinished, it is not an incomplete work. Its round ending, promoted by the dialogue between the first and last volumes, was the subject of much Proustian criticism. With respect to its composition, its writing process has gone through many changes and the construction, equivalent to the execution of a cathedral, could also be characterized by the process of montage or the stitching of textual fragments contained in Prousts seventy-five exercise books. The search for unity amongst this profusion of texts has led the writer to the ceaseless activity of rereading and rewriting and thus to the incompleteness of the work. The analysis presented here is aimed at studying this composition, having the reading and the analysis of exercise books 53 and 55, both related to the elaboration of the story of Albertine, as a starting point.

A maior parte da biodiversidade global está concentrada nas florestas tropicais. Um dos principais fatores que ocasionam o desaparecimento dessa diversidade é a perda de hábitats pelas ações antrópicas, como o desmatamento e o crescimento urbano desordenado. Fragmentos florestais que possuem elevada biodiversidade, altas taxas de endemismo e fortes pressões antrópicas, são chamados de hotspots. A Floresta Atlântica é um dos hotspots brasileiros mais devastados. Por serem sensíveis as alterações do ambiente, as aves são consideradas importantes bioindicadores da qualidade dos ecossistemas. O presente estudo foi realizado na Reserva Particular do Patrimônio Natural (RPPN) Rio dos Pilões, em uma região antropizada e com remanescentes de Mata Atlântica (Floresta Ombrófila Densa Montana), localizada no município de Santa Isabel, no Estado de São Paulo. A RPPN pertence a um empreendimento imobiliário que visa à integração entre as atividades de proteção dos recursos naturais com as ações humanas. Com o intuito de conhecer e analisar a comunidade de aves da RPPN estudou-se três ambientes principais: um ambiente de campo antrópico (ACA), um ambiente antrópico inundado (AAI) e um ambiente florestal antropizado (AFA). O estudo foi realizado de maio de 2005 a maio de 2006, utilizandose o método de captura e recaptura com redes-neblina e o método de observações em trajetos irregulares, sendo o primeiro aplicado no AFA e o segundo no ACA e no AAI. Foram registradas 141 espécies de aves em um total de 1.824 horas de trabalhos. Estas espécies estão distribuídas em 20 ordens, 46 famílias, 125 gêneros, resultando em 2.243 indivíduos observados, 184 capturados e 17 recapturados. A curva acumulada de espécies não mostrou tendência à estabilização, sugerindo que o esforço de coleta despendido não tenha sido suficiente para amostrar toda a comunidade, indicando assim que novas espécies possam ser registradas. Os Não-Passeriformes somaram 56 espécies, com maior representatividade nas famílias Ardeidae e Trochilidae. Os Passeriformes foram os mais representativos, com 85 espécies, sendo Tyrannidae a de maior número. O ambiente que apresentou maior riqueza foi o AAI com 85 espécies, seguido pelo AFA com 72 e o ACA com 52 espécies. As espécies mais freqüentes (FR) foram Patagioenas picazuro no ACA, Thraupis sayaca no AAI e Chiroxiphia caudata no AFA. A análise da freqüência de ocorrência (FO) mostrou que a maioria das espécies teve FO abaixo de 25%, enquanto que poucas espécies apresentaram FO maior que 75%. As espécies com maiores FO foram Vanellus chilensis, Pitangus sulphuratus, T. sayaca e Basileuterus leucoblepharus. A comunidade foi agrupada em 13 guildas tróficas, sendo a insetívora a de maior predomínio em todos os ambientes. Das espécies registradas, 04 são migrantes e 03 estão ameaçadas de extinção. Embora a RPPN apresente um elevado grau de degradação, possui elevada riqueza e diversidade de espécies de aves, fator este que pode contribuir não somente para aumentar seu valor de conservação, como também auxiliar na implantação de projetos de restauração ecológica dos remanescentes. / The most of global biodiversity is intent in the tropical forests. One of the main factors that they cause the disappearance of this diversity is the loss of habitats for the anthropic actions, as the deforestation and the disordered urban growth. Forest fragments that possess high biodiversity, high taxes of endemism and forts anthropics pressures, are called hotspots. The Atlantic Forest is a Brazilian hotspots more deforested. By being sensible the alterations of the environment, the birds are considered the most important bioindicators of the quality of ecosystems. The present study River of the Piloes was carried through in the Particular Reserve of Patrimony Natural (RPPN), in an anthropic region and with remainders of Atlantic Forest, located in the city of Santa Isabel, State of Sao Paulo. The RPPN belongs to a real estate enterprise that aims at the integration enters the activities of protection of the natural resources with the actions human beings. Whit the intention to know and to analyze the community of birds of the RPPN one studied three main environments: environment of anthropic field (ACA), anthropic environment flooded (AAI) and the anthropic forest environment (AFA). The study has been at the May of 2006 to May of 2005, using the capture method with mist-nets and the method of irregular courses, being the first one applied in the AFA, and as in the ACA and the AAI. They had been registered 141 species of birds in a total of 1.824 working hours. These are distributed in 20 orders, 46 families, 125 genders, resulting in 2.243 observed individuals, 184 captured and 17 recaptured. The accumulated curve of species as soon as did not show to trend to the stabilization, suggesting that the expended effort of collection has not been enough to show to all the community, indicating new species can be registered. The Non- Passeriformes had added 56 species, with bigger representation in the families Ardeidae and Trochilidae. The Passeriformes had been most representative, with 85 species and in Tyrannidae are the bigger. The environment that presented greater wealth was the AAI with 85 species, AFA with the 72 and the ACA with 52 species. The most frequent species (FR) had been Patagioenas picazuro in ACA, Thraupis sayaca in AAI and Chiroxiphia caudata in AFA. The analysis of the occurrence frequency (FO) showed that the majority of the species had FO below of 25%, whereas few species had presented bigger FO that 75%. The bigger with FO had been Vanellus chilensis, Pitangus sulphuratus, T. sayaca and Basileuterus leucoblepharus. The community was grouped in 13 trophic guilds, being the insectivora of the bigger predominance in all environments. Of the registered species, 04 are migrants and 03 are threatened of extinguishing. Although the RPPN presents one high degree of degradation, it possess high wealth and diversity of species of birds, it is the factor that can contribute to not only increase its value of conservation, as well as auxiliary in the implantation of projects of ecological restoration of the remainders.

Made available in DSpace on 2016-01-26T12:51:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 danielaprudenteteixeiranunes_dissert.pdf: 2007548 bytes, checksum: 1b9b96cf5d50556af914f8157e7d26ec (MD5) Previous issue date: 2010-12-16 / Adenosine deaminase (ADA), an enzyme coded by ADA gene (20q13.11) acts in adenosine metabolism and it is involved in the modulation of the immune response. ADA gene G22A polymorphism originates two co-dominants alleles ADA*01 and ADA*02 and influences the level of ADA enzyme in the organism. Apparently it has a fundamental role in gestational maintenance. The ADA*02 allele has been associated as protector effect against recurrent spontaneous abortion (RSA) in European Caucasian women. Aim: To investigate if ADA gene G22A polymorphism is associated with occurrence of RSA in Brazilian women. Methods: After obtaining the written consent 311 women were selected to compose two groups: G1 with previous history of RSA (n=129) and G2 without previous history of RSA (n=182). Genomic DNA was isolated from peripheral blood using commercial kits. The PCR-RFLP method was used to identify ADA gene G22A polymorphism. p>0005 was considered statistically significant. Results: The frequencies of ADA*01;*01, ADA*01;*02 and ADA*02;*02 genotypes were similar in both groups (G1 and G2) with no statistically significance differences observed (p = 0,7170; x2 = 0,6653; GL = 2). ADA*01 and ADA*02 alleles frequencies were 95,6% and 4,4% in G1 group and 94,9% and 5,1% in G2 group, respectively (p = 0,8433; OR = 1,179; CI 95%: 0,5340 2.601). Conclusion: The results suggest that ADA alleles ADA*01 and ADA*02 are not associated with RSA. It xvi is possible that the reduction of ADA levels resulting from the presence of at least one ADA*02 allele do not have a role against abortion in Brazilian women. / Polimorfismo G22A do gene ADA e abortamento espontâneo recorrente: ausência de associação Introdução: A adenosina deaminase (ADA), uma enzima codificada pelo gene ADA (20q13.11), atua no metabolismo da adenosina e modula a resposta imune. O polimorfismo G22A deste gene origina os alelos co-dominantes ADA*01 e ADA*02 e influencia o nível de expressão da enzima ADA, que possui papel fundamental na manutenção da gestação. O alelo ADA*02 tem sido associado a um efeito protetor contra o abortamento espontâneo recorrente (AER) em mulheres caucasianas européias. Objetivo: Investigar se o polimorfismo G22A do gene ADA se associa à ocorrência de AER em brasileiras. Métodos: Após obtenção do Termo de Consentimento Livre e Esclarecido (Parecer CEP FAMERP 308/2008), 311 mulheres foram selecionadas para compor dois grupos: G1 com histórico de AER (N=129) e G2 sem histórico de AER (N=182). O DNA genômico foi extraído a partir de sangue periférico com o uso kit comercial. O polimorfismo G22A do gene ADA foi identificado com o uso do método PCR-RFLP. O valor p>0,005 foi considerado significante. Resultados: As frequências dos genótipos ADA*01;*01, ADA*01;*02 e ADA*02;*02 foram semelhantes entre os grupos e não apresentaram diferenças estatisticamente significantes (p = 0,7170; &#967;2 = 0,6653; GL = 2). As frequências dos alelos ADA*01 e ADA*02 em G1 foram iguais a 95,6% e 4,4%; em G2, 94,9% e 5,1%, respectivamente (p=0,8433; OR=1,179; IC 95%: 0,5340-2.601). Conclusões: Os resultados sugerem que xiv os alelos ADA*01 e ADA*02 do gene ADA não estão associados ao AER. É possível que a redução nos níveis da ADA resultantes do alelo ADA*02 não apresente um efeito protetor contra o AER em brasileiras.