Les carcinoïdes pulmonaires, les carcinomes neuroendocriniens à grandes cellules (LCNEC) et les mésothéliomes malins sont des tumeurs thoraciques rares, dont l'incidence a augmenté au cours des dernières années. Le diagnostic de ces tumeurs est soumis à la variabilité inter-observateur et les opportunités thérapeutiques sont limitées. De grandes études génomiques visant à les caractériser au niveau moléculaire pourraient aider à mieux comprendre les mécanismes sous-jacents à leur développement et faciliter le diagnostic et le traitement de ces maladies. Mon projet de thèse visait à combler les lacunes dans la compréhension des carcinoïdes pulmonaires, des LCNEC et du mésothéliome péritonéal malin. À la suite des travaux entrepris au cours de ma thèse, nous avons constaté que (1) de la même manière que le mésothéliome pleural, les mésothéliomes péritonéaux sont également caractérisés par des mutations conduisant à la perte d'expression de BAP1, facteur de bon pronostic, (2) les patients atteints d’un LCNEC conservant une expression de RB1 présentent de meilleurs résultats lorsqu’ils sont traité avec une chimiothérapie du cancer du poumon non à petites cellules par rapport à une chimiothérapie du cancer du poumon à petites cellules, (3) les carcinoïdes pulmonaires peuvent être classés en trois groupes moléculaires pertinents sur le plan clinique, et (4) , l'identification de supra carcinoïdes confirme l'existence d'un lien moléculaire entre les néoplasmes neuroendocriniens pulmonaires de faible et de haut grade / Pulmonary carcinoids, large-cell neuroendocrine carcinomas (LCNEC), and malignant mesotheliomas are rare thoracic tumours, which incidence has been increasing over the past years. The diagnosis of these tumours is subjected to inter-observer variability and the therapeutic opportunities are limited. Large genomic studies to characterize them at a molecular level might help to better understand the mechanisms underlying their development, and to help the diagnosis and treatment of these diseases. My thesis project aimed to fill the gap in the understanding of pulmonary carcinoids, LCNEC, and malignant peritoneal mesothelioma. As result of the work undertaken during my thesis, we found that (1) similarly to pleural mesothelioma, peritoneal mesotheliomas are also characterised by mutations leading to the loss of expression of BAP1, which is a factor of good prognostic, (2) LCNEC patients with a remaining expression of RB1 have a better outcome when treated with non-small cell lung cancer chemotherapy in comparison to small-cell lung cancer chemotherapy, (3) pulmonary carcinoids can be classified in three clinically-relevant molecular groups, and (4), the identification of supra carcinoids supports a molecular link between the low and high-grade lung neuroendocrine neoplasms