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Detecção do Paracoccidioides spp. em amostras ambientais e diferenciação do complexo P. brasiliensis da espécie P. lutzii por Nested PCR e hibridização in situ /

Arantes, Thales Domingos. January 2015 (has links)
Orientador: Eduardo Bagagli / Coorientador: Raquel Cordeiro Theodoro / Banca: Patricia Albuquerque de Andrade Nicola / Banca: Adriana Pardini Vicentini / Banca: Silvio de Alencar Marques / Banca: Renata Castiglioni Pascon / Resumo: O solo é o provável habitat do fungo patogênico Paracoccidioides spp., devido à detecção molecular deste patógeno neste tipo de amostra, associada à frequente infecção de trabalhadores rurais e isolamento em animais silvestres (Dasypus novemcinctus e Cabassous centralis). O presente estudo visou detectar e diferenciar as espécies Paracoccidioides brasiliensis (complexo) e Paracoccidioides lutzii no ambiente, pelas técnicas de Nested PCR, FISH, respectivamente, em amostras ambientais aerossóis e solo de tocas de tatus provenientes de áreas endêmicas para a Paracoccidioidomicose nas regiões Sudeste, Centro-Oeste e Norte brasileiras. Além da detecção ambiental de Paracoccidioides sp. por métodos moleculares, foi estudada a ocorrência de tatus infectados com P. lutzii no centro-oeste brasileiro, região de maior prevalência desta espécie, onde nenhum animal havia sido avaliado até o presente momento. Obtivemos a detecção positiva para ambas as espécies de Paracoccidioides por ambas as técnicas de detecção (Nested PCR e hibridização in situ), além da diferenciação por ITS (Internal Transcribed Spacer) pudemos visualizar os espécimes fúngicos em algumas amostras aerossóis. Acreditamos que os dados refletem a real ocorrência dos fungos em seu nicho, no entanto, o isolamento animal em tatus demonstrou-se negativo para 7 animais avaliados no trabalho, o que pode indicar que a relação da espécie P. lutzii com os tatus pode não ser a mesma com os casos de tatus infectados com P. brasiliensis em outras regiões brasileiras / Abstract: Soil is probably the habitat of pathogenic fungi Paracoccidioides spp., due to the molecular detection of this pathogen in these samples, associated with the frequent of infection in rural workers and the isolation in wild animals (Dasypus novemcinctus and Cabassous centralis). This project aimed to detect and differentiate the species P. brasiliensis (complex) and P. lutzii in the environment, by the techniques of Nested PCR and FISH, respectively, in environmental aerosol samples and soil from armadillo's burrows, from endemic and non-endemic areas to Paracoccidioidomycosis in the Southeast, Midwest and North regions of Brazil. Besides the environmental detection of Paracoccidioides spp. by molecular methods, the occurrence of armadillos infected with P. lutzii the Brazilian center-west region with the highest prevalence of this kind, where no animals were evaluated at the present time will be studied. We achieved positive detection of both species of Paracoccidioides by both detection techniques (PCR and in situ hybridization), and further the differentiation by the ITS (Internal Transcribed Spacer) we could visualize fungal species in some aerosol samples also differentiating the two species. We believe of the data reflect the actual occurrence of fungi in their niche, however the animal isolation in armadillo's showed up negative for 7 animals evaluated at work, which indicated that the ratio of the species P. lutzii with armadillo may not be the same with cases of armadillo's infected with P. brasiliensis in other regions of Brazil / Doutor
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Produção e preservação de estruturas de resistência de fungos fitopatogênicos habitantes do solo /

Bueno, César Júnior. January 2004 (has links)
Orientador: Nilson Luiz de Souza / Banca: Edson Luiz Furtado / Banca: Yodiro Masuda / Banca: Raquel Ghini / Banca: Walmir Contra de Jesus Junior / Resumo: Os fungos fitopatogênicos habitantes de solo causam grandes perdas em culturas econômicas. Estes organismos, por produzirem estruturas de resistência na ausência de hospedeiros e/ ou condições climáticas desfavoráveis, inviabilizam o controle do patógeno. A preservação de fungos por longos períodos é importante para que pesquisas possam ser realizadas a qualquer tempo. O método de manutenção destes organismos requer que sejam conservados em baixa atividade biológica para preservar as características de esporulação e patogenicidade. O objetivo deste trabalho foi desenvolver metodologias para produzir, avaliar a sobrevivência e preservar as estruturas de resistência dos fungos Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici raça 2, Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani GA4 HGI, Sclerotium rolfsii, Sclerotinia sclerotiorum e Verticillium dahliae. O primeiro experimento foi feito no delineamento de parcelas inteiramente casualizadas em que a sobrevivência das estruturas de resistência dos seis fungos foi avaliada mensalmente por seis meses, em condições de campo e de laboratório. Para tanto, estruturas de cada fungo, produzidas através das metodologias desenvolvidas, foram enterradas no campo a 10 cm de profundidade e outras mantidas no laboratório. O objetivo deste experimento foi verificar a eficiência das metodologias para manter e também para avaliar a capacidade da sobrevivência dos patógenos, permitindo desta forma, manusear as estruturas de resistência de todos os fungos estudados. No segundo experimento, frascos de 500 mL (duas repetições/fungo) contendo estruturas de resistência, produzidas através das 2 metodologias desenvolvidas, foram mantidos em temperatura natural de laboratório, de refrigeração (º5C) e de freezer (-20ºC) para determinar a melhor condição para preservar as estruturas de cada fungo...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Soilborne phytopathogenic fungi cause great losses in economical cultures. These organisms produce resistance structures in the absence of hosts and / or unfavorable climatic conditions. These structures, when presents, make unfeasible the pathogen control. The preservation of fungi for long periods is important to make possible researches the any time. The method of maintenance of these organisms requests that are conserved in low biological activity to preserve the sporulate characteristics and pathogenicity. The objective of this work was to develop methodologies to produce and to evaluate the survival and also to preserve the resistance structures of Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici race 2, Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani AG4 HGI, Sclerotium rolfsii, Sclerotinia sclerotiorum and Verticillium dahliae. The first experiment was carried out in a randomized plots design where the survival of the resistance structures of the six fungi was monthly evaluated for six months under field and laboratory conditions. The structures of each fungus, produced through the developed methodologies, were buried in the field at 10 cm of depth and another maintained at the laboratory. The objective of this experiment was to verify the efficiency of the methodologies to maintain and also to evaluate the survival capacity of the pathogens in order to set methodologies to handle the resistance structures of those fungi. In the second experiment 500 mL flasks (two repetitions/fungus) containing resistance structure produced through developed methodologies were maintained at room, refrigerator and freezer temperature to determine the best condition to preserve the structures those pathogens. Monthly and for a period of 4 one year the survival and the vigour of each pathogen were evaluated on their specific medium...(Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Produção de proteases por fungos isolados no semiárido da Paraíba e na Antártida / Protease production by fungi isolated in the semiarid region of Paraíba and Antarctica

Machado, Suellen Emilliany Feitosa 02 March 2015 (has links)
Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2018-04-11T14:25:22Z No. of bitstreams: 1 PDF - Suellen Emilliany Feitosa Machado.pdf: 24739108 bytes, checksum: 438a71a15a2d959f1a98b9e35d78fdb3 (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2018-04-23T20:27:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Suellen Emilliany Feitosa Machado.pdf: 24739108 bytes, checksum: 438a71a15a2d959f1a98b9e35d78fdb3 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-23T20:27:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Suellen Emilliany Feitosa Machado.pdf: 24739108 bytes, checksum: 438a71a15a2d959f1a98b9e35d78fdb3 (MD5) Previous issue date: 2015-03-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Proteases are essential constituents of all living beings, since they are involved in essential biological processes such as blood clotting, cell death, tissue differentiation, protein transport across the membrane etc. They also have important biotechnological applicability, because they can be used in food processing, manufacture of detergents, leather processing, meat softening, drug formulation, in the textile industry etc. These enzymes represents about 60% of the global market for industrial enzymes; so, they are considered an important group of enzymes. This work was divided into two stages and aimed to isolate filamentous fungi collected from coconut trees and soil from a coconut located in Varzeas de Sousa, Paraiba, Brazil and do a screening for the production of proteases and to evaluate, in a bioreactor, the production of proteases by the yeast Rhodotorula mucilaginosa L07. In all, 32 fungi were isolated in Paraiba semiarid. They were grown in rotary shaker and sent to the analysis of proteolytic activity. The specie, originally called Fung1, showed better results in the qualitative stage and was taken to the molecular identification and selected for production in rotary shaker (30°C / 200rpm / 240h). R. mucilaginosa L07, originally from Antarctica, was cultivated in a bioreactor (25°C / 72h), varying agitation and aeration. The maximum enzyme activity by the Fung1, identified as Aspergillus tubingensis, was 29 U.mL^-1, after 144h cultivation. This fungus is not a fumonisin B2 and ochratoxin A producer. The greatest value of proteolytic activity of R. mucilaginosa L07 was 124.88 U.mL^-1 with agitation of 500rpm and aeration 1,0vvm. The results indicated that A. tubingensis produces proteases, but other studies are needed to optimize production and classify proteases. The supply of oxygen to R. mucilaginosa L07 were positive for proteolytic activity, because it increased from 33.36 to 124.88 U.mL^-1 in rotary shaker and bioreactor, respectively. / Proteases são constituintes essenciais em todos os seres vivos, pois estão envolvidas em processos biológicos essenciais como coagulação sanguínea, morte celular, diferenciação de tecidos, transporte de proteínas através da membrana etc. Também possuem importante aplicabilidade biotecnológica, pois podem ser usadas no processamento de alimentos, formulação de detergentes, processamento de couro, amaciamento de carnes, formulação de medicamentos, na indústria têxtil etc. Por representarem aproximadamente 60% do mercado mundial de enzimas industriais, são consideradas um importante grupo de enzimas. Este trabalho foi dividido em duas etapas e objetivou isolar fungos filamentosos coletados em coqueiros e solo de um coqueiral localizado nas Várzeas de Sousa, Paraíba, Brasil e fazer um screening quanto à produção de proteases, além de avaliar, em biorreator, a produção de proteases pela levedura Rhodotorula mucilaginosa L07. Ao todo, 32 fungos foram isolados no semiárido paraibano, cultivados em agitador rotatório e encaminhados à análise da atividade proteolítica. A espécie inicialmente denominada Fung1 apresentou melhor resultado na etapa qualitativa, foi encaminhada à identificação molecular e selecionada para a produção em agitador rotatório (30°C/ 200rpm/ 240h). A R. mucilaginosa L07, coletadada na Antártida, foi cultivada em biorreator (25°C/ 72h), variando agitação e aeração. A atividade enzimática máxima do Fung1, identificado como Aspergillus tubingensis, foi 29 U.mL , após 144h de cultivo. Este fungo não é produtor de fumonisina B2 e ocratoxina A. O maior valor de atividade proteolítica da R. mucilaginosa L07 foi de 124,88 U.mL^-1 , com agitação de 500rpm e aeração de 1,0vvm. Os resultados indicaram que A. tubingensis produz proteases, porém outros estudos são necessários para otimizar a produção e classificar as proteases. O fornecimento de oxigênio em cultivos da R. mucilaginosa L07 foi positivo para a atividade proteolítica, pois a mesma aumentou de 33,36 para 124,88 U.mL^-1, em agitador rotatório e biorreator, respectivamente.
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Transformações microbianas e avaliação da citotoxicidade de lactonas sesquiterpênicas de \'Viguiera robusta\' Gardn. (Asteraceae) / Microbial Transformations and cytotoxic evaluation of sesquiterpene lactones from Viguiera robusta Gardn. (Asteraceae).

Nilton Syogo Arakawa 08 February 2008 (has links)
O processo de transformação microbiana de metabólitos secundários é uma técnica emergente no Brasil e que apresenta enorme potencial para obtenção de substâncias biotransformadas com novas e diferentes moléculas, as quais podem apresentar melhor desempenho de suas atividades biológicas. O objetivo do presente projeto foi efetuar transformações microbianas de metabólitos secundários oriundos da espécie vegetal Viguiera robusta Gardn. (família Asteraceae), com ênfase nas lactonas sesquiterpênicas (LSTs), para posterior avaliação de sua citotoxicidade frente a linhagens celulares. As etapas de isolamento e purificação de LSTs foram realizadas através de métodos cromatográficos e a elucidação estrutural através de métodos espectroscópicos. A avaliação da atividade citotóxica dos metabólitos biotransformados foi proposta em virtude de estudos iniciais indicarem potencial citotóxico da LST budleína A frente às linhagens SK-BR-3 (adenocarcinoma de mama) e células leucêmicas JURKAT. / The microbial transformation of secondary metabolites is an emerging technique in Brazil with high potential to obtain biotransformed compounds with new and different molecules which can show enhanced biological activities. Herein, microbial transformations of secondary metabolites from Viguiera robusta Gardn. (family Asteraceae), with emphasis in sesquiterpene lactones (STLs), were proposed with the aim to evaluate their cytotoxic activity against tumor cells lines. Isolation and purification of STLs were carried out through chromatographic methods and structural elucidation by spectroscopic methods. The evaluation of cytotoxic activity of the biotransformed metabolites was proposed due to the fact that previous studies indicated potential cytotoxic activity of the STLs budlein A against SK-BR-3 and JURKAT cells lines.
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Tratamento de sementes de tomate associado ? microbioliza??o com Trichoderma spp / Treatment of tomato seeds associated to microbiolization with Trichoderma spp

Sudo-martelleto, Mariluci 28 April 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2016-04-28T14:59:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009 - Mariluci Sudo Martelleto.pdf: 631667 bytes, checksum: 81045920c104dc187741ab864bd0fe1c (MD5) Previous issue date: 2009-04-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / This study was conducted at the Laboratory of Pathology and Epidemiology, Department of Plant Science of UFRRJ and at PESAGRO-RIO / Serop?dica Experimental Station with the objective of selecting Trichoderma spp. antagonistic to Rhizoctonia in vitro; to quantify the effect of Trichoderma spp. in protecting seeds and seedlings of tomato against the attack of Rhizoctonia spp.; evaluate the effect of Trichoderma spp. in the emergence and quality of tomato seedlings developed in the presence of the pathogen and determine the macronutrient seedlings grown in a substrate inoculated with Trichoderma spp. and Rhizoctonia; study the effect of the combination of thermal and chemical treatments with microbiolization seeds with previously selected isolates of Trichoderma spp. and evaluate the survival of Trichoderma spp. in spermosphere and in the rhizosphere of seedlings. Were used isolates of Trichoderma spp, pre-selected from seeds of Santa Clara Miss Brazil , Garrafinha Vermelho and Perinha ?gua Branca , untreated with fungicide. Three of the isolates showed antagonistic activity in vitro and suppression of colony growth of Rhizoctonia spp. In tests of biological control under greenhouse conditions, effects of treatments were seen in the emergence, length and dry weight of shoot and root, root area of plants, teor and content of nitrogen, phosphorus and potassium, and easy recovery of Trichoderma spp. from seeds and roots of seedlings. For combination of thermal and chemical treatments of the seeds with Trichoderma spp. there went significant effects of treatments on emergence and seedling development. The seed treatment via dry heat at 70 ? C / 96 hours resulted in low germination both in Gerbox? and in the substrate, while treatments with water heated to 50 ? C for 30 minutes and with HCl 5% per 10 minutes were the least damage caused to the seeds. Seed treatment with hot water associated with isolated or TENA7 TENA16 as biological protectors resulted in good emergence and development of seedlings and saplings, as well as the association between treatment with 5% HCl for 10 minutes followed by application of Trichoderma isolate TENA7. / O presente trabalho foi realizado no Laborat?rio e Epidemiologia e Patologia de Sementes do Departamento de Fitotecnia da UFRRJ e na PESAGRO-RIO/ Esta??o Experimental de Serop?dica com o objetivo de selecionar isolados de Trichoderma spp. antagonistas a Rhizoctonia in vitro; quantificar o efeito da aplica??o de Trichoderma spp. na prote??o de sementes e pl?ntulas de tomate contra o ataque de Rhizoctonia spp; .avaliar o efeito da aplica??o de Trichoderma spp. na emerg?ncia e qualidade das mudas de tomate desenvolvidas na presen?a do pat?geno; determinar os teores de macronutrientes das mudas formadas em substrato inoculados com isolados de Trichoderma spp. e Rhizoctonia; estudar o efeito da associa??o de tratamentos t?rmicos e qu?mico com a microbioliza??o das sementes com isolados previamente selecionados de Trichoderma spp. e avaliar a sobreviv?ncia de isolados de Trichoderma spp. na espermosfera e rizosfera das mudas. Utilizaram-se isolados de Trichoderma spp. previamente selecionados e sementes das cultivares Santa Clara Miss Brasil e Garrafinha Vermelho sem tratamento pr?vio com fungicida. Tr?s dos isolados testados apresentaram antagonismo in vitro e supress?o do crescimento das col?nias de Rhizoctonia spp. Nos ensaios de controle biol?gico sob condi??es de casa-de-vegeta??o, foram observados efeitos dos tratamemtos na emerg?ncia, comprimento e massa seca de parte a?rea e ra?zes, ?rea radicular das mudas, nos teores e conte?dos de N, P e K e f?cil recupera??o dos isolados de Trichoderma spp. a partir das sementes e ra?zes das mudas. Na associa??o de tratamentos t?rmico e qu?mico das sementes com isolados de Trichoderma spp. houve efeito significativo dos tratamentos sobre a emerg?ncia e desenvolvimento das mudas. O tratamento das sementes via calor seco a 70?C/ 96 hs resultou em baixa germina??o de sementes tanto, em gerbox quanto em substrato, enquanto os tratamentos com ?gua aquecida a 50? C por 30 min e com HCl a 5% por 10 min foram os que menos danos causaram ?s sementes. O tratamento de sementes com ?gua quente associado aos isolados TENA7 ou TENA16 como protetores biol?gicos resultaram em boa emerg?ncia e desenvolvimento das pl?ntulas e mudas, assim como a associa??o entre tratamento com HCl a 5% por 10 min seguido da aplica??o do isolado TENA7 de Trichoderma.
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Solarização em microcosmo: efeito de materiais vegetais na sobrevivência de fitopatógenos e na produção de voláteis

Basseto, Marco Antonio [UNESP] 11 December 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-12-11Bitstream added on 2014-06-13T18:45:55Z : No. of bitstreams: 1 basseto_ma_dr_botfca.pdf: 601741 bytes, checksum: 682ae120d3b404d74fd6cd7839640f84 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A incorporação de culturas específicas associadas à solarização do solo tem sido apresentada como um avanço muito promissor para o controle de fungos fitopatogênicos habitantes do solo. Além das brássicaceas, comumente utilizadas, novos materiais vegetais como a mandioca e a mamona têm apresentado potencial para controle desses fitopatógenos. Vários fatores são apontados como responsáveis pelo controle, entre eles os voláteis oriundos da decomposição dos vegetais. Assim, este trabalho foi idealizado com dois objetivos divididos em duas etapas complementares: biológica - avaliar o efeito ocasionado pela incorporação e decomposição de parte aérea de brócolis, mamona e mandioca brava e mandioca mansa, associadas à simulação da solarização, sobre diferentes estruturas dos fungos Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici Raça 2, Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani AG-4 HGI e Sclerotium rolfsii; química - identificar e apontar dentro de cada material vegetal qual(is) é(são) o(s) volátil(eis) potencial(ais) pelo controle das estruturas dos fungos. Na primeira etapa, quatro ensaios idênticos foram instalados em conjuntos de microcosmos, com quatro períodos de exposição diferentes e independentes (7, 14, 21 e 28 dias), avaliando efeitos no crescimento micelial (inócuo, fungistático e fungicida) e na sobrevivência das estruturas de resistência dos fungos de solo. Verificou-se efeito fungistático e fungicida no crescimento micelial de F. oxysporum f. sp. lycopersici Raça 2, R. solani AG-4 HGI e de S. rolfsii. O efeito fungicida apenas ocorreu aos 21 dias de incubação para F. oxysporum e R. solani e aos 28 dias para S. rolfsii. Para M. phaseolina, observou-se apenas efeito inócuo. Os tratamentos solo+materiais vegetais, ao longo dos períodos testados, reduziram, significativamente, a sobrevivência das estruturas de resistência de todos os fungos... / The incorporation of specific cultures associated with solarization has been a highly promising advance to control phytopathogenic fungi inhabiting the soil. In addition to the commonly used Brassicaceae, new plant materials such as cassava and castor plants have shown potential to control these phytopathogens. Several factors are considered responsible for this control, including volatile compounds from plant decomposition. Thus, the present work was divided into two complementary steps according to its two major aims: biological step – to evaluate the effect of the incorporation and decomposition of broccoli, castor and cassava (bitter and sweet) shoot, associated with simulated solarization, on different structures of the fungi Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici Race 2, Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani AG-4 HGI and Sclerotium rolfsii; chemical step – to identify for each plant material which volatile compound(s) present(s) potential to control fungal structures. In the first step, four identical assays were established in groups of microcosms, with four different and independent exposure periods (7, 14, 21 and 28 days), to evaluate the effects on mycelial growth (innocuous, fungistatic and fungicide) and survival of resistance structures of soil fungi. Fungistatic and fungicide effects were detected on the mycelial growth of F. oxysporum f. sp. lycopersici Race 2, R. solani AG-4 HGI and S. rolfsii. Fungicidal effect occurred only at 21 days of incubation for F. oxysporum and R. solani and at 28 days for S. rolfsii. As regards M. phaseolina, only an innocuous effect was observed. The treatments soil+plant material, over the tested periods, significantly reduced the survival of resistance structures for all fungi. In general, broccoli and bitter and sweet cassava had expressive... (Complete abstract click electronic access below)
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Tratamento de sementes no controle de Fusarium verticillioides e Pythium ultimum no desenvolvimento do milho / Seed treatment in control Fusarium verticillioides and Pythium ultimum on corn development

Sachs, Cristiano 23 November 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV13MA130.pdf: 162031 bytes, checksum: 6225aa759350de534e1b4790835b40a1 (MD5) Previous issue date: 2013-11-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Diseases as rotten seed and damping-off cause damages in corn stand. These diseases are more common in the southern region, for the sowing in cold soil. It increases during the period between sowing and seedling emergence, which contributes to the infection by pathogens associated with seed and/or in the soil pathogens. The Chemical Seeds treatment (ST) with fungicide can be an alternative to control these pathogens. The aim of this study was to quantify the mix of estrobilurin and carboxamides with moléculas already used on seed treatment against Fusarium verticillioides and Pythium ultimum beyond the effect of these on the emergence and rate emergence of plants, stalk rot incidence and barren plants and yield. The field experiments were carried out in the season of 2010/11 and 2011/12, in the locations of Xanxerê, São Domingos and Lages in Santa Catarina. It was evaluated the percentage of emerged plants, emergence rate speed, barren plants and stem rotting incidence and yield. Experiments were also carried out "in vitro" for the F. verticillioides control associated with seed and the seedling protection against P. ultimum in the soil. It was evaluated the chemical control of fungicides belonging benzimidazoles, carboxamides and strobilurin groups, isolated and/or in combination, compared with the standard fludioxonil + metalaxyl-m and in combination with carbendazim + thiram. ST with fungicides fludioxonil + metalaxyl-m + carbendazim + thiram and fludioxonil + metalaxyl-m + azoxystrobin + thiabendazole resulted in higher percentage of emerged plants and emergence rate speed in wet and cold soil conditions. As there was an increase in soil temperature it increased the emergence rate speed of plants, 3 regardless of the ST. Seeds treatment with fungicides reduced the stem rotting incidence in this trial with sowing on fallow, however in trials it was sown on oat straw it had no effect. In subsequent sowing, there was a reduction in barren plants incidence, wich was also significantly reduced by ST, indicating that the two factors have an effect on this parameter. The ST did not increase the yield in the trials in São Domingos and Lages, while the experiment was carried out in Xanxerê showed difference in just one hybrid evaluated. The fungicides fludioxonil + metalaxyl-m + carbendazim + thiram and fludioxonil + metalaxyl-m + azoxystrobin + thiabendazole + abamectin showed potential for eradication of F. verticillioides in seeds. The fungicide azoxystrobin mixed with fludioxonil + metalaxyl-m reduced the damage caused by P. ultimum. It did not occur an increasing of P. ultimum control efficiency adding sedaxane. The ST is able to control the pathogens F. verticillioides and P. ultimum, increases the emergency and emergency speed of corn plants, reduces the stem rotting incidence and barren plants incidence and under certain conditions increases the yeld / Doenças como podridões de sementes e tombamento de plântulas causam danos no estande da cultura do milho. Estas são de ocorrência comum na região sul, pois a semeadura em solo frio aumenta o período necessário para emergência das plântulas, o que favorece a infecção por patógenos associados a semente e/ou presentes no solo. O tratamento químico de sementes (TS) pode ser uma alternativa no controle desses patógenos. O objetivo deste trabalho foi quantificar a eficácia de misturas de estrobilurinas e carboxamidas com moléculas atualmente empregadas no TS visando controle de Fusarium verticillioides e Pythium ultimum além do efeito destas sobre a emergência e velocidade de emergência de plantas, incidência de podridões de colmo e plantas dominadas e o rendimento de grãos. Foram conduzidos experimentos de campo, nas safras agrícolas de 2010/11 e 2011/12, nos municipios de Xanxerê, Lages e São Domingos, estado de Santa Catarina. Foram avaliadas a porcentagem de plantas emergidas, velocidade de emergência, incidência de plantas dominadas e de podridões da base do colmo e produtividade de grãos. Também foram realizados experimentos in vitro no controle de F. verticillioides associado à semente e na proteção de plântulas contra P. ultimum presente no solo.Testaram-se fungicidas pertencentes aos grupos químicos dos benzimidazóis, carboxamidas e estrobilurinas, isolados e/ou em mistura, comparados com o padrão fludioxonil + metalaxil-m isolado e em mistura com carbendazim + tiram. O TS com os fungicidas fludioxonil + metalaxil-m + carbendazim + tiram e fludioxonil + metalaxil-m + 1 tiabendazole + azoxistrobina sozinho ou em mistura com sedaxane ou abamectina, proporcionou aumento na porcentagem de plantas emergidas e velocidade de emergência em condições de solo úmido e frio. À medida que houve incremento na temperatura do solo aumentou a velocidade de emergência de plantas, independente da presença de TS com fungicidas. O TS com misturas de fungicidas reduziu a incidência de podridões da base do colmo no experimento onde o milho foi semeado sobre pousio, no entanto nos experimentos onde foi semeado sobre palhada de aveia não teve efeito. À medida que a semeadura foi realizada nas épocas subsequentes, ocorreu redução na incidência de plantas dominadas, que também foi reduzida significativamente pelo TS com fungicidas, indicando que os dois fatores tem efeito sobre esse parâmetro. O TS com misturas de fungicidas não incrementou estatisticamente o rendimento de grãos, nos experimentos de São Domingos e Lages, sendo que no experimento conduzido em Xanxerê houve diferença em apenas um híbrido. Os fungicidas fludioxonil + metalaxil-m + carbendazim + tiram e fludioxonil + metalaxil-m + tiabendazole + azoxistrobina + abamectina apresentaram potencial para erradicação de F. verticillioides das sementes. O fungicida azoxistrobina em mistura com fludioxonil + metalaxil-m reduziu os danos causados por P. ultimum. A adição de sedaxane não incrementou a eficiência do tratamento padrão no controle de P. ultimum. O TS é capaz de controlar os patógenos F. verticillioides e P. ultimum, aumentar a emergência e velocidade de emergência, diminuir a incidência de podridões da base do colmo e plantas dominadas e em determinadas condições aumentar o rendimento de grãos
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Sobrevivência em microcosmo e em campo solarizado de fitopatógenos submetidos à fermentação acelerada de diferentes matériais orgânicos /

Ambrósio, Márcia Michelle de Queiroz, 1976- January 2006 (has links)
Orientador: Nilton Luiz de Souza / Banca: Edson Luiz Furtado / Banca: Roberto Lyra Villas Bôas / Banca: Alfredo Seiti Urashima / Banca: Flávia Rodrigues A. Patricio / Resumo: A solarização é uma das alternativas de controle físico para vários fitopatógenos que podem sobreviver por vários anos no solo por meio de estruturas de resistência, causando danos em muitas culturas, e muitas vezes inviabilizando vastas áreas agrícolas. No entanto, existem algumas espécies que possuem temperatura letal acima daquela atingida pela solarização do solo. Vem sendo estudado a incorporação de material orgânico previamente a colocação do plástico, situação esta que promove o aprisionamento dos gases oriundos da decomposição, conferindo um efeito aditivo à solarização. O objetivo do presente trabalho consistiu na prospecção de materiais orgânicos promissores para produzir voláteis fungitóxicos capazes de controlar fitopatógenos de solo. Foram realizados dois ensaios em condições de microcosmo (câmara de vidro) para simular a solarização do solo, onde incorporou-se 1kg/m2 de material orgânico fresco e posteriormente, dois experimentos de campo, em épocas diferentes e em áreas contíguas com os mesmos materiais orgânicos. No primeiro experimento foi incorporado 1kg/m2 de material orgânico e no segundo 3Kg/m2. Estudou-se quatro fitopatógenos (Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici Raça 2; Macrophomina phaseolina; Rhizoctonia solani AG-4 HGI e Sclerotium rolfsii) frente a quatro 2 materiais orgânicos frescos e triturados incorporados ao solo (folhas e ramos de brócolos, eucalipto, mamona e mandioca brava). O controle dos fungos foi avaliado por meio da análise da sobrevivência das estruturas em meio semi-seletivo específicos, durante quatro períodos (7, 14, 21 e 28 dias do início do experimento). Nos experimentos de campo, foram monitoradas a temperatura por um coletor de dados Tipo CR23X (Campbell Scientific) e a porcentagem de CO2 e de O2 pelo equipamento analisador de gases (Texto 325-1)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo). / Abstract: Solarization is one of the physical control alternatives available against a number of plant pathogens capable of surviving for several years in the soil by means of resistance structures, causing damage to many crops, and often rendering vast agricultural areas unviable. However, there are a few species whose lethal temperature is above the temperature reached during soil solarization. The incorporation of organic material prior to mulching with plastic is currently being studied. This condition promotes the trapping of gases from decomposition, imparting an additive effect to solarization. The objective of the present work consisted in the investigation of organic materials which are promising to produce fungitoxic volatiles that can control soil plant pathogens. Two assays were carried out under microcosmic conditions (glass chamber) to simulate soil solarization, in which 1kg/m2 of fresh organic material were incorporated. Later, two field experiments were carried out during different seasons and at contiguous areas, using the same organic materials. In the first experiment, 1kg/m2 of organic material was incorporated, while 3Kg/m2 were incorporated in the second. Four plant pathogens (Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici Strain 2; Macrophomina phaseolina; Rhizoctonia solani AG-4 HGI, and Sclerotium rolfsii) were studied under four types of fresh, ground organic materials incorporated into the soil (leaves and branches of broccoli, eucalyptus, castor bean, and wild cassava). Fungus control was evaluated through the analysis of the survival of structures in a specific semi-selective medium, during four periods (7, 14, 21, and 28 days from the beginning of the experiment). In 4 the field experiments, temperature was monitored with a Type CR23X (Campbell Scientific) data collector, and CO2 and O2 percentages were monitored with a Testo 325-1 gas analyzer equipment. In both field experiments...(Complete abstract, click electronic address below) / Doutor
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Solarização em microcosmo : efeito de materiais vegetais na sobrevivência de fitopatógenos e na produção de voláteis /

Basseto, Marco Antonio, 1981- January 2009 (has links)
Resumo: A incorporação de culturas específicas associadas à solarização do solo tem sido apresentada como um avanço muito promissor para o controle de fungos fitopatogênicos habitantes do solo. Além das brássicaceas, comumente utilizadas, novos materiais vegetais como a mandioca e a mamona têm apresentado potencial para controle desses fitopatógenos. Vários fatores são apontados como responsáveis pelo controle, entre eles os voláteis oriundos da decomposição dos vegetais. Assim, este trabalho foi idealizado com dois objetivos divididos em duas etapas complementares: biológica - avaliar o efeito ocasionado pela incorporação e decomposição de parte aérea de brócolis, mamona e mandioca brava e mandioca mansa, associadas à simulação da solarização, sobre diferentes estruturas dos fungos Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici Raça 2, Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani AG-4 HGI e Sclerotium rolfsii; química - identificar e apontar dentro de cada material vegetal qual(is) é(são) o(s) volátil(eis) potencial(ais) pelo controle das estruturas dos fungos. Na primeira etapa, quatro ensaios idênticos foram instalados em conjuntos de microcosmos, com quatro períodos de exposição diferentes e independentes (7, 14, 21 e 28 dias), avaliando efeitos no crescimento micelial (inócuo, fungistático e fungicida) e na sobrevivência das estruturas de resistência dos fungos de solo. Verificou-se efeito fungistático e fungicida no crescimento micelial de F. oxysporum f. sp. lycopersici Raça 2, R. solani AG-4 HGI e de S. rolfsii. O efeito fungicida apenas ocorreu aos 21 dias de incubação para F. oxysporum e R. solani e aos 28 dias para S. rolfsii. Para M. phaseolina, observou-se apenas efeito inócuo. Os tratamentos solo+materiais vegetais, ao longo dos períodos testados, reduziram, significativamente, a sobrevivência das estruturas de resistência de todos os fungos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The incorporation of specific cultures associated with solarization has been a highly promising advance to control phytopathogenic fungi inhabiting the soil. In addition to the commonly used Brassicaceae, new plant materials such as cassava and castor plants have shown potential to control these phytopathogens. Several factors are considered responsible for this control, including volatile compounds from plant decomposition. Thus, the present work was divided into two complementary steps according to its two major aims: biological step - to evaluate the effect of the incorporation and decomposition of broccoli, castor and cassava (bitter and sweet) shoot, associated with simulated solarization, on different structures of the fungi Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici Race 2, Macrophomina phaseolina, Rhizoctonia solani AG-4 HGI and Sclerotium rolfsii; chemical step - to identify for each plant material which volatile compound(s) present(s) potential to control fungal structures. In the first step, four identical assays were established in groups of microcosms, with four different and independent exposure periods (7, 14, 21 and 28 days), to evaluate the effects on mycelial growth (innocuous, fungistatic and fungicide) and survival of resistance structures of soil fungi. Fungistatic and fungicide effects were detected on the mycelial growth of F. oxysporum f. sp. lycopersici Race 2, R. solani AG-4 HGI and S. rolfsii. Fungicidal effect occurred only at 21 days of incubation for F. oxysporum and R. solani and at 28 days for S. rolfsii. As regards M. phaseolina, only an innocuous effect was observed. The treatments soil+plant material, over the tested periods, significantly reduced the survival of resistance structures for all fungi. In general, broccoli and bitter and sweet cassava had expressive... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Edson Luiz Furtado / Coorientador: César Junior Bueno / Banca: Francisco Maximino Fernandes / Banca: Marli Teixeira de Almeida Minhoni / Banca: Flavia Rodrigues Alves Patricio / Banca: Fabio Augusto / Banca: Marcia Michelle de Queiroz Ambrósio / Doutor
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Avaliação in vitro da suscetibilidade antifúngica de conídios e células muriformes de Fonsecaeae spp

TAKAHASHI, Aline Barral 14 August 2018 (has links)
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New azolics such as posaconazole and voriconazole began to be used, but with limitations due to the high cost, the use of physical methods such as cryosurgery, thermotherapy, laser therapy and both. The low cure rates and high rates of relapse of the disease may be related to the different treatment methods employed and the lack of a standardized regimen itself. The objective of this work was to evaluate the in vitro sensitivity of conidia and in vitro induced muriform cells of Fonsecaea spp. in the presence of different antifungal agents, to date there are no studies evaluating the action of drugs using the pathogenic form of the fungus, reinforcing the importance of this study, following the method established in the standard M38-A2, Clinical and Laboratory Standards Institute. The minimum inhibitory concentration for each drug was obtained after 5 days of interaction, posaconazole showed better in vitro inhibitory activity for conidia (CIMMG = 0.632μg / ml) and muriform cells (CIMMG = 1μg / ml). In the analysis of the fungicidal concentration, in both conidia and muriform cells, posaconazole presented lower value (CFMMG = 6.72μg / ml, in both). The fungus samples presented distinct times to differentiate their conidia in muriform cells, therefore we believe that although they belong to the same genus the fungi present physiological peculiarities still unknown. In the in vitro susceptibility tests PCZ had the lowest inhibitory and fungicidal concentrations in both conidia and muriform cells, thus investing in susceptibility testing was important to identify sensitive or resistant strains. / A cromoblastomicose (CBM) é uma doença fúngica caracterizada por lesões crônicas cutâneas e subcutâneas, decorrentes da implantação transcutânea prévia de diferentes fungos negros, pertencentes a família Herpotrichiellaceae, o principal agente pertencente ao gênero Fonsecaea. A região amazônica é a principal área endêmica do Brasil, o estado do Pará a principal área endêmica no país e segunda no mundo. Não há uma padronização de tratamento, é usado a terapia medicamentosa, com diferentes esquemas, principalmente itraconazol. Novos azólicos como posaconazol e voriconazol começaram a ser utilizados, mas com limitações devido ao alto custo, o uso de métodos físicos como a criocirurgia, termoterapia, terapia a laser e a combinação de ambos. As baixas taxas de cura e altas taxas de recidivas da doença pode estar relacionado aos diferentes métodos de tratamento empregados e a própria falta de um esquema padronizado. O objetivo deste trabalho foi avaliar a sensibilidade in vitro de conídios e células muriformes, induzidas in vitro, de Fonsecaea spp. frente a diferentes antifúngicos, até o momento não há estudos que avaliem a ação de fármacos usando a forma patogênica do fungo, reforçando a importância deste estudo, seguindo o método estabelecido na norma M38-A2, do Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). A concentração inibitória mínima para cada fármaco utilizado foi obtida após 5 dias de interação, o posaconazol apresentou melhor atividade inibitória in vitro para conídios (CIMMG=0.632μg/ml) e células muriformes (CIMMG=1μg/ml). Na análise da concentração fungicida, tanto em conídios quanto em células muriformes, o posaconazol apresentou menor valor (CFMMG=6.72μg/ml, em ambos). As amostras fúngicas apresentaram tempos distintos para diferenciar seus conídios em células muriformes, portanto acreditamos que apesar de pertencerem ao mesmo gênero os fungos apresentam particularidades fisiológicas ainda desconhecidas. Nos testes de suscetibilidade in vitro, o PCZ teve as menores concentrações inibitórias e fungicidas tanto em conídios quanto em células muriformes,com isso investir em testes de suscetibilidade foi impor importante para identificar cepas sensíveis ou resistente.

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