Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-02-19T14:47:21Z No. of bitstreams: 1 PGCA16MA200.pdf: 906352 bytes, checksum: a8a793c2fb4ce9135d1ad04376522869 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-19T14:47:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCA16MA200.pdf: 906352 bytes, checksum: a8a793c2fb4ce9135d1ad04376522869 (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Among the pathogens foodborne are thermophilic bacteria of genus Campylobacter, gastroenteritis important agents of food-borne, in this case called campylobacteriosis. Campylobacter are defined as Gram-negative, curved or spiral, capnófilos with characteristic movement of corkscrew or comes and goes. They stand out as considerable thermophilic Campylobacter transmission sources for man meat and chicken giblets contaminated during handling and misguided slaughter operations, and cross-contamination of these with other foods that will be eaten raw. Due to the emphasis that the western region of Santa Catarina has the production and marketing of chicken, it was necessary to verify the occurrence of the pathogen in chilled carcasses of chickens slaughtered in this region, and its behavior to the seasons. For a period of 26 months, from January 2013, chicken carcass samples were weekly collected after the cooling process water in slaughterhouses under Federal Inspection of the three largest micro-regions in broiler slaughter number of the western region of Santa Catarina, totaling 808 samples. Campylobacter thermophiles was performed according to the methodology recommended by ISO 10272-1: 2006. Thermophilic Campylobacter were isolated in 1.82% (8/440) of the micro-region 1 of the samples, 4.95% (10/202) of samples of themicro-region 2 and 13.86% (23/166) samples of the micro-region 3 totaling 41 positive samples (5.07%) of the total samples collected. The index reported for the microregion 3 was statistically significant (P <0.05) when compared to the ratios found for the other two microregions. Although the prevalences have solid lower than expected when compared to the already published for this region, still provide risk to consumers, mainly through cross-contamination with food that will be consumed raw state, requiring greater controls on the production chain and slaughter of chickens. With respect to the seasons, the Campylobacter rates thermophilic were not statistically significant (P <0.05), however, it is necessary to evaluate for a longer period of time, since there was a numerically positive trend with respect to summer / Dentre os patógenos veiculados por alimentos, estão as bactérias termofílicas do gênero Campylobacter, importantes agentes de gastrenterite de origem alimentar, neste caso denominada de campilobacteriose. Campylobacter são definidos como bastonetes Gram-negativos, curvos ou espiralados, capnófilos, com movimento característico de saca-rolha ou em vai e vem. Destacam-se como consideráveis fontes de transmissão de Campylobacter termofílicos para o homem a carne e miúdos de frango, contaminadas durante a manipulação e operações de abate mal conduzidas, e a contaminação cruzada destes com outros alimentos que serão ingeridos crus. Devido ao destaque que a região oeste de Santa Catarina possui na produção e comercialização da carne de frango, fez-se necessário verificar a ocorrência do patógeno em carcaças resfriadas de frangos abatidos nesta região, e seu comportamento frente às estações do ano. Por um período de 26 meses, a partir de janeiro de 2013, foram semanalmente coletadas amostras de carcaça de frango, após o processo de resfriamento em água, em abatedouros sob Inspeção Federal das três maiores microrregiões em número de abate de frangos da região oeste de Santa Catarina, totalizando 808 amostras. Foi realizada a pesquisa de Campylobacter termofílicos conforme a metodologia recomendada pela ISO 10272-1:2006. Campylobacter termofílicos foram isolados em 1,82% (8/440) das amostras da microrregião 1, em 4,95% (10/202) das amostras da microrregião 2 e em 13,86% (23/166) amostras da microrregião 3, totalizando 41 amostras positivas (5,07%) do total de amostras coletadas. O índice relatado para a microrregião 3 foi estatisticamente significativo (P<0,05) quando comparado aos índices encontrados para as outras duas microrregiões. Embora as taxas encontradas tenham sidas abaixo das esperadas quando comparadas com as já publicadas para esta região, ainda fornecem riscos aos consumidores, principalmente por meio da contaminação cruzada com alimentos que serão consumidos crús, sendo necessários controles maiores na cadeia produtiva e abate dos frangos. Com relação às estações do ano, os índices de Campylobacter termofílicos não foram estatisticamente significativos (P<0,05), porém, faz-se necessário uma avaliação por um período maior de tempo, já que houve uma tendência numericamente positiva com relação ao verão

Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-03-15T13:03:38Z No. of bitstreams: 1 PGCA16MA207.pdf: 1011799 bytes, checksum: cc3f945283e9dbd2cb016b09c05e7f70 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-15T13:03:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCA16MA207.pdf: 1011799 bytes, checksum: cc3f945283e9dbd2cb016b09c05e7f70 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Capes / Yersinina enterocolitica is a Gram-negative bacteria with zoonotic potential. It is associated with the occurrence of enteric diseases in humans. Pigs are considered the main source of Y. enterocolitica and the bacteria is mainly found in the pig’s palatine tonsils. The objective of this study was to evaluate the occurrence of pathogenic Y. enterocolitica in palatine tonsils of healthy pigs from Santa Catarina, during the slaughter process. In order to achieve this goal, a multiplex PCR technique was performed so as to detect the presence of virulence genes (ail, yadA and virF). This technique was compared to quantitative real time PCR (qPCR), only for the ail gene. Palatine tonsils were randomly collected from 400 pigs from four federally inspected slaughterhouses of the state of Santa Catarina. One positive sample was found for the three studied virulence genes, which were confirmed by DNA sequencing. The analysis of partial sequences of the three virulence genes identified three unique amino acid changes, one in the virF gene and two in YadA gene. This sample had 11.058.398 molecules/μL detected by qPCR. By comparing the two techniques, qPCR was 100 times more sensitive than standard PCR. This result shows low occurrence of pathogenic Y. enterocolitica in healthy pigs from federally inspected slaughterhouses in Santa Catarina / Yersinia enterocolitica é uma bactéria Gram-negativa emergente que possui potencial zoonótico e está associada a quadros de infecção alimentar em humanos. Os suínos são considerados o principal reservatório de Y. enterocolitica, abrigando-a principalmente nas tonsilas. Tendo em vista a carne suína como uma das mais consumidas no mundo e a importância deste agente zoonótico, o objetivo deste trabalho foi avaliar a ocorrência de Y. enterocolitica patogênica em tonsila de suínos no momento do abate no estado de Santa Catarina. Para isto, foi utilizada uma PCR convencional multiplex que detecta a presença de genes de virulência (ail, yadA e virF) e comparou-se esta técnica com a PCR quantitativa em tempo real (qPCR), somente para o gene ail. Foram coletadas aleatoriamente tonsilas de 400 suínos provenientes de quatro frigoríficos com inspeção federal em diferentes regiões do estado. Foi realizado o sequenciamento do DNA dos genes amplificados das amostras positivas na cPCR e posteriormente foi feita a análise filogenética. Apenas uma amostra foi positiva para os três genes pesquisados na PCR convencional, os quais foram confirmados por sequenciamento. A análise das sequências parciais dos três genes de virulência identificou três mudanças de aminoácidos exclusivas, sendo uma no gene virF e duas no gene yadA. Na qPCR esta amostra apresentou 11.058.398 moléculas/μL. Ao comparar as duas técnicas, a qPCR foi 100 vezes mais sensível que a PCR convencional. Isso demonstra uma baixa ocorrência de Y. enterocolitica patogênica em suínos sadios ao abate em frigoríficos com inspeção federal em Santa Catarina