Made available in DSpace on 2014-07-29T15:26:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese caritas medicina tropical.pdf: 1784866 bytes, checksum: b85c7ab5508fd90ff809159f179430cc (MD5) Previous issue date: 2009-02-17 / Objectives: (i) to identify risk factors for S. pneumoniae penicillin nonsusceptible isolates (PNSp) in children attending day-care centers (DCCs) in Goiânia, Brazil and to assess the genetic patterns of pneumococcal isolates; (ii) to estimate the coverage for carriage serotypes for the 7-valente (PCV7) pneumococcal conjugate vaccine, and for the investigational 10 (PCV10) and 13-valent (PCV13) vaccines; (iii) to assess the genetic relatedeness between isolates expressing capsular type 14 and those non(sero)- typeable isolates (NTPn); (iv) to investigate if carriage isolates match genetically to any international pneumococcal clone (PMEN network). Methods: A cross-sectional survey of carriage PNSp was conducted among 1.192 children, 2 months to 5 years of age, attending 62 DCCs in Central Brazil. Capsular typing was performed in PNSp isolates (CLSI, 2007) and in a sample of isolates susceptible to penicillin (PSSp) matched to PNSp and DCCs whenever possible. Serotyping was performed by Quellung reactions and confirmed by multibead assay. NTPn isolates and serotype 14 were tested by PCR for capsule genes. Odds ratio for PNSp carriage and respective 95% confidence interval (95%CI) were assessed by logistic regression. Pulsed field gel electrophoresis (PFGE) was applied to assess the genetic similarity between PNSp serotype 14 and NTPn isolates. PCR was performed for the presence of pneumococcal capsule gene locus. For comparison purpose we also evaluated the genetic profile of PNSp serotype 14 invasive strains derived from the current pneumococcal invasive disease surveillance for the same pediatric population. Isolates were epidemiologically related if they shared &#8805;80% similarity on the dendrogram (Dice coefficient). A cluster was defined as three or more related isolates. Results: A total of 686 pneumococci were isolated for a colonization rate of 57.6% and 178 (25.8%) were PNSp. Among the PNSp isolates the usual common types were found: 14 (53%), 23F (10.2%), 6B (6%), 19F (4.8%) and 19A (4.2%). PSSp isolates displayed 30 different serotypes although serotype 14 was the most common. Overall a high prevalence of NTPn (11.1%) was observed with 62.9% PNSp. Serotypes coverage xvi for the PCV7, PCV10 and PCV13 vaccines were 55.2%, 55.9% and 65.1%, respectively. Being less than 24 months of age (OR=1.79; p=0.006), hospitalization in the previous three months (OR=2.19; p=0.025), and recurrent acute otitis media (OR=2.89; p=0.013) were independently associated with PNSp in a multivariate model. Among the 123 PNSp submitted to PFGE (106/carriage and 17/ invasive isolates) a major group of 34 serotype 14 strains (8 invasive and 26 carriage) was identified and found to be genetically related to the global pneumococcal clone Spain 9V-3 (82.7% similarity). All NTPn presented capsule gene locus and 10 (45.4%) of them presented capsule gene locus to type 14. Conclusions: (i) DCC attendees with history of recurrent AOM could significantly contribute to the spread of nasopharyngeal PNSp strains into the community; (ii) epidemiologic and molecular evidences support the findings that pneumococcal nonypeable carriage isolates are genetically similar to carriage and invasive isolates expressing capsular type 14; (iii) carriage and invasive isolates circulating in Goiânia belong to a serotype 14 variant of the Spain 9V -3 clone and play a critical role in the spread of PNSp strains to the entire pediatric community of Goiânia / Objetivo: (i) identificar fatores associados à colonização nasofaríngea por S. pneumoniae não suscetíveis à penicilina em crianças que frequentam creches no município de Goiânia-GO e caracterizar geneticamente as cepas não suscetíveis; (ii) determinar a cobertura das vacinas conjugadas pneumocócicas 7, 10 e 13 valente; (iii) avaliar o relacionamento genético entre cepas do sorotipo 14 e pneumococos não tipáveis (PnNT); (iv) identificar a presença de cepas colonizadoras relacionadas geneticamente aos clones internacionais de S. pneumoniae. Metodologia: Um estudo de prevalência de portador de pneumococo não suscetível à penicilina (SpNP) foi conduzido de agosto a dezembro de 2005, em 1192 crianças de dois a 59 meses de idade, atendidas em 62 creches em Goiânia. Os testes de suscetibilidade antimicrobiana seguiram as recomendações do CLSI de 2007 e a sorotipagem foi realizada pela reação de Quellung e confirmada por ensaio multibead. Isolados PnNT e do sorotipo 14 foram analisados por reação de PCR. Odds ratio para portador de SpNP e respectivos intervalos de 95% de confiança foram estimados por regressão logística. Para avaliar a similaridade genética entre os isolados de portador (sorotipo 14 e PnNT) e isolados invasivos (sorotipo 14) obtidos de crianças de Goiânia utilizou-se amostras de isolados invasivos de um estudo maior de vigilância populacional que vem sendo conduzido desde 2007. Assim, eletroforese em campo pulsado (PFGE) foi utilizada para a tipagem molecular. Definiu-se como linhagem a presença de três ou mais cepas resistentes com similaridade genética &#8805; 80%. Resultados: S. pneumoniae foi isolado de 686 (57,6%) crianças das creches e 178 (25,9%) dessas eram portadoras de SpNS. Sorotipo 14 (53%), 23F (10,2%), 6B (6%), 19F (4,8%) e 19A (4,2%) estavam presentes em 78,2% dos PnNS. Detectou-se alta prevalência (11,1%) de isolados não tipáveis, dos quais 62.9% eram resistentes à penicilina. A cobertura dos sorotipos colonizadores para as vacinas 7-valente, 10- valente e 13-valente foi respectivamente 55,2%, 55,9% e 65,1%. Crianças menores de 24 meses de idade (OR=1,79; p=0,006), hospitalização nos últimos três meses (OR=2,19; p=0,025), e otite média aguda recorrente (OR=2,89; p=0,013) foram fatores xiv independentemente associados com SpNS na análise multivariada. Entre os 123 isolados submetidos à PFGE, 106 eram de nasofaringe de crianças das creches, dos quais 84 expressavam a cápsula tipo 14 e 22 eram isolados PnNT. Todas as cepas invasivas eram sorotipo 14. A maior linhagem agrupou 34 pneumococos do sorotipo 14, com 82,7% de similaridade, os quais foram geneticamente relacionados ao clone Spain 9V-3. Todas as cepas PnNT apresentaram locus para o gene da cápsula para o tipo 14. Houve uma diferença estatisticamente significante entre os valores da CIM para a penicilina entre as três principais linhagens (Krukal-Wallis, p<0,001). Conclusões: (i) crianças com otite média recorrente podem exercer papel importante na disseminação de pneumococos resistentes para a comunidade; (ii) Evidências genéticas apóiam os achados de que cepas de pneumococo não tipáveis assemelham-se ao genótipo das cepas do sorotipo 14; (iii) isolados de portadores e invasivos que circulam em Goiânia pertencem a um sorotipo 14 variante do clone Spain9V-3, responsável pela disseminação da resistência do pneumococo na população pediátrica de Goiânia