Orientador: Ana Fabrícia Braga Magalhães / Resumo: ABSTRACT – Preweaning calf mortality is one of main causes of economic losses in beef cattle, since most of economic incomes are represented by the number of weaned calves available for sale. It is also detrimental for genetic progress due to the reduction of young candidates for selection. The inclusion of molecular markers in genetic analysis allows a better understanding of genetic mechanisms underlying calf mortality. The objectives of this study were: i) to estimate direct and maternal heritability of preweaning calf mortality in Nellore cattle and ii) to seek for genomic regions and candidate genes affecting direct and maternal effects of preweaning calf mortality in Nellore cattle. Variance components were estimated via Bayesian Inference using a threshold animal model, that included the systematic effects of contemporary group, birth weight as linear covariate, and age of dam at calving as linear and quadratic covariates. The direct and maternal genetics, and the residual were fitted as random effects. The final dataset used contained phenotypic records on 67,196 animals, offspring of 1,469 sires and 30,970 dams. The SNPs effects were estimated based on the weighted single-step GBLUP approach, using information of 8,443 genotyped animals with 410,936 SNPs. Direct and maternal heritability estimates were of 0.2143±0.0348 and 0.0137±0.0066, respectively. The top 10 genomic regions accounted for 13.61 and 14.23% of direct and maternal additive genetic variance and harbor... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-02-27T13:30:33Z No. of bitstreams: 5 28.pdf: 596682 bytes, checksum: c60fee0c05c0fc8e8692627652f61d10 (MD5) license_url: 49 bytes, checksum: fd26723f8d7edacdb29e3f03465c3b03 (MD5) license_text: 20626 bytes, checksum: 7851d446050a985bd0603b7c4cee472d (MD5) license_rdf: 19710 bytes, checksum: aa65da15f424ff71c620a992a187295c (MD5) license.txt: 2109 bytes, checksum: aa477231e840f304454a16eb85a9235f (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-02-27T18:08:03Z (GMT) No. of bitstreams: 5 28.pdf: 596682 bytes, checksum: c60fee0c05c0fc8e8692627652f61d10 (MD5) license_url: 49 bytes, checksum: fd26723f8d7edacdb29e3f03465c3b03 (MD5) license_text: 20626 bytes, checksum: 7851d446050a985bd0603b7c4cee472d (MD5) license_rdf: 19710 bytes, checksum: aa65da15f424ff71c620a992a187295c (MD5) license.txt: 2109 bytes, checksum: aa477231e840f304454a16eb85a9235f (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-27T18:08:03Z (GMT). No. of bitstreams: 5 28.pdf: 596682 bytes, checksum: c60fee0c05c0fc8e8692627652f61d10 (MD5) license_url: 49 bytes, checksum: fd26723f8d7edacdb29e3f03465c3b03 (MD5) license_text: 20626 bytes, checksum: 7851d446050a985bd0603b7c4cee472d (MD5) license_rdf: 19710 bytes, checksum: aa65da15f424ff71c620a992a187295c (MD5) license.txt: 2109 bytes, checksum: aa477231e840f304454a16eb85a9235f (MD5) Previous issue date: 2010 / A batata-doce (Ipomoea batatas (L.)), esp?cie pertencente ? fam?lia Convolvulaceae, ? uma planta r?stica, cultivada principalmente por pequenos produtores. Apesar de ser uma das oler?colas mais cultivada no Brasil e apresentar grande potencial de uso na alimenta??o humana, animal e industrial, tem sido pouco estudada. O objetivo deste trabalho foi identificar clones superiores e avaliar a produ??o e a qualidade de ra?zes, ramas e silagem de ramas de clones de batata-doce em diferentes ?pocas de colheita e ambientes de cultivo. Foi realizado um experimento no Campus II e outro na Fazenda Forquilha, ambos localizados no munic?pio de Diamantina-MG, com tr?s ?pocas de colheita. Foram avaliados nas ra?zes tuberosas: a produtividade total, produtividade comercial, peso m?dio total, peso m?dio comercial, resist?ncia a insetos de solo, formato de ra?zes, prote?na bruta, fibra bruta, cinzas, amido, compostos fen?licos e herdabilidade. Na parte a?rea foi avaliado a produtividade de mat?ria verde, teor de mat?ria seca, produtividade de mat?ria seca, prote?na bruta e fibra bruta. Foi feito silagem das ramas aos 150 dias ap?s a colheita na Fazenda Forquilha, onde foi analisado prote?na bruta, FDA, FDN, NDT, pH, mat?ria seca, hemicelulose e nitrog?nio amoniacal em rela??o ao nitrog?nio total. Atrav?s dos resultados apresentados, percebe-se que Os clones BD-25, BD-38 e BD-45, na Fazenda Forquilha, apresentaram as maiores produtividade totais e comercial de ra?zes e devem ser colhidas mais tardiamente. A Fazenda Forquilha foi o local onde os clones de batata-doce apresentaram, em m?dia, as maiores produtividades totais e comercial de ra?zes e os maiores pesos m?dios de ra?zes total e comercial. As menores notas para formato de ra?zes foram obtidas nas colheitas mais precoces. Os teores de prote?na bruta, fibra bruta, cinzas e amido, na mat?ria seca de ra?zes, n?o foram influenciados pelos ambientes de cultivo. Para obten??o de maiores produtividades de mat?ria verde e mat?ria seca, as ramas devem ser colhidas at? 150 dias ap?s o plantio. Na Fazenda Forquilha foram obtidas as maiores produtividades de mat?ria verde e mat?ria seca das ramas. Os teores de mat?ria seca nas ramas aumentam com o ciclo da cultura. As ramas de batata-doce apresentam potencial de utiliza??o na alimenta??o animal, tanto na forma fresca como na forma de silagem. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Produ??o Vegetal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2009. / ABSTRACT The sweet potato (Ipomoea batatas (L.)), species belonging to the family Convolvulaceae, is a rustic plant, grown mainly by small producers. Despite being one of most vegetables grown in Brazil and show great potential for use in food, animal and industrial, have been little studied. The objective was to identify superior clones and assess the production and quality of roots, stems and branches of silage from sweet potato clones in different harvesting periods and environments of cultivation. An experiment was conducted on campus and another on Farm II forks, both located in the city of Diamantina-MG with three seasons of harvest. Roots were evaluated in the total yield, commercial yield, total weight, weight commercial, insect resistance of soil, shape of roots, crude protein, crude fiber, ash, starch, phenolic compounds and heritability. In shoots was evaluated the yield of green matter, dry matter yield of dry matter, crude protein and crude fiber. Silage was made of branches to 150 days after harvest at Farm forks, where it was considered crude protein, ADF, NDF, TDN, pH, dry matter, hemicellulose and ammonia nitrogen in relation to total nitrogen. The results presented, we find that the BD-25 clones, and BD-38 BD-45, at Farm forks, submitted the highest total and commercial yield of roots and should be harvested later. The Farm was the fork where the sweet potato clones showed, I mean, the highest total and commercial yields of roots and the highest average weight of roots and total trade. The lowest notes to format roots were in earlier harvests. The crude protein, crude fiber, ash and starch in dry matter of roots were not influenced by the environment of cultivation. To obtain higher yields of green matter and dry, the stems should be harvested up to 150 days after planting. Farm forks were obtained in the highest yield of green matter and dry matter of branches. The dry matter in branches increased with the crop cycle. The stems of sweet potato, have potential for use in animal feed, both as fresh and as silage.

Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-10-26T13:23:58Z No. of bitstreams: 2 camila_tangari_meira.pdf: 312940 bytes, checksum: a4627c11344e9979ceee55d723fadc4a (MD5) license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-10-26T13:24:42Z (GMT) No. of bitstreams: 2 camila_tangari_meira.pdf: 312940 bytes, checksum: a4627c11344e9979ceee55d723fadc4a (MD5) license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-26T13:24:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 camila_tangari_meira.pdf: 312940 bytes, checksum: a4627c11344e9979ceee55d723fadc4a (MD5) license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Previous issue date: 2010 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Objetivou-se com este estudo avaliar um conjunto de caracter?sticas morfofuncionais, caracter?sticas morfom?tricas e pontua??o da marcha, atrav?s da an?lise de componentes principais (ACP), e estimar os par?metros gen?ticos, para as caracter?sticas relevantes ap?s an?lise multivariada em cavalos da ra?a Mangalarga Marchador. Dados de 14288 animais, nascidos de 1990 a 2005, foram submetidos ? ACP, objetivando reduzir a dimensionalidade do conjunto de caracter?sticas. Foram consideradas as seguintes caracter?sticas: altura na cernelha, altura na garupa, comprimento da cabe?a, comprimento do pesco?o, comprimento do dorso, comprimento da garupa, comprimento da esp?dua, comprimento do corpo, largura da cabe?a, largura das ancas, per?metro do t?rax, per?metro da canela e a pontua??o da marcha. A partir desta an?lise, sugeriram-se sete vari?veis para descarte, por apresentarem maiores coeficientes de pondera??o, em valor absoluto, a partir do ?ltimo componente principal. Assim, recomendaram-se as seguintes caracter?sticas para serem mantidas em trabalhos que utilizar?o esta mesma base de dados: pontua??o da marcha (PM), altura na garupa (AG), comprimento do dorso (CD), comprimento da garupa (CG), largura da cabe?a (LC) e per?metro da canela (PC). Estas caracter?sticas foram submetidas a uma an?lise gen?tica a fim de estimar suas herdabilidades e correla??es gen?ticas e fenot?picas. Os componentes de (co)vari?ncia necess?rios ? estima??o dos par?metros gen?ticos das caracter?sticas estudadas foram estimados pelo m?todo da M?xima Verossimilhan?a Restrita (REML). O modelo animal multicaracter?stica incluiu efeito gen?tico aditivo direto de animal, como aleat?rio, e os efeitos fixos de grupos contempor?neos, al?m da covari?vel idade do animal ao registro. Altas estimativas de herdabilidade (0,66 para PM a 0,94 para CD) foram encontradas, evidenciando a possibilidade de resposta direta ? sele??o. Foram estimadas correla??es gen?ticas e fenot?picas de ausentes a moderadas magnitudes e discretas tend?ncias gen?ticas ao longo dos anos para maior parte das caracter?sticas avaliadas. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2010. / ABSTRACT This study aimed to evaluate a set of morphofunctional traits, morphometric traits and marcha score data through the principal component analysis (PCA) and genetic parameters for the relevant traits in a multivariate analysis in horses Mangalarga Marchador . Data from 14,288 animals born from 1990 to 2005 were submitted to PCA aimed at reducing the dimensionality of the data set. There had been considered the following characteristics: height at withers, height at croup, lengths of head, neck, back, croup, hip length and body, widths of head, hip width, thorax perimeter, cannon bone circumference and marcha score. From this analysis, it was suggested seven variables to be discarded, because they have higher weightings (eigenvectors) in absolute value from the last major component. Based on the results, there was recommended the following characteristics to be maintained in future work: marcha score, height at croup, length of back, length of croup, width of head and cannon bone circumference. In a second step, these features were subjected to a genetic analysis to estimate their heritability?s and genetic and phenotypic correlations. The components of (co) variance needed to estimate the genetic parameters studied were estimated by Restricted Maximum Likelihood (REML). The trait animal model included direct genetic effect as random and fixed effects of contemporary groups and the covariate age record. High heritability estimates were found, suggesting the possibility of direct response to selection. Genetic and phenotypic correlation were estimate of absence to moderate magnitudes between traits and observed discrete genetic trends over the years for most traits.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-11T11:31:48Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 168448 bytes, checksum: cac1c0a520e55d1c502dc8fdb8011b36 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T11:31:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 168448 bytes, checksum: cac1c0a520e55d1c502dc8fdb8011b36 (MD5) Previous issue date: 2003-07-10 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Utilizaram-se registros de pesos do nascimento aos 196 dias de idade de 927 cordeiros filhos de 45 reprodutores e 323 matrizes de ovinos da raça Santa Inês, controlados de 1983 a 2000, pertencentes à Empresa Estadual de Pesquisa Agropecuária da Paraíba (EMEPA-PB), com os objetivos de estimar parâmetros genéticos para os efeitos aditivos direto e materno e predizer os valores genéticos dos animais, por meio de análises bicaracterísticas e regressão aleatória, para pesos em diferentes idades. Os componentes de (co)variâncias e os parâmetros genéticos direto e materno para os pesos foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal, por intermédio de análises unicaracterísticas, para testar três modelos de análises, com o intuito de determinar o mais apropriado para descrever as características estudadas, o qual foi utilizado nas análises bicaracterísticas e de regressão aleatória. O modelo bicaracterística foi ajustado utilizando-se o aplicativo MTDFREML (BOLDMAN et al., 1995) e regressão aleatória, por meio de polinômios de Legendre quadráticos e cúbicos, do programa DXMRR (MEYER, 1998). De acordo com o teste de razão de verossimilhança, o modelo que incluiu o efeito aditivo mais o materno foi o que apresentou maior valor para o logaritmo da função de verossimilhança em todas as características estudadas, sendo, portanto, o escolhido. A não-inclusão do efeito materno no modelo de análise resultou em superestimação das herdabilidades para o efeito direto. A importância do efeito materno diminuiu ao longo da trajetória de crescimento, à medida que a idade dos cordeiros aumentava. As herdabilidades estimadas nas análises bicaracterísticas para o efeito genético direto foram superiores às obtidas pelas análises unicaracterísticas e tenderam a decrescer do nascimento aos 196 dias de idade, variando de 0,23 a 0,03. Já as estimadas por meio dos modelos de regressão aleatória aumentaram do nascimento aos 196 dias de idade (0,004 a 0,28), com tendência de serem mais baixas nas idades em que as estimativas do efeito materno foram mais altas. As herdabilidades para o efeito materno, obtidas por ambos os modelos, aumentaram do nascimento aos 56 dias e, então, decresceram com a idade, tendendo a apresentar o mesmo comportamento, porém as estimadas pelos modelos de regressão aleatória foram de menor magnitude. As correlações genéticas estimadas por ambos os modelos tenderam a ser altas e positivas. As correlações de Spearman e de Pearson entre os valores genéticos preditos pelos dois modelos foram baixas. As herdabilidades estimadas por meio das análises bicaracterísticas sugerem que este método permite obter estimativas mais acuradas, comparadas às obtidas nas análises unicaracterísticas. As estimativas de herdabilidade e correlações genéticas obtidas pelo modelo de regressão aleatória foram biologicamente mais coerentes quando comparadas àquelas obtidas pelo modelo bicaracterística. Entretanto, estudos adicionais envolvendo maior número de informações devem ser realizados, como também usando dados simulados, com o objetivo de avaliar com mais precisão os resultados obtidos por ambos os modelos. / Records of body weights from birth to 196 days of age of 927 lambs progeny of 45 sires and 323 dams of Santa Ines sheep, controlled from 1983 to 2000, extracted from a database of Agricultural Research Corporation of Paraiba, were used to estimate genetic parameters for the additive direct and maternal effects and to predict breeding values by two-trait and random regression analyses for weights in different ages. The (co)variance components and both direct and maternal genetic parameters were estimated by using restricted maximum likelihood methods, under animal model, by means of single-trait analyses, to test three analyses models, to establish the most appropriated to describe the studied traits, which was used in two-trait and random regression analyses. The two-traits model was fitting by using MTDFREML system (BOLDMAN et al., 1995) and the random regression by means of orthogonal Legendre polynomials, using DXMRR program (MEYER, 1998). According to the likelihood ratio test, the model that included additive direct effect and the maternal was the one that showed higher value for ln likelihood for all the studied trait. The not inclusion of maternal effect in analyses model overestimated the heritability for direct effect. The importance of maternal effect decreased along the growth trajectory, while the age of the lambs increased. The heritability estimates in two-trait analyses for genetic direct effect were higher than those obtained by single-trait analyses and tended to decrease from birth to 196 days of age, ranging from 0.23 to 0.03. However, these estimated by means of the random regression models increased from ixbirth to 196 days of age (0.004 to 0.28), tending to be lower at ages where the estimates of the maternal effects were higher. The heritability for the maternal effect obtained by both models, increased from birth to 56 days and, after, decreased with the age, tending to show the same behavior, however these estimated by random regression models were of smaller greatness. The genetic correlations estimated for both models tended to be high and positive. The Spearman and Pearson correlations among the breeding values obtained both by the models were low. The heritability estimated by means of the two-trait analyses suggest that technique allows to obtain more accurated estimates, compared to the obtained by single-trait analyses. The estimates of heritability and genetic correlations obtained by means of random regression model were biologically more consistent when compared those obtained by two-trait model. However, additional studies involving larger number of information should be accomplished, as well using simulated data, with purpose of evaluation with more accuracy the results obtained by both models.

MUNIZ, Lorena Mirelle Santos. Associação genética entre a mudança de peso vivo e características relacionadas à fertilidade e à habilidade materna de ovelhas Santa Inês. 2016. 96 f. Tese (Doutorado em Zootecnia)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016 / Submitted by Aline Mendes (alinemendes.ufc@gmail.com) on 2017-01-18T20:54:01Z No. of bitstreams: 1 2016_tese_lmsmuniz.pdf: 6678931 bytes, checksum: 726bdafc2862a3655fe80abfe10e37f2 (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2017-01-19T11:55:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_tese_lmsmuniz.pdf: 6678931 bytes, checksum: 726bdafc2862a3655fe80abfe10e37f2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-19T11:55:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_tese_lmsmuniz.pdf: 6678931 bytes, checksum: 726bdafc2862a3655fe80abfe10e37f2 (MD5) Previous issue date: 2016 / As Santa Inês is the breed with the largest number of animals available in Brazil, which makes it the maternal base of the country's meat sheep industry, and in the moment that signals to need to increase the effective size of the flocks, to meet the suppressed domestic demand by meat lamb, evaluate the reproductive performance of this breed is a fundamental issue. As in meat production, much emphasis is given to growth traits over those of fertility, the aim of this study was to investigate a possible association between the change in body weight in the pre- and post-partum, and traits related to fertility and maternal ability of Santa Ines sheep. The analyzed traits were mating weight (MW), lambing weight (LW) and weight of the ewe at weaning of their lambs (WW), number of lambs born per ewe (NLB), number of lambs weaned per ewe (NLW), total weight of lambs born per ewe (LWB) and total weight of lambs weaned per ewe (LWW), weight change between mating and lambing (WC1 = (LW – MW)/(lambing date – mating date)) and weight change between lambing and weaning (WC2 = (WW – PP)/(weaning date – lambing date)) of 2,166 ewes, from 2004 to 2010. Four multivariate animal models were analyzed: 1) Limiar2 x Linear2 (NLB, NLW, WC1 and WC2), 2) Linear4 (LWB, LWW, WC1 and WC2), 3) Linear3 x Limiar2 (MW, LW, WW, NLB and NLW) and 4) Linear5 (MW, LW, WW, LWB and LWW) by Bayesian inference with THRGIBBS1F90 and GIBBS2F90 software. The heritabilities for NLB, NLW, LWB, LWW, WC1, WC2, MW, LW and WW were 0.24, 0.24, 0.15, 0.10, 0.07, 0.01, 0.40, 0.44 and 0.44, respectively. The mode estimation for genetic correlation between WC1 and WC2 was equal to 1.0. Genetic correlations of WC1 and WC2 with the traits NLB, NLW, LWB and LWW tended to be negative. We conclude that ewes which do not show major changes in their body weight, in the period close to lambing, are more efficient and should be selected to improve flock productivity. This aspect should be associated with a greater number of lambs weaned per ewe. / Por ser a raça com maior número de animais disponíveis no Brasil, o que a torna a base materna da ovinocultura de corte do país, e no momento que se sinaliza para necessidade do aumento do tamanho efetivo dos rebanhos, para atender a demanda interna reprimida por carne ovina, avaliar o desempenho reprodutivo da raça Santa Inês é um tema fundamental. Como na exploração para corte, muita ênfase é dada às características de crescimento em detrimento daquelas de fertilidade, o objetivo deste estudo foi verificar uma possível associação entre a mudança de peso vivo, nos períodos pré e pós-parto, e características relacionadas à fertilidade e habilidade materna de ovelhas da raça Santa Inês. Foram analisadas as características peso à cobrição (PC), peso ao parto (PP) e peso ao desmame das crias (PDES), número de crias nascidas por matriz (NCN), número de crias desmamadas por matriz (NCD), peso total de crias nascidas por matriz (PTCN) e peso total de crias desmamadas por matriz (PTCD), mudança de peso entre a cobrição e o parto (MUD1 = (PP – PC)/(data do parto – data da cobertura)) e mudança de peso vivo entre o parto e o desmame (MUD2 = (PDES – PP)/(data do desmame – data do parto)) de 2.166 ovelhas, no período de 2004 a 2010. Quatro modelos animal multivariados foram analisados: 1) Limiar2 x Linear2 (NCN, NCD, MUD1 e MUD2), 2) Linear4 (PTCN, PTCD, MUD1 e MUD2), 3) Linear3x Limiar2 (PC, PP, PDES, NCN e NCD) e 4) Linear5 (PC, PP, PDES, PTCN e PTCD) por meio de inferência bayesiana com os softwares THRGIBBS1F90 e GIBBS2F90. As herdabilidades para NCN, NCD, PTCN, PTCD, MUD1, MUD2, PC, PP e PDES foram 0,24; 0,24; 0,15; 0,10; 0,07; 0,01; 0,40; 0,44 e 0,44, respectivamente. A estimativa da moda para a correlação genética entre MUD1 e MUD2 foi igual a 1,0. As correlações genéticas de MUD1 e MUD2 com as características NCN, NCD, PTCN e PTCD tenderam a ser negativas. Conclui-se que ovelhas que não apresentam grandes mudanças em seu peso vivo, nos períodos próximo ao parto, são mais eficientes e devem ser selecionadas para melhoria da produtividade do rebanho. Deve-se associar a isto um maior número de cordeiros desmamados por matriz.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-01-26T14:30:39Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 838600 bytes, checksum: d3161a58a95f8212328fb3a175156b6e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-26T14:30:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 838600 bytes, checksum: d3161a58a95f8212328fb3a175156b6e (MD5) Previous issue date: 2015-07-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Objetivou-se avaliar a influência da estrutura de grupos de contemporâneos (GC) e da conexidade de dados na avaliação genética de peso ao desmame padronizado para 210 dias de idade em bovinos da raça Nelore. Foram utilizados 713.474 registros de pesos de animais Nelore provenientes de 3.066 rebanhos das regiões Centro-Oeste e Norte do Brasil. Os dados fazem parte do Serviço de Registro Genealógico das Raças Zebuínas (SRGRZ) disponibilizados pela Associação Brasileira dos Criadores de Zebu – ABCZ. Os GC foram formados com os efeitos de rebanho, condição de criação, regime alimentar, sexo, data de pesagem, ano e estação de nascimento. Os GC e as classes de idade da vaca ao parto concatenada com sexo da progênie foram definidos como efeitos sistemáticos, a idade do animal na data de pesagem foi considerada como covariável (linear e quadrática). Foram utilizados três níveis de desvios-padrão em relação à média para remoção de outliers (2, 2,5 e 3,5) e GC que continham pelo menos 3, 7 e 15 animais, que possibilitou a combinação de nove diferentes estruturas de dados. A conexidade entre os dados foram mensuradas e avaliados considerando o número total de ligações genéticas diretas entre GC (NTLGD). Foram consideradas 5, 10 e 15 ligações entre os GC, L5, L10 e L15, respectivamente. Empregou-se o modelo animal unicaracterístico via inferência Bayesiana para estimação dos valores e parâmetros genéticos. A estrutura de dados com 3,5 desvios-padrão e GC com no mínimo 15 animais apresentou maior valor de variância genética aditiva (82,65±2,8575). A estrutura de dados com 2 desvios-padrão e GC com no mínimo 15 animais apresentou menor valor de variância residual (206,86±1,451), e o maior valor foi verificado para estrutura de dados com 3,5 desvios-padrão e GC com no mínimo 3 animais (276,42±1,4902). O maior valor de herdabilidade (0,18±0,006) foi estimado ao considerar a estrutura com 2,5 desvios-padrão e GC com no mínimo 15 animais. As estruturas com 3,5 desvios-padrão e mínimo de 15 animais por GC proporcionaram maiores ganhos genéticos, de 5,04 e 3,34 kg para os 1% dos machos e 20% das fêmeas e para 5% dos machos e 40% das fêmeas, respectivamente. Ao avaliar a conexidade de dados, não verificou-se diferença entre as estruturas de dados com as diferentes ligações genéticas, sendo a conexidade acima de 99% em todas as estruturas. Ao considerar a conexidade, os valores encontrados para as estimativas dos parâmetros genéticos nas diferentes estruturas de dados foram iguais aos encontrados na avaliação sem considerar a conexidade entre os dados. A alta conexidade entre os GC é reflexo da alta qualidade na estrutura de dados, justificada pela intensa comercialização de sêmen de touros provados e troca de material genético entre os rebanhos. Os diferentes critérios para formação de grupos de contemporâneos influenciaram na avaliação genética. O uso de critérios para remoção de outliers com 2 desvios-padrão e grupos de contemporâneos com mínimo de 3 animais proporcionaram menores estimativas de herdabilidade. O uso de critérios para remoção de outliers com 2,5 e 3,5 desvios- padrão e grupos de contemporâneos com mínimo de 15 animais proporcionaram maiores estimativas de herdabilidade, porém resulta em maior perda de registros. Os dados apresentam boa qualidade na estrutura em função da alta conexidade existente entre os grupos de contemporâneos. / We aimed to evaluate the influence of contemporary groups (CG) structure and data connectivity in the genetic evaluation for body weight at weaning standardized for 210 days of age in Nellore cattle. A total of 713,474 records from 3,066 herds located at Middle West and North of Brazil were used. These herds are included at Genealogical Records Service of Zebu Breeds (SRGRZ) provided by Brazilian Association of Zebu Breeders – ABCZ. The CG were formed according herd, handling condition, diet, sex, date of weighting, year and birth season effects. Contemporary groups and classes of cow age at calving concatenated with offspring gender were defined as systematic effects, and the animal age at weighting was considered as covariate (linear and quadratic). Three standard deviations from the average (2, 2.5 and 3.5) were used for outliers removal, and CG with at least 3, 7 and 15 animals were included, thus allowing the formation of nine different data structures. Connectivity across the data was measured considering the total direct genetic linkage between CG (NTLGD). Five, ten and fifteen linkages between CG, L5, L10 and L15, respectively, were considered. Genetic evaluation was performed using a single trait animal model under a Bayesian approach to estimate the breeding values and genetic parameters. Data structure with 3.5 standard deviations and CG with at least 15 animals presented higher additive genetic variance values (82.65±2.8575). Data structure with 2 standard deviations and CG with at least 15 animals presented lower residual variance values (206.86±1.451), and the higher value (276.42±1.4902) was verified for the data structure with 3.5 standard deviations and CG with at least 3 animals. The higher heritability value (0.18±0.006) was estimated when considering the structure with 2.5 standard deviations and CG with at least 15 animals. Structures with 3.5 standard deviations and least 15 animals per CG had the highest genetic gains, 5.04 and 3.34 kg for the 1% of the males and 20 % of the females and 5% of the males and 40% of the females, respectively. The evaluation the data connectivity snowed no difference between structures with different genetic linkage, resulting in more than 99% of connectivity for all considered structures. Genetic parameters estimates values of different data structures considering the data connectivity were the same as those without consider the data connectivity. The high connectivity between CG is due the good quality of the data structure explained by the intense marketing of proven bulls semen and genetic material exchange between herds. The different criteria for CG formation influenced the data structure and genetic evaluation. Criteria usage for removing outliers with 2 standard deviations and CG with at least 3 animals had the lowest heritability estimates. The criteria used for removing outliers with 2.5 and 3.5 standard deviation and CG with at least 15 animals had the highest heritability estimates, but lead to a higher records loss. Data presents a good structure quality due the high existing connectivity between CG.

Submitted by Ricardo Faria (fariasky@gmail.com) on 2016-03-19T01:28:20Z No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_RICARDO_ANTONIO_DA_SILVA_FARIA.pdf: 1017582 bytes, checksum: 84a709da815cc0db9987696624f4e936 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-03-22T13:37:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 faria_ras_me_jabo.pdf: 1017582 bytes, checksum: 84a709da815cc0db9987696624f4e936 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-22T13:37:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 faria_ras_me_jabo.pdf: 1017582 bytes, checksum: 84a709da815cc0db9987696624f4e936 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A raça Quarto de Milha (QM) teve seus primeiros exemplares criados no Brasil em 1956, cujos pais foram importados dos Estados Unidos, com fundação da associação dos criadores em 1969, totalizando mais de 415 mil animais registrados e destes 45% são puros. A raça apresenta-se como versátil para trabalho, conformação e corrida, atributos que a tornam como de escolha entre os criadores e de maior população equina nacional. Apesar disto, poucos estudos foram realizados na raça, particularmente acerca da variabilidade genética. Os objetivos do estudo foram obter informações da estrutura populacional da raça QM no Brasil e estimar os parâmetros genéticos da característica Classe de Tempo (CT), relacionada com a performance em corridas de equinos em diferentes distâncias. O escore aplicado a CT, classifica os animais baseado na comparação percentual de tempo do vencedor de cada páreo. Os dados avaliados foram provenientes da Associação Brasileira de Criadores do Cavalo Quarto de Milha e do hipódromo do Jockey Clube de Sorocaba em São Paulo. A preparação da base de dados e estatística inicial foi realizada no programa SAS, os parâmetros populacionais com o programa ENDOG e os componentes de (co) variâncias e parâmetros genéticos com o programa THRGIBBS1F90. A característica CT foi estabelecida nas corridas com distância de 301 (CT301), 320 (CT320), 365 (CT365) e 402 (CT420) metros e analisada por meio de modelo animal limiar. Os parâmetros populacionais obtidos foram 0,49% de endogamia, 0,29% de parentesco, 9,3 anos de intervalo gerações, a probabilidade de origem dos genes com valor igual a 333 de número efetivo de fundadores, a variabilidade genética total apresentou-se explicada por 7.254 ancestrais, com 161 ancestrais explicando 50%. As estimativas a posteriores da herdabilidade e da repetibilidade, obtidas em análise multicaracterística, foram de 0,52±0,04 e 0,85±0,04 (CT301), 0,48±0,06 e 0,97±0,01 (CT320), 0,56±0,04 e 0,88±0,06 (CT365) e 0,45±0,06 e 0,78±0,04 (CT420), respectivamente. Os valores obtidos indicam que a característica CT pode ser utilizada como critério de seleção e obter rápido ganho genético. A baixa variabilidade genética na raça Quarto de Milha foi evidenciada, sugerindo aos criadores inserção de reprodutores no rebanho. / The Quarter Horse (QH) had its first specimens bred in Brazil in 1956, whose parents were imported from the United States, with its breeder association founded in 1969, totaling more than 415,000 registered animals and of these 45% are purebred. The breed is versatile in what concerns performance, conformation and racing, attributes that make the QH the breed of choice among breeders and makes it the largest national equine population. In spite of that, few studies have been conducted about the breed, particularly on the genetic variability of strains. The aim of this study was to gather information about the population structure and estimate the genetic parameters of the trait class time (CT) related to performance in different QH racing distances, contributing with results that enable their use in the design of animal breeding programs aimed at maintaining the variability of the breed and decreasing race times. The score applied to CT, ranks animals based on comparing percentage winning time of each match. The analyzed data originates from the Brazilian Association of Breeders of Quarter Horse and Jockey Clube de Sorocaba’s hippodrome, in Sao Paulo. The preparation of the initial data and statistical base was done using SAS software, the population parameters with the ENDOG software and the (co) variances and genetic parameters components with the THRGIBBS1F90 software. The CT characteristic was established in racing with 301 (CT301), 320 (CT320), 365 (CT365) and 402 (CT420) meters distances and analyzed by threshold animal model. The obtained population parameters were 0.49% of inbreeding, 0.29% of kinship, 9.3-year generation interval, The probability of origin of genes with value 333 related to effective number of founders, the total genetic variability is explained by 7,254 ancestors, with 161 ancestors responsible for 50%. The estimates later heritability and repeatability obtained in multi-trait analysis were 0.52 ± 0.04 and 0.85 ± 0.04 (CT301), 0.48 ± 0.06 and 0.97 ± 0, 01 (CT320), 0.56 ± 0.04 and 0.88 ± 0.06 (CT365) and 0.45 ± 0.06 and 0.78 ± 0.04 (CT420), respectively. The values obtained indicate that CT feature can be used as selection criteria and obtain rapid genetic gain. The low genetic variability in the Quarter Horse breed was evidenced, suggesting to breeding insertion breeders in the herd.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-30Bitstream added on 2014-06-13T18:29:28Z : No. of bitstreams: 1 buzanskas_me_me_jabo.pdf: 287295 bytes, checksum: 143c58eec91adb632f95592d8c22bf67 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / As características reprodutivas das fêmeas são de grande importância na exploração de bovinos de corte no Brasil, pois estas influenciam diretamente no número de bezerros produzidos. A habilidade de permanência de fêmeas no rebanho apresenta grande impacto nos custos das propriedades rurais, pois está diretamente ligada à capacidade das vacas em produzir determinado número de bezerros em um espaço de tempo. O objetivo deste trabalho foi estudar a habilidade de permanência de fêmeas no rebanho aos 76 meses de idade (HP) e suas associações genéticas com a idade ao primeiro parto (IPP), peso corporal de machos e de fêmeas aos 420 dias de idade (P420) e perímetro escrotal aos 420 dias de idade (PE420), para fornecer subsídios ao programa de avaliação genética da raça Canchim. Por se tratar de uma característica binária, definiu-se HP como sucesso (2) quando as fêmeas obtiveram no mínimo três bezerros até os 76 meses de idade e fracasso (1) para as demais. No modelo animal, foi incluído o efeito fixo de grupo de contemporâneos (GC) e os efeitos aleatórios aditivos direto e residual. Os dados foram analisados por meio de inferência Bayesiana, em análise bi-característica de HP com as demais características. Aos 76 meses de idade 40,77% das vacas obtiveram sucesso. As médias de IPP, P420 e PE420 foram iguais a 40,28 ± 7,85 meses, 254,92 ± 45,05 kg e 24,63 ± 3,84 cm, respectivamente. As estimativas de herdabilidade obtidas para HP, IPP, P420 e PE420 foram iguais a 0,03 ± 0,01; 0,04 ± 0,01; 0,24 ± 0,04 e 0,24 ± 0,06, respectivamente. As associações genéticas da característica HP com IPP, P420 e PE420 foram iguais a -0,63 ± 0,20; -0,09 ± 0,11 e 0,45 ± 0,21, respectivamente. As correlações ambientais, de HP com IPP e P420 foram iguais... / Improvement of female fertility has become of fundamental importance for profit maximization in the beef cattle herds in Brazil. The stayability trait was defined as whether or not a cow calved in a herd at a specific age. Therefore, the objectives of the present study are to analyze stayability (Stay) and its genetic association with age at first calving (AFC), body weight in males and females at 420 days of age (BW420) and scrotal circumference at 420 days of age (SC420), in Canchim cattle. In this research, Stay was defined as success (2) for females that had a minimum of three calves at 76 months of age and failure (1) for the others. Genetic parameters were estimated for all traits. The animal model included the fixed effect of contemporary group (CG) and the additive direct and residual random effects. The data was studied using Bayesian inference in two-trait analyses. At 76 months of age the percent of success was equal to 40.77%. The means for AFC, BW420 and SC420 were equal to 40.28 ± 7.85 months, 254.92 ± 45.05 kg e 24.63 ± 3.84 cm, respectively. The analyses provided heritability estimates of 0.03 ± 0.01, 0.04 ± 0.01, 0.24 ± 0.04 and 0.24 ± 0.06 for Stay, AFC, BW420 and SC420, respectively. The estimates of posterior genetic association were equal to -0.63 ± 0.20, -0.09 ± 0.11 and 0.45 ± 0.21 between Stay with AFC, BW420 and SC420, respectively. The environmental association between Stay with AFC and BW420 were 0.02 ± 0.01 and -0.06 ± 0.04, respectively, and for SC420 the environmental correlation was computed as zero. Selection for higher BW420 should not improve the Stayability trait. However, selection for SC420 should improve this trait and also contribute positively in Stayability. The improvement of age at first calving and Stayability should not be obtained by selection for these traits, but mainly, by changes in management and environmental conditions.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-27Bitstream added on 2014-06-13T19:54:01Z : No. of bitstreams: 1 campos_rv_me_jabo.pdf: 253429 bytes, checksum: 8d9f4fe4ec3cc0553b735dfab36c9a5a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A eficiência em produção de uma propriedade depende de fatores técnicos, biológicos, financeiros e gerenciais. Avanços na genética, nos métodos estatísticos e na melhoria da capacidade de processamento dos computadores podem contribuir para o progresso genético do rebanho bubalino. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi verificar a associação genética entre a produção de “mozzarella” (PM) com a produção e os constituintes do leite bubalino considerando como objetivo de seleção a PM. Para isso, estimaram-se os parâmetros genéticos das produções de leite (PL) e “mozzarella”, bem como das porcentagens de gordura (PG) e proteína (PP), utilizandose 4389 lactações ocorridas entre os anos 1985 e 2005. Estimou-se ainda o ganho e a tendência genética das características ao longo dos anos bem como a eficiência da seleção. Estimou-se os componentes de variância por meio de análises bi-característica usando modelos animal, pela metodologia REML, ao qual foram obtidas as estimativas de herdabilidade que variaram de 0,17 a 0,37 entre todas as características analisadas, o que indica que existe variabilidade passível de seleção. As repetibilidades também foram altas, de 0,42 a 0,63, indicando que poucos desempenhos podem ser considerados para se praticar o descarte de animais através da seleção. A correlação genética entre as PL acumuladas aos 270 (P270) e 305 (P305) dias com a PP foram negativas e mediana (-0,04 e -0,29, respectivamente) e com a PG foram negativas e alta (-0,56 e -0,68, respectivamente) acarretando na diminuição dos constituintes à medida que se seleciona para as PL. Com base nas altas correlações genéticas entre as PL com a PM (acima de 0,86) e nas respostas correlacionadas visando à PM, é mais indicado praticar seleção direta para a PL devido ao seu maior peso na fórmula de estimação da mesma, ainda que os teores dos... / The efficiency in production of a farm depends factors technical, biological, financial and managerial. Progresses in the genetics, in the statistical methods and in the improvement of the capacity of processing of the computers they can contribute with the genetic progress of the herd buffalo. The objective of this study was to verify the genetic association among the mozzarella yield (MY) with the yield and components composition of the milk buffalo considering as selection objective the MY. They were considered the genetic parameters of the yield of milk (YM) and mozzarella, as well as of the fat percentages (FP) and protein (PP), being used 4389 lactations happened among the years 1985 and 2005. Estimation also the genetic gain, the efficiency and the tendency of the selection along the years. It was used for the analysis of the environmental factors and definition of the models of the characteristics the procedure GLM of the SAS. For the study of the genetic factors, they were considered the variance components across analyses bi-characteristic using models animal, across of the methodology REML of MTDFREML, to which was obtained the heritability estimates that varied from 0,17 to 0,37 among the characteristics, what indicates that variability susceptible to selection. The repeatability were also high, from 0,42 to 0,63, indicating that few performance can be considered to be practiced the selection. With base in the correlated answers to the MY, it is more suitable to practice direct selection for the MY due to your largest weight in the formula of estimate of the mozzarella, even if the representative’s component constituents are maximum. Besides, it is treated of a characteristic of easy measure and low cost, allowing larger number of animals to be controlled...(Complete abstract, click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-16Bitstream added on 2014-06-13T18:29:30Z : No. of bitstreams: 1 guidolin_dgf_me_jabo.pdf: 239613 bytes, checksum: 25503ca97d099f8707e7f0c6cd325324 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A identificação de interação genótipo-ambiente em bovinos de corte pode auxiliar o processo de seleção, aumentando a eficiência da avaliação genética de reprodutores submetidos à ambientes distintos. Características medidas pós-desmame estão mais sujeitas aos efeitos da interação genótipoambiente do que na fase pré-desmame. Assim, o objetivo deste trabalho foi verificar a existência do efeito da interação genótipo-ambiente sobre os pesos corporais aos 365 (P365), 450 (P450) e aos 550 (P550) dias de idade de bovinos Nelore criados nos estados de Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerais, Pará e São Paulo. Os componentes de (co)variância, parâmetros genéticos e os valores genéticos preditos foram estimados para cada característica, por estado e para o conjunto total de dados, pelo método da máxima verossimilhança restrita. Correlações de Spearman entre as classificações dos touros por estado quanto ao valor genético para cada característica ou considerando cada estado individualmente e em conjunto (todos os estados), assim como a correlação genética entre observações da mesma característica, medida em dois estados distintos foram utilizadas para avaliar o efeito da interação genótipo-ambiente sobre as características estudadas. Correlações de Spearman não significativas indicaram mudança de posição na classificação de touros e conseqüente existência de interação genótipo-ambiente. A ocorrência desta interação também foi constatada em algumas ocasiões por estimativas de correlação genética entre observações da mesma característica em estados diferentes, para P365 foi observada indícios de interação entre SP e GO (0,71), SP e MT (0,68) e também entre SP e PA (-0,11), para P450, MT e MG (-0,28), GO e PA (0,62) e SP e PA (0,66), para a característica P550, MT e MG (-0,38), MG e PA (0,73), MG e SP (-0,34) e para... / The properly identification of genotype-environment interaction in beef cattle herds can help the selection process and improve genetic evaluation of sires submitted in different environments. Post weaning traits may be more influenced by the genotype-environment interactions than others. So, this paper objective was verify genotype-environment interaction in, beef cattle, body weight at 365 (P365), 450 (P450) and 550 (P550) days of age in herds distributed in six Brazilian states, Goiás (GO), Mato Grosso (MT), Mato Grosso do Sul (MS), Minas Gerais (MG), Pará (PA) and São Paulo (SP). Genetic parameters, (co)variance components and genetic values were estimated for each trait, each state and for all states together, using maximum restricted likelihood method. Spearman correlations among sire’s classifications due to its genetic value, for each trait, by state individually or in group (using data from all states), genetic correlation between the same trait measured in two different states were used to evaluate genetic-environment interaction over the traits studied. Non significant Spearman’s correlation indicated position changes at sires classification and consequently genotype-environment interaction. This interaction occurrence was also observed between genetic correlations of the same trait measured in two different states. Genetic correlation for P365, between SP and GO states were (0, 71), SP and MT (0, 68) and also between SP and PA (-0, 11). For P450, MT and MG (-0, 28), GO and PA (0, 62) and SP and PA (0, 66). P550, MT and MG (-0, 38), MG and PA (0, 73), MG and SP (-0, 34) and SP and PA (-0, 86). There so, selection conduced considering data obtained in one state could be different than one based in others. Beef cattle summary organized by state would be indicated if this one would be economically viable.