Autorius: Aušra Lozoraitytė Tema: Listeria monocytogenes padermių, išskirtų iš mažmeninėje rinkoje parduodamų žuvų produktų, identifikavimas ir serotipavimas molekuliniais tyrimo metodais Darbo vadovas: prof. dr. Artūras Stimbirys Atlikimo vieta: Darbas 2012-2014 metais atliktas Lietuvos sveikatos mokslų universitete, Veterinarijos akademijoje, Maisto saugos ir kokybės katedroje. Darbo dydis: 52 puslapiai, 10 lentelių, 17 paveikslų. Darbo tikslas: palyginti Listeria monocytogenes identifikavimui naudotus standartinį ir molekulinį metodus. Atlikto darbo tyrimų objektas yra Listeria monocytogenes, kuri buvo išskiriama iš mažmeninėje rinkoje parduodamų šaltai rūkytų žuvų (lašišų) produktų. Tyrimai atlikti tarpusavyje derinant standartinius mikroorganizmų kultivavimo metodus ir molekulinius DNR analizės metodus. Tyrimų metu buvo ištirta 160 šaltai rūkytų žuvų produktų, t. y. lašišų papilvės, lašišų gabalėliai, lašišų file ir lašišų nugarėlės. Tyrimo metu nustatyta, kad šaltai rūkytų žuvų užkrėstumas listerijomis priklauso nuo produkto rūšies. Šaltai rūkytų lašišų papilvėse užkrėstumas listerijomis yra 7,5 karto didesnis nei lašišų nugarėlėse (p<0,05), 1,8 karto nei lašišų gabalėliuose (p<0,05) ir 30 kartų didesnis nei lašišų file (p<0,05). Mikrobiologinių tyrimų metu nustatyta, kad 32,5 % (p<0,05) žuvų produktų mėginių buvo užkrėsti L. monocytogenes, o atlikus dauginę PGR nustatyta, kad L. monocytogenes buvo užkrėsti 23,13 % mėginių (p<0,01). Tai įrodo, kad molekuliniai tyrimo... [toliau žr. visą tekstą] / Author: Ausra Lozoraityte Subject: The molecular research methods in the identification and serotyping of Listeria monocytogenes strains in fish products in retail Supervisor of the work: prof. dr. Arturas Stimbirys Location: The study was conducted in the Food Safety and Quality Department of Veterinary Academy of the Lithuanian University of Health Sciences, in 2012-2014. Scope of the work: 52 pages, 10 tables, 17 figures. The aim of the work: Identification of the Listeria monocytogenes by comparing molecular and standard methods. The study object is Listeria monocytogenes, which is found in the cold smoked fish (salmon) products, sold in the retail market. The study has been carried out combining standard micro-culture cultivation and molecular DNA analysis methods. 160 cold-smoked fish products, i. e. underbellies of the salmon, salmon pieces, salmon fillet and backs of the salmon was investigated during in the study. Also it was found that contamination of the cold smoked fish products with listeria depends on the type of the product. Contamination with listeria in the underbellies of the salmon is 7.5 times higher, than in the backs of the salmon (p<0.05), 1.8 times higher, than in the pieces of salmon (p<0.05) and 30 times higher, than in the salmon fillet (p<0.05). Microbiological researches showed that 32.5 % (p<0.05) of the fish products samples were infected with L. monocytogenes, and after the multiplex PCR was found that 23.13 % of samples (p<0.01) were... [to full text]

Flavobacterium columnare yra gerai žinomas patogenas sukeliantis kolumnariozę, ir kurio sukeliama liga paliečia gėlavandenes žuvis: tiek akvariumines, tiek žuvivaisos įmonėse, tiek gyvenančias natūraliose gamtinėse sąlygose. Bakteriją pirmą kartą 1922 metais aprašė Herber Spencer Davis, ir jai suteikė pavadinimą, kuris vėliau kelis kartus keitėsi (Bacillus columnaris, Cytophaga columnaris, Chondrococcus columnaris, Flexibacter columnaris) kol buvo pripažintas Flavobacterium columnare pavadinimas, kuris dabar naudojamas. Jungtinėse Amerikos Valstijose ši bakterija atneša labai didžiulius nuostolius. Registruotais duomenimis 2003 m. kolumnaris liga nusinešė daugiau nei 30 milijonų JAV dolerių vien tik iš šamų pramonės. F. columnare dažniausiai pasižymi tuo, kad sukelia žiaunų nekrozę, pelekų erozijas ir žvynų pažeidimus. Išauginta ant Cytophaga agaro kolonija dažniausiai būna rizoidinio tipo, adhezyvi, gelsvos spalvos (dėl pigmento fleksirubinino). Raudonųjų Kongo dažų absorbcija – vienas labiausiai patikimiausių biocheminių testų. Taip pat egzistuoja ir kiti diagnozavimo metodai – serologiniai, molekuliniai. Šios ligos prevencijai reikia reguliariai naudoti kalio permanganatą, vario sulfatą ar kitą dezinfekcinę medžiagą, kuri naikina F. columnare bakterijas. Jei tenka gydyti – visai neseniai pasirodė tyrimai, kuriuose buvo aprašytas fagų panaudojimas. Jie pasižymi kolonijų augimą stabdančiu ar bakterijas naikinančiu poveikiu, tačiau dar reikia atlikti daugybę tyrimų norint... [toliau žr. visą tekstą] / Flavobacterium columnare is a well known worldwide pathogen, causative agent of Columnaris disease, elicting significant problems in freshwater fish including aquariums, culture places, natural surroundings. The first time the bacteria was described and named by Herber Spencer Davis. The name has changed for several times till reached the one is used now (Bacillus columnaris, Cytophaga columnaris, Chondrococcus columnaris, Flexibacter columnaris). In the industry of USA catfish this pathogen causes millions of dollars of losses. According to the statistics of the year 2003, the industry lost more than 30 millions of dollars of income. F. columnare in fish infections may cause skin lesions, fin erosions and gill necrosis, with a high degree of mortality. Cultured on Cytophaga agar grows mostly in rhizoit type very much adhesive collonies coloured in yellow due to pigment flexirubinin. One of the most revieling biochemical tests – absorbance of Congo red dye. Also it can be diagnosed by many serological and molecular assays. Preventive control should be used regularly involving potassium permanganate, copper sulphate or other desinfecant, which is available for F. columnare on the market. The latest treatment described for columnariosis is based upon phages which prevent the growth of F. columnare or kill it, but there are many studies to be done before making any conlusions. The aim of the research – to evaluate morfophysiological status and infestation with Flavobacterium... [to full text]