Tese (doutorado)-Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, 2006. / Submitted by Mariana Fonseca Xavier Nunes (nanarteira@hotmail.com) on 2010-09-25T18:16:49Z No. of bitstreams: 1 2006_Rejane da Silva Sena Barcelos.pdf: 1116902 bytes, checksum: e5d460c540afd6b0f7ba420948133f97 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-10-06T23:28:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_Rejane da Silva Sena Barcelos.pdf: 1116902 bytes, checksum: e5d460c540afd6b0f7ba420948133f97 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-10-06T23:28:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_Rejane da Silva Sena Barcelos.pdf: 1116902 bytes, checksum: e5d460c540afd6b0f7ba420948133f97 (MD5) / O objetivo desse trabalho foi analisar e comparar a constituição genética masculina e feminina da região Centro-Oeste brasileira utilizando 11 UEPs, um elemento AluYAP e 4 STRs localizados na região não-recombinante do cromossomo Y, além de 13 SNPs situados na região codificante do DNA mitocondrial (DNAmt) e uma deleção de 9 pb localizados no DNAmt. Estes marcadores foram analisados em 200 homens não aparentados do Estado de Goiás e Distrito Federal. As análises dos marcadores situados no cromossomo Y e no DNA mitocondrial demonstraram uma ampla diversidade genética entre as populações. A análise estatística dos dados foi realizada pelos programas ARLEQUIN 2000, PopGENE e pelo teste Z. Os marcadores binários do cromossomo Y e do DNA mitocondrial não indicaram diferenças estatisticamente significativas entre as populações. Entretanto, na análise dos STRs Y específicos foram observadas diferenças genéticas (p<0.05). Os resultados para contribuição paterna indicaram uma maior contribuição de homens europeus que africanos e ameríndios. Já o DNA mitocondrial mostrou uma predominância de linhagem materna ameríndia/asiática em ambas populações, seguida pela africana e uma pequena contribuição européia. Sendo assim, os resultados da contribuição paterna e materna são claramente divergentes. Esses resultados corroboram dados históricos que indicam: o cruzamento direcional entre homens europeus e mulheres dos três grupos étnicos principais que colonizaram o Brasil; e um pequeno número de homens descendentes de ameríndios na população brasileira atual, o qual é conseqüência da colonização européia. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / This research aimed to analyze and compare the male and female genetic constitution of Middle-West Brazilian region by the investigation of 11 UEPs, an AluYAP element and 4 STRs located in the nonrecombinant region of the Y-chromosome, and, also, 13 SNPs placed in coded regions of mitochondrial DNA (mtDNA) and a 9 bp deletion of mtDNA. These markers were analyzed in 200 unrelated men from Goiás state and Federal District. The analysis of the Y-chromosome and mtDNA markers demonstrated a great genetic diversity between populations. The statistical analysis of the data obtained was done using the ARLEQUIN 2000 software, PopGENE and Z test. The binary markers of Y-chromosome and mtDNA did not indicate statistic supported differences between the populations. However, genetic differences were observed in Y-chromosome STRs analysis (p<0.05). The paternal contribution results indicated a greater European men contribution than African or Amerindian ones. Besides, mtDNA showed a predominance of Amerindian/Asiatic maternal lineage in both populations constitution, followed by African and then a small European contribution. Therefore, the results showed a clear divergence from paternal to maternal lineages. These results corroborated historical data that points to: directional mating between European males and females from any of the main three ethnic groups that colonized Brazil; and to a small number of Amerindians males descendants in nowadays Brazilian populations, which is a consequence of the European colonization.

A taxonomia dos cestóides do gênero Echinococcus está submetida a constante revisão. Dez espécies são atualmente aceitas para Echinococcus, duas delas são o Echinococcus oligarthrus, agente causador da equinococose unicística, e o Echinococcus vogeli, agente causador da equinococose policística e que parece ser a espécie mais patogênica do gênero. Existem haplótipos que ainda não foram determinados como espécies e permanecem dentro da categoria de variantes genéticas. Atualmente, os estudos genéticos em Echinococcus concentram-se na análise do DNA mitocondrial, um genoma que não recombina, de rápida evolução, e de herança materna na maioria dos animais. Além disso, esses estudos têm se concentrado em E. granulosus e E. multilocularis, usando uma ou poucas amostras de Echinococcus neotropical. Este estudo teve como objetivo analisar, utilizando sequências nucleares, a composição genética das duas espécies neotropicais, visando colaborar para a compreensão dos processos evolutivos do gênero Echinococcus e, consequentemente, contribuir para o correto manuseio do parasito nas regiões afetadas. No total, foram utilizados 45 isolados para extração de DNA e subsequentes análises, 38 E. vogeli, 4 E. oligarthrus, 1 E. granulosus, 1 E. ortleppi e 1 E. multilocularis. As espécies foram determinadas a partir da amplificação e análise da sequência parcial (366 pb) do gene mitocondrial da citocromo-oxidase (cox1). Para os 45 isolados, 6 diferentes alvos nucleares (P-29, EG10, AG4, Ir, Er e TGF) foram amplificados por PCR e os diferentes genótipos foram selecionados através da técnica de SSCP. Os loci mais polimórficos encontrados em E. vogeli foram Ag4 e E10, ambos com 2 alelos, e nos loci Ir, Er, P-29 e Tgf, com um alelo. E. oligarthrus tem alelos exclusivos para cinco dos seis loci nucleares analisados; contudo, o alelo T2, do locus Tgf, também está presente em seis isolados de E. vogeli. O fluxo gênico entre as metapopulações de E. vogeli das duas áreas geográficas parece ser restrito. Além disso, o fluxo gênico entre a população de E. oligarthrus e as demais populações é restrito. A AMOVA revelou que o nível mais significante de variabilidade genética ocorre dentro das metapopulações, o segundo nível mais significativo foi encontrado entre as metapopulações dentro das suprapopulações do Acre e Pará. Os isolados amostrados no estado do Acre parecem formar um “cluster” distinto. Além disso, foi possível verificar que os isolados de E. vogeli amostrados no estado do Pará também tendem a constituir um “cluster” único, mas de forma menos uniforme. Os 11 haplótipos mitocondriais de E. vogeli constituem um grupo monofilético e distinto de E. oligarthrus e das demais espécies do gênero. / Cestodes of the genus Echinococcus are subjected to a constant taxonomic revision. Ten species are currently accepted for the genus Echinococcus, two of them are Echinococcus oligarthrus, the agent of unicystic echinococcosis and Echinococcus vogeli, the agent of polycystic echinococcosis, which seems to be one of the most pathogenic species of Echinococcus. There are haplotypes that have not been determined as species and remain within the genetic variants category. Currently, the genetic studies on Echinococcus have focused on the analysis of mitochondrial DNA, a non-recombining, fast evolving and maternally inherited genome in most animals. Besides, these studies have been concentrated in the E. granulosus and E. multilocularis, using one or few samples from neotropical Echinococcus. This study aimed to analyze, using nuclear sequences, the genetic composition of the two neotropical species, which may support the understanding of evolutionary processes on the genus Echinococcus and, consequently, will contribute to the correct handling of the parasite in the affected regions. A total of 45 isolates were used for DNA extraction and further analyses, 38 E. vogeli, 4 E. oligarthrus, 1 E. granulosus, 1 E. ortleppi and 1 E. multilocularis. The species were determined by amplification and sequence analysis of a partial sequence (366 bp) of the mitochondrial cytochrome oxydase 1 gene (cox1). For the 45 isolates, 6 different nuclear targets (P-29, Eg10, Ag4, Ir, Er and Tgf) were amplified by PCR and the genotypes were screened by SSCP technique. In E. vogeli, the most polymorphic loci found were Ag4 and E10, both with 2 alleles, and the Ir, Er, P-29 and Tgf loci with 1 allele. E. oligarthrus has exclusive alleles for five of the six analyzed nuclear loci. However, the allele T2, from Tgf locus, is also present in six E. vogeli isolates. The gene flow between the metapopulations of E. vogeli seems to be restricted. In addition, the gene flow between the E. oligarthrus population and the other populations of E. vogeli is restricted. The AMOVA revealed that the most significant level of genetic variability occurs within metapopulations, and the second most significant level of variability was found among metapopulations within suprapopulations of Acre and Pará. Isolates sampled in Acre seems to form a distinct cluster. Furthermore, it was possible to verify that the E. vogeli isolates sampled in Pará also are likely to form a single "cluster", but less uniform. The 11 mitochondrial haplotypes of E. vogeli constitute a monophyletic group and distinct from E. oligarthrus and other Echinococcus species.

As populações da América pós-colombiana, em especial as populações brasileiras, foram estabelecidas principalmente através de cruzamentos envolvendo colonizadores europeus e mulheres ameríndias ou africanas. No entanto, têm sido descritas particularidades regionais e locais. Desta forma, este trabalho objetivou esclarecer os detalhes da formação da população de Porto Alegre através de dados genéticos. Para isto uma amostra de 290 indivíduos fenotipicamente identificados como brancos foi investigada com relação a marcadores de linhagens uniparentais maternos e paternos. Duzentos e três homens foram genotipados para doze marcadores bialélicos (single nucleotide polymorphisms - SNPs ) presentes na região não recombinante do cromossomo Y, sendo também seqüenciada a primeira região hipervariável (HVS-I) do DNA mitocondrial (mtDNA) de cento e setenta e dois indivíduos. Com relação aos marcadores do cromossomo Y a freqüência dos SNPs mostrou um cenário predominante de cromossomos europeus (~93%), sendo o restante de cromossomos possivelmente de origem africana. Além disso, mais de 51% dos cromossomos genotipados pertencem ao haplogrupo R1b3*, amplamente distribuído em populações ibéricas. Em consonância com este achado as análises dos dados apontaram para uma herança predominante dos colonizadores açorianos e portugueses, confirmando que o legado genético masculino da população de Porto Alegre tem origem em seus colonizadores históricos. Um cenário diferente foi encontrado para o mtDNA, pois além da presença européia (69%), também foram detectadas linhagens ameríndia (21%) e africana (10%). A avaliação das seqüências ameríndias mostrou a presença Guarani e também pela primeira vez, considerando-se uma amostra gaúcha, a herança Kaingang. Finalmente, os dados comparativos com uma amostra de negros revelaram a possibilidade de que distintas dinâmicas de mestiçagem ocorreram na formação da população porto-alegrense. / The post-Columbian American populations, especially Brazilians, are mainly the result of intercrossings between European males and Amerindian or African females. However, regional and local particularities have been described. The main objective of this investigation was to reveal details about the formation of the Porto Alegre population using genetic markers. A sample of 290 persons phenotypically classified as white was investigated in relation to several uniparental genetic systems. Two-hundred and three men were genotyped considering twelve biallelic loci (single nucleotide polymorphisms - SNPs) located in the non-recombinant region of the Y-chromosome, while the first hipervariable region (HVS-I) of the mitocondrial DNA (mtDNA) was sequenced in 172 individuals. The main origin of Y-chromosomes is European (~93%), the complementary fraction having a probable African origin. The Y-SNP haplogroup R1b3*, the most frequent in Iberian populations, is present in Porto Alegre with a frequency of 51%. These and other results show that the male contribution to this population is predominantly Azorean and Portuguese, confirming historical sources. A different scenario was oberved considering the mtDNA, because European (69%), Amerindian (21%) and African (10%) mtDNA sequences were identified. Restricting our attention to the sequences of Amerindian origin, it was Introdução possible to detect Guarani and for the first time considering a gaúcho sample, Kaingang heritages. The comparative analysis with a black sample revealed that distinct admixture dynamics have occurred in the formation of the Porto Alegre population.

Submitted by Luiz Felipe Barbosa (luiz.fbabreu2@ufpe.br) on 2015-03-13T13:06:28Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação de Nádia Consuelo Aragão.pdf: 1585136 bytes, checksum: 4b11b83e4f0926aea9f62bb8fcd6ee80 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T13:06:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação de Nádia Consuelo Aragão.pdf: 1585136 bytes, checksum: 4b11b83e4f0926aea9f62bb8fcd6ee80 (MD5) Previous issue date: 2012 / FACEPE / Lutzomyia longipalpis, principal vetor do parasito causador de Leishmaniose Visceral Americana, tem sido estudado em aspectos morfológicos, bioquímicos e genéticos para a elucidação do seu controverso status taxonômico que abrange, na verdade, não apenas uma espécie, mas um complexo de espécies. Com a análise do gene period, um conhecido gene envolvido no ciclo circadiano, foram encontrados polimorfismos que caracterizaram a divisão da população de Lutzomyia longipalpis do município de Sobral (Ceará) em duas populações (1S para uma mancha abdominal ou 2S para duas manchas). O objetivo deste trabalho foi verificar por meio do marcador period, os padrões de divergência genética das populações de Lutzomyia longipalpis encontradas em dois municípios do Estado do Ceará, Caririaçu e Sobral, que estão separados por uma distância linear aproximada de 500 km. As coletas dos insetos foram realizadas com armadilhas do tipo CDC. O DNA dos mesmos foi extraído, amplificado por meio de PCR, purificado, quantificado e sequenciado. As sequencias foram alinhadas e a estruturação genética das populações foi avaliada utilizando-se programas de bioinformáica. Com a análise dos resultados, observou-se que a árvore de Evolução Mínima separou os dois morfotipos (uma e duas manchas) com valor de bootstrap superior a 80%, no entanto não diferenciou as populações de acordo com as localidades. Na estruturação das populações, verificou-se que há fixação de polimorfismos que separam as populações 1S e 2S em Sobral, e não foram encontrados haplótipos compartilhados entre as populações das duas localidades. Esses dados ratificam a existência de espécies crípticas de Lutzomyia longipalpis na localidade de Sobral e amplia esta condição ao município de Caririaçu.

Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-06-09T18:09:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação biblioteca CD - corrigida.pdf: 1306281 bytes, checksum: f6269bdbfa9eb44850607213a01cdaa0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-09T18:09:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação biblioteca CD - corrigida.pdf: 1306281 bytes, checksum: f6269bdbfa9eb44850607213a01cdaa0 (MD5) Previous issue date: 2015-02-12 / FACEPE / Cromossomos B foram descritos para a subespécie de gafanhoto Xyleus discoideus angulatus e embora alguns estudos tenham proposto a possível origem do cromossomo B na subespécie, pouco se conhece a respeito da sua composição molecular. Neste trabalho, uma análise citogenética foi realizada nos cromossomos supernumerários do gafanhoto X. d. angulatus em distintas populações do nordeste do Brasil, para obter um melhor conhecimento acerca das características destes cromossomos e de sua dinâmica evolutiva em diferentes populações. Para isso, um levantamento populacional de cromossomos B em X. d. angulatus foi realizado, assim como a medição cromossômica destes elementos e o mapeamento físico do DNA C0t-1, de sequências teloméricas e de cromossomos B no cariótipo de indivíduos com B. Os resultados mostraram que houve uma alta prevalência (44,44%) de cromossomos B em uma população de Juazeiro do Norte – CE, além de mostrar que alguns cromossomos B eram menores em algumas populações. A técnica de FISH apresentou padrões semelhantes para sondas de C0t-1 em todos os indivíduos, além disso, as sondas teloméricas e de cromossomos B obtidas por microdissecção mostraram variações na sua distribuição. É provável que tenham ocorrido mecanismos de mutação e acumulação dos elementos supernumerários, que deram origem à sua alta prevalência. A presença de quatro morfotipos de cromossomos B em X. d. angulatus evidencia uma variação da composição molecular destes elementos ao longo da evolução. / B chromosomes was described for the grasshopper subspecie Xyleus discoideus angulatus and, although some studies have suggested the possible origin of the B chromosomoes in this subspecies, little is known about its molecular composition. In this study, cytogenetic analysis was performed in supernumerary chromosomes of grasshopper X. d. angulatus in distinct populations of northeastern Brazil, in order to get a better understanding of the characteristics of these chromosomes and their evolutionary dynamics in different populations. For this purpose, a populational survey of B chromosomes in X. d. angulatus was performed, as well as chromosomal measurement of these elements and the physical mapping of DNA C0t-1, telomeric and B chromosomes sequences in the karyotype of individuals with B. Results showed a high prevalence (44,44%) of B chromosomes in a population of Juazeiro do Norte - CE, and also that some B chromosomes were smaller in some populations. The FISH approach showed similar patterns for C0t-1 probes in all subjects, in addition, telomeric and B chromosome probes obtained by chromosome microdissection showed variations in their distribution. It is likely to have occurred mutation mechanisms and accumulation of supernumerary elements, giving rise to its high prevalence. The presence of four B chromosomes morphotypes in X. d. angulatus shows a variation of the molecular composition of these elements throughout evolution.

Submitted by Caroline Falcao (caroline.rfalcao@ufpe.br) on 2017-04-10T16:35:57Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-Dissertação-NádiaAragão.pdf: 1585344 bytes, checksum: 4feec3b9bcc9e48fc4421e5be34c7492 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-10T16:35:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-Dissertação-NádiaAragão.pdf: 1585344 bytes, checksum: 4feec3b9bcc9e48fc4421e5be34c7492 (MD5) Previous issue date: 2012 / Lutzomyia longipalpis, principal vetor do parasito causador de Leishmaniose Visceral Americana, tem sido estudado em aspectos morfológicos, bioquímicos e genéticos para a elucidação do seu controverso status taxonômico que abrange, na verdade, não apenas uma espécie, mas um complexo de espécies. Com a análise do gene period, um conhecido gene envolvido no ciclo circadiano, foram encontrados polimorfismos que caracterizaram a divisão da população de Lutzomyia longipalpis do município de Sobral (Ceará) em duas populações (1S para uma mancha abdominal ou 2S para duas manchas). O objetivo deste trabalho foi verificar por meio do marcador period, os padrões de divergência genética das populações de Lutzomyia longipalpis encontradas em dois municípios do Estado do Ceará, Caririaçu e Sobral, que estão separados por uma distância linear aproximada de 500 km. As coletas dos insetos foram realizadas com armadilhas do tipo CDC. O DNA dos mesmos foi extraído, amplificado por meio de PCR, purificado, quantificado e sequenciado. As sequencias foram alinhadas e a estruturação genética das populações foi avaliada utilizando-se programas de bioinformáica. Com a análise dos resultados, observou-se que a árvore de Evolução Mínima separou os dois morfotipos (uma e duas manchas) com valor de bootstrap superior a 80%, no entanto não diferenciou as populações de acordo com as localidades. Na estruturação das populações, verificou-se que há fixação de polimorfismos que separam as populações 1S e 2S em Sobral, e não foram encontrados haplótipos compartilhados entre as populações das duas localidades. Esses dados ratificam a existência de espécies crípticas de Lutzomyia longipalpis na localidade de Sobral e amplia esta condição ao município de Caririaçu. / Lutzomyia longipalpis, major vector of visceral leishmaniasis, probably includes a species complex, and has had its morphology, biochemistry and genetics studied for understanding its controversial taxonomic status. The period gene, known for its involvement in circadian rhythm, was utilized to check the occurrence of polimorphisms associated to the splitting in two subpopulations of Lutzomyia longipalpis in Sobral (state of Ceará) (1S for one abdominal spot and 2S for two spots). Present study was developed to check genetic divergence among populations from Caririaçu and Sobral, separated by 500 km. DNA was extracted, amplified, purified and sequenced. Populations sequences were aligned and Minimal Evolution tree separated both morphotypes (one and two spots), with a bootstrap value higher than 80%, but did not differentiated populations according to localities. In structuration of populations, fixed polymorphisms separated 1S and 2S populations, without haplotypes shared between both localities.

Orientador: Ana Maria Lima de Azeredo-Espin / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-22T21:51:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Valle_JulianaSilveirado_M.pdf: 7005280 bytes, checksum: 05b580dd95979568b1ab0452c4757286 (MD5) Previous issue date: 1997 / Resumo: A espécie Cochliomyia macellaria (Fabricius) caracteriza-se por ser exclusivamente saprófaga, podendo causar miíases apenas em infestações secundárias de feridas. Apresenta ampla distribuição geográfica nas Américas, do sul do Canadá até a Argentina. Esta espécie, por ser sinantrópica, tem grande importância como vetor mecânico de microorganismos patogênicos. Na década de 70, as Américas foram invadidas por espécies do gênero Chrysomya (Robineau-Desvoidy) cuja distribuição geográfica era confinada ao Velho Mundo. A introdução no continente Americano ocorreu através de intervenção humana. O estabelecimento de espécies de Chrysomya no Novo Mundo afetou diretamente a fauna local de moscas varejeiras que exploram o mesmo recurso e mostram-se competidores eficientes. As espécies nativas do Novo Mundo do gênero Cochliomyia são consideradas equivalentes ecológicos das espécies de Chrysomya. A introdução e estabelecimento de espécies deste gênero na região Neotropical tem contribuído para alterar a distribuição e freqüência de populações de C. macellaria no Brasil. O conhecimento básico da variabilidade genética e evolução intraespecífica é uma informação necessária para a compreensão da estrutura de população e eventos evolutivos recentes como introduções e fluxo gênico. Em insetos, o DNAmt tem mostrado ser um marcador genético efetivo para obter informações sobre a variabilidade e estrutura genética de populações. Neste trabalho, a análise de restrição do DNArnt e o cálculo da divergência de seqüência nucleotídica no DNArnt de 6 populações brasileiras de C. macellaria, foram conduzidos para examinar a variabilidade genética e para fornecer bases para a compreensão da atual estrutura populacional de C. macellaria. Foi realizada também a análise cariotípica, para a obtenção de dados que relacionassem informações nucleares e citoplasmáticas de algumas populações. O uso de 13 endonucleases de restrição na análise do DNArnt de C. macellaria revelou que 3 enzimas (EcoRV, HindIII e PvuII) foram eficientes para detectar variabilidade. Baseado nos padrões de restrição obtidos para estas enzimas, foram caracterizados 11 haplótipos mitocondriais. Entre os haplótipos mitocondriais, os valores obtidos para divergência de seqüência de nucleotídeos (o) variaram de 0.002 a 0.009. Estes dados sugerem diferenciação local do DNArnt de algumas populações. A análise cladística dos haplótipos observados e da distribuição geográfica sugere que algumas populações de C. macellaria apresentam certa descontinuidade genética com separação espacial, dados que refletem barreiras ao fluxo gênico. Por outro lado, algumas populações revelam que haplótipos intimamente relacionados não apresentam localização geográfica, o que pode refletir interação dessas populações através de fluxo gênico, migração entre as diferentes localidades ou interferência humana. A análise cariotípica de três populações de C. macellaria (Ca, Cp e PU) revelou diferenças quanto a posição dos centrômeros e tamanho dos cromossomos sexuais, além de detectar constrições secundárias que podem ser utilizadas como marcadores interpopulacionais e interespecíficos a nível cromossômico. Apesar de ter sido detectada interação via fluxo gênico entre algumas das populações de C. macellaria e dos baixos valores de divergência de seqüência, a alta variabilidade observada no DNArnt representa um marcador genético molecular efetivo para a compreensão de eventos evolutivos recentes e no monitoramento de afunilamento e competição entre as espécies causadoras de miíases nativas e introduzidas da família Calliphoridae / Abstract: Cochliomyia macellaria (Fabricius) is an endemic New World species ranging from southern Canada to Argentina, that is specially abundant in the tropical regions. This species is exclusively saprophagous species breeding in carrion and is also a secondary agent of myiasis. It is perhaps the most widely distributed calliphorid in the Americas. The adults of C. macellaria are attracted to a wide variety of substrates for food or reproduction, such as urban garbage, human and livestock feces and wounds infested with dipteran larvaes or not. This species has been reported as a mechanical vector of human and animal diseases. Recently, four Old World blow flies of the genus Chrysomya (Robineau-Desvoidy) were introduced in the New World. These species, particularly C. albiceps and C. putoria, have the same habitat of the native species, including C. macellaria, providing strong interspecific competition, and have caused a population reduction and displacement of C. macellaria in several regions of Brazil. Investigations of the genetic variability among populations of this species would help to understand historical patterns of dispersal and current levels of gene flow. In insects, the mtDNA has been considered an effective genetic marker to obtain informations about species variability and their genetic structure. In this work, the mtDNA restriction analysis and the sequence divergence of six Brazilian populations of C. macellaria were conducted to estimate the genetic variability and to understand the actual populational structure of this species. A karyotipic analysis was also conducted to obtain data that compare nuclear and cytoplasmatic information in some populations. Three out of thirteen enzymes (EcoRV, HindIII and PvuII) were suitable to detect mtDNA variation between the sampled C. macellaria populations. Combined restriction patterns for these three enzymes comprised the mtDNA haplotypes of each of the individuals. Eleven mitochondrial haplotypes were detected. Among the mitochondrial haplotypes, the values of sequence divergence estimated (o) ranged from 0.002 to 0.009. These data suggest local differentiation of mtDNA of some populations. The cladistic analysis of the haplotypes and the analysis of geographical distribution suggest that some populations of C. macellaria show genetic discontinuity with spatial separation, reflecting barrier to gene flow. The karyotipic analysis of three populations (Ca, Cp e PU) revealed differences in centromere position and size of sexual chromosomes besides the presence of secondary constrictions that can be used as interspecific and interpopulation markers. The data presented in this work confirm the effectiveness of mtDNA as a genetic marker to understand recent evolutionary events, and to monitorize bottlenecks and competition among native and introduced species of the Calliphoridae family / Mestrado / Genetica / Mestre em Ciências Biológicas

Orientador: Paulo Yoshio Kageyama / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-28T11:11:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Seoane_CarlosEduardoSicoli_M.pdf: 4471149 bytes, checksum: 2869772f508d920d07e791d774275009 (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: Atualmente os planos da conservação biológica devem incluir estratégias de proteção da diversidade genética dentro das espécies, buscando mante-las viáveis à longo prazo. A fragmentação florestal provoca alterações nos padrões de troca de alelos das populações das espécies, causando conseqüências deletérias na diversidade genética. Para elaborar estratégias de conservação genética das espécies arbóreas necessita-se estudar os efeitos da fragmentação sobre a variabilidade e a estrutura genética de determinadas espécies que sirvam como exemplo do comportamento genético de grupos de espécies como características ecológicas semelhantes. Esenbeckia leiocarpa, ou guarantã, da família das rutáceas, é espécies de fecundação cruzada por miofilia e dispersão autocórica com possível diplocoria, ocorre em freqüência elevada somente em poucas áreas e não é encontrada em formações secundárias. È um exemplo de espécies do grupo sucessional clímax, com alta densidade de indivíduos por hectare e de distribuição agregada. Utilizou-se tecidos foliares de plântulas de progênies e de indivíduos adultos de dois fragmentos florestais de distintos tamanhos, um de 2178 hectares (E. E. de Caetetus ¿ fragmento maior) e outro de 76 hectares (E. E. de Ibicatú ¿ fragmento menor). A tecnica utilizada foi a eltroforese de isso enzimas na posição horizontal, conduzida em meio suporte de gel de amido de milho ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Currently, conservation plans seek the protection of the diversity within species, in order to maintain their evolutionary viability. Forest fragmentation leads to alterations in allelic exchange patterns of the species,causing deleterious consequences in generic diversity, compromising their survival. When elaborating genetic conservation strategies for tree species, we need the study of fragmentation effects upon the genetic variability and structure of some species which will indicate the genetic behaviour of groups of species with similar ecological characteristics. Esenbeckia leiocarpa, popularly know as guarantã, belonging to the Rutaceae plant family, is a species with myophilic pollination syndrome and autochoric dispersion with possible diplochory, occurring in high frequencies only in certain areas, not being found is second forest. It is a example for the climax succesional group, with high density of individuals per hectare and aggregated distribution. The basic hypothesis was that in smaller fragments genetic drifit effects would not be counterbalanced by gene flux, leading to genetic erosion as a consequence. The experiment used leaf tissues of protegenies and adults from two brazillian Semideciduos Atlantic forest fragments with different sizes, 2178 and 76 hectares. The technique used was aloymes horizontal electrophoresis in a cornstarch gel support ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Mestrado / Biologia Vegetal / Mestre em Ciências Biológicas

As estimativas de parâmetros genéticos e fenotípicos de uma população possibilitam a avaliação de seu potencial para fins de melhoramento. Foram estimadas as variâncias genéticas e fenotípicas, herdabilidades e coeficientes de variação genético em duas populações de arroz de sequeiro, a CNA-IRAT (P 0) e a PCT-4\0\0\0 (P 1) do projeto de seleção recorrente da Seção de Arroz do Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT, Colômbia), a partir de um experimento em bloco são acaso, com quatro repetições, instalado na Estacion Experimental"La Libertad", Villavicencio, Colômbia, no primeiro semestre do ano agrícola 1995. Foram avaliadas as características altura da planta, dias para floração, número de perfilhos por planta, número de panículas por planta, produção de grãos por planta, peso de 100 grãos e fertilidade, e comparou-se as duas populações com relação ao potencial destas em programas de melhoramento. As comparações entre médias e variâncias foram feitas através de análises de variâncias, onde as cinco linhagens, que haviam sido utilizadas como parentais para a formação de P1 também foram utilizadas como tratamentos. Para estimar as variâncias genéticas que a variância existente dentro de linhagens homozigotas correspondia à variância ambiental, e por diferença estimou-se as variâncias genéticas. Concluiu-se que a população P 1 diferiu da P 0 em termos de média, para as características altura de planta, dias para floração, número de perfilhos por planta, número de panículas por planta e peso de cem grãos. Em termos de variância, as populações diferiram entre si para as características dias para floração, número de perfilhos por planta e número de panículas por planta. Com base nas estimativas de parâmetros genético- estatísticos, pode-se afirmar que a população P 1 apresenta-se mais favorável ao melhoramento genético para as características número de ) perfilhos por planta, número de panículas por planta e produção de grãos por planta que a população P 0. A população P 1 foi considerada superior à população P 0 por ter apresentado diminuição na característica altura de planta e aumento em número de perfilhos por planta e número de panículas por planta / not available

O presente trabalho refere-se à avaliação do potencial genético das populações de milho (Zea mays L.) BR-105 e BR-106 para o melhoramento interpopulacional. Utilizaram- se para tanto, de progênies de meios irmãos interpopulacionais obtidas de plantas endogâmicas - S1,s. Estas progênies foram avaliadas em Goiânia-GO, Sete Lagoas-MG e Londrina-PR. Foram tomados dados de produção (peso de espigas espalhadas), altura da planta e da espiga e índice de espigas (número de espigas dividido pelo número de plantas por parcela). A estimativa da heterose para peso de espigas despalhadas foi de 23,55 e 11,19% em relação à média dos pais e ao pai superior, respectivamente. Com relação aos caracteres altura da planta e da espiga, verificou-se que o híbrido interpopulacional possui porte semelhante ã media dos híbridos comerciais utilizados como testemunhas e valores de heteroses baixos e até negativos, principalmente em relação à população parental superior (BR-106). Para todos os caracteres avaliados, foram apresentados dados de variabilidade genética interpopulacional e progressos esperados com seleção, para investigar o potencial destas populações para o melhoramento interpopulacional. Verificou-se que as magnitudes destas estimativas permitem progressos substanciais com seleção recorrente recíproca. A variância da interação efeitos aditivos x locais foi 2,40 vezes inferior à variância genética aditiva para o caráter peso de espigas. Estes resultados indicam que existe variabilidade genética aditiva suficiente para permitir progressos substanciais com seleção para uma ampla região, uma vez que o progresso esperado com a seleção recorrente recíproca para o híbrido interpopulacional foi de 9,05% para o caráter peso de espigas, o que corresponde a cerca de 900 kg por hectare. Para os demais caracteres, a variância da interação efeitos aditivos x locais apresentaram magnitudes baixas e ou insignificantes. A metodologia proposta por MORENO GONZALES(1986), de avaliação das populações envolvidas no programa de seleção recorrente reciproca em locais diferentes e contrastantes, não se mostrou promissora. Os resultados das estimativas de progressos esperados no híbrido interpopulacional obtidos segundo esta metodologia variaram de 5,75 a 8,52%, sendo que o melhor resultado e inferior ao obtido quando se avalia e seleciona em todos os locais propostos. Entretanto, estes resultados mostram que uma escolha errada de locais, na eventualidade de falta de recursos e ou sementes, poderia diminuir em muito a magnitude do progresso esperado com a seleção. As estimativas dos progressos indiretos esperados com a seleção, obtidas neste trabalho permitem concluir que, ocorrendo falta de recursos e ou sementes, o melhor local para a avaliação das progênies seria Sete Lagoas (local 2 ). A produtividade teórica dos melhores híbridos de linhagens e em média 66,04 e 57,52% superior à média dos híbridos utilizados como testemunhas (BR-301 e XL-670) , considerando híbridos simples e duplos, respectivamente. As elevadas produtividades das populações per se e do híbridos interpopulacional, a heterose para peso de espigas relativamente alta, o porte das plantas e a altura das espigas semelhantes ás testemunhas, a elevada magnitude da variabilidade genética e do progresso com seleção, e a possibilidade de obtenção de híbridos de linhagens muito produtivos, evidenciam o potencial destas populações para serem utilizadas em programas de seleção recorrente recíproca e de híbridos de linhagens. / The present work was carried out in order to evaluate the genetic potencial of the maize (Zea mays L.) populations BR-105 and BR-106 aiming an interpopulation breeding program. There were used interpopulation half - sib progenies from S1 plants. These progenies were evaluated in Goiânia-GO, Sete Lagoas-MG and Londrina-PR, Brazil. Data of ear yield, plant and ear height and ear index (number of ears/number of plants per plot) were recorded. The estimate of heterosis for ear yield was 23.55 and 11 .9% in relation to the mid-parent .and high-parent respectivelly. For plant and ear height the interpopulation hybrid was similar to the commercial hybrids used as checks. These traits had shown low and even negative values of heterosis, mainly in relation to the higher parental population (BR-106). To investigate the potential of these populations for interpopulation breeding, data of interpopulation genetic variability and expected progress with selection were estimated for all the evaluated traits. According to the magnitude of these estimates, a substantial expected progress with reciprocal recurrent selection was estimated. The additive environment interaction variance was 2.40 times inferior to the additive genetic variance for ear yield. This result indicated there is enough additive genetic variability to allow a substancial progress with selection for a large region since the expected progress with reciprocal recurrent selection for ear yield in the interpopulution hybrid was 9.05% which means 900 kg per hectare. For the other traits, the additive genotype x environment interaction variances were low and/or non significant. The proposed methodology by MORENO GONZALES (1986) for evaluating populations involved in reciprocal recurrent selection programs in different and contrasting locations was shown to be not very much promising. According to this methodology the estimates of the expected progress in the interpopulation hybrid varied from 5.75 to 8.52%: The best result is inferior to that obtained when selection for interpopulation hybrid was based in all locations. Meanwhile these results show that a wrong choice of places, in the case of lack of resources or seeds might decrease the expected progress with. selection. The estimates of the indirect expected progress with selection allow the conclusion that in a lack of resources and/or seeds, Sete Lagoas (place 2) would be the best location for progenies evaluation. The theoretical productivity of the best estimated hybrids of inbred lines are in average 66.04 and 57.52% higher than the average of the hybrids used as checks (BR-301 and XL-670), considering simple and double - crosses hybrids respectivelly. The high per se population yield as their interpopulation hybrid, the high heterosis for ear yield, plant size and ear height similar to the checks, the high genetic variability and progress with selection and the possibility in getting hybrids of high production, put in evidence the potential of these populations for a reciprocal recurrent selection program and/or an inbred line hybrid program