Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-03-09T14:09:25Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese Ivan Ricardo 05.03 Ajustada e correta.pdf: 1156151 bytes, checksum: 0fba4df804fe3ebd632eaedacfe2e4f2 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-03-28T12:50:42Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese Ivan Ricardo 05.03 Ajustada e correta.pdf: 1156151 bytes, checksum: 0fba4df804fe3ebd632eaedacfe2e4f2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-28T12:50:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Ivan Ricardo 05.03 Ajustada e correta.pdf: 1156151 bytes, checksum: 0fba4df804fe3ebd632eaedacfe2e4f2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-02-15 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / O melhoramento genético do milho é dinâmico e requer do melhorista uma compreensão multidisciplinar, capacidade de planejamento e execução de atividades voltadas ao âmbito agronômico, cruzamentos, seleções, aplicabilidade de modelos biométricos, obtenção de genótipos produtivos egrãos biofortificados. Os objetivos do presente trabalho foram: 1) Estimar os componentes de variância e parâmetros genéticos (REML), as correlações lineares fenotípicas, genéticas, de ambiente e canônicas para os caracteres de interesse agronômico em milho; 2) Identificar as associações lineares, de causa e efeito entre os caracteres e a estabilidade pelo método de Annicchiarico da proteína bruta dos grãos do milho cultivado em quatro diferentes ambientes; 3) Determinar as associações lineares, as estimativas dos parâmetros genéticos e a heterose de compostos bioativos e micronutrientes em híbridos intervarietais de milho; 4) Estimar a heterose, os componentes de variância e parâmetros genéticos mais relevantes, utilizar uma abordagem multivariada para definir perfis de herdabilidade com sentido restrito para os componentes do rendimento e nutricionais em progênies de meios-irmãos de milho;5) Estimar os componentes de variância e parâmetros genéticos (REML/BLUP) de um dialelo intervarietal, selecionar e predizer os melhores genótipos para os componentes de rendimento do milho. As principais conclusões obtidas foram: 1) evidenciou-se a maior contribuição da variação genética na interação genótipos x ambientes e herdabilidade com sentido amplo para o diâmetro da espiga, número de fileiras de grãos da espiga e diâmetro do sabugo; 2) o aumento da altura de planta, massa de mil grãos e do rendimento de grãos reduz o teor de proteína bruta no grão do milho; 3) a espessura e a coloração das sementes, fenóis totais, radical antioxidante ABTS e zinco são incrementados através dos efeitos da heterose intervarietal; 4) a herdabilidade com sentido restrito entre e dentro das progênies são superiores para o teor de manganês, glicina, prolina e triptofano nos grãos do milho; 5) os genitores paternos e a fração genética aditiva são determinantes ao índice relativo para o volume do grão, entretanto, a massa de10 cem grãos e o rendimento de grãos são determinados pela capacidade específica de combinação intervarietal. / The genetic breeding of maize is dynamic and requires a multidisciplinary comprehension from the breeder, ability to plan and execute agronomic activities, crosses, selections, applicability of biometric models, obtaining of productive genotypes and biofortified grains. The objectives of the present work were: 1) To estimate the variance components and genetic parameters (REML), the linear phenotypic, genetic, environmental and canonical correlations for the traits of agronomic interest in maize; 2) To identify the linear, cause and effect associations between traits, and the stability by Annicchiarico´s method of the crude protein of maize grains cultivated in four different environments; 3) To determine the linear associations, to estimate genetic parameters and heterosis of bioactive compounds and micronutrients in maize intervarietal hybrids; 4) To estimate heterosis, components of variance and the most relevant genetic parameters, to use a multivariate approach to define narrow sense heritability profiles for yield and nutritional components in maize half-sibling progenies; 5) To estimate the variance components and genetic parameters (REML/BLUP) of an intervarietal diallel, to select and predict the best genotypes for maize yield components. The main conclusions were: 1) the greatest contribution of genetic variation in the genotypes x environments interaction and broad sense heritability was verified for spike diameter, number of rows in the ear, and cob diameter; 2) the increase of plant height, mass of a thousand grains and grain yield reduces crude protein content in maize grain; 3) the thickness and color of the seeds, total phenols, antioxidant radical by ABTS and zinc content are increased through the effects of intervarietal heterosis; 4) the narrow sense heritability among and within the progenies are superior for manganese, glycine, proline and tryptophan content in maize grains; 5) male genitors and the additive genetic fraction are determinant to the grain volume relative index, however, the mass of one hundred grains and grain yield are determined by the intervarietal specific combining ability.

O objetivo geral deste trabalho foi avaliar aspectos fenotípicos e genéticos de características de crescimento, temperamento e repelência em bovinos da raça Nelore. As características analisadas neste trabalho foram peso ao nascer (PN, N=13.374), peso a desmama (PD, N=19.835), peso ao sobreano (P18M, N=15.291), ganho de peso da desmama ao sobreano (GP345, N=12.873), ganho de peso da desmama ao sobreano diferenciado (GP345DIF, N=12.873), temperamento (TEMP, N=13.253) e repelência (REP, N=1.859). O arquivo de pedigree foi constituído por 30.233 animais. Os componentes de variância, (co)variância, parâmetros genéticos, bem como as predições dos valores genéticos foram estimados por máxima verossimilhança restrita (REML). As estimativas de herdabilidade observadas para PN, PD, P198M, GP345, GP345DIF, TEMP e REP foram 0,22, 0,34, 0,34, 0,12, 0,12, 0,15 e 0,18, respectivamente. As estimativas de correlação genéticas verificadas foram 0,50 (PD e PN), 0,96 (PD e P18M), 0,49 (PD e GP345), 0,55 (PD e GP345DIF), 0,41 (PD e TEMP) e 0,20(PD e REP). As tendências fenotípicas para as características avaliadas foram todas negativas (P<0,01), a exceção de PD (P>0,05). As tendências genéticas para as características avaliadas foram todas positivas (P<0,01), a exceção de REP (P<0,01) que apresentou tendência negativa. As taxas de endogamia individual, paterna e materna apresentaram comportamento crescente (P<0,01) ao longo do período de estudo. Foram verificados efeitos significativos dos coeficientes de endogamia individuais sobre todas as características avaliadas, a exceção de TEMP. Os coeficientes de endogamia paternos influenciaram significativamente as características P18M, GP345 e GP345DIF. Por outro lado, a endogamia materna influenciou significativamente as características PD, GP345 e GP345DIF. / The general aim of this study was evaluated phenotypic and genetic aspects to growth traits, temperament and resistance in Nelore beef cattle. The traits analyzed in this study were birth weight (BW, N=13,374), weaning weight (WW, N=19,835), weight to over year (W18M, N=15,291), weight gain from weaning to over year (WG345, N=12,873), differentiated weight gain from weaning to over year (WG345DIF, N=12,873), temperament (TEMP, N=13,253) e resistance (RES, N=1,859). The pedigree information was composed by 30,233 animals. Variance and (co)variance components, genetic parameters, as well as predict breeding values were estimated using restricted maximum likelihood analyses (REML). Heritability estimates for BW, WW, W18M, WG345, WG345DIF, TEMP and RES were 0.22, 0.34, 0.34, 0.12, 0.12, 0.15 e 0.18, respectively. The genetics correlations verified were 0.50 (WW and BW), 0.96 (WW and W18M), 0.49 (WW and WG345), 0.55 (WW and WG345DIF), 0.41 (WW and TEMP) and 0.20 (WW and RES). All phenotypic trends to the evaluated traits were negatives (P<0.01), except for WW (P>0.05). All genetic trends to the evaluated traits were positives (P<0.01), except for RES (P<0.01) which presented negative trend. The individual, paternal and maternal inbreeding rates showed increasing behavior (P<0.01) along the study period. Were verified significant effects of individual inbreeding coefficients in all evaluated traits, except for TEMP. The paternal inbreeding coefficients affected significantly the W18M, WG345, WG345DIF traits. Even so, the maternal inbreeding coefficients affected significantly the WW, WG345, WG345DIF traits.

O presente estudo foi subdividido em duas partes: análises genéticas e análises econômicas. A primeira teve por objetivos definir modelos de avaliação genética para as características de desempenho e carcaça em uma linhagem comercial de frangos e estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos para essas características. A segunda parte teve por objetivos derivar os ponderadores econômicos para essas características de acordo com dois segmentos de mercado de carne de frango e propor índices econômicos de seleção para esses segmentos. As características avaliadas foram: taxa de conversão alimentar (CA), peso corporal à seleção juvenil (PC), pesos de carcaça (PCAR), carne de peito (PPEI) e pernas (PPER), rendimentos de carcaça (RCAR), carne de peito (RPEI) e pernas (RPER). As estimativas dos componentes de (co)variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança restrita utilizando os programas MTDFREML e VCE-6. O teste de razão de verossimilhança foi utilizado para verificar qual o modelo mais adequado à avaliação genética para cada característica. Para a obtenção dos ponderadores econômicos foi desenvolvido um modelo bioeconômico determinístico e a análise econômica foi simulada para uma cadeia de produção de frangos integrada. Foi proposto um índice de seleção para o segmento de mercado frango inteiro e outro para cortes de frango. Foram obtidas estimativas de correlação por postos de Spearman entre os valores preditos pelos dois índices para três intensidades de seleção. Os efeitos de ambiente permanente materno e genético aditivo materno foram significativos (P<0,01) para todas as características. As estimativas de herdabilidade direta e materna foram 0,29 e 0,02 para CA, 0,45 e 0,05 para PC, 0,17 e 0,04 para PCAR, 0,26 e 0,06 para PPEI, 0,22 e 0,02 para PPER, 0,31 e 0,02 para RCAR, 0,53 e 0,04 para RPEI, e 0,44 e 0,02 para RPER, respectivamente. Os ponderadores econômicos foram -1,1783 R$/ponto para CA, 0,007 e 0,006 R$/g para PC respectivamente para o segmento de mercado frango inteiro e cortes de frango, 0,0552, 0,0758 e 0,0629 R$/% para RCAR, RPEI e RPER, respectivamente. Os resultados sugerem que todas as características podem ser selecionadas esperando progresso genético na população estudada. Os efeitos maternos foram importantes, mesmo de pequena magnitude (0,02 a 0,06), e devem ser considerados nos modelos de avaliação genética a fim de obter maior acurácia da predição dos valores genéticos individuais. A CA representou relevante impacto econômico para os dois segmentos de mercado. Para o segmento de mercado cortes de frango, as características de carcaça foram quase tão importantes quanto às de desempenho. A classificação das aves gerada pelos dois índices foi alterada à medida que diminuiu a proporção de aves selecionadas. Portanto, índices de seleção distintos devem ser considerados nos programas de melhoramento de frangos enquanto segmentos diferentes de mercado de carne de frango na proposta de maior eficiência econômica da utilização do mérito genético predito. / The present research was subdivided in two parts: genetic analyses and economic analyses. The first part was conducted to determine models for genetic evaluation of performance and carcass traits in a commercial broiler line and to estimate genetic and phenotypic parameters for these traits. The second part was conducted to derive economic weights for these traits according to two market segments of broiler meat and to propose economic selection indexes for these segments. The traits analyzed were: feed conversion ratio (CA), body weight at juvenile selection (PC), carcass (PCAR), breast meat (PPEI) and leg (PPER) weights, and carcass (RCAR), breast meat (RPEI) and leg (RPER) yields. Estimates of the (co)variance components were obtained by the restricted maximum likelihood method by the software MTDFREML and VCE-6. The likelihood ratio test was applied in order to verify which model was more adapted to the genetic evaluation for each trait. A deterministic bioeconomic model was developed for the derivation of economic weights and the economic analysis was simulated for an integrated broiler production system. It was proposed a selection index for the market segment of whole carcass and another for cuts. Spearman correlation estimates among predicted values from the two indexes were obtained for three selection intensities. For all traits, the maternal genetic and permanent environmental effects were significant (P<0.01). The estimates of direct and maternal heritability were 0.29 and 0.02 for CA, 0.45 and 0.05 for PC, 0.17 and 0.04 for PCAR, 0.26 and 0.06 for PPEI, 0.22 and 0.02 for PPER, 0.31 and 0.02 for RCAR, 0.53 and 0.04 for RPEI, and 0.44 and 0.02 for RPER, respectively. The economic weights were -1.1783 R$/point for CA, 0.007 and 0.006 R$/g for PC respectively for the market segment of whole carcass and cuts, 0.0552, 0.0758 and 0.0629 R$/% for RCAR, RPEI and RPER, respectively. The results suggest that traits analyzed can be selected and genetic progress will be expected. Maternal effects were important, even of small magnitude (0.02 to 0.06), and should be considered in genetic evaluation models in order to obtain accurate prediction of the breeding values of the individuals. The CA represented significant economic impact for the two market segments. For the market segment of cuts, carcass traits were almost as important as the performance traits. The classification of chickens generated by the two selection indexes was changed as the proportion of selected chickens decreased. Therefore, different selection indexes should be considered in broiler breeding programs while different segments of broiler meat market in the proposal for greater economic efficiency in the use of predicted genetic merit.

A avicultura é uma das principais atividades agropecuárias no Brasil, no entanto apresenta grande dependência de material genético importado. Além disso, o crescente interesse por produtos avícolas oriundos de sistemas alternativos de criação, onde as aves são criadas fora das gaiolas, pode exigir animais mais adaptados a esse sistema de criação bem como ao clima tropical brasileiro. Desta forma, dois estudos foram desenvolvidos. No primeiro, o objetivo foi estimar os parâmetros genéticos para características de produção e qualidade dos ovos de oito linhagens de galinhas caipiras. Foram utilizadas as medidas de idade à primeira postura (IPP), produção total de ovos até a 45ª semana (PROD), peso do ovo (PO), altura do albúmen (AA), cor da gema (CG), unidades Haugh (HU), resistência da casca (RC), espessura da casca (EC), peso da gema (PG) e peso da casca (PC) de 2030 ovos, oriundos de 645 aves. Os componentes de variância foram obtidos por meio de um modelo misto animal, onde foram incluídos os efeitos fixos de grupo de contemporâneas, corredor da gaiola e linhagem da galinha e os efeitos genético aditivo, ambiente permanente e residual. As herdabilidades variaram de 0,03 a 0,33. As correlações genéticas entre PROD e as características de qualidade dos ovos foram negativas e variaram entre -0,42 e -0,05. Correlações genéticas altas e positivas, entre 0,36 e 0,69, foram estimadas entre as características de qualidade externa do ovo. No segundo estudo, o objetivo foi estimar os parâmetros genéticos para características de cor da casca do ovo, bem como as correlações genéticas e fenotípicas entre estas características e as características de produção e qualidade dos ovos avaliadas no primeiro estudo. Foram realizadas análises colorimétricas (coordenadas L*, a*, b*, do sistema de cor CIELab) de 1142 ovos oriundos de 597 aves. As herdabilidades estimadas para estas coordenadas variaram de 0,35 a 0,48 e as correlações genéticas entre elas foram altas. No geral, as correlações genéticas entre a cor da casca e as características de qualidade do ovo foram baixas, sugerindo que a cor da casca não influencia a qualidade interna e externa do ovo. / Poultry farming is one of the main agricultural activities in Brazil, but it is highly dependent on imported genetic material. Moreover, the growing interest in poultry products from cage-free systems may require animals better adapted to free- range systems and tropical climate. Regarding this subject, two studies were developed. The aim of the first one was to estimate genetic parameters for egg production and egg quality traits in eight alternative poultry lines. The traits of interest were age at first egg (AFE), total egg production up to the 45th week (PROD), egg weight (EW), albumen height (AH), yolk color (YC), Haugh units (HU), eggshell strength (ESS), eggshell thickness (EST), yolk weight (YW) and eggshell weight (ESW). Phenotypic records of 645 laying hens and 2030 eggs were used. Variance components were estimated from a mixed animal model, which included the fixed effects of contemporary groups, cage location and hen line, and the additive genetic, permanent environmental and residual effects. Heritabilities ranged from 0.03 to 0.33. Genetic correlations between PROD and egg quality traits were negative and varied between -0.42 and -0.05. High and positive genetic correlations were estimated between eggshell quality traits. In the second study, the aim was to estimate genetic parameters for eggshell color and also genetic and phenotypic correlations between eggshell color and egg quality traits which were evaluated in the first study. Color coordinates from CIELab color space L* (brightness), a* (red/green scale) and b* (yellow/blue scale) of 1142 eggs were determined. The estimated heritabilities ranged from 0.35 to 0.48 and the genetic correlations between them were high. In general, the genetic correlations between eggshell color and egg quality traits were low, suggesting that the eggshell color does not influence internal and external egg quality.

Made available in DSpace on 2016-08-12T19:15:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JarinaIAD_DISSER.pdf: 514833 bytes, checksum: 641caa6d8e62a6f321b602c8088bf35f (MD5) Previous issue date: 2014-08-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Gherkin (Cucumis anguria L.) is a very common cucurbit but still underutilized in the Brazilian north-northeast. This study aimed to evaluate the genetic potential of two populations of gherkin with germplasm obtained from small farms. Hundred families half-sibs of MCE-20 (fruit with spikes) and MSE-03 (fruit without spikes) populations were evaluated in design in randomized blocks with three replications for the traits fruit weight, number of fruits per plant, longitudinal diameter, transverse diameter, format index, and soluble solids. Both populations have the potential for breeding programs to obtain plants with large fruit (> 90 g) and prolific plants. Indirect selection based on the selection of plants with higher number of fruits per plant is efficient for the selection of families with large fruit, long fruit (IF> 1.3) and prolific plants / O maxixe (Cucumis anguria L.) é uma cucurbitácea muito comum no norte-nordeste brasileiro mas ainda subutilizada. O presente trabalho teve o objetivo de avaliar o potencial genético de duas populações de maxixe obtidas com germoplasma provenientes de pequenas propriedades. Foram avaliadas cem famílias de meio-irmãos das populações MCE-20 (frutos com espículos) e MSE-03 (frutos sem espículos) em delineamento em blocos casualizado com três repetições para os caracteres peso médio do fruto, número de frutos por planta, diâmetros longitudinal e transversal, índice de formato e sólidos solúveis. As populações MCE-20 e MSE-03 têm potencial para programas de melhoramento visando obter plantas com frutos grandes (> 90 g) e prolíficas. A seleção indireta com base na seleção de plantas com maior número de frutos por plantas é eficiente para a seleção de famílias com frutos grandes, compridos (IF > 1,3) e plantas prolíficas. Palavras-chave: Cucumis anguria, parâmetros genéticos, REML-BLUP, ganho genético

Made available in DSpace on 2016-08-12T19:18:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JarinaIAD_DISSER.pdf: 514833 bytes, checksum: 641caa6d8e62a6f321b602c8088bf35f (MD5) Previous issue date: 2014-08-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Gherkin (Cucumis anguria L.) is a very common cucurbit but still underutilized in the Brazilian north-northeast. This study aimed to evaluate the genetic potential of two populations of gherkin with germplasm obtained from small farms. Hundred families half-sibs of MCE-20 (fruit with spikes) and MSE-03 (fruit without spikes) populations were evaluated in design in randomized blocks with three replications for the traits fruit weight, number of fruits per plant, longitudinal diameter, transverse diameter, format index, and soluble solids. Both populations have the potential for breeding programs to obtain plants with large fruit (> 90 g) and prolific plants. Indirect selection based on the selection of plants with higher number of fruits per plant is efficient for the selection of families with large fruit, long fruit (IF> 1.3) and prolific plants / O maxixe (Cucumis anguria L.) é uma cucurbitácea muito comum no norte-nordeste brasileiro mas ainda subutilizada. O presente trabalho teve o objetivo de avaliar o potencial genético de duas populações de maxixe obtidas com germoplasma provenientes de pequenas propriedades. Foram avaliadas cem famílias de meio-irmãos das populações MCE-20 (frutos com espículos) e MSE-03 (frutos sem espículos) em delineamento em blocos casualizado com três repetições para os caracteres peso médio do fruto, número de frutos por planta, diâmetros longitudinal e transversal, índice de formato e sólidos solúveis. As populações MCE-20 e MSE-03 têm potencial para programas de melhoramento visando obter plantas com frutos grandes (> 90 g) e prolíficas. A seleção indireta com base na seleção de plantas com maior número de frutos por plantas é eficiente para a seleção de famílias com frutos grandes, compridos (IF > 1,3) e plantas prolíficas. Palavras-chave: Cucumis anguria, parâmetros genéticos, REML-BLUP, ganho genético

Orientador: João Antonio da Costa Andrade / Resumo: Populações braquíticas têm sido constantemente estudadas no melhoramento de milho, o interesse por cultivares de porte baixo tem aumentado, principalmente por tolerarem plantios adensados, permitindo maior número de plantas por hectare. A prolificidade é um dos principais componentes na produção do milho que além da estabilidade de produção permite maior eficiência na utilização de nutrientes na planta. O objetivo deste trabalho foi verificar a variabilidade genética, para diferentes caracteres, presente nas populações Isanão VF-1 e Isanão VD-1 após sete ciclos de seleção massal para prolificidade. Foram avaliadas 121 progênies de meios irmãos da população Isanão VF-1 e 65 progênies da população Isanão VD-1, ambas populações de milho braquítico, na segunda safra do ano agrícola 2017 (E1) e primeira safra 2017/2018 (E2). Os caracteres avaliados para as duas épocas de semeadura foram enfezamento, tombamento, prolificidade e rendimento de espigas, e apenas para a E2 foram avaliados florescimento feminino, altura de plantas, altura de espigas e rendimento de grãos. Foram estimados parâmetros genéticos e os ganhos esperados com seleção com intensidade de seleção de 20%, para cada época e conjuntamente. Para a população Isanão VF-1 foram estimadas herdabilidades que variaram entre 37,70% e 74,82%, e ganhos de -5,11%, -10,48% para enfezamento, 19,57% e 7,13% para prolificidade, 20,75% e 15,74% para rendimento de espigas na E1 e E2 respectivamente. Para a população Isanão VD-1 as her... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Maize brachytic populations have been constantly studied in maize breeding, the interest for low-growing cultivars has increased, mainly because they tolerate high density of plants. Prolificacy is one of the main components of yield in maize that besides the yield stability allows higher efficiency in the use of nutrients in the plant. The objective of this work was to verify the genetic variability for different carachteres in the Isanão VF-1 and Isanão VD-1 brachytic populations after seven cycles of mass selection for prolificacy. A total of 121 open cross corn progenies from the Isanão VF-1 population and 65 open cross corn progenies from the Isanão VD-1 population, both brachytic maize populations, were evaluated in first crop 2017 (E1) and second crop 2017/2018 (E2). The evaluated traits for the two seasons were corn stunt complex, fall index, prolificacy and ear yield, and only for E2 were evaluated feminine flowering, plant height, ear height and grain yield. Genetic parameters and expected gains with selection, with 20% of intensity, were calculated for each season and jointly. For the Isanão VF-1 population, heritabilities were estimated from 37.70% to 74.82%, and expected gains of -5.11%, -10.48% for corn stunt complex, 19.57% and 7.13% for prolificacy, 20.75% and 15.74% for ear yield at E1 and E2 respectively. For the Isanão VD-1 population the heritabilities varied between 8.01% and 75.36%, and estimated gains were -3.198% and -9.565% for corn stunt complex, 12.... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

SILVA, Tamiris Pereira da. Predição de ganhos genéticos via REML/BLUP em progênies s2 de mamoeiro. 2015. 55 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Agronomia / Fitotecnia, Fortaleza, 2015 / Submitted by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-18T13:36:39Z No. of bitstreams: 1 2015_dis_tpsilva.pdf: 2166972 bytes, checksum: 0de92041ba6608b1e1d6c3eec9dfedde (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-18T13:37:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_dis_tpsilva.pdf: 2166972 bytes, checksum: 0de92041ba6608b1e1d6c3eec9dfedde (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-18T13:37:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_dis_tpsilva.pdf: 2166972 bytes, checksum: 0de92041ba6608b1e1d6c3eec9dfedde (MD5) Previous issue date: 2015 / The reduced number of registered papaya cultivars has made breeders to access the genetic variability of the species in order to gather in one genotype the maximum phenotypes required by producers and consumers. Among the commercial hybrids,Tainung 1 and Calimosa are the most used, which the first has its seeds imported from Taiwan to high costs. In order to increase the accuracy and to obtain selective genetic gain, more efficient selection methodologies have been explored. For this reason, the adoption of more refined genetic statistical procedures is a trend in plant breeding, such as the REML / BLUP methodology. Based on the above, the aims of the present study are: (i) estimate the main genetic parameters in papaya progenies, (ii) predict genetic gain with selection of the best progenies and (iii) the selection of the best individuals within the progenies. The experiment was conducted at the Experimental Field of Curu, which belongs to Embrapa Agroindústria Tropical in the municipality of Paraipaba. The genetic material consisted of 36 S2 progenies and two witnesses, 17 derived from hybrid Calimosa and 19 Tainung1, all evaluated in a randomized block design with four replicates. The analyzed characters were height of first flower, fruit and plant at 6, 12 and 18 months; stem diameter at 6, 12 and 18 months; number of days after planting to emergence of first flower and fruit; number, mass and average mass of marketable fruits and number and mass of carpelloid, pentandric and bananiformes fruits. For data analysis, the methodology via linear mixed models REML / BLUP (Restricted Maximum Likehood / Best Linear Unbiased Prediction) was used, by which genetic parameters were estimated and the prediction of breeding values was made. The magnitudes of the genetic parameters indicated that the variability present in most of the characters enables genetic gain if the selection is practiced at the progenies level and not at individual plants, since the greater heritability and accuracies values are relative to the average of the progenies. For the selection of progenies, PROC-323, PROC-130, PROT-13 and PROC-217 were the most promising, bearing greater genetic gains among most of the analyzed characters. Regarding the selection among and within progenies, individuals 1421 and 1422 are the most potential for continuity of selection. Finally, the increase of the character expression was higher in number of marketable fruits and the reduction of expression was higher for pentandric number of fruits. / O reduzido número de cultivares de mamoeiro registrados, tem feito com que melhoristas acessem a variabilidade genética da espécie, a fim de reunir em um só genótipo o máximo de fenótipos exigidos pelos produtores e consumidores. Dentre os híbridos comerciais, Tainung nº 1 e Calimosa são os mais empregados, onde este primeiro tem suas sementes importadas de Taiwan a altos custos. Tem-se então buscado metodologias mais eficientes de seleção, a fim de aumentar a acurácia seletiva e obter maiores ganhos genéticos. Em razão disto, a adoção de procedimentos genético-estatísticos mais refinados é uma tendência no melhoramento genético de plantas, como a metodologia REML/BLUP. Com base no exposto, objetivou-se com o presente estudo: (i) estimar os principais parâmetros genéticos em progênies de mamoeiro, (ii) predizer os ganhos genéticos com a seleção das melhores progênies e (iii) com a seleção dos melhores indivíduos dentro de progênies. O experimento foi conduzido no Campo Experimental do Curu, pertencente à Embrapa Agroindústria Tropical no município de Paraipaba. O material genético foi constituído de progênies 36 progênies S2 e duas testemunhas, sendo 17 derivadas do híbrido Calimosa e 19 do Tainung nº1, avaliadas no delineamento em blocos casualizados, com quatro repetições. Os caracteres avaliados foram altura de primeira flor, fruto e planta aos 6, 12 e 18 meses; diâmetro de caule aos 6, 12 e 18 meses; quantidade de dias após plantios para surgimento da primeira flor e fruto; número, massa e massa média de frutos comerciais e número e massa de frutos carpelóides, pentândricos e bananifornmes. Para análises dos dados, a metodologia utilizada foi via modelos lineares mistos REML/BLUP (Restricted Maximum Likehood/ Best Linear Unbiased Prediction), onde foram estimados os parâmetros genéticos e feita a predição dos valores genéticos. As magnitudes dos parâmetros genéticos estimados indicaram que a variabilidade presente para a maioria dos caracteres, possibilita maiores ganhos genéticos se a seleção for praticada a nível de progênies e não por plantas individuais, já que os maiores valores de herdabilidades e acurácias são relativos a média de progênies. Para a seleção entre progênies, PROC-323, PROC-130, PROT-13 e PROC-217, foram as mais promissoras, comportando-se com ganhos genéticos superiores entre maior parte dos caracteres envolvidos. Na seleção entre e dentro de progênies, os indivíduos 1421 e 1422 são os mais potenciais para continuidade da seleção. O aumento da expressividade de caráter foi superior para número de frutos comerciais e a redução da expressividade foi superior para número de frutos pentândricos.

A raça Brasileiro de Hipismo (BH) consiste em uma população aberta, selecionada para a modalidade Salto, entre outros esportes equestres. Os objetivos deste estudo consistiram na pesquisa de parâmetros genéticos para características avaliadas subjetivamente durante a Aprovação de Garanhões, e suas correlações genéticas com medidas de desempenho esportivo em competições de salto. A estimativa de indicadores de variabilidade genética e descrição da contribuição individual dos ancestrais de maior importância para a geração atual da raça foi também realizada. Três bancos de dados foram utilizados: um com informações genealógicas de 34.393 animais (PEDIGREE); o segundo com avaliações subjetivas das características morfológicas e funcionais de 294 cavalos (APROVAÇÃO) e o terceiro com 54.852 resultados de competições de salto de 1.596 animais (DESEMPENHO). A análise de PEDIGREE foi realizada duas vezes: para a subpopulação de cavalos nascidos até 1995 (ANTERIOR) e para aquela nascida nos últimos 15 anos (15ANOS) representando a geração atual; e permitiu a estimativa dos parâmetros: endogamia (F) individual e média, tamanho efetivo da população (Ne), número efetivo de fundadores (fe), número efetivo de ancestrais (fa) e número de fundadores genoma equivalentes (fg). A análise conjunta das três bases de dados permitiu a estimação de parâmetros genéticos e correlações genéticas entre os aspectos funcionais avaliados subjetivamente em APROVAÇÃO com os resultados de competições oficiais: classificação em cada percurso de salto executado (CLASSI) e pontuação final resultante de cada classificação (PONTF). Os componentes de (co)variância foram obtidos com a aplicação do Modelo Animal, via metodologia de Máxima Verossimilhança Restrita Livre de Derivadas. O parâmetros Ne estimado por aumento na coancestria foi igual a 188.59 (±3.24). O parâmetro fe foi estimado em 466 e 222 para ANTERIOR e 15ANOS; fa representou o número de ancestrais igual a 274 e 129, respectivamente. A diferença encontrada em fe e fa para ANTERIOR e 15ANOS indicou a perda de alelos originais. O aumento na contribuição de alguns fundadores informou a preferência dos criadores por algumas linhagens, sem impactos negativos sobre os níveis de endogamia. As estimativas de herdabilidade (h²) foram de maior magnitude para as características avaliadas em APROVAÇÃO; particularmente para temperamento (h²=0,43), conformação de dorso-lombo (h²=0,42) e de casco (h²=0,40). Em menor grau, foram importantes para outras características morfológicas como: membro anterior (h²=0,37), cabeça-pescoço (h²=0,36), garupa (h²=0,32), aprumos dinâmicos (h²=0,32) e peito-tórax-ventre (h²=0,30). As características funcionais de maior herdabilidade e com correlações genéticas (ϒg) favoráveis com resultados de competição esportiva foram: passo (h²=0,36), mecânica de posteriores no salto (h²=0,36) e galope (h²=0,35). As estimativas para CLASSI (h² entre 0,00 e 0,09) e PONTF (h² entre 0,07 e 0,67) indicaram grande variação ambiental e possibilidade de redução da mesma com a utilização de resultados de eventos específicos, voltados para cavalos com idades padronizadas. As avaliações subjetivas do salto com potencial de resposta favorável à seleção indireta para PONTF, e sem prejuízos à CLASSI, foram elencadas em ordem de importância: potência (ϒg=1,00), mecânica de membros posteriores (ϒg=0,39), respeito (ϒg=0,20), e regularidade (ϒg=0,08). As estimativas de herdabilidade e correlações genéticas obtidas permitem o direcionamento futuro de um programa de seleção baseado em valores genéticos e critérios passíveis de maior resposta à seleção. / Brasileiro de Hipismo (BH) represents an open population under selection for show jumping and other equestrian sports. The objectives of this study consisted in the estimation of genetic parameters for traits evaluated subjectively during the Stallion’s Approval procedure, and their genetic correlations with measures performance in jumping competitions. Indicators of genetic variability and the individual contribution of the most important ancestors for the current generation were also estimated. Three databases were used: one with genealogical information on 34,393 animals (PEDIGREE); the second with subjective assessments of morphological and functional characteristics on 294 horses (APPROVAL) and the third with 54,852 results of jumping competitions on 1,596 horses (PERFORMANCE). PEDIGREE analysis was performed twice: for the subpopulation of horses born until 1995 (PREVIOUS) and the subpopulation of horses born in the last 15 years (15YEARS), representing the current generation. The following parameters were estimated: individual and average inbreeding (F); effective population size (Ne), effective number of founders (fe), effective number of ancestors (fa) and number of founder genome equivalents (fg). Heritability (h²) was estimated for the available traits, as well as genetic correlations between those subjectively evaluated in APPROVAL with the classification in each competition (CLASSI) and the points resulting from each classification (PONTF) in PERFORMANCE. The (co)variance components were estimated by applying the Animal Model, via Derivative-Free Restricted Maximum Likelihood methodology. Phenotypic relationships between the APPROVAL traits and PERFORMANCE were also described. Ne estimated by increase in coancestry was equal to 188.59 (± 3:24). fe was estimated at 466 and 222 for PREVIOUS and 15YEARS subpopulations; fa was equal to 274 and 129, respectively. The difference in fe and fa from PREVIOUS to 15YEARS indicated a loss of alleles. The increase in the contribution of some founders represented the breeder’s preference for some strains, without negative impacts on inbreeding levels. Estimates of heritability (h²) for each trait were greater for the traits evaluated in APPROVAL; particularly for temperament (h²=0,43), conformation of the back (h²=0,42) and hooves (h²=0,40). Additive genetic variance was also important for some other morphological characteristics including: forelimb (h²=0,37), head-neck (h²=0,36), rump (h²=0,32), pace correctness (h²=0,32) and chest-thorax-abdomen (h²=0,30). The functional traits of greater heritability and favorable genetic correlation (ϒg) with jumping performance in competitions (PONTF) were: walk (h²=0,36), hind limbs mechanics during jumping (h²=0,36) and canter (h²=0,35). Estimates for CLASSI (h² from 0,00 to 0,09) and PONTF (h² entre 0,07 e 0,67) indicated strong environmental influence. As lower heritabilities were estimated for performance in competitions with high environmental variation the possibility of reduction of such variation was demonstrated by including exclusively results from specific competitions designed for young horses. Subjective assessments for jumping potential which could provide a favorable response to indirect selection for PONTF, were listed in order of importance: power (ϒg=1,00), hind limbs mechanics during jumping (ϒg=0,39), respect (ϒg=0,20), and regularity (ϒg=0,08). Estimates obtained of heritability and genetic correlations should allow for the future direction of a selection program based on breeding values and scientific criteria.

Submitted by LILIAN CRISTINA ANDRADE DE ARAUJO TEIXEIRA null (lili_crist@hotmail.com) on 2016-03-03T00:05:52Z No. of bitstreams: 1 Tese_Lilian_Cristina_Andrade_de_Araújo_Teixeira.pdf: 1549316 bytes, checksum: 8c099514dd713d5bf0160216b03c05b0 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-03-04T14:26:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 teixeira_lcaa_dr_jabo.pdf: 1549316 bytes, checksum: 8c099514dd713d5bf0160216b03c05b0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-04T14:26:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 teixeira_lcaa_dr_jabo.pdf: 1549316 bytes, checksum: 8c099514dd713d5bf0160216b03c05b0 (MD5) Previous issue date: 2016-01-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A soja [Glycine max (L.) Merrill] é uma leguminosa de ciclo anual que apresenta distintas finalidades, dentre elas, uma crescente vertente relaciona-se ao uso na alimentação humana. Há demanda de cultivares de soja com esta destinação com resistência a patógenos e pragas. Em especial destaca-se o nematoide de cisto da soja (Heterodera glycines) que causa expressiva perda na produtividade. Em virtude do exposto, utilizando topocruzamentos de soja tipo alimento x tipo grão, o objetivo do presente trabalho é: a. Determinar a herança da cor do tegumento, da cor do hilo e da expressão do caráter derramamento de hilo em populações F2:3; b. Determinação do estudo da herança da resistência ao nematoide de cisto da soja (NCS), bem como estimativa do número e modo de ação dos genes envolvidos a fim de contribuir no delineamento de cruzamentos, que envolvem os genitores em estudo, com maior possibilidade de acumular genes que conferem resistência à raça 3 do NCS e; c. Verificar com uma abordagem quantitativa, a adequação das populações a um modelo aditivo-dominante, assim como estimar parâmetros genéticos nos cruzamentos gerados. Utilizaram-se genitores contrastantes, um resistente ao NCS raça 3 (‘BRSMG 810C’) e dois suscetíveis, porém aptos para utilização na alimentação humana (‘BRSMG 790A’ e ‘BRSMG 800A’). Obtiveram-se as gerações F1, RCr, RCs e F2 que foram utilizadas para o estudo da herança da resistência, por meio da segregação do caráter. As avaliações de nematoide foram realizadas utilizando-se como estimador o Índice de Fêmeas (IF) e analisadas pelo teste de Qui-Quadrado (χ2) para testar o ajuste ao modelo proposto para a herança. As sementes F3 provenientes de plantas F2 foram caracterizadas para elucidar a herança para caracteres morfológicos de interesse (cor de tegumento, cor e aspecto de hilo). Para os caracteres morfológicos dos grãos avaliados, os resultados observados se ajustam à proporção esperada considerando a existência de quatro genes (R/I/W/T) controlando a expressão da cor do tegumento e cor do hilo para ambos os cruzamentos. Para o cruzamento ‘BRSMG 810C’ x ‘BRSMG 800A’ genótipos ii impediram a expressão dos genes W e T na pigmentação da semente. Ocorreu variação na expressividade do caráter hilo derramado, com herança monogênica e dominância completa para o fenótipo ausência de derramamento de hilo. Há ligação do locus que confere derramamento do hilo com o genótipo T_ (pubescência marrom). O processo de hibridação foi eficiente na geração de variabilidade. Quanto à avaliação nematológica, as plantas F2 apresentaram dois padrões de segregação aceitos (resistente: suscetível): 1:15 (dois genes recessivos complementares) e 3:61 (um gene dominante e dois recessivos complementares). A herança foi confirmada utilizando-se as plantas do RCr, que segregaram na proporção de 1:7, padrão esperado para herança condicionada por três genes. A hipótese de segregação 1:3 (dois genes) foi rejeitada em RCr. A falta de um dos genes recessivos proporcionou resistência moderada ao NCS raça 3 aceitando-se a hipótese de moderadamente resistente: suscetível na proporção de 3:13 (um gene dominante e um gene recessivo). Assim, nestes cruzamentos, a resistência moderada ao NCS raça 3 é condicionada por dois genes epistáticos (um dominante e um recessivo) e o acúmulo de um terceiro gene recessivo confere resistência completa em relação ao fitonematoide em estudo. Os resultados evidenciam que ambos os cruzamentos apresentam acentuada variabilidade genética em F2. O modelo aditivo-dominante foi suficiente para explicar o caráter, sendo o efeito genético aditivo o mais importante. A resistência ao NCS raça 3 teve grande influência ambiental. De acordo com os resultados obtidos, existe evidência de ganho com seleção em processo seletivo. A herdabilidade no sentido restrito de baixa magnitude indica provável ponderação na pressão de seleção, fato que prioriza a realização de seleção em fase avançada dos programas de melhoramento, como no teste de progênies, para a obtenção de cultivares especiais para a alimentação humana e homozigota para resistência a este fitonematoide. / Soybean [Glycine max (L.) Merrill] is an annual leguminous that has distinct purposes, among them, a growing amount is related to the human feed. There is a demand of cultivars aiming this destination, which are resistant to pathogens and plagues. A special plague is highlighted, the soybean nematode of cyst (Heterodera glycines) (NCS). It causes expressive loss of productivity. Facing this, using soybean topcrosses feed-like x grain-like this work aims: a. determine the tegument color, hilum color, and hilum spread character heritance in F2 populations; b. determine the NCS resistance heritage, as well the involved genes number and action mode estimative in order to contribute in the crosses design, which involve the parents studied, with a higher possibility of accumulation of genes which provide resistance to the NCS race 3; and c. Verify in a quantitative approach the adequacy population in an additive-dominant model, as well estimate the genetic parameter into the crossings. We used contrasting parents, being resistant to the race 3 (‘BRSMG 810C’) and two susceptible, however suitable to the human feed (‘BRSMG 790A’ and ‘BRSMG 800A’). Thus, the generations F1, RCr, RCs, and F2 were created. They were used to study heritage resistance through the character segregation. The nematode evaluations were done using as estimator the Female Index (IF) and they were analyzed by the chi-square test (χ2) to test the adjustment to the suggested model to the heritage. The F3 seeds from the F2 plants were characterized to elucidate the heritage to interest morphologic traits (seed coat color, hilum color and hilum aspect). For the morphological character of grain, the results observed of descendent were adjusted to the expected proportion, considering that there were four genes (R/I/W/T) controlling the expression coat and hilum color to both crossings. At crossing ‘BRSMG 810C’ x ‘BRSMG 800A’, the allele ii genetic owners hindered the expression of genes W and T at seed pigmentation. There was variation in the expression of spread hilum character, presenting monogenic heritance and full dominance to the characteristic. There are locus binding that gives outpouring of spread hilum with T_ locus (brown pubescence). The hybridization process was efficient to obtain genetic variability. Regarding to the nematologic evaluation, F2 plants presented two segregation patterns accepted: (resistant:susceptible) 1:15 (two complementary recessive genes) and 3:61 (one dominant gene and two complementary recessive genes). The heritability was confirmed using the BCr plants, which segregated at 1:7 proportion. Such proportion is expected in heritance conditioned to three genes. The 1:3 segregation hypothesis (two genes) was rejected in BCr. The lack of one of recessive gene provided moderate resistance to NCS race 3, accepting the hypothesis of moderately resistant: susceptible at 3:13 proportion (one dominant and one recessive). Thus, in these crossings, the moderate resistance to NCS race 3 is conditioned by two epistatic genes (one dominant and one recessive) and the accumulation of a third recessive gene provides full resistance to the phytonematodes evaluated in this article. The results highlight that both crossings have high genetic variability in the F2. The additive-dominant model was enough to explain the character, where the most important genetic effect was the additive. The NCS race 3 resistance had a great environmental influence. According to the obtained results, there is an evidence of gain with selection in the selective process. The heritability in the narrow sense of low magnitude indicates a probable weighting in the selection pressure. This fact prioritizes the selection conduction in a more advanced phase of breeding program, like in the progenies test, to obtain special cultivars to feed humans, and in the homozygote to resist to this phytonematode. / CNPq: 1406592012-9 / FAPESP: 2012/15448-4