Orientador: Laura Sterian Ward / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-15T03:45:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos_LuisEduardoMurgeldeCastro_D.pdf: 684034 bytes, checksum: 23d763337837e7c15426a84955a7074e (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Vários estudos já investigaram a associação do polimorfismo do códon 72 de P53 (P53 Arg72Pro) a um risco aumentado para desenvolver câncer de bexiga, com resultados controversos. Aproveitando a diversidade étnica da população brasileira, nós genotipamos 94 indivíduos com câncer de bexiga (76 homens e 18 mulheres; idade 21 - 96 anos; 67 ±13 anos; 79 fumantes e 15 não fumantes), que foram cuidadosamente pareados com 159 indivíduos controle (104 homens e 55 mulheres; idade 20 - 100 anos; 65 ±21 anos; 33 fumantes e 126 não fumantes). A avaliação levou em conta exposição ambiental, fatores alimentares, história ocupacional, tabagismo, condições gerais de saúde e doenças prévias. O genótipo Arg/Pro foi menos frequente na população de pacientes e conferiu um risco 44% menor de câncer de bexiga. A análise de regressão logística univariada também identificou sexo masculino (OR = 6,87, 95% CI = 3,78 - 12,5; P < 0,001), idade acima de 65 anos (OR = 4,44, 95% CI = 2,56 - 7,71; P < 0,001), e tabagismo (OR = 18,61, 95% CI = 9,62 - 36,03; P < 0,001) como importantes fatores de risco para câncer vesical. No entanto, o genótipo P53 Arg72Pro desapareceu como um fator de susceptibilidade numa análise de regressão multivariada e univariada ajustada para sexo, idade e tabagismo, sugerindo que estava conectada a um destes fatores na predisposição ao câncer de bexiga. Além disto, uma análise mais detalhada revelou que o alelo Pro foi menos frequente em pacientes com >=65 anos (23, 88%) do que nos com <65 anos (51,85%) (P = 0,009; P = 0,029). Todos os pacientes e controles apresentaram o tipo selvagem Pro no códon 47. Nós concluímos que P53 Arg72Pro pode não constituir fator independente, mas sim ligado à idade na susceptibilidade ao câncer vesical / Abstract: Several studies have investigated the association between P53 Arg72Pro and an increased risk of developing bladder tumors, with controversial results. Taking advantage of the high admixture rates in the Brazilian population, we genotyped 94 bladder cancer patients (76 males and 18 females; aged 21 - 96 years old; 67 ± 13 years old; 79 smokers and 15 nonsmokers) carefully paired with 159 controls (104 males and 55 females; aged 20 - 100 years old; 65 ± 21 years old; 33 smokers and 126 nonsmokers) with respect to environmental exposure, diet routine, lifetime occupational history, smoking history, general health conditions, and previous diseases. Arg/Pro genotype was under-represented in the patient population, and conferred a 44% lower risk of bladder cancer. Univariate logistic regression analysis also identified male sex (OR = 6,87, 95% CI = 3,78 -12,50; P < 0,001), age over 65 years (OR = 4,44, 95% CI = 2,56 - 7,71; P < 0,001), and smoking habits (OR = 18,61, 95% CI = 9,62 - 36,03; P < 0,001) as important risk factors for bladder cancer. However, the P53Arg72Pro genotype disappeared as a susceptibility factor both in the multivariate regression analysis and in an univariate regression analysis adjusted for gender, age, and smoking, suggesting that it was connected with one of these factors in the predisposition to bladder cancer. Indeed, a further analysis demonstrated that both alleles and genotype variants of P53Arg72Pro are less frequent in older patients (P = 0,029). All the patients and control presented the wild-type Pro genotype at codon 47. We concluded that the effect of P53Arg72Pro, described in some studies as an important risk factor, may not be an independent, but an age-related factor of susceptibility to bladder cancer / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica

A leishmaniose visceral constitui grave doença infecciosa causada por um protozoário parasita intracelular obrigatório. Alguns fatores podem alterar a gravidade das manifestações clínicas, sendo um deles a predisposição genética. Este estudo investigou polimorfismos dos genes TGFB1, IL8 e IL6, que são citocinas relacionadas com o desencadeamento e a gravidade da doença, visando identificar fatores de susceptibilidade. Os polimorfismos TGFB1 -509 C/T e TGFB1 +869 T/C, IL8 -251A/T e IL6 -174G/C foram analisados por PCR-RFLP, em 198 pacientes com leishmaniose visceral (LV), 98 indivíduos com infecção assintomática (teste de hipersensibilidade tardia - DTH+) e 100 indivíduos sem evidências de infecção (DTH-). O alelo T na posição -509 do gene TGFB1 conferiu risco duas vezes maior de desenvolver LV ou ser positivo para o teste DTH (p = 0,007, OR = 1,9 [1,19-3,02]), em comparação com indivíduos DTH-. Os resultados sugerem uma associação do polimorfismo TGFB1 -509C/T com a susceptibilidade à LV, podendo contribuir para o desencadeamento da doença clínica. / Visceral leishmaniasis is a serious protozoan infectious disease caused by an obligate intracellular parasite. Some factors can affect the severity of the clinical manifestations; one of which is genetic susceptibility. This study investigated polymorphisms in the TGFB1, IL8 and IL6 genes, which are cytokines related with the onset and severity of the disease, to look for genetic susceptibility factors. Polymorphisms at TGFB1 -509C/T and +869T/C, and IL8 - 251A/T and IL6 -174G/C were analyzed by a PCR-RFLP technique, in 198 patients with Visceral Leishmaniasis (VL), 98 individuals with asymptomatic infection (positive delayed-type hypersensitivity, DTH+) and 100 individuals with no evidence of infection (DTH-). The T allele of the TGFB1 polymorphism in position -509C/T conferred a two risk fold to develop LV or to be DTH+ (p=0.007; OR=1.9 [1.19 - 3.02]) when compared with DTH- individuals. We suggest the TGFB1 -509C/T polymorphism is associated with susceptibility to LV and may contribute to development of the clinical disease.

O aborto espontâneo recorrente (AER) é caracterizado pela ocorrência de três ou mais abortos consecutivos e acomete 2-4% das mulheres em idade fértil. A etiologia está associada a vários fatores de risco, tais como anomalias uterinas, aberrações cromossômicas, autoimunidade, trombofilias, elevação na concentração de homocisteína (tHcy), porém cerca de 40% dos casos permanece sem causa definida. O metabolismo de unidades de carbono desempenha papel fundamental na disponibilidade de folato na célula, sendo essencial para o desenvolvimento placentário e fetal. Deficiência de vitaminas que regulam este metabolismo, como o ácido fólico, e polimorfismos em genes que codificam enzimas relacionadas ao metabolismo de folato (MTHFR, RFC1, GCP2 e MTHFD1) podem levar à redução das concentrações desta vitamina e ao aumento das concentrações de tHcy. Objetivo foi avaliar a associação entre polimorfismos em genes relacionados ao metabolismo do folato (RFC1, GCP2, MTHFR e MTHFD1) e o risco de se ter AER, bem como avaliar a associação entre estes polimorfismos e as alterações nas concetranções de folato, cobalamina e homocisteína. Foram constituídos três grupos: AER primário: 117 mulheres com AER e nenhum feto viável; AER secundário: 139 mulheres com AER e pelo menos um feto viável; e Controle: 264 mulheres sem história de aborto espontâneo. Nenhuma das mulheres estava grávida no momento da coleta do sangue. Amostras de sangue foram obtidas para dosagens bioquímicas (folato, Cbl, tHcy, entre outras), imunológicas e extração de DNA genômico. As genotipagens foram feitas por PCR-RFLP ou PCR em tempo real. As concentrações séricas de folato e Cbl foram maiores no AER primário e secundário (p<0,05). A distribuição dos genótipos de todos os polimorfismos foi semelhante nos três grupos. O aumento nas concentrações de folato sérico (OR: 1,05, 95% IC: 1,03 - 1,07, p<0,001), Cbl (OR: 1,00, 95% IC: 1,00 - 1,00, p= 0,016), tHcy (OR: 1,03, 95% IC: 0,97 - 1,11, p= 0,033) e T4 (OR: 1,02, 95% IC: 1,00 - 1,03, p= 0,006) e a presença de FAN reagente (1:160) (OR: 2,90, 95% IC: 1,25 - 6,75, p= 0,013) foram considerados fatores de risco para aborto primário. Para o aborto secundário, foram considerados fatores de risco o aumento nas concentrações de folato sérico (OR: 1,04, 95% IC: 1,02 - 1,05, p<0,001), Cbl (OR: 1,00, 95% IC: 1,00 - 1,00, p= 0,019) e tHcy (OR: 1,05, 95% IC: 1,00 - 1,09, p= 0,039), maiores idades (OR: 1,02, 95% IC: 0,98 - 1,06, p= 0,031), hábito de fumar (OR: 2,54, 95% IC: 1,41 - 4,60, p= 0,002) e ter maior IMC (OR:1,42, 95% IC: 1,07 - 1,88, p= 0,015). Os polimorfismos estudados não foram associados ao maior risco de se ter AER, quando analisados isoladamente, e também não foram associados a alterações nas concentrações séricas de folato, Cbl e tHcy, com exceção do genótipo MTHFR 677TT, cujas portadoras apresentaram maior concentração de tHcy, quando comparadas com as portadoras de genótipos 677CC e 677CT nos três grupos. As variáveis concentrações de folato, Cbl, tHcy e T4 e presença de FAN reagente foram associadas ao maior risco de se ter aborto primário. As variáveis idade, IMC, tabagismo, concentrações de folato, Cbl e tHcy foram associadas ao maior risco de aborto secundário. / The recurrent spontaneous abortion (RSA) is characterized by the occurrence of three or more consecutive miscarriages and affects 2-4% of women of childbearing age. The etiology is associated with several risk factors such as uterine abnormalities, chromosomal aberrations, autoimmunity, thrombophilia, increased concentration of homocysteine (tHcy). About 40% of cases remains unknown cause. The units of carbon metabolism plays an essential role in the availability of the cell folate, is essential for the placental and fetal development. A deficiency of the vitamins that regulate this metabolism, like folic acid, and polymorphisms in genes encoding enzymes related to folate metabolism (MTHFR, RFC1, and GCP2 MTHFD1) may lead to decreased concentrations of this vitamin and increased concentrations of tHcy. Objective was to evaluate the association between polymorphisms in genes related to folate metabolism (RFC1, GCP2, MTHFD1 and MTHFR) and the risk of having AER, and to evaluate the association between these polymorphisms and changes in concetranções folate, cobalamin, and homocysteine. Three groups were divided: AER primary: 117 women with RSA and no viable fetus, AER secondary: 139 women with RSA and at least one viable fetus and Control: 264 women with no history of miscarriage. None of the women was pregnant at time of blood collection. Blood samples were taken for biochemical (folate, Cbl, tHcy, etc.), immunological and genomic DNA extraction. The genotyping were carried out by PCR-RFLP or real time PCR. Serum concentrations of folate and Cbl were higher in groups 1 and 2 (p <0.05). The distribution of genotypes of MTHFR c.677C> T, MTHFR c.1298A> C, MTHFD1 c.1958G> A, RFC1 c.80G>GCP2 A and c.1561C> T was similar among the three groups. The increased concentrations of serum folate (OR: 1.05, 95% CI: 1.03 - 1.07, p <0.001), Cbl (OR: 1.00, 95% CI: 1.00 to 1.00, p = 0.016), tHcy (OR: 1.03, 95% CI: 0.97 to 1.11, p = 0.033) and T4 (OR: 1.02, 95% CI: 1.00 to 1.03, p = 0.006) and the presence of ANA (1:160) (OR: 2.90, 95% CI: 1.25 - 6.75, p = 0.013) were considered risk factors primary for abortion. For secondary abortion, were considered risk factors increased the concentrations of serum folate (OR: 1.04, 95% CI: 1.02 - 1.05, p <0.001), cobalamin (OR: 1.00, 95 % CI: 1.00 to 1.00, p = 0.019) and tHcy (OR: 1.05, 95% CI: 1.00 to 1.09, p = 0.039), higher age (OR: 1.02, 95% CI: 0.98 to 1.06, p = 0.031), cigarette smoking (OR: 2.54, 95% CI: 1.41 to 4.60, p = 0.002) and had a higher BMI (OR : 1,42,95% CI: 1.07 to 1.88, p = 0.015). The studied polymorphisms were not associated with increased risk of having RSA when analyzed separately, and were not associated with changes in serum folate, Cbl and tHcy, with the exception of the MTHFR 677TT genotype, whose patients had a higher concentration of total tHcy compared with those with 677CC and 677CT genotypes in the three groups. The variable concentrations of folate, Cbl, tHcy, and T4, presence of ANA and have been associated with increased risk for miscarriage primary. The variables age, BMI, smoking, concentrations of folate, Cbl and tHcy were associated with increased risk of secondary miscarriage.

Os estudos de polimorfismos dos genes de citocinas podem ser utilizados como uma ferramenta de anÃlise antropolÃgica para determinar perfis genÃticos distintos, para traÃar relaÃÃes entre populaÃÃes e para promover o entendimento das disparidades raciais na susceptibilidade genÃtica a doenÃas. O objetivo deste estudo foi correlacionar os polimorfismos das citocinas, TNF-&#945; -308, TGF-&#946;, cÃdon 10 e cÃdon 25, IL-10 -1082, -819, -592, IL-6 -174, e IFN-&#947; +874 com a susceptibilidade e a proteÃÃo Ãs infecÃÃes por M. tuberculosis e M. leprae. A casuÃstica incluiu 194 pacientes, sendo 65 com hansenÃase e 129 com tuberculose. Como controles foram selecionados 168 voluntÃrios saudÃveis. Todos os indivÃduos assinaram termo de consentimento informado e o estudo foi aprovado pelo Comità de Ãtica local. Para a obtenÃÃo do DNA genÃmico e amplificaÃÃo foram coletados 3-5ml de sangue perifÃrico, sendo utilizado na extraÃÃo do DNA o kit Easy-DNA (Invitrogen). Os SNPs dos genes das citocinas TNF-&#945; (-308G>A), TGF-&#946; cÃdon 10 e 25, IL-10 (-1082G>A, -819C>T, -592C>A), IL-6 (-174G>C) e IFN-&#947; (+874T>A) foram tipificados por reaÃÃo em cadeia da polimerase, empregando-se iniciadores de seqÃÃncia especÃfica (PCR-SSP) (One-Lambda). Utilizou-se para a anÃlise estatÃstica o programa GraphPad prism 5, sendo o valor de &#961; determinado atravÃs do Teste de Fisher bicaudal com significÃncia em &#961;<0,05. Durante a comparaÃÃo dos resultados entre os grupos estudados observou-se que nÃo houve diferenÃas entre as freqÃÃncias dos genÃtipos de TNF&#945;. Entretanto, na anÃlise dos genÃtipos de IL10, houve uma reduÃÃo da freqÃÃncia do GCC/GCC nos casos (7,1% vs 17,9%, p=0,006). Esta reduÃÃo tambÃm foi observada quando analisados os genÃtipos IL-6 GC (22,1% vs 32,8%, p=0,04) e IFN&#947; TA (36,6% vs 51,6%, p=0,01). No entanto, as freqÃÃncias dos genÃtipos GG de IL-6 (72,1% vs 57,0%, p=0,008) e AA de IFN&#947; (54,0% vs 41,4%, p=0,03) estavam aumentadas nos casos. Ademais, houve uma tendÃncia para aumento da freqÃÃncia do CC/GC de TGF&#946; (7,5% vs 0,8%, p=0,06). Dessa forma pode-se concluir que os genÃtipos: IL-10 (GCC/GCC), IL-6 (GC) e IFN-&#947; (TA) conferiram efeito protetor, enquanto os genÃtipos TGF-&#946; (CC/GC), IL-6 (GG) e IFN-&#947; (AA) conferiram efeito de susceptibilidade para infecÃÃo por micobactÃrias. Por outro lado, os alelos T no cÃdon 10 e G no cÃdon 25 de TGF-&#946; determinaram efeito protetor contra tuberculose. Em contraste, o alelo -174G de IL-6 determinou susceptibilidade Ãs infecÃÃes por micobactÃrias. / Cytokine genetic polymorphisms studies are helpful to determine diverse genetic profiles, to correlate populations, and to promote the knowledge of ethnic influence on the genetic susceptibility to diseases. The aim of the present study was to correlate TNF-&#945; -308, TGF-&#946;, codon 10 and codon 25, IL-10 -1082, -819, -592, IL-6 -174, and IFN-&#947; +874 polymorphisms with the susceptibility and the protection to M. tuberculosis and M. leprae infection. The study included 194 patients, 65 of them with leprosy and 129 with tuberculosis, and 168 healthy volunteers. The local Ethical Committee approved the study and all of the participants consented. To DNA purification and amplification 3-5 mL of peripheral blood was collected. An Easy-DNA (Invitrogen) kit was used to purification. Cytokines SNPs TNF-&#945; (-308G>A), TGF-&#946; codon 10 and 25, IL-10 (-1082G>A, -819C>T, -592C>A), IL-6 (-174G>C) and IFN-&#947; (+874T>A) were amplified by the polymerase chain reaction using sequence-specific primers (SSP-PCR) (One-Lambda). Statistical analysis was proceeded using GraphPad prism 5, and p values were determined by the Fisher test, with significance when p<0.05. Frequencies of TNF&#945; genotypes were not different among patients and controls. However, IL-10 genotypes analyses showed a reduction on the frequency of the GCC/GCC in patients (7.1% vs 17.9%, p=0.006). This reduction was also observed with the IL-6 GC (22.1% vs 32.8%, p=0.04) and IFN&#947; TA (36.6% vs 51.6%, p=0.01) genotypes. In contrast, the frequencies of the IL-6 GG (72.1% vs 57.0%, p=0.008) and the IFN&#947; AA (54.0% vs 41.4%, p=0.03) genotypes were increased in patients. Furthermore, there was a trend to an increase in the frequency of the TGF&#946; CC/GC genotype (7.5% vs 0.8%, p=0.06). In conclusion, IL-10 (GCC/GCC), IL-6 (GC) and IFN-&#947; (TA) genotypes conferred protection against, while TGF-&#946; (CC/GC), IL-6 (GG) and IFN-&#947; (AA) genotypes determined susceptibility to mycobacteria infection. On the other hand, T allele in codon 10 and G allele in codon 25 of the TGF-&#946; gene, determined protection against tuberculosis. In contrast, the IL-6 -174G conferred susceptibility to mycobacteria infection.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-03-06T14:02:56Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Agostinho Tavares Semedo - 2017.pdf: 2917656 bytes, checksum: 0a4e0b9aac67ef54832262a3818baf13 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-03-06T14:03:17Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Agostinho Tavares Semedo - 2017.pdf: 2917656 bytes, checksum: 0a4e0b9aac67ef54832262a3818baf13 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-06T14:03:17Z (GMT). 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The present study included 69 schizophrenic patients and 137 healthy individuals as a control group. Genotyping test and analysis of polymorphisms was done using sequencing technique and enzymatic restriction (RFLP) for patients and control’s group respectively. The results showed a major distribution of CYP2C19*17 polymorphism in patients’s group in comparison to control’s group. The CYP2C19*2 polymorphism was significantly higher in patients with TRS than to patients with SRS. The CYP2C19*17 polymorphism in heterozygous (CYP2C19*1/*17) was associated to higher clozapine’s doses in polytherapy and less efficient therapeutic response in SRS patients’s group, while the CYP2C19*2 was associated to lower clozapine’s doses in monotherapy and good therapeutic response in TRS patients’s group. In addition, parameters like daily mean clozapine dose, symptons severity according to Brief Psyquiatric Rating Scale (BPRS) and female individuals were also associated to super-refractoriness response to CLZ having a major distribution in SRS patients’s group. These findings suggest that new treatment strategies must be evaluated for the patients carriers of CYP2C19*17 polymorphism with SRS, above all the female individuals. Future studies with larger sample should be relevant to give more consistence to these findings. / A clozapina (CLZ) é um antipsicótico de escolha no tratamento de esquizofrenia refratária (ER). No entanto, cerca de 30% dos pacientes não respondem adequadamente à este antipsicótico, sendo considerados super-refratários ao tratamento (ESR). Sabe-se que polimorfismos genéticos nas enzimas do citocromo P450 podem influenciar o metabolismo das drogas, interferindo na variabilidade individual de resposta terapêutica. Sendo a CYP2C19 uma enzima altamente polimórfica e com a segunda maior participação no metabolismo da CLZ, o presente estudo visou analisar as influências dos polimorfismos CYP2C19*2 e *17 na resposta ao tratamento à este antipsicótico. O estudo incluiu 69 pacientes diagnosticados com esquizofrenia e 137 indivíduos saudáveis como controle. Utilizou-se a técnica de sequenciamento na genotipagem dos pacientes e a restrição enzimática (RFLP- Restrition Fragment Length Polymorphism) para o controle. Os resultados mostraram uma maior distribuição do polimorfismo CYP2C19*17 no grupo dos pacientes em comparação ao grupo controle. O polimorfismo CYP2C19*2 teve uma maior distribuição no grupo dos pacientes com ER em comparação aos pacientes com ESR. O polimorfismo CYP2C19*17 em heterozigose (CYP2C19*1/*17) estava associado à maior dose de CLZ em politerapia e resposta terapêutica menos eficiente no grupo dos pacientes com ESR, enquanto que a CYP2C19*2 em heterozigose estava associado à menor dose de CLZ em monoterapia e à boa resposta terapêutica nos pacientes com ER. Notou-se também uma associação da média da dose diária de CLZ, da gravidade sintomatológica (BPRS) e dos indivíduos do sexo feminino à super-refratariedade de resposta ao tratamento à clozapina tendo esses parâmetros uma maior distribuição no grupo dos pacientes com esquizofrenia super-refratária. Esses achados sugerem que outras estratégias de tratamento sejam avaliadas para os pacientes portadores do polimorfismo CYP2C19*17 diagnosticados com ESR, sobretudo os do sexo feminino. Futuros estudos com amostras mais alargadas seriam relevantes para dar uma maior consistência a esses achados.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-17T11:51:08Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alessandro Arruda Alves - 2017.pdf: 2612408 bytes, checksum: c21fd834dc73ac66ba55f32ba689f6f3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-17T11:51:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alessandro Arruda Alves - 2017.pdf: 2612408 bytes, checksum: c21fd834dc73ac66ba55f32ba689f6f3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-17T11:51:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alessandro Arruda Alves - 2017.pdf: 2612408 bytes, checksum: c21fd834dc73ac66ba55f32ba689f6f3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-10 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / In Brazilian agriculture, the State of Goiás is one of the largest producers of corn, beans, cotton, sorghum, sugarcane and soybeans, with 75% of its exports composed of products related to agriculture and minerals. Thus, a large part of the economy of the State of Goiás is focused on rural activities, justifying the intense use of pesticides in the region. These pesticides will be metabolized in the liver in two main phases, the first one of bioactivation converting the original substances into more polar metabolites, through oxidation reduction reactions, hydrogenation and dehalogenation, most of the reactions are made by the cytochrome P450 (CYP) superfamily And the second phase in which conjugation reactions occur, in which metabolites are converted into non-toxic products. Agrochemicals are also known to cause various human health damage, such as cancer, cholinergic syndrome, Parkinson's disease and Alzheimer's as well as cytogenetic changes such as DNA damage and chromosome translocations. Thus, polymorphisms in enzymes acting in the path of detoxification and DNA repair may be important biomarkers of diseases in individuals exposed to pesticides. The present study sequenced 3 regions of the following genes: CYP2E1 (promoter region), CYP1A1 (exon 7) and OGG1 (intron region) of 260 individuals from Goiânia and Aparecida de Goiânia, GO. 20 ml of blood was collected, DNA was extracted using commercial kits and PCR was performed. Subsequently, the amplicons were sequenced by the automated Sanger method and compared to the 1000 Genome project. The population of this study was composed of 159 men and 101 women, mean age of 38 years. A total of 5 SNP's were found in the Goias population, being rs2031922 (change of C> T and frequency of the T allele of 0.05) of the CYP2E1 gene, rs1048943 (change of A> G and frequency of the G allele of 0.1 ) And rs1799814 (change of C> A and frequency of allele A of 0.07) of the CYP1A1 gene and rs1052133 (change of C> G and frequency of allele G of 0.2) and rs293795 (change of A> G and frequency Of the 0.18 T allele) of the OGG1 gene. All loci did not deviate from the Hardy-Weinberg equilibrium, nor was a statistically significant difference between age and genotype composition. The rs1048943 and rs1799814 loci of the CYP1A1 gene showed a moderate disequilibrium linkage and the rs1052133 and rs293795 loci of the OGG1 gene showed a strong disequilibrium linkage. The haplotype inference revealed a frequency of the haplotypes of loci rs1048943 and rs1799814 of A / C = 0.8, G / A = 0.12, A / A = 0.07 of the CYP1A1 gene. The haplotypes of the loci rs293795 and rs1052133 had A / G = 0.07, A / C = 0.8, G / C = 0.13. Due to the important participation in detoxification or DNA repair and relationship with pesticides, SNPs rs2031920 of the CYP2E1 gene, rs1048943 of CYP1A1 and rs1052133 of the OGG1 gene are potential biomarkers of susceptibility to disease development in individuals who have contact with these xenobiotics / Na agricultura brasileira o Estado de Goiás é um dos maiores produtores de milho, feijão, algodão, sorgo, cana-de-açúcar e soja, tendo 75% de suas exportações compostas de produtos ligados às áreas de agricultura, agropecuária e minérios. Dessa forma, grande parte da economia do Estado de Goiás é voltada para atividades rurais, justificando o intenso uso de agrotóxicos na região. Esses agrotóxicos serão metabolizados no fígado em 2 fases principais, a primeira de bioativação convertendo as substâncias originais em metabolitos mais polares, por meio de reações de oxidação redução, hidrogenação e desalogenação, grande parte das reações são feitas pela superfamília de enzimas citocromo P450 (CYP) e a segunda fase na qual ocorrem reações de conjugação, na qual metabolitos são convertidos em produtos atóxicos. Os agrotóxicos também são conhecidos por causarem diversos danos à saúde humana, tais como, câncer, síndrome colinérgica, mal de Parkinson e Alzheimer assim como alterações citogenéticas, tais como dano no DNA e translocações cromossômicas. Assim, polimorfismos nas enzimas atuantes em vias de detoxificação e reparo de DNA podem ser importantes biomarcadores de doenças em indivíduos com exposição a agrotóxicos. O presente estudo sequenciou 3 regiões dos seguintes genes: CYP2E1 (região promotora), CYP1A1 (éxon 7) e OGG1 (região de íntron) de 260 indivíduos de Goiânia e Aparecida de Goiânia, GO. Foram coletados 20 ml de sangue, o DNA foi extraído com o uso de kits comercias e foi realizada a PCR. Posteriormente, os amplicons foram sequenciados pelo método de Sanger automatizado e comparados com a população do projeto 1000 genomas. A população deste estudo foi composta por 159 homens e 101 mulheres, médias de idade de 38 anos. Foram encontrados na população goiana um total de 5 SNP’s, sendo eles rs2031922 (mudança de C>T e frequência do alelo T de 0,05) do gene CYP2E1, rs1048943 (mudança de A>G e frequência do alelo G de 0,1) e rs1799814 (mudança de C>A e frequência do alelo A de 0,07) do gene CYP1A1 e rs1052133 (mudança de C>G e frequência do alelo G de 0,2) e rs293795 (mudança de A>G e frequência do alelo T de 0,18) do gene OGG1. Todos os locos não desviaram do equilíbrio de Hardy-Weinberg, também não houve diferença estatisticamente significativa entre a idade e a composição genotípica. Os locos rs1048943 e rs1799814 do gene CYP1A1 apresentaram um desequilíbrio de ligação moderado e os locos rs1052133 e rs293795 do gene OGG1 apresentaram um desequilíbrio de ligação forte. A inferência haplotípica revelou uma frequência dos haplótipos dos locos rs1048943 e rs1799814 de A/C=0,8, G/A= 0,12, A/A=0,07 do gene CYP1A1. Os haplótipos dos locos rs293795 e rs1052133 apresentaram frequência de A/G=0,07, A/C=0,8, G/C=0,13. Devido a importante participação em vias de detoxificação ou reparo de DNA e relação com agrotóxicos, os SNP’s rs2031920 do gene CYP2E1, rs1048943 do CYP1A1 e o rs1052133 do gene OGG1 são potenciais biomarcadores de susceptibilidade ao desenvolvimento de doenças em indivíduos que possuem contato com estes xenobióticos.

Tendo em vista a possibilidade da utilização de marcadores moleculares relacionados à leptina em programas de melhoramento genético no Brasil, com o objetivo de auxiliar a seleção de bovinos da raça Nelore para características de importância econômica e, particularmente, para aquelas relacionadas ao crescimento e precocidade de acabamento, a proposta do presente trabalho foi caracterizar as freqüências gênicas e genotípicas de alguns polimorfismos e estudar seus efeitos nas características de precocidade de acabamento e crescimento em bovinos da raça Nelore. Foram avaliadas as associações dos marcadores moleculares com medidas de ultra-som de área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), espessura de gordura da picanha (EGP), peso à desmama (PD), peso ao sobreano (PS), ganho de peso da desmama ao sobreano (GPS) e circunferência escrotal ao sobreano (CE). Para a caracterização dos marcadores na população Nelore foram avaliadas as freqüências genotípicas e gênicas, testes de equilíbrio de Hardy-Weinberg, heterozigoses, diversidades alélicas e conteúdos de informação polimórfica. A análise dos efeitos dos diferentes genótipos dos marcadores moleculares foi realizada através da análise de variância, desvios de dominância, efeitos aditivos e efeitos médios de substituição. As freqüências genotípicas e gênicas demonstraram que alguns alelos de determinados marcadores moleculares se encontram em baixa freqüência na população, porém apresentam os mesmos polimorfismos já relatados em bovinos de raças européias. Os marcadores A1457G, C963T e UASMS1 apresentaram associação significativa com características avaliadas por ultra-som. Os marcadores E2JW, A59V e T945M apresentaram associação significativa com características de crescimento. O marcador E2FB apresentou associações significativas apenas pela análise de efeito médio de substituição. Estes achados reforçam o potencial de utilização dos marcadores moleculares ligados a leptina na melhoria das características economicamente importantes em animais da raça Nelore. A seleção assistida por marcadores de animais portadores de alelos favoráveis pode impactar positivamente na cadeia produtiva de bovinos de corte em todos os seus segmentos. / Considering the possibility of utilization of molecular markers linked to leptin in animal breeding programs from Brazil and aiming to aid in the selection of Nellore cattle to economic traits and particularly, for those related to growth and finishing traits, the purpose of this research was to characterize the allelic and genotypic frequencies and associate with growth and finishing in Nellore cattle. There were evaluated the associations of the molecular markers on the ultrasound Longissimus muscle area (AOL), ultrasound backfat thickness (EGS), ultrasound fat thickness in Biceps femoris muscle, weaning weight (PD), yearling weight (PS), weight gain from weaning to yearling (GPS) and yearling scrotal circumference (CE). The characterization of the molecular markers in Nellore cattle was evaluated through of the allelic and genotypic frequencies, Hardy-Weinberg equilibrium tests, heterozigosity, allelic diversity and polymorphism information content. The different genotype effects of the molecular markers were evaluated through ANOVA, dominance deviation, additive and substitution effect. The allelic and genotype frequencies shown some alleles of the molecular markers were low frequencies in Nellore cattle. However there were identified the same polymorphisms described in taurine cattle. Markers A1457G, C963T and UASMS1 demonstrated significant association with ultrasound measurement traits. The E2JW, A59V and T945M markers showed significant association with growth traits. The E2FB marker showed significant effects when it was evaluated for substitution effect. These findings emphasize the potential utilization of molecular markers linked to leptin in the improvement of economic traits in the Nellore cattle. The improvement this traits through marker assisted selection of carrier animals of desirable alleles might positively aid the whole beef cattle productive chain.

A performance musical requer um alto nível de habilidade em diversos parâmetros como coordenação motora, atenção e memória, o que a torna uma atividade particularmente susceptível aos estados de ansiedade. Pesquisas nessa área têm avançado com a introdução de instrumentos específicos para abordar a ansiedade na performance musical (MPA), como é o caso da the Kenny Music Performance Anxiety Inventory (K-MPAI). Estudos recentes apontam polimorfismos genéticos envolvidos na base do quadro de ansiedade os quais já foram descritos no genoma humano e avaliados em pacientes com autismo, ataque de pânico e na depressão. No entanto, não existia na literatura mundial qualquer estudo relacionando polimorfismos de DNA e MPA. O presente estudo teve duas fases. A primeira fase, com objetivo traduzir, adaptar e validar a K-MPAI para a língua portuguesa e a segunda fase, o objetivo foi avaliar polimorfismos genéticos possivelmente associados à MPA. Após a autorização da autora, a escala KMPAI foi traduzida e validada. A escala em língua portuguesa foi aplicada a 218 músicos de ambos os sexos, amadores e profissionais. Para a validação concorrente, foi utilizado o Inventário de Ansiedade Traço-Estado (IDATE), versão validada na língua portuguesa da State Trait Anxiety Inventory (STAI). A análise da consistência interna apresentou alfa de Cronbach=0.957 com p<0.001, reprodutibilidade com p=0.378 e validação concorrente com a IDATE com alfa de Cronbach=0.642 e p<0.001. O estudo de validação permitiu considerar a amostra com graus de confiabilidade e reprodutibilidade elevados, o que traduz este estudo como provindo de uma amostra não tendenciada e replicável a outras populações. A validação concorrente entre a K-MPAI e a IDATE permite inferir que ambas são comparáveis na capacidade de medir os níveis de MPA. Na segunda fase, foi analisada a associação entre polimorfismos dos genes GLO1 (rs4746), GSR (rs1002149), NPY (rs16147) e TMEM132D (rs900256) e o quadro de MPA. Após a aplicação da escala K-MPAI em 307 músicos (197 homens e 110 mulheres) amostras de sangue periférico foram coletadas de dos 80 sujeitos das extremidades da curva de distribuição de scores da K-MPAI (35 homens e 45 mulheres), sendo seu DNA usado para genotipagens. Análises das freqüências genotípicas e alélicas não evidenciaram diferenças estatisticamente significativas entre os grupos polares, muito embora tendências à significância fossem observadas em alguns casos, quando os gêneros foram avaliados separadamente, sugerindo que mais indivíduos devam ser analisados. A detecção de polimorfismos de DNA associados à MPA poderá permitir uma melhor compreensão dos mecanismos moleculares associados a este quadro que também ocorre em outras situações de exposição em diversas áreas de atuação. Além disso, futuros estudos poderão permitir delinear exames prognósticos e diagnósticos mais precisos, levando a um melhor conhecimento da origem da MPA / Music performance requires high levels of ability in parameters such as coordination, attention and memory, which makes it particularly susceptible to anxiety states. Scales were recently developed to evaluate and quantify music performance anxiety (MPA). However, although we are able to measure MPA, biomarkers for this condition are not available and its biological basis has not been established. On the first part of this work, we translated, adapted and validated the K-MPAI to Portuguese, generating the first MPA evaluation instrument in the language. After authorization from the author, the K-MPAI scale was translated and validated. The scale in the Portuguese language was applied to 218 musicians of both genders, professionals and amateurs. For the concurrent validation, the IDATE inventory, a validated version of the STAI Inventory (State Trait Anxiety Inventory) was used. Consistency analyses showed Cronbach\'s alpha=0.957 with p<0.001, reproducibility with p=0.378 and concurrent validation with IDATE with Cronbach\'s alpha=0.642 and p<0.001. The validation study allowed the samples to be considered with high degrees of certainty and reproducibility, which shows that this study is based on an unbiased sample and can be replicable to other populations. On the second part of this work, we strived to contribute to the knowledge of the biological basis of MPA, validating and analyzing the frequency of DNA polymorphisms possibly associated to this condition. We searched for genes that could be involved with the anxiety processes and evaluated the polymorphisms with higher frequency and/or more capacity of causing functional alterations. The genes and the polymorphisms selected (presented with their identification codes in the dbSNP database) were: GLO1 (rs4746), GSR (rs1002149), NPY (rs16147) and TMEM132D (rs900256). The status of these polymorphisms was determined in a process of selective genotyping, from a group of 80 subjects who had the higher and lower scores in the distribution curve of the K-MPAI scores (derivating from a total of 307 musicians, having scores deviating at least 1 standard deviation in average). Tests for these polymorphisms were designed, validated and evaluated with the DNA of these 80 subjects. Analysis of the allelic and genotypic frequencies of these polymorphisms did not show associations that were statistically significant. Tendencies to significance were observed when analyses were conducted separately in each gender, suggesting that studies with higher sample size should be performed. The study of genetic polymorphisms associated to MPA has the potential for contributing to a better understanding of the biological basis of anxiety

Em um cenário em que a qualidade da informação é essencial para a sustentação do processo de gestão do sistema ou do processo de seleção animal, corretas atribuições de paternidade se tornam importante para a manutenção das informações de pedigree e, consequentemente, para a estimativa dos valores genéticos dos animais em programas de seleção. Com o advento do uso de marcadores moleculares do tipo SNP na seleção genômica e em diferentes painéis de teste de parentesco, maiores estudos se fazem cada vez mais necessários. Dessa maneira esse estudo buscou analisar os ganhos em acurácia dos valores genéticos para características produtivas em um cenário de seleção real entre avaliações genéticas que continham ou não animais com atribuições de paternidade por teste de DNA e além disso, verificar os possíveis conflitos de seleção entre elas. Como resultados foram encontrados ganhos em acurácia principalmente em animais mais jovens, mas de maneira geral todos os animais foram beneficiados e apresentaram ganhos acima de 8% os animais diretamente submetidos ao teste. Conflitos de seleção variaram entre 14 a 52% quando considerada somatória das diferenças de seleção nas duas avaliações genéticas, mostrando também, que existiu uma alteração na ordem de classificação dos animais nas características analisadas. Como o fator custo é um ponto importante quando se fala em avaliação genética e tudo que envolve a nova fase dos marcadores moleculares, um painel de paternidade eficiente é aquele que apresenta o melhor desempenho na determinação da paternidade sob um menor custo. Dessa forma, foram comparados alguns grupos de marcadores e o painel de 195 SNP proposto pelo grupo ISAG se mostrou eficiente, assim como outros, na determinação de paternidade em um grupo especifico de animais. Os resultados deste trabalho indicam também que o teste de parentesco por DNA é uma ferramenta que pode aumentar a precisão do arquivo pedigree por aumentar a conexão dos animais, ou seja, por criar maiores ou mais laços genéticos entre os indivíduos. Assim, poder-se-ia melhorar o desempenho da avaliação genética em um programa de melhoramento genético bovino através de pequenos grupos de marcadores moleculares com um custo-benefício atrativo. / In a scenario where information quality is essential to support a process management system or an animal selection process, correct paternity assignments become important for maintaining pedigree information and hence to estimate animals genetic values in breeding programs. With the advent of the use of SNP molecular markers in genomic selection and different kinship test panels, larger studies are increasingly necessary. Thus, this study investigated the gains in accuracy of breeding values for production traits (in a real selection scenario) between the genetic evaluations of animals with or without parenting assignment by DNA testing. It also verified possible selection conflicts between them. The following results showed gains in accuracy, especially in younger animals. However, in general, all animals benefited having gains greater than 8% where animals were directly impacted. Checking conflicts ranged from 14-52% when the sum of the differences of selection in both genetic evaluations was considered. This also showed that there was a change in the ranking of animals in the analyzed characteristics. As cost is also an important factor in genetic evaluations using new molecular markers, an effective parenting panel would be one that had the best performance in the paternity determination under a lower cost. Therefore, we compared some small marker groups and the 195 SNP panel proposed by ISAG group and determined this was efficient in estimating paternity on a specific group of animals. These results also suggest that kinship testing by DNA is a tool that can increase the accuracy of the pedigree file to increase the animals\' connection, or to create larger or more genetic links between individuals. This study shows that testing with small groups of molecular markers improves the performance of genetic evaluation in a bovine genetic selection program with an attractive cost-benefit.

A doença de Parkinson (DP) é a segunda doença neurodegenerativa mais comum do mundo, e seu tratamento atual se baseia principalmente no uso de medicações que facilitam a transmissão dopaminérgica nos núcleos da base. A L-DOPA é a principal medicação usada no tratamento da DP, contudo seu uso crônico está associado ao surgimento de complicações motoras, como as discinesias induzidas por L-DOPA (DIL). As DIL ocorrem em cerca de 50% dos pacientes com DP que usaram LDOPA por cerca de 4 a 6 anos, e podem causar uma série de impactos negativos aos pacientes. Pela incapacidade adicional que esta complicação traz aos pacientes com DP, a definição de fatores que possam predizer o surgimento das DIL é de importância direta para o clínico que prescreve L-DOPA rotineiramente. O objetivo deste estudo foi determinar os principais fatores de risco clínicos e genéticos para o desenvolvimento de DIL em uma casuística de pacientes brasileiros com DP. Um estudo transversal foi realizado em pacientes brasileiros de dois centros (Ribeirão Preto e São Paulo) como parte do projeto \"Latin American Research Consortium on the Genetics of PD\" (LARGE-PD), incluindo apenas pacientes com DP e em uso de L-DOPA. A avaliação foi baseada em um exame neurológico completo e em uma entrevista semi-estruturada feita por um médico neurologista especialista em Distúrbios de Movimentos. A presença de DIL foi considerada se a pontuação fosse >= 1 no item 32 da Parte IV na MDS-UPDRS. Baseados em estudos prévios, nós escolhemos oito polimorfismos tipo single nucleotide polymorphism (SNP) nestes genes: COMT, MAOB, ANKK1, DRD3, DAT1, BDNF, ADORA2A and NOS1. A genotipagem foi realizada através de ensaios TaqMan SNP. Foram realizados modelos de regressão logística e análises de sobrevivência para identificarmos os fatores de risco clínicos e genéticos associados ao surgimento de DIL. Ao todo, foram analisados 199 pacientes (sexo masculino - 59%; idade média 61.8 anos), sendo 96 indivíduos (48.2%) com DIL. Através de um modelo de regressão logística multivariado com 7 variáveis independentes, o fenótipo clínico motor do tipo postural instability with gait disorder (PIGD) (OR 0.17, IC 95% 0.07-0.39; p < 0.001), longos períodos de tratamento com L-DOPA (OR 1.31, IC 95% 1.17-1.47; p < 0.001), altas doses diárias equivalentes de L-DOPA (OR 1.00, IC 95% 1.000-1.002; p = 0.04) e a início precoce dos sintomas da 11 DP (OR 1.04, IC 95% 1.01-1.07; p = 0.009) foram os fatores de risco clínicos mais associados ao surgimento de DIL. Dentre os fatores de risco genéticos, apenas o alelo T do SNP rs1799836 no gene da MAOB esteve associado ao aumento na chance de surgimento de DIL (OR 1.51, IC 95% 1.00-2.28; p = 0.05). Nossos resultados mostraram que a predição de surgimento de DIL em pacientes com DP em uso de L-DOPA pode ser feita através de alguns fatores de risco clínicos (fenótipo clínico motor, duração do tratamento com L-DOPA, dose diária equivalente de L-DOPA e idade de início de sintomas) e genéticos, como o SNPrs1799836 no gene da MAOB. Novos estudos com amostras maiores e desenhos prospectivos longitudinais são necessários para se explorar a associação entre estes preditores e o surgimento de DIL. / Parkinson\'s disease (PD) is the second most common neurodegenerative disease in the world, and its treatment is mainly based on drugs involved on dopaminergic neurotransmission in basal ganglia. L-DOPA is the major medication used on the management of PD, but its chronic use is associated with the onset of motor complications, as L-DOPA-induced dyskinesias (LID). LID occur in approximately 50% of patients using L-DOPA over 4 and 6 years, and they cause negative impacts on the quality of life of patients PD. To predict the onset of LID based on clinical and genetic risk may be an useful tool for clinicians which prescribe L-DOPA. The aim of this study was to determinate the main clinical and genetic risk factors for the onset of LID in Brazilian PD patients. A cross-sectional study was conducted with Brazilian PD patients from two centers (Ribeirao Preto and Sao Paulo) as part of the Latin American Research consortium on the Genetics of PD (LARGE-PD), which enrolled only PD patients using L-DOPA. PD patients were submitted to neurological examination and semi-structured interviews performed by movement disorders specialists. Presence of LID was confirmed if UPDRS Part IV had a score >= 1 on item 32. Based on previous studies, we chose eight Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) in the following genes: COMT, MAOB, ANKK1, DRD3, DAT1, BDNF, ADORA2A and NOS1. Genotyping was performed using TaqMan SNP genotyping assays. We performed logistic regression and survival analysis to identify clinical and genetic risk factors associated with LID onset We enrolled 199 PD patients (males - 59%; mean age 61.8 years), and 96 patients (48.2%) had LID. At a multivariate model with 7 independent variables, postural instability with gait disorder (PIGD) clinical phenotype (OR 0.17, CI 95% 0.07-0.39; p < 0.001), longer duration of L-DOPA therapy (OR 1.31, Cl 95% 1.17-1.47; p < 0.001), higher L-DOPA equivalent daily doses (OR 1.00, CI 95% 1.000-1.002; p = 0.04), as also as early onset of PD (OR 1.04, CI 95% 1.01-1.07; p = 0.009) were the clinical risk factor more associated with onset of LID. Regarding genetic risk factors, only MAOB SNP rs1799836 was associated with LID, with the T allele increasing the risk of developing LIDs (OR 1.51, CI 95% 1.00-2.28; p = 0.05). Our results showed onset of LID can be predicted based on some clinical (motor clinical phenotype, duration of L-DOPA therapy, L-DOPA equivalent daily dose and age at PD onset) and genetic risk factors, as MAOB SNP rs1799836. Further studies in larger samples, using longitudinal and prospective designs, are needed to explore the association between these predictors and onset of LID.