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Characterization of Liver Damage Mechanisms Induced by Hepatitis C VirusSoare, Catalina P. 01 November 2011 (has links)
Hepatitis C Virus (HCV) is one of the most important causes of chronic liver disease, affecting more than 170 million people worldwide. The mechanisms of hepatitis C pathogenesis are unknown. Viral cytotoxicity and immune mediated mechanisms might play an important role in its pathogenesis. HCV infection and alcohol abuse frequently coexist and together lead to more rapid progression of liver disease, increasing the incidence and prevalence of cirrhosis and hepatocellular carcinoma. The cytopathic effect of HCV proteins, especially the core, E1 and E2 structural proteins, which induce liver steatosis, oxidative stress and cell transformation may be amplified by alcohol abuse. The purpose of this study was to characterize the liver damage mechanisms induced by HCV structural proteins and alcohol and to determine the potential molecular mechanism(s) that may promote chronic, progressive liver damage. A transgenic mouse model expressing HCV core, E1 and E2 was used to investigate whether alcohol increased HCV RNA expression. Real-time RT-PCR analysis of genes involved in lipid metabolism and transport confirmed their abnormal expression in the alcohol-fed transgenic mice. In addition, light and electron microscopy analysis were performed on liver tissues of transgenic mice on an alcoholic diet versus those on a normal diet, in order to identify histological changes. The severe hepatopathy in HCV transgenic mice was exacerbated by alcohol. Mitochondria and endoplasmic reticulum had severe abnormalities in the electron microscopy analysis. The second part of this study focused on adaptive immune responses, which may also play an important role in HCV pathogenesis. I focused my analysis on dendritic cells (DC), which have been the main suspects to explain immune impairment in HCV infection. Their powerful antigen-presenting function allows them to stimulate the antiviral response of CD4+ and CD8+ T cells, the effector cells of the immune system. This unique function of the DC makes them possible targets for immune evasion by the Hepatitis C virus. In this study, DCs were generated from mouse bone marrow cells. I investigated their maturation capacity in the presence of structural proteins of HCV. The impact of HCV core/E1/E2 polyprotein on DCs cytokine expression and ability to activate T-cell lymphocytes was also analyzed. A dysfunctional CD4 T cell response was observed after exposure of DCs to core/E1/E2 polyprotein, indicating inefficient CD4 priming, which might lead to chronic HCV infection in humans. The presence of the core/E1/E2 polyprotein reduced the DC maturation capacity and the expression of certain cytokines (IL-12, IFNg, IL-6, MCP-1) important for stimulation and chemotaxis of T cells and other immune cells. My studies contribute to the understanding of HCV pathogenesis and may have implications to the development of better therapies for HCV infection.
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Seguimiento de una cohorte de portadores de virus de la hepatitis B: factores de riesgo para la enfermedad hepática crónicaRibes Puig, Josepa 15 March 2005 (has links)
INTRODUCCIÓN:Diversos estudios epidemiológicos han mostrado la infección crónica por el virus de la hepatitis B (VHB) como factor etiológico del cáncer hepático (CH) y en las dos últimas décadas se ha constatado un incremento de la incidencia de éste en los países industrializados. Sin embargo, los factores de progresión a CH en portadores del VHB han sido estudiados mayoritariamente en países asiáticos, por lo que es importante determinar cuál es su incidencia en Catalunya. OBJETIVOSDeterminar: i) la tendencia de la incidencia y la mortalidad por cirrosis y cáncer hepático en Catalunya en el período 1980-1997; ii) la mortalidad por enfermedad hepática en una cohorte de 2.352 donantes de sangre infectados por el VHB; iii) los factores de riesgo de desarrollar enfermedad hepática en individuos infectados por el VHB.METODOLOGÍAi) los datos de incidencia y mortalidad por cirrosis y CH en Catalunya se recogieron a partir del Registro de Cáncer Poblacional de Tarragona y del Registro de Mortalidad de Catalunya. Las tendencias se evaluaron mediante el análisis joinpoint y el análisis edad-período-cohorte; ii) como grupo control se escogió a 15.504 donantes de sangre no infectados por el VHB. La cohorte y el grupo control se cruzaron con el Registro de Mortalidad de Catalunya para determinar el estado vital y la causa de defunción de los individuos fallecidos. El exceso de mortalidad de la cohorte respecto al grupo control se determinó mediante la Razón de la Mortalidad Estandarizada; iii) se invitó a la cohorte a una visita médica en el periodo 1994-1996, que incluyó una exploración médica, análisis de sangre (función hepática y marcadores serológicos de los virus hepatotrópicos) y un cuestionario epidemiológico. El cuestionario recogió la exposición a diversos factores de riesgo asociados a enfermedad hepática. Los sujetos diagnosticados de hepatopatía fueron los casos y los sujetos con función hepática normal los controles del estudio caso-control anidado en la cohorte. La asociación de cada factor de riesgo y la enfermedad hepática se determinó mediante la razón de las odds (OR). RESULTADOS i) En el período de estudio se constató una disminución de la mortalidad por cirrosis (- 3% anual) en ambos sexos, a excepción de los hombres de 25 a 35 años en que la mortalidad por esta causa aumentó (4.5% de incremento anual). La mortalidad y la incidencia del CH permanecieron estables en ambos sexos y en todos los grupos de edad. Se constató un incremento de la mortalidad por colangiocarcinoma en ambos sexos (10% de incremento anual). ii) Exceso de mortalidad por CH y cirrosis en los hombres infectados por el VHB respecto a los del grupo control (RME CH: 17.7; RME cirrosis: 10.5). En las mujeres, solo se evidenció un exceso de muertes por cirrosis respecto a las del grupo control (RME: 7.2). iii) Los factores de progresión a enfermedad hepática en individuos infectados por el VHB fueron: la replicación del VHB (OR: 20.5 IC95%: 7.9-53.0), historia de episodios de hepatitis agudas (OR: 2.3 IC 95%: 1.3-4.2), el consumo de alcohol (OR: 2.4 IC 95%: 1.5-4.1), la infección por el VHC (OR: 6.9 IC95%: 2.3-20.5). Se constató una interacción entre el consumo de alcohol y la historia de episodios de hepatitis agudas, y posiblemente, entre el consumo de alcohol y diabetes.CONCLUSIONESi) No se ha constatado en Catalunya un aumento de la incidencia y de la mortalidad por CH como en otros países industrializados. Si se ha constatado un incremento de la mortalidad por colangiocarcinoma; ii) Los individuos infectados por el VHB tienen un exceso de mortalidad por enfermedad hepática respecto a los individuos no infectados por el VHB; iii) La replicación del VHB, los antecedentes de episodios de hepatitis agudas, el consumo de alcohol y la coinfección por el VHC incrementan el riesgo de desarrollar enfermedad hepática en individuos infectados por el VHB. / GOALS:To Determine: i) time trends on incidence and mortality by cirrhosis and liver cancer in Catalonia during the period 1980-1997; ii) the mortality by liver disease in a cohort of 2352 blood donors infected by the Hepatitis B Virus (HBV); iii) risk factors to develop liver disease in HBV infected individuals.METHODS: i) Liver cancer incidence and mortality and cirrhosis mortality data were extracted from the population-based cancer registry of Tarragona and from the Catalan Mortality Registry. Statistical analysis: joinpoint analysis and an age-period-cohort modeling. ii) Control Group: 15504 blood donors non-infected by HBV. Record Linkage of the cohort and the control group with the Catalan Mortality Registry. Statistical Analysis: Standardized Mortality Ratios for all causes of death in the cohort. iii) Nested case-control study in the cohort. Cases: ndividuals with liver disease. Controls: individuals without liver disease. Statistical analysis: logistic regression in order to estimate the odds ratios.RESULTS AND CONCLUSIONS:i) During the period of study it has been shown: stability of the incidence and mortality by liver cancer in Catalonia, and a decrease in the mortality by cirrhosis in both sexes excluding males aged 25-35 years old in which mortality by this cause of death increased, and an increase by death of cholangiocarcinoma in both sexes. ii) An excess of risk of death by liver cancer and cirrhosis in the cohort men when they were compared with the control group. It has been observed an excess mortality by cirrhosis in the cohort women. iii) Risk factors associated to de development of liver disease in individuals infected by HBV were replication of HBV, acute hepatitis history, alcohol consumption and Hepatitis C virus infection.
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Hepatitis B en instituciones penitenciarias. Estrategias para su prevenciónBayas Rodríguez, José María 21 December 1990 (has links)
Estudios realizados en diversos países han llegado a la conclusión de que las personas ingresadas en prisión deben ser consideradas como grupos de riesgo de infección por virus de la hepatitis B (VHB). El objetivo fundamental del presente trabajo ha sido investigar la utilidad de las campañas de vacunación anti-hepatitis B en la población reclusa, considerando: l. La inmunogenicidad de la vacuna, y 2. La factibilidad del propio programa (aceptación del cribaje serológico prevacunal y adeherencia al calendario vacunal establecido). Los objetivos adicionales fueron: 1º. Esclarecer si la permanencia en prisión constituye en sí misma un factor de riesgo de infección por los virus de la hepatitis B y D. 2º. Describir el papel que juegan determinadas características personales y otros factores de riesgo de los reclusos sobre la infección por VHB. 3º. Valorar la importancia relativa del consumo de drogas por vía parenteral (CDVP) sobre la infección por VHB y virus de la hepatitis Delta (VHD), y 4º. Interpretar el significado de la presencia aislada de anti-HBc y de anti-HBs, en el examen prevacunal.Previamente a la vacunación, se ha estudiado la prevalencia de marcadores del VHB (HBsAg, anti-HBc y anti-HBs) en 1742 reclusos varones de tres centros penitenciarios (CP) de Cataluña de diferentes características. Ello representa más del 98% de la población total de estos CP (reclusos presentes el día de inicio del estudio, más nuevos ingresos durante un periodo de 4, 5 y 6 meses). En los casos simultáneamente positivos para HBsAg y anti-HBc, se determinó además anti-HBc-IgM, HBeAg, anti-HBe y anti-HD. La presencia de marcadores se ha re1acionado con una serie de vbriab1es (demográficas, penitenciarias y factores de riesgo de infección), obtenidas mediante entrevista personal dirigida.Los reclusos ca1ificados como susceptibles a la infección por VHB (n=705, inc1uyendo 68 casos anti-HBs positivo aislado), fueron vacunados con vacuna recombinante antihepatitis B (20 microgramos, pauta de 0, 1 y 6 meses), practicándose extracciones postvacunales (6º y 9º mes del inicio), para determinar el título de anti-HBs alcanzado.En el examen prevacunal, el 63% de los reclusos presentaron algún marcador del VHB, el 7'1% HBsAg. Tanto el análisis simple como el estratificado (Mantel-Haenszel), mostró que el consumo de drogas por vía parenteral (COVP) era, en cada CP, el factor más fuertemente asociado a la infección por VHB, (para el conjunto de CP, CDVP seropositivos 83'6%, no CDVP seropositivos 41%, OR cruda 7'35, IC 95% 5'84+9'27). Los distintos patrones sero1ógicos de los seropositivos (excepto la prevalencia aislada de anti-HBs), fueron significativamente más comunes en el grupo drogadicto. El 53'9% de los reclusos portadores de HBsAg presentaron anticuerpos anti-HB (65'3% los CDVP vs. 26'7% los no CDVP, OR 5.17).Se consigue vacunar con 2 dosis a 2/3, y con 3 dosis a 1/3 de los reclusos susceptibles, obteniéndose tasas de seroconversión (80% al 9º mes) y títulos de anti-HBs moderadamente más bajos a los logrados en grupos de población sana. Son causa de peor respuesta la mayor edad, el CDVP y la infección por VIH. No inf1uye la presencia previa, aislada, de anti-HBs.La baja adherencia vacunal es fundamentalmente debida a la excarcelación del recluso antes de completar la pauta establecida de 0, l y 6 meses, proponiéndose para mejorar esta adherencia el empleo de pautas flexibles, y la de 0, 1 y 2 meses como pauta de referencia. La vacunación antihepatitis B de los reclusos permite actuar sobre grupos de población muy poco accesibles, de otro modo, a las redes sanitarias convencionales, protegiendo a estas personas dentro de la cárcel y fuera de ella.Se concluye además que el estilo de vida antes, o durante el encarcelamiento, especialmente el CDVP, es la principal causa de propagación de la infección por VHB y VHD, y que el mayor riesgo de los reclusos gitanos se relaciona probablemente con transmisión vertical y horizontal precoz en la infancia. / The fundamental purpose of this study was to investigate the usefulness of anti-hepatitis B vaccination campaigns in the prison population, considering: 1) the vaccine's immunogenicity and 2) the feasibility of the programme itself (acceptance of pre-vaccination serologic screening and compliance of the vaccination schedule).Prior to vaccination, the prevalence of hepatitis B virus (BBV) markers was studied in 1,742 male prisoners in 3 different types of prison centre (PC) in Catalonia. This number of prisoners represents over 98% of these PC's total population. Marker presence was related to a series of variables (demographic, prison and infection risk factors), obtained by means of personal guided interviews.In 63% of prisoners, some kind of HBV marker was detected, which was HBsAg in 7.1%. Parenteral drug consumption (POC) was the factor most strongly associated with BBV infection (raw OR 7.35, IC95% 5.84+9.27) .The different serologic patterns of the seropositive subjects (except the prevalence of anti-HBs alone), were more common in those practising PDC.It was possible to give two thirds of the prisoners 2 vaccine doses, and one-third 3 doses, obtaining seroconversion rates and anti-HBs titres moderately lower than those obtained in groups of healthy population. Advanced age, PDC and BIV infection cause a worse response. The prior presence of anti-HBs alone does not have any influence.Vaccination of prisoners against hepatitis B allows the conventional health networks to act on population groups that otherwise would be difficult to reach, thus protecting these people both inside and outside the prison. In order to improve vaccination schedule compliance, the use of flexible systems is suggested, 0, 1 and 2 months being the reference system.
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Prevalença de la infecció pel virus de la hepatitis B i C en pacients amb malaltia inflamatòria intestinal. Impacte del tractament immunosupressor en l’evolució de l’hepatopatiaLoras Alastruey, Carme 14 December 2010 (has links)
INTRODUCCIÓ: Hi ha molt poca informació a la literatura mèdica que suggereix que existeix una alta prevalença de la infecció pel virus hepatitis B (VHB) i C (VHC) en malalts amb malaltia inflamatòria intestinal (MII). El seu coneixement és important per la possibilitat de reactivació viral relacionada amb el tractament immunosupressor. HIPÒTESI: La infecció per VHB i C és més freqüent en la MII que en la població general de referència. El tractament immunosupressor pot reactivar la infecció per VHB i C. OBJECTIUS: Avaluar: 1) La prevalença d'infecció per VHB i C en pacients amb MII de diferents àrees geogràfiques d'Espanya. 2) L'efecte del tractament immunosupressor i els fàrmacs biològics sobre l'evolució de la infecció per VHB i C. METODOLOGIA: Estudi 1: inclusió de 2076 pacients amb MII, als quals s'avalua l'existència d'infecció per VHB i C mitjançant tècniques analítiques estàndard (ELISA i PCR). Es van registrar els factors relacionats amb la MII i la infecció. Estudi 2: Inclusió de 162 pacients amb MII i infecció per VHB i / o C i que van rebre tractament immunosupressor per la MII. Es van registrar variables clíniques i analítiques relacionades amb la reactivació. Tots dos són estudis multicèntrics amb registre electrònic (www.repentina.com). Per a l’anàlisi de resultats es van utilitzar tests univariants (2 i test de t Student) i multivariants (regressió logística i model de risc proporcional de Cox). RESULTATS: Estudi 1: El 9.7% de pacients amb colitis ulcerosa (CU) i malaltia de Crohn (MC) van presentar positivitat de marcadors d'infecció pel VHB i C actual o passada (CU: HBsAg 0.8 % , anti-HBc 8 % , anti-VHC 1.3 % ; MC: HBsAg 0.6 % , anti-HBc 7.1 % , anti-VHC 2.3 % ). El 12% de pacients amb MII van presentar marcadors de vacunació eficaç. En l’anàlisi multivariant, l'edat, la història familiar d'hepatitis i la MII moderada-greu, es van relacionar de manera significativa amb el VHB, mentre que les transfusions i l'ús d'antibiòtics ho van fer amb el VHC. Estudi 2: Un 36% de pacients van presentar disfunció hepàtica (DH) relacionada amb el VHB, un 66% dels quals van presentar insuficiència hepàtica. L’anàlisi multivariant va demostrar que l’únic factor relacionat amb la DH per VHB va ser l'ús simultani de 2 o més immunosupressors. En canvi només un 15.7% dels pacients amb VHC van presentar DH. CONCLUSIONS:Estudi 1: El pacients amb MII presenten una prevalença d’infecció pels VHB i VHC similar a la de la població general de referència, i aquesta és més baixa del que prèviament s’havia publicat. L’escassa relació de la infecció pel VHC i VHB amb els procediments invasius i ingressos hospitalaris suggereix que aquestes infeccions rarament s’adquireixen en l’àmbit hospitalari al nostre país. Es detecta un baix percentatge de vacunació eficaç pel VHB, el que obliga a intensificar els programes de vacunació en aquests pacients. Estudi 2: La DH en pacients amb MII tractats amb immunosupressors, és més freqüent i greu en els pacients amb infecció pel VHB que en el pacients amb infecció pel VHC. La immunosupressió combinada va ser l’únic factor predictiu independent de reactivació pel VHB. / Background: Limited information suggests the existence of a high prevalence of hepatitis B (HBV) and C virus (HCV) in inflammatory bowel disease (IBD). Hypothesis: HBV and HCV infection is more common in IBD than in the general population. Immunosuppressants can reactivate these infections.Objectives: To asses: 1) the prevalence of HBV and HCV in IBD, in a nationwide study, and to evaluate associated risk factors. 2) the influence of immunosuppressants on the course of HBV and HCV in IBD.Methods: Study 1: inclusion of 2076 IBD patients, which evaluates the existence of HBV and HCV using ELISA and PCR. Factors related to IBD and to infection were registered. Study 2: Inclusion of 162 IBD patients with HBV and HCV infection and immunosuppressants. Registration of clinical and laboratory variables related to reactivation. Both are multicentre studies with electronic data base (www.repentina.com). The results are analyzed by univariate and multivariate analysis. Results: Study 1: Present and / or past HBV and HCV infection was found in 9.7 % of IBD patients (HBsAg 0,6-0,8% / antiHBc 7-8% / anti-HCV 1.3-2.3%). Effective vaccination was present in 12 % of patients. In multivariate analysis, age, family history of hepatitis and moderate-to-severe IBD were significantly associated with HBV, whereas transfusions and antibiotics were significantly associated with HCV. Study 2: Liver dysfunction (LD) was observed in 36% HBsAg positive patients, 66% of whom developed hepatic failure. In contrast LD in HCV was observed in 15.7% of HCV-RNA positive patients. Treatment with ≥2 immunosuppressants was an independent predictor of HBV reactivation.Conclusions: Study 1: Prevalence of HBV and HCV infection in IBD is similar to that of the general population and lower than that in previously published series. This fact, in addition to the lack of association with invasive procedures, suggests the existence of adequate preventive measures in centres attending to these patients. The low percentage of effective vaccination makes it mandatory to intensify B virus vaccination in IBD. Study 2: LD in patients with IBD treated with immunosuppressants is more frequent and severe in those with HBV than in HCV carriers and is associated with combined immunosuppression.
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Diseño y síntesis de péptidos para el diagnóstico de la infección por el virus de la hepatitis G (GBV-C/HGV)Pérez Escoda, María Teresa 30 May 2007 (has links)
El virus de la hepatitis G (GBV-C/HGV) es un virus ARN perteneciente a la familia Flaviviridae. Su prevalencia, basada en la positividad del ARN, oscila entre el 1 y el 4% en la población general. Sin embargo este porcentaje aumenta hasta el 20-30% en los individuos expuestos a sangre o sus derivados, en individuos infectados por el virus de la hepatitis C o por el virus de la inmunodeficiencia humana (HIV), hecho que indica que se transmite principalmente por vía parenteral. Aunque no está claro su potencial patogénico, los estudios más recientes sugieren que la infección por este virus reduce la mortalidad en los pacientes infectados por el HIV, de ahí el interés en disponer de una herramienta que permita el diagnóstico de la infección por GBV-C/HGV de un modo rápido y sencillo. Desde hace años, los péptidos sintéticos se vienen utilizando en sistemas de diagnóstico para muchas enfermedades, sin embargo, los péptidos lineales que mimetizan epítopos B son débilmente reconocidos por los anticuerpos, y por ello, existe la tendencia de utilizar combinaciones más complejas que permitan mejorar tanto la sensibilidad como la especificidad de los ensayos.En esta tesis se han diseñado y sintetizado, utilizando la metodología de síntesis en fase sólida, construcciones peptídicas en las que se combinan regiones de proteínas de envoltura y no estructurales. Se han sintetizado tanto péptidos quiméricos, que contienen más de un epítopo (lineales y ramificados), como péptidos cíclicos en los que los epítopos sufren restricción de movilidad. La capacidad antigénica de las construcciones sintéticas se ha evaluado utilizando principalmente la técnica del enzimoinmunoensayo (ELISA) aunque también se ha investigado la utilidad de la técnica de la resonancia del plasmón de superficie (SPR) para detectar la presencia de anticuerpos anti-GBV-C/HGV en muestras de suero de individuos pertenecientes tanto a los grupos de riesgo como en la población sana. Además, se ha realizado un estudio conformacional con la finalidad de establecer una correlación entre la estructura secundaria adoptada por los péptidos y su capacidad antigénica. Finalmente, se ha estudiado la capacidad inmunogénica de las construcciones peptídicas en animales de experimentación. Los resultados obtenidos muestran, por un lado, que las construcciones en las que se combinan varios epítopos son las que presentan una mejor precisión diagnóstica, y por otro lado, que la introducción de restricción de movilidad permite incrementar la sensibilidad mostrada por la molécula precursora lineal. / "Design and synthesis of peptides for serodiagnose of the hepatitis G virus (GBV-C/HGV) infection". The GB virus C, so called hepatitis G virus (GBV-C/HGV), is a single-strand RNA virus belonging to the Flaviviridae family. The prevalence rate of GBV-C/HGV in healthy blood donors is 1-4% in worldwide and about 20-35% in high risk populations, thus indicating that this virus is transmitted via the parenteral route. Although controversial data exit concerning the potential to cause hepatitis in humans recent studies suggest that coinfection with HIV is associated with prolonged survival. For this reason it would be interesting to find an easy tool to diagnose this apparently non-pathogenic virus. In recent years, synthetic peptides that mimic specific epitopes of infectious agents have been used in diagnostic systems for various diseases. The main drawback of this approach is that peptides representing topographic B-cell epitopes are poorly recognised by antibodies. There is a tendency toward using chimeric to avoid those problems and to improve the sensitivity and specificity of the assays.In this thesis, new putative epitopes located both in envelope and in nonstructural proteins of GBV-C/HGV were synthesized using solid-phase chemistry. The corresponding synthetic peptides, obtained in linear, multimeric and cyclic forms, were used as antigens in ELISA and in real-time bioespecific interaction measurements (SPR) to detect GBV-C/HGV-specific antibodies in different panels of human sera. Furthermore, CD and FT-IR have been used in conjunction to characterize the conformational changes therein with synthetic constructs that could explain their different antigenicity.The results obtained showed, on one hand, that the combination of different antigens seems to be necessary to ensure good sensitivity and more specificity and, on the other hand, that cyclic compounds show higher ability to recognize anti-GBV-C/HGV antibodies than its parent peptide. Our results offer a new approach to develop new diagnostic peptide based biosensors for serodiagnosis of GBV-C/HGV infection.
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Hepatitis C tras el trasplante hepático: Historia natural y factores de riesgo de evolución desfavorable.Berenguer Haym, Marina 14 December 2001 (has links)
La infección por el virus de la hepatitis C (VHC) tiene gran importancia a nivel del trasplante hepático (HC) por varias razones. Por lo tanto, resulta de una gran importancia establecer el pronóstico post-trasplante en dichos casos.El objetivo del presente proyecto de tesis fue, por un lado, definir la historia natural de la hepatitis C postrasplante en nuestro medio; y por otro, establecer los factores de riesgo de evolución desfavorable. Dicha información es fundamental para validar la idoneidad de un trasplante hepático, así como para considerar la posibilidad de un tratamiento antivírico precoz y mejorar el manejo de la inmunosupresión de los pacientes.
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In vitro characterisation of the hepatitis C virus genotype 3a RNA dependent RNA polymeraseClancy, Leighton Edward, Biotechnology And Biomolecular Sciences, UNSW January 2007 (has links)
Hepatitis C virus (HCV) replication is directed by NS5b, the viral RNA dependent RNA polymerase (RdRp). To date, our understanding of the HCV polymerase has come almost entirely from genotype 1. The aim of this study was to examine the influence of sequence variation in the polymerase region by characterising a polymerase derived from genotype 3a. The genotype 3a CB strain polymerase was cloned into the bacterial expression vector pTrcHis2C incorporating a hexahistidine tag to facilitate purification. An optimised process produced 2.5 mg of highly purified recombinant protein per litre of bacterial culture. The 3a preparation possessed an RdRp activity and could utilise both homopolymeric and heteropolymeric RNA templates. Optimal activity was seen at 30oC at pH 8 in reactions containing 160nM enzyme, 10??g/ml RNA template and 2.5mM MnCl2. Subsequently, three genotype 1b polymerases including the HCV-A, Con1 and JK1 strains were cloned for the comparison of activity under identical conditions. Steady state kinetic parameters for GMP incorporation revealed the 3a polymerase exhibited the highest activity, with an almost two fold higher catalytic efficiency (Kcat/Km) than HCVA-1b, primarily due to differences in Km for GTP (2.984??M vs 5.134??M). Furthermore, the 3a polymerase was 3.5 fold and 15 fold more active than JK1-1b and Con1-1b respectively. Improving our understanding of the influence of sequence difference on polymerase activity, particularly in the context of replication will be crucial to developing effective antiviral therapies.
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Hepatitis B-related liver disease burden in Vietnam and AustraliaNguyen, Van Thi Thuy, Public Health & Community Medicine, Faculty of Medicine, UNSW January 2008 (has links)
This thesis investigates the epidemiology of hepatitis B virus infection (HBV) and estimates HBV-related liver disease burden in Vietnam and Australia using a cross-sectional study design and mathematical modelling. A population-based seroprevalence survey was undertaken in rural Northern Vietnam. In a sample of 870 study participants, prevalence of anti-HBV core antibody (anti-HBc) and hepatitis B virus surface antigen (HBsAg) was 68.2% and 19.0%, respectively, and hepatitis B e antigen (HBeAg) was detected in 16.4% of the HBsAg-positive group. Factors associated with HBV infection (anti-HBc and/or HBsAg-positive) were age 60 years or older (adjusted odds ratio (AOR), 3.82; 95% CI, 1.35??10.80; P = 0.01), residence in Vu Thu district (AOR, 3.00; 95% CI, 2.16??4.17; P <0.001), hospital admission (AOR, 2.34; 95% CI, 1.33??4.13; P = 0.003) and history of acupuncture (AOR, 2.01; 95% CI, 1.29??3.13; P = 0.002). Household contact with a person with liver disease (AOR, 2.13; 95% CI, 1.29??3.52; P = 0.003), reuse of syringes (AOR, 1.81; 95% CI, 1.25??2.62; P = 0.002) and sharing of razors (AOR, 1.69; 95% CI, 1.03??2.79; P = 0.04) were independent predictors of HBsAg positivity. Alanine aminotransferase (ALT) level was elevated (>40 IU/L) in 43% of the HBsAg-positive group; the proportion of elevated ALT was higher in HBeAg-positive (65%) compared with HBeAg-negative (39%) (P = 0.02). Based on data from the seroprevalence study, other prevalence estimates and HBV natural history parameters, a mathematical model was used to estimate HBV-related liver disease burden in Vietnam. Estimated chronic HBV prevalence increased from 6.4 million cases in 1990 to around 8.4 million cases in 2005 and was projected to decrease to 8.0 million by 2025. Estimated HBV-related liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma (HCC) incidence increased linearly from 21 900 and 9400 in 1990 to 58 650 and 25 000 in 2025. Estimated HBV-related mortality increased from 12 600 in 1990 to 40 000 in 2025. To estimate HBV-related HCC incidence among Australians born in the Asia-Pacific region (APR), a mathematical modelling was developed utilising HBV natural history parameters, HBV prevalence estimates in APR countries and immigration data. Chronic HBV cases among the APR-born population increased rapidly from the late 1970s, reaching a peak of 4182 in 1990. Chronic HBV prevalence increased to more than 53 000 in 2005. Estimates of HBV-related HCC increased linearly from one in 1960 to 140 in 2005, with a projected increase to 250 in 2025. Universal HBV vaccination programs in countries of origin had limited impact on projected HBV-related HCC to 2025. HBV-related HCC survival was analysed in a population-based linkage study in New South Wales (NSW), Australia. Between 1994 and 2002, 278 HCC cases notified to the NSW Cancer Registry were linked to chronic HBV infection notifications to the NSW Health Department. The majority of cases were male (83.5%) and overseas born (93.6%); Asian-born cases accounted for 72.1%. Median survival following HCC diagnosis was 15 months. HCC survival was poorer among older age groups (P <0.001), and among cases with regional spread (HR 3.23; 95% CI, 1.83??5.69; P <0.001) and distant metastases (HR 3.85; 95% CI, 2.44??6.08; P <0.001). Sex, region of birth, and study period (1994??1997 versus 1998??2002) were not associated with HCC survival. The results of these studies show that HBV infection remains a major public health challenge in highly endemic countries such as Vietnam. HBV-related liver disease burden in Vietnam was estimated to increase for at least two decades despite the introduction of a universal infant HBV-vaccination program. Similarly, HBV-related HCC among Australians born in the APR was estimated to continue to increase over the next two decades. Survival for HBV-related HCC even in settings such as Australia continues to be extremely poor. Strategies are required to expand HBV treatment to individuals with chronic HBV infection who are at greatest risk of progression to advanced liver disease.
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Characterisation of duck lymphoid all populations and their role in immunity to duck hepatitis B virus / Edward M. Bertram.Bertram, Edward M. January 1997 (has links)
Bibliography: leaves 184-218. / xx, 218, [135] leaves, [15] leaves of plates : ill. (chiefly col.) ; 30 cm. / Title page, contents and abstract only. The complete thesis in print form is available from the University Library. / The research in this thesis describes the development and use of assays to detect cellular immune responses in ducks with application to duck hepatitis B virus (DHBV) infections. This animal model is used to provide an additional area of research which complements the study of hepadnaviruses. The introduction contains an outline of the significance of hepadnavirus research, including hepatitis B virus (HBV) epidemiology, structure, replication and clinical manifestations of the diseases caused by the virus. / Thesis (Ph.D.)--University of Adelaide, Dept. of Microbiology and Immunology, 1997
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Envelope protein domains of duck hepatitis B virus: role in assembly and infectivityChojnacki, Jakub Unknown Date (has links) (PDF)
Hepatitis B virus (HBV) is a global public health problem with an estimated number of 350 million carriers world wide who are at risk of development of severe liver disease and hepatocellular carcinoma. Despite currently available nucleoside analogue therapies no general therapeutic breakthrough, which completely clears infection has been achieved after more then two decades of research. Therefore there is a continuing need to identify new antiviral targets that may be translated into useful therapies. / Hepatitis B fusion represents a possible novel antiviral target. However, its mechanism and the envelope proteins involved remain unknown, due to the lack of an efficient infection system to study the early stages of virus infection. On the other hand, the study of the related duck hepatitis B virus (DHBV) and the ability to carry out an in vitro infection of primary duck hepatocytes has provided some insight into the hepadnaviral mechanism of entry and the role of envelope proteins domains in this process. ( For complete abstract open document)
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