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Identificação de polimorfismos de genes candidatos nos transtornos alimentares / Identification of polymorphisms of candidate genes in eating disordersSarrassini, Felícia Bighetti 28 September 2012 (has links)
Os transtornos alimentares (TA) são quadros psiquiátricos graves, de etiologia multifatorial e a influência genética parece exercer importante papel. Três genes são candidatos em potencial para o desenvolvimento desses quadros e são investigados: o gene do receptor 5-hidroxitriptamina (5-HT2A), o do Fator Neurotrófico Derivado do Cérebro (BDNF) e do receptor ? do estrogênio (ER?). O objetivo deste estudo foi identificar a presença de polimorfismos (SNPs) desses genes em pacientes e ex-pacientes com TA (grupo de pacientes-GP) e em mulheres jovens saudáveis (grupo controle-GC) e foi realizado junto ao Grupo de Assistência em Transtornos Alimentares do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto-USP. Coletaram-se os dados: idade, peso e altura para cálculo do índice de massa corporal (IMC) e aplicou-se o Eating Atitudes Test (EAT-26) para excluir possível caso de doença no GC (<21pontos). Os SNPs foram determinados pela técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR). Para análises estatísticas, utilizou-se o Statistical Package for Social Sciences (SPSS, 20.0), nas variáveis contínuas (IMC e idade) usou-se o teste ANOVA, na variável dicotômica (presença ou não de SNPs), teste qui-quadrado e regressão logística binária (pa ). Como resultados, foram coletados dados de 29 indivíduos do GP e 78 do GC. A idade foi de 26,37±7,00 anos no GP e 28,65±6,67 anos no GC (p=0,274), o IMC foi de 20,83±4,47kg/m2 no GP e 21,56±1,67kg/m2 no GC (p=0,294), e o EAT-26 foi de 30,34±18,83 pontos no GP e 7,83±4,94 pontos no GC (p=0,000). Calcularam-se as frequências alélicas e genotípicas dos genes e foi feita análise que unia genótipos que possuíam alelos de risco para cada gene. No gene 5HT2A 75,8% do GP e 38,4% do GC apresentaram-se os genótipos com o alelo de risco (GA e AA) (pX2 =0,253; OR=1,964; IC95%=0,748-5,156 e pa =0,552). No do BDNF, encontraram-se frequências de 96,5% no GP e 96,1% no GC com os genótipos com alelo de risco, MM e MV (pX2 =1,00; OR=1,120; IC95%=0,112-11,221 e pa =0,362 ). No gene do ER?, para o SNP presente no éxon 5 (1082 G->A), as frequências dos genótipos de risco GA e AA foram de 6,8% no GP e 8,9% no GC (pX2 =1,00; OR=0,751; IC95%=0,147-3,841 e pa =0,883), e o SNP situado no éxon 8 (1730 A->G), as frequências dos genótipos de risco AG e AA foram de 65,5% no GP e 83,3% no GC (pX2 =0,064; OR=0,380; IC95%=0,144-1,002 e pa =0,399). Todas as análises não apresentaram diferença estatística significativa para a presença dos alelos de risco que podem contribuir para o desenvolvimento de TA. Concluiu-se que a heterogeneidade da população brasileira, a baixa incidência da doença e a amostra limitada do GP podem ter influenciado para as semelhanças entre os grupos. Futuros estudos, utilizando marcadores genéticos de etnias e amostras maiores, devem prosseguir na linha promissora da investigação etiológica. / Eating disorders (ED) are serious psychiatric conditions with multifactorial etiology, it seems genetic influence has an important role. Three genes were investigated: the receptor 5-hydroxitriptamine (5-HT2A), the Brain-Derived Neurotrophic Factor (BDNF) and the Estrogen Receptor ? (ER?). This study aims at identifying the presence of polymorphisms (SNPs) in patients or in ex-patients with ED (Group of patients - GP) and in wealthy women (Control Group - CG). The study was conducted with the Eating Disorders Assistence Group at Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto-USP. To calculate the Body Mass Index (BMI), we collected data referring to age, weight and height, we applied the Eating Attitudes Test (EAT-26) to exclude a possible occurrence of disease in the CG (<21 points). The polymerase chain reaction (PCR) was used to determine SNPs. For the statistical analysis we used the Statistical Package for Social Sciences (SPSS, 20.0): for the continuous variables (BMI and age), the ANOVA and for the dichotomous variable (presence or not of SNPs), Chi-square test and Binary logistic regression (pa ). There were 29 individuals of the GP and 78 of the CG. The age was 26,37±7,00 in the GP and 28,65±6,67 in the CG (p=0,274), the BMI was 20,83±4,47Kg/m2 in the GP and 21,56±1,67Kg/m2 in the CG (p=0,294), and the EAT-26 was 30,34±18,83 points in the GP e 7,83±4,94 points in the CG (p=0,000). We calculated the allelic and genotypic frequencies in the genes of the studied groups and afterwards we did an analysis that joined genotypes with risk alleles for each gene. The genes 5HT2A 75,8% of GP and 38,4% of the CG presented the genotype with risk allele (GA and AA) (pX2 =0,253; OR=1,964; IC95%=0,748-5,156 e pa =0,552). In the BDNF we found frequencies of 96,5% in the GP and 96,1% in the CG with genotypes with risk allele, MM and MV (pX2 =1,00); OR=1,120; IC95%=0,112-11,221 e pa =0,362). Regarding the gene ER?, for the SNP present in the exon 5 (1082 G->A), the frequency of risk genotypes GA and AA were of 6,8% in the GP and of 8,9% in the CG (pX2 =1,00; OR=0,751; IC95%=0,147-3,841 and pa =0,883), and for the SNP located in the exon 8 (1730 A->G), the frequency of risk genotypes AG and AA were of 65,5% in the GP and 83,3% in the CG (pX2 =0,064; OR=0,380; IC95%=0,144-1,002 e pa =0,399). There were no significant differences between the studied groups for the presence of risk alleles that may contribute to the development of ED. We concluded that heterogeneity of Brazilian population, the low incidence of the disease in it and the limited sample of GP may have influenced the similarities between the groups. Future studies using genetic markers of ethnicity and a wider sampling may contribute to the promising trend of etiologic investigation.
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Associação de poliformismos de genes relacionados à obesidade e comorbidades com resposta à intervenção no estilo de vida de indivíduos de risco cardiometabólico / Association of related-obesity diseases genes polymorphisms and response to lifestyle intervention in individuals at cardiometabolic riskCurti, Maira Ladeia Rodrigues 21 August 2012 (has links)
Introdução: Fatores genéticos estão entre os determinantes de obesidade, podendo influenciar a resposta a intervenções em estilo de vida. O impacto de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) na resposta de biomarcadores a intervenções não é claro. Objetivo: Este estudo examinou as associações de seis SNPs FTO T/A, PPAR Pro12Ala, Apo A1 -75G/A, TNF- -308G/A, IL-6 - 174G/C e AdipoQ 45T/G com mudanças induzidas por uma intervenção em amostra de brasileiros de risco cardiometabólico. Métodos: Em um programa de nove meses de orientações em hábitos alimentares e atividade física, 180 indivíduos com prediabetes ou síndrome metabólica foram genotipados e agrupados segundo a presença do alelo variante de cada SNP e comparados quanto a variáveis antropométricas, metabólicas e inflamatórias. Resultados: A intervenção resultou em redução do consumo calórico, aumento da atividade física, melhora na antropometria e outros biomarcadores. Estratificando pelos SNPs, os principais achados estão contidos em dois artigos. Artigo 1: Houve melhor resposta do perfil glicêmico após a intervenção nos portadores do alelo variante do SNP TNF -308 G/A. Observou-se melhora das variáveis lipídicas nos portadores do alelo variante do SNP IL-6 -174 G/C, enquanto que aqueles com o genótipo referência obtiveram melhora no metabolismo da glicose. Carreadores do SNP AdipoQ 45T/G não obtiveram melhora no perfil lipídico nem no glicêmico.Artigo 2: O alelo variante do FTO T/A associou-se a melhores perfis 9 inflamatório e glicêmico em resposta à intervenção. Portadores do alelo variante do SNP PPAR Pro12Ala obtiveram melhora na pressão arterial, enquanto que indivíduos com o genótipo referência melhoraram o metabolismo lipídico. Carreadores do alelo variante do SNP Apo A1 -75G/A apresentaram melhora no perfil lipídico que, após ajuste para medicação, não se manteve significante. Conclusões: SNPs relacionados à obesidade e comorbidades podem influenciar a resposta de marcadores metabólicos e inflamatórios a intervenções em hábitos de vida em brasileiros. O SNP TNF -308G/A parece favorecer um melhor perfil glicêmico. O SNP IL-6 -174G/C pode conferir efeito benéfico no perfil lipídico, mas não na glicemia. O SNP AdipoQ 45T/G compromete a resposta à intervenção em indivíduos de risco cardiometabólico no nosso meio. O SNP FTO T/A pode favorecer a resposta do metabolismo da glicose e a atenuação da inflamação. O SNP PPAR Pro12Ala pode ter impacto benéfico na pressão arterial, mas não no metabolismo lipídico. Em contraste com a literatura, o SNP Apo A1 -75G/A não parece influenciar resposta dos lípides à intervenção. Mais estudos envolvendo estes SNPs são necessários para possível direcionamento de intervenções a subgrupos específicos de indivíduos de risco. / Introduction: Genetic factors are one of the determinants of obesity and may influence the response to interventions. The impact of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in weight loss and inflammatory response to interventions is not clear. Objective: This study examined associations of six polymorphisms FTO T/A, PPAR Pro12Ala, Apo A1 -75G/A, TNF- -308G/A, IL-6 -174G/C and AdipoQ 45T/G with changes induced by lifestyle intervention in Brazilians at cardiometabolic risk. Methods: In a 9-month intervention on diet and physical activity, 180 individuals with prediabetes or metabolic syndrome were genotyped and compared according the presence of variant allele of the SNPs and antrophometric, metabolic and inflammatory variables. Results: The intervention resulted in lower energy intake and greater total physical activity as well as improvement in anthropometry and several biomarkers. Stratified by SNPs, the main findings are covered in two articles. Article 1: Variant allele carriers of TNF -308 G/A SNP decreased plasma glucose after intervention. Lipid profile improved after intervention in variant allele carriers of IL-6 -174 G/C, while individuals with reference genotype had better plasma glucose response. Variant allele carriers of AdipoQ 45T/G did not improve lipid and glycemic profile. Article 2: Only variant allele carriers of FTO T/A decreased fasting plasma glucose and C-reactive protein concentration after intervention. Blood pressure reduced after intervention in variant allele carriers of the PPAR Pro12Ala, while the reference genotype increased Apo A1. Apparent favorable response of lipid profile to intervention in variant allele carriers of Apo A1 -75G/A was not maintained after adjustments for lipid-lowering medication. Conclusions: SNPs associated with obesity and comorbidities may influence the response of metabolic and inflammatory markers after lifestyle intervention. The TNF -308G/A may predispose a better response of glucose metabolism. The IL-6 -174 G/C SNP may confer a beneficial effect on lipid profile but not in glucose metabolism. Our findings reinforce unfavorable effects of the AdipoQ 45T/G SNP in lipid and glucose metabolism after lifestyle intervention in Brazilians at cardiometabolic risk. FTO T/A SNP induces a favorable impact on inflammatory status and glucose metabolism. The reference genotype of PPAR Pro12Ala seems to favor a better lipid profile, while the variant allele to decrease blood pressure. In contrast to literature, our data did not support benefits on lipid profile of the variant allele of Apo A1 -75G/A SNP. Further studies of these SNPs are needed to direct interventions to specific subgroups of at-risk individuals.
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Polimorfismos genéticos relacionados à hemostasia e a sua relação com abortos espontâneos recorrentes / Genetic polymorphism associated with hemostasis and its relationship with recurrent pregnancy lossesBertinato, Juliano Felix 28 May 2013 (has links)
Aborto espontâneo recorrente (AER) é definido pela presença de três ou mais abortos espontâneos e consecutivos que ocorreram até a 20ª semana de gestação. O AER possui origem multifatorial. Dentre os diversos fatores associados ao AER, alterações na hemostasia podem comprometer o fluxo sanguíneo na placenta e com isso pode aumentar o risco de complicações obstétricas, como o aborto. O objetivo geral deste estudo foi investigar se existe associação entre polimorfismos genéticos (no gene do fibrinogênio (FGB -455G>A e -148C>T), da trombomodulina (THBD 1418C>T), do fator V (F5 1691G>A), da protrombina (F2 20210 G>A), do PAI-1 (SERPINE1 4G/5G) e do TAFI (CPB2<i/> c.505G>A)) e os abortos espontâneos recorrentes (primários e secundários). Os objetivos específicos desse estudo foram: 1- avaliar se existe associação entre os sete polimorfismos e o período em que ocorreram as perdas fetais (precoce ou tardia) e o número de abortos recorrentes; 2- determinar se os haplótipos dos polimorfismos FGB -455G>A e FGB -148C>T estão ou não associados aos abortos primários e secundários. Foram incluídas 256 mulheres com história de abortos espontâneos recorrentes, provenientes do Ambulatório de Obstetrícia da Clínica Obstétrica do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP e 264 mulheres saudáveis, sem história de aborto espontâneo e que tiveram pelo menos duas gestações normais (grupo controle), pareadas segundo as idades. Amostras de sangue foram obtidas para realização das genotipagens dos polimorfismos por meio de PCR em tempo real (FGB -148C>T, FGB -455G>A, THBD 1418C>T e CBP2 c.505G>A), e PCR-RFLP (SERPINE14G/5G, F5 1691G>A e F2 20210 G>A). As frequências dos genótipos e de alelos para os sete polimorfismos foram semelhantes entre os grupos aborto primário, aborto secundário e grupo controle. Entretanto, quando foi realizada um modelo de regressão logística multivariada saturada, que incluiu as variáveis independentes: F5 1691G>A (referência GG vs GA), F2 20210G>A (referência GG vs GA), CBP2 c.505G>A (referência GG + GA vs AA), THBD 1418C>T (referência CC + CT vs TT), SERPINE1 4G/5G (referência 5G/5G vs 4G/4G + 4G/5G) FGB -455G>A (referência GG vs GA vs AA) e FGB -148C>T (referência CC vs CT vs TT), apenas o polimorfismo FGB -148C>T foi associado ao maior risco de ter aborto primário (OR: 2,91, IC 95% 1,02 - 8,29, p=0,045). Quando os haplótipos para os polimorfismos FGB -455G>A e FGB 148C>T foram considerados, foi observada maior frequência de haplótipo 455G/148T em mulheres com AER primário (3,4%) do que no grupo controle (1,1%), (p=0,030); porém esse efeito não foi observado no AER secundário. Em relação ao número de abortos consecutivos, houve uma tendência (p=0,060) a maior frequência de genótipo TT para o polimorfismo FGB -148C>T no grupo de aborto primário com até três perdas quando comparado com as mulheres do mesmo grupo, porém com número maior de perdas (>3). Em conclusão, os sete polimorfismos quando analisados separadamente, não foram associados ao AER; no entanto, em modelo multivariado de regressão logística, o genótipo TT do polimorfismo FGB 148C>T foi associado com o aumento do risco de ter AER primário. Além disso, foi encontrado maior frequência do haplótipo 455G/148T para os polimorfismos FGB -455G>A e FGB -148C>T em mulheres com aborto primário. / Recurrent pregnancy loss (RPL) is defined by the presence of three or more consecutive losses prior to 20 weeks of gestation. The RPL has multifactorial origin. Among several factors associated with RPL, changes in hemostasis may impair the blood flow in the placenta and thus may increase the risk of obstetric complications, such as pregnancy loss. The general aim of this study was to investigate the association between genetic polymorphisms (in the genes of fibrinogen (FGB -455G>A and -148C>T), thrombomodulin (THBD 1418C>T), factor V (F5 1691G>A), prothrombin (F2 20210 G>A), PAI-1 (SERPINE1 4G/5G) and TAFI (CPB2 c.505G>A)) and recurrent pregnant losses (primary and secondary). The specific aims of this study were: 1 - to evaluate the association between the seven polymorphisms and the period in which the fetal losses occurred (early or late) and the number of recurrent losses; 2 - to determine if the haplotypes of polymorphisms FGB -455G>A and FGB -148C>T present association with primary and secondary pregnant losses. We included 256 women with a RPL history, from the Ambulatory of Obstetrics from Clinical Hospital of the Medical School of USP and 264 healthy women without losses history that have had at least two normal pregnancies (control group), matched according to age. Blood samples were obtained to perform the genotyping of polymorphisms by real-time PCR (FGB -148C>T, FGB -455G>A, THBD 1418C>T and CBP2 c.505G>A), and PCR-RFLP (SERPINE1 4G/5G, F5 1691G>A and F2 20210G>A). The frequencies of genotypes and alleles for the seven genetic polymorphisms were similar in 3 groups. However, when it was performed a model of multivariate logistic regression, which included the independent variables: F5 1691G>A (GG vs GA reference), F2 20210G>A (GG vs GA reference), CBP2 c.505G>A (GG + GA reference vs AA), THBD 1418C>T (reference CC + CT vs TT), SERPINE1 4G/5G (reference 5G/5G + 4G/5G vs 4G/4G), FGB -455G>A (GG reference vs GA vs AA) and FGB - 148C>T (reference CC vs CT vs TT), only the polymorphism FGB 148C>T polymorphism was associated with a higher risk of having primary losses (OR: 2.91, 95% CI 1.02 to 8.29, p = 0.045). When the haplotypes for the polymorphisms FGB -455G>A and FGB -148C>T were considered, had a higher frequency of the haplotype 455G/148T in women with primary RPL (3.4%) than in the control group (1.1%) (p = 0.030); but this effect was not observed in secondary RPL. Regarding the number of successive pregnant losses, there was a trend (p = 0.060) to higher frequency of the TT genotype for FGB -148C>T polymorphism in the group with primary RPL up to three losses when compared with women of the same group, but with loss number higher than three. In conclusion, when the seven genetic polymorphisms were evaluated separately, they do not show association with RPL, however, in multivariate logistic regression analysis, the TT genotype of the FGB -148C>T polymorphism was associated with increased risk for primary RPL. Furthermore, it was found higher frequency of the haplotype 455G/148T for the FGB -455G>A and FGB -148 C>T polymorphisms in women with primary RPL.
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Influência dos polimorfismos do gene da Perilipina1 (PLIN1) no risco de síndrome metabólica e na perda de peso em crianças e adolescentes obesos / Effects of Perilipin1 (PLIN1) gene variation on metabolic syndrome risk and weight loss in obese children and adolescentsDeram, Sophie Marie Michèle 18 August 2010 (has links)
Introdução: Perilipina, a proteína mais abundante no adipócito, tem um papel importante na regulação da lipólise intracelular. Polimorfismos genéticos no lócus da perilipina1 (PLIN1) foram estudados e associados à obesidade e aos riscos de alterações dos fatores da síndrome metabólica (SM) em populações diferentes. Objetivo: Avaliamos crianças e adolescentes obesos (CAO) antes e após tratamento multidisciplinar com reeducação alimentar e estímulo à prática de atividade física, por um período de 20 semanas. Estudamos a associação entre SNPs (Polimorfismos de um Único Nucleotídeo) e dados antropométricos e metabólicos, como também a resposta à perda de peso após a intervenção. Metodologia: Foram avaliados 234 CAO (idade 10,6±1,3 anos) (IMC 30,4±4,5 kg/m2; ZIMC 2,31±0,28). As genotipagens dos SNPs PLIN1* 6209T>C, PLIN4* 11482G>A e PLIN6* 14995A>T foram realizadas através de PCR em Tempo Real. A ingestão alimentar foi calculada pelo método de registro da ingestão de três dias. O SM foi avaliado pelos critérios do IDF. Resultados: As freqüências dos alelos PLIN1*, 0,48; PLIN4*, 0,30 e PLIN6*, 0,26 foram semelhantes às outras populações; PLIN1* e PLIN4* mostraram um desequilíbrio de ligação (DL) (D=0,999, r=0,67). Antes da intervenção, não houve diferenças nas medidas antropométricas, porém a presença do alelo A no PLIN4 foi associada a triglicérides mais elevados (111±49 x 93,9±42,5 mg/dL P= 0,003), HDLC mais baixo (40±9 x 43,6±10mg/dL P=0,003) e HOMA-IR maior (4,0± 2,3 x 3,5±2,1 P=0,015). A presença do alelo A no PLIN4* associou-se a um risco relativo maior de ter SM (ajustado por idade e sexo: 2,4 (95% Intervalo de confiança: 1,1-4,9) para heterozigoto e 3,5 (95% Intervalo de confiança: 1,2-9,9) para homozigoto. Os resultados do PLIN1* foram semelhantes devido ao DL. Após intervenção, a presença do alelo T no PLIN6* foi associada a uma resposta melhor na perda de peso (3,3±3,7 x 1,9±3,5 kg; P=0,002) e uma maior perda de ZIMC (0,23±0,18 x 0,18±0,15; P=0,01). Discussão: Este estudo mostrou a influência da presença do alelo A no PLIN4* sobre o risco de ter SM em crianças e adolescentes obesos similares em termos antropométricos e de ingestão alimentar. Foi mostrado também que a presença do alelo T no PLIN6* influencia uma melhor resposta de perda de peso durante intervenção multidisciplinar. Conclusões: Os resultados sugerem que os polimorfismos da Perilipina têm influência nas co-morbidades associadas à obesidade e podem ajudar nas estratégias aplicadas no tratamento multidisciplinar em crianças e adolescentes obesos / Introduction: Genetic polymorphisms at the perilipin1 (PLIN1) locus have been investigated for their potential utility as markers for obesity and metabolic syndrome (MS). We examined in obese children and adolescents (OCA) aged 714 yr the association of single-nucleotide polymorphisms (SNP) at the PLIN1 locus with anthropometric, metabolic traits, and weight loss after 20-wk multidisciplinary behavioral and nutritional treatment without medication. Design: A total of 234 OCA (body mass index (BMI) = 30.4 ± 4.5 kg/m2; BMI Z-score = 2.31 ± 0.28) were evaluated at baseline and after intervention. We genotyped four SNPs (PLIN1* 6209T>C, PLIN4* 11482G>A and PLIN6* 14995A>T). Results: Allele frequencies were similar to other populations, PLIN1* and PLIN4* were in linkage disequilibrium (D´= 0.999; P=0.001). At baseline, no anthropometric differences were observed, but minor allele A at PLIN4* was associated with higher triglycerides (111 ± 49 vs. 94 ± 42 mg/dl; P = 0.003), lower high-density lipoprotein cholesterol (40 ± 9 vs. 44 ± 10 mg/dl; P = 0.003) and higher homeostasis model assessment for insulin resistance (4.0±2.3 vs. 3.5±2.1; P=0.015). Minor allele A at PLIN4*was associated with MS risk (age and sex adjusted) hazard ratio 2.4 (95% confidence interval = 1.1 4.9) for genotype GA and 3.5 (95% confidence interval = 1.29.9) for AA. After intervention, subjects carrying minor allele T at PLIN6* had increased weight loss (3.3±3.7 vs. 1.9±3.4 kg; P=0.002) and increased loss of the BMI Z-score (0.23±0.18 vs. 0.18±0.15; P=0.01). Due to group size, risk of by-chance findings cannot be excluded. Conclusion: The minor A allele at PLIN4* was associated with higher risk of MS at baseline, whereas the PLIN6* SNP was associated with better weight loss, suggesting that these polymorphisms may predict outcome strategies based on multidisciplinary treatment for OCA
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Anomalias dentárias como extensão fenotípica das fissuras orais: estudos moleculares de genes e regiões candidatas / Dental anomalies as phenotypic extension of oral clefts: molecular studies of candidate genes and chromosomal regionsLetra, Ariadne Machado Gonçalves 04 May 2007 (has links)
A fissura labial com ou sem fissura palatina (FL/P) é uma anomalia craniofacial muito comum em humanos, e pode ocorrer como característica de um quadro sindrômico ou isolada, quando os indivíduos afetados não apresentam qualquer anomalia estrutural associada. A etiologia da FL/P isolada é complexa, com a contribuição de componentes genéticos e ambientais. Diversos genes/loci candidatos a FL/P foram sugeridos nos últimos anos, apesar de discrepâncias entre resultados. Alguns autores consideram a FL/P como parte de um fenótipo mais amplo, e sugerem que características clínicas adicionais, como a presença de anomalias dentárias, poderiam ser utilizadas para uma melhor descrição do fenótipo individual em investigações genéticas da FL/P. Quinhentos indivíduos com FL/P e quinhentos indivíduos sem FL/P e não relacionados entre si foram examinados com relação ao tipo de fissura e anomalias dentárias apresentadas e amostras de saliva foram coletadas de cada indivíduo para estudos moleculares. A freqüência das anomalias dentárias foi significativamente maior nos indivíduos com FL/P e as associações preferenciais observadas para algumas anomalias e determinados subfenótipos de FL/P foram consideradas novos subfenótipos de FL/P e incluídos nas análises moleculares. Um total de 30 polimorfismos distribuídos nos genes MMP1, MMP3, MMP9, TGFA, IRF6 e no cromossomo 6q foram estudados com relação à associação com a FL/P e seus subfenótipos através de restrição enzimática, PCR cinético e método Taqman. As diferenças observadas para as freqüências dos genótipos e alelos de cada polimorfismo estudado em casos e controles foram avaliadas estatisticamente através do teste Qui-quadrado e correção de Bonferroni para múltiplos testes. O padrão de desequilíbrio de ligação entre os polimorfismos estudados também foi avaliado. Os genes MMP3, TGFA, IRF6, e outros e três genes (PRSS35, SNAP91 e CYB5R4) e dois polimorfismos localizados no cromossomo 6q mostraram-se associados a FL/P e seus subfenótipos na população estudada. / Cleft lip with or without cleft palate (CL/P) is a common craniofacial anomaly in humans, and may occur as part of a syndrome or isolated, when the affected individuals do not present any associated structural anomalies. The etiology of CL/P is complex, with both genetic and environmental factors involved. Several genes/loci have been suggested in the past years although discrepancies among results are often found. Some investigators consider CL/P as part of a broader phenotype, and suggest that additional clinical characteristics, such as the presence of dental anomalies, could be used for a better description of the individual phenotype in genetic studies. Five hundred individuals with CL/P and five hundred non-related individuals without CL/P were examined regarding type of cleft and dental anomalies and saliva samples were collected from each individual for molecular analysis. The frequencies of the dental anomalies were significantly higher in CL/P individuals than controls, and the preferential associations observed for certain anomalies in specific cleft subphenotypes were considered new subphenotypes and included in the molecular analyses. A total of 30 polymorphisms distributed in MMP1, MMP3, MMP9, TGFA, and IRF6 genes and in chromosome region 6q were assayed regarding association with CL/P and its subphenotypes through restriction-fragment length polymorphism, kinetic PCR and Taqman methods. Differences in allele and genotype frequencies observed in cases and controls for each polymorphism were assessed using Chi-square test and Bonferroni correction. The pattern of linkage disequilibrium among the markers was also evaluated. Associations between CL/P and markers in MMP3, TGFA, and IRF6 genes were observed. Additionally, three genes (PRSS35, SNAP91 and CYB5R4) and two polimorphisms in chromosome 6q region also demonstrated association to CL/P and its phenotypes in the population studied.
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O PAPEL DOS POLIMORFISMOS DE GENES DA VIA DE REPARO COM A RADIOTOXICIDADE EM PACIENTES COM CÂNCER DE CÓLO UTERINOCarvalho, Ana Terra Silva 18 May 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-05-18 / In Brazil, cervical cancer is the second most common among
women. Radiation therapy is part of its interdisciplinary management, playing
an important role in their loco regional control. The major challenge of modern
medicine in radiotherapy is to develop predictive methods that can determine
the level of radiosensitivity of the patient and the healthy surrounding tissue in
order to individualize the prescribed radiation dose, to prevent severe side
effects and promoting better local tumor control. This study evaluated the
acute and chronic adverse effects on the skin, lower gastrointestinal tract and
urinary tract of radiotherapy in 47 cervical cancer patients. Methods and
Materials: Biological material was collected and DNA from peripheral blood
was extracted of all patients studied. The fragments of TP53 and ATM were
amplified to be sequenced, to verify if there are any polymorphisms witch
could be responsible to the radiosensitivity of the patients. Results and
Discussion: In a univariate analysis, the variable age was strongly
associated with a risk of acute toxicity skin (p=0,023). Patients that received a
high dose of external beam radiation and patients who have undergone
brachytherapy, showed a significantly higher incidence of chronic urinary tract
toxicity (p=0,031) and (p=0,019), respectively. The exchange G>A in the
position 5557 of the ATM gene was significantly associated with the risk of
acute lower gastrointestinal tract (p=0,008). There wasn t association between
the other TP53 polymorphisms analyzed and the frequency of side effects
(p>0,05). Our data revealed that patients who evolved significant association
presented death (p=0,019) with the increase of chronic skin radiossensitivity.
Conclusions: These observations corroborate the importance of investigating
the genetic profile to predict adverse side effects in cervical cancer patients
undergoing radiotherapy. These genes have an important role in DNA repair
pathways and probably are capable of modifying the responses of normal
tissues to radiotherapy. / No Brasil, o câncer cervical é o segundo mais
comum entre as mulheres. A radioterapia faz parte do seu manejo
interdisciplinar, desempenhando papel importante em seu controle loco
regional. O grande desafio da medicina moderna em radioterapia é
desenvolver métodos preditivos que possam determinar o grau de
radiossensibilidade da paciente e dos tecidos adjacentes saudáveis, afim de
individualizar a dose de radiação prescrita, prevenindo efeitos colaterais
severos e promovendo um melhor controle tumoral local. Este estudo avaliou
os efeitos adversos agudos e crônicos na pele, trato gastrointestinal inferior e
trato urinário durante a radioterapia, em 47 pacientes de câncer do colo do
útero. Material e Métodos: O DNA foi extraído do material biológico (sangue
periférico) coletado de todas as pacientes estudadas. Os fragmentos de TP53
e ATM foram amplificados e em seguida sequenciados, afim de verificar se
há qualquer polimorfismo que poderia ser responsável pela
radiossensibilidade das pacientes. Resultados e Discussão: Por meio de
uma análise univariada, a variável idade do diagnóstico se associou
fortemente ao risco de desenvolvimento de toxicidade aguda da pele
(p=0,023). Pacientes que receberam uma dose elevada de teleterapia e
pacientes que foram submetidas a braquiterapia, mostraram uma incidência
significativa de toxicidade crônica do trato urinário (p=0,031) e (p=0,019),
respectivamente. A troca G>A na posição 5557 do gene ATM mostrou uma
associação significativa com o risco de toxicidade aguda do trato
gastrinstestinal inferior (p=0,008). Não houve associação entre os
polimorfismos de TP53 analisados e a frequência de efeitos adversos
(p>0,05). Nossos dados revelaram ainda que pacientes que evoluíram a óbito
apresentaram associação significativa (p=0,019) com a o aumento de
radiossensibilidade crônica da pele. Conclusão: Estas observações
corroboram a importância de investigar o perfil genético para prever efeitos
adversos em pacientes com câncer cervical submetidas a radioterapia. Esses
genes têm um papel importante em vias de reparo de DNA e provavelmente
são capazes de modificar as respostas dos tecidos normais para radioterapia.
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ESTUDO DE POLIMORFISMOS NOS GENES GSTT1 E GSTM1 E SUAS ASSOCIAÇÕES AO TABAGISMO E AO CÂNCER DE CAVIDADE ORAL.Lopes, Ana Karolina 11 March 2016 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:55:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1
ANA KAROLINA LOPES.pdf: 9734532 bytes, checksum: 4203439893759543f5fa8773dd844696 (MD5)
Previous issue date: 2016-03-11 / The oral cancer is considered a public health problem worldwide. Are estimated for the
biennium 2016-2017, in Brazil, 15,490 new cases of this disease that is the result of
interactions between genetic and environmental factors, therefore, considered to be
multifactorial. Genes related to the carcinogen detoxification process can influence the
risk of developing cancer of the oral cavity. The objective of this study was to evaluate
the relationship between tobacco risk factor, polymorphisms of GSTM1 and GSTT1 and
the risk for oral cancer. The series consisted of 100 cases of patients diagnosed with
oral cavity cancer, in 2005 and 2006, in the Hospital Araújo Jorge, Goiânia - GO and 70
control individuals without cancer. After DNA extraction from paraffin material from the
group of cases and peripheral blood for the control group, the samples were analyzed
by PCR and separated by electrophoresis. The frequency of null polymorphisms for the
case group was 28.0% for GSTM1 and 49.0% to GSTT1. Among the control group, the
frequency of null polymorphism was 31.5% for GSTM1 and 44.3% to GSTT1. The
results showed that the GSTM1 and GSTT1 null genotypes were not associated with
oral cancer in the population studied, as well as no significant association of
polymorphisms with smoking status has not been established. The overall survival of
patients with oral cavity cancer included in this study was 51,71%, however, the
prognosis of this disease were not significantly associated with the GSTT1 and GSTM1
polymorphisms. The oral cancer was more correlated whith risk factors than genetic
factors. Further studies correlating other xenobiotics metabolizing genes, must be
performed in order to elucidate the influence of genetic polymorphisms in increasing the
risk for cancer of the oral cavity and other cancers induced by toxic agents. / O câncer de cavidade oral é considerado um problema de saúde pública em todo o
mundo. Estimam-se para o biênio 2016-2017, no Brasil, 15.490 novos casos dessa
patologia que é resultado de interações entre fatores genéticos e fatores ambientais,
portanto, considerada como multifatorial. Genes relacionados com o processo de
detoxificação de carcinógenos podem interferir no risco para o desenvolvimento de
câncer de cavidade oral. Este estudo objetiva avaliar a relação entre o fator de risco
tabaco, os polimorfismos de GSTM1 e GSTT1 e o risco para o câncer de cavidade oral.
No estudo, foram incluídos 100 casos de pacientes diagnosticados com câncer de
cavidade oral, nos anos de 2005 e 2006, no Hospital Araújo Jorge, Goiânia-GO e 70
controles de indivíduos sem história de câncer. Após extração de DNA do material
parafinado do grupo de casos e de sangue periférico para grupo controle, as amostras
foram avaliadas por técnica de PCR e separação por eletroforese. A frequência de
polimorfismos nulos para o grupo de casos foi de 28,0% para GSTM1 e 49,0% para
GSTT1. No grupo controle, a frequência dos polimorfismos nulos foi de 31,5% para
GSTM1 e de 44,3% para GSTT1. Não foi possível estabelecer uma associação
significativa entre os polimorfismos dos genes GSTM1 e GSTT1 e o aumento do risco
para o câncer de cavidade oral, bem como não foi estabelecida nenhuma associação
significativa dos polimorfismos com o hábito tabagista. A sobrevida global dos
pacientes com câncer de cavidade oral incluídos neste estudo foi de 51,71%, porém, os
fatores prognósticos desta patologia não foram significativamente associados aos
polimorfismos de GSTT1 e GSTM1, correlacionando o câncer de cavidade oral mais a
fatores de risco do que a fatores genéticos. Novos estudos, que correlacionem outros
genes metabolizadores de xenobióticos, precisam ser realizados a fim de elucidar a
influência dos polimorfismos genéticos no aumento do risco para o câncer de cavidade
oral e demais cânceres induzidos por agentes tóxicos.
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Estudo de associação entre obesidade na infância e os SNPs TaqIA C32806T do gene DRD2 e G308A do gene TNF-aPinto, Renata Machado 26 March 2014 (has links)
Submitted by admin tede (tede@pucgoias.edu.br) on 2017-02-06T17:10:02Z
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RENATA MACHADO PINTO.pdf: 1879389 bytes, checksum: 1e831384ae5ac2534e9b7187fd6e1ae5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-06T17:10:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1
RENATA MACHADO PINTO.pdf: 1879389 bytes, checksum: 1e831384ae5ac2534e9b7187fd6e1ae5 (MD5)
Previous issue date: 2014-03-26 / The worldwide prevalence of obesity has increased at an alarming rate in all age groups.
Although it has been described some rare obesity syndromes caused by mutations in single
genes, the highest proportion of obesity results from an interaction between variants in multiple
genes (susceptible genotype) and a favorable environment (plenty of calories and lack of
physical activity). Classically, it has been studied genes involved in the control of intake, energy
expenditure and the metabolism of glucose and lipids. In the last decade the discovery of
numerous substances secreted by adipocytes among them hormones and inflammatory cytokines
opened a new research front. The “Reward Deficient Syndrome” (RDS) is characterized as a
hypodopaminegic state that predisposes to obsessive-compulsive behavior and impulsivity.
Obesity is part of the RDS, as the individual overeats as a manner to compensate de dopamine
defect. In this context, this study was designed to investigate the relationship between childhood
onset obesity and polymorphisms of the tumor necrosis factor alpha (TNF alpha) and the
Dopamine D2 Receptor (DRD2). Our research is a case control study that included 105 children,
being 55 obese and 50 normal weight (control group). Peripheral blood samples were collected
for the determination of lipid profile, glucose and insulin levels, and for the evaluation of the
genetic polymorphisms of TNF- gene (G308A) and DRD2 (Taq1 - C32806T), by ARMS-PCR
and RFLP-PCR, respectively. Genetic variants of the SNP G308A TNF- failed to confirm a
participation in weight gain in children. The A1 allele (T) of the Taq1 polymorphism in the
DRD2 gene was associated with an increase in childhood obesity and higher BMI of the parents,
corroborating some data of the literature. Our results showed for the first time that the A1 allele
is associated with Total Cholesterol 70 mg/dl, minor levels of triglycerides and a relative risk
of 1.5 for HOMA ß
secretion. Understanding how genetic variations affect the tendency to become or remain obese
is an important step in understanding the mechanisms that lead to obesity. / A prevalência mundial da obesidade tem aumentado a um ritmo alarmante em todos os grupos
etários. Embora tenham sido descritas algumas síndromes raras de obesidade causadas por
mutações em genes individuais, a maior proporção de obesidade resulta de uma interação entre
variantes em vários genes (genótipo suscetível) e um ambiente favorável (abundância de calorias
e falta de atividade física). Classicamente, tem-se estudado genes envolvidos no controle da
ingestão, do gasto de energia e do metabolismo da glicose e lipídios. Na última década a
descoberta de numerosas substâncias secretadas pelos adipócitos, entre elas hormônios e
citocinas inflamatórias abriu uma nova frente de pesquisa. A "Síndrome de Deficiência de
Recompensa" (RDS) é caracterizada como um estado hipodopaminérgico que predispõe a
comportamentos obsessivo-compulsivos e impulsividade. A obesidade é parte da RDS, já que o
indivíduo come demais como uma forma de compensar o defeito nos níveis de dopamina. Neste
contexto, o presente estudo foi desenhado para investigar a relação entre a obesidade de início na
infância e polimorfismos do fator de necrose tumoral alfa (TNF- ) e do Receptor D2 de
dopamina (DRD2). Nossa pesquisa é um estudo de caso-controle que incluiu 105 crianças, sendo
55 obesas e 50 eutróficas (grupo controle). Amostras de sangue periférico foram colhidas para a
determinação do perfil de lipídios, glicemia e os níveis de insulina, e para a avaliação dos
polimorfismos do gene do TNF - (G308A) e DRD2 - C32806T), por ARMS - PCR e
PCR - RFLP, respectivamente. Variantes genéticas do SNP G308A do TNF- não conseguiu
confirmar uma participação no ganho de peso em crianças. O alelo A1 (T) do polimorfismo
Taq1A do gene DRD2 foi associado a um aumento da obesidade infantil e IMC superior dos
pais, corroborando alguns dados da literatura. Os nossos resultados mostram pela primeira vez
que o alelo A1 está associado a colesterol total , a menores níveis de triglicérides, e
confere um risco relativo de 1,5 para HOMA ß
proteção contra a secreção de insulina prejudicada. A compreensão de como variações genéticas
afetam a tendência de tornar-se ou permanecer obeso é um passo importante na compreensão dos
mecanismos que levam à obesidade.
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AVALIAÇÃO EPIDEMIOLÓGICA DE PACIENTES SUBMETIDOS AO TESTE DE GALACTOMANANA SÉRICA COM SUSPEITA DE ASPERGILOSE INVASIVACunha, Daiane de Oliveira 13 March 2017 (has links)
Submitted by admin tede (tede@pucgoias.edu.br) on 2017-04-27T14:24:41Z
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DAIANE DE OLIVEIRA CUNHA.pdf: 2074632 bytes, checksum: 76e82c4169a9d294dcddcc8e9ad849cb (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-27T14:24:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1
DAIANE DE OLIVEIRA CUNHA.pdf: 2074632 bytes, checksum: 76e82c4169a9d294dcddcc8e9ad849cb (MD5)
Previous issue date: 2017-03-13 / The present dissertation was constructed in the form of scientific articles, being constituted by two
articles. The first one, titled "Epidemiological evaluation of patients submitted to the serum
galactomannan test with suspected Aspergillosis Invasive", aimed to evaluate the incidence of
Invasive Aspergillosis in patients with hematological diseases followed at a reference hospital in
Goiânia, Goiás, Brazil. Determine the main factors that contribute to the development of the disease.
For this, 1367 samples of 264 patients with malignant hematological diseases treated in the
Hematology Sector of Hospital Araújo Jorge, who underwent galactomannan detection, were
evaluated in the period from 2013 to 2015, and were excluded patients who had no clinical data in
Medical records and loss of follow-up at the hospital. Among the data obtained through the present
study it was observed that the mean age was 43.7 years, where 55.5% were male. Of the total number
of patients evaluated, 133 performed BMT, 38.9% of which were autologous and 17.9% of the
allogeneic type. According to the classification for Invasive Aspergillosis according to the European
Organization for Research and Treatment of Cancer, the disease was interpreted as proven in 7.3%,
defined by culture positive for the fungus, 6.4% as probable by the detection of galactomannan in the
Blood and presence of pulmonary infiltrates and 5.1% as possible by radiological alterations
suggestive of Invasive Aspergillosis and galactomannan negative. The estimated / probable / probable
Aspergillosis Invasive mortality rate was 61.3% and showed that the disease was significantly
associated with the risk of death (p <0.0001). When considering the high mortality rate caused by the
development of Aspergillosis Invasive and the fact that an early therapy promotes a significant
improvement in the prognosis of patients, we conclude that the detection of galactomannan, performed
as a follow-up of patients at high risk of developing the disease, can Be considered an effective
method to aid in the identification of Invasive Aspergillosis. The second article entitled "Association
between polymorphisms of genes encoding Dectin-1 and Toll-like cellular receptors and susceptibility
to Invasive Aspergillosis", aimed to describe the polymorphisms in genes encoding Dectin-1 and Tolllike
receptors, Seeking possible associations with the individual susceptibility to Invasive
Aspergillosis. This study used as a methodological basis a systematic review of the literature and as a
database to PubMed and PMC of the NCBI. The keywords used were: Invasive aspergillosis,
polymorphism, Dectin-1 and Toll-like. From this search, 415 studies were found and according to the
inclusion and exclusion criteria 8 studies were selected. With the accomplishment of this, it was
verified that several are the studies that describe the single base polymorphisms with a greater
susceptibility to the Invasive Aspergillosis. The major ones are in genes encoding Toll-like receptors
and those that encode cytokines and chemokines (Dectin-1). Thus, it can be observed that, according
to studies already carried out, there is a significant association of genetic polymorphisms with
Aspergillosis Invasive, but more extensive studies must be performed to obtain more reliable results.
In general, we conclude with this dissertation that the development of Invasive Aspergillosis is
associated with several factors, one of them being genetic, and that, due to the high mortality rates
caused by Invasive Aspergillosis, the detection of galactomannan is of fundamental importance for the
Treatment of patients who are more likely to develop the disease, mainly aiding in the prognosis and
early diagnosis of it. / A presente dissertação foi construída na modalidade de artigos científicos, sendo constituída por dois
artigos. O primeiro, intitulado “Avaliação epidemiológica de pacientes submetidos ao teste de
galactomanana sérica com suspeita de Aspergilose Invasiva”, teve como objetivo avaliar a incidência
de Aspergilose Invasiva em pacientes com doenças hematológicas acompanhadas em um hospital de
referência de Goiânia, Goiás, Brasil, e determinar os principais fatores que contribuem para o
desenvolvimento da doença. Para isso, foram avaliadas 1367 amostras de 264 pacientes com doenças
hematológicas malignas tratadas no Setor de Hematologia do Hospital Araújo Jorge, os quais
realizaram exame de detecção de galactomanana, no período de 2013 a 2015, e foram excluídos
pacientes que não possuíam dados clínicos em prontuários e com perda de seguimento no hospital.
Dentre os dados alcançados por meio do presente estudo observou-se que a média de idade foi de 43,7
anos, onde 55,5% eram pertencentes ao sexo masculino. Do total de pacientes avaliados, 133
realizaram TMO, sendo que 38,9% eram do tipo autólogo e 17,9% do tipo alogênico. De acordo com a
classificação para Aspergilose Invasiva conforme a European Organization for Research and
Treatment of Cancer, a doença foi interpretada como comprovada em 7,3%, definida por cultura
positiva para o fungo, 6,4% como provável pela detecção de galactomanana no sangue e presença de
infiltrados pulmonares e 5,1% como possível por alterações radiológicas sugestivas de Aspergilose
Invasiva e galactomanana negativo. A taxa de mortalidade para Aspergilose Invasiva
comprovada/provável/possível foi de 61,3% e mostrou que a doença estava significativamente
associada com o risco de morte (p<0,0001). Ao considerarmos a alta taxa de mortalidade causada pelo
desenvolvimento da Aspergilose Invasiva e que a realização de uma terapia precoce promove
significativa melhora do prognóstico dos pacientes, concluímos que a detecção de galactomanana,
realizada como acompanhamento dos pacientes com alto risco de desenvolver a doença, pode ser
considerada um método eficaz para auxiliar na identificação de Aspergilose Invasiva. O segundo
artigo, intitulado “Associação entre polimorfismos dos genes que codificam os receptores celulares
Dectina-1 e Toll-like e susceptibilidade à Aspergilose Invasiva”, teve como objetivo descrever os
polimorfismos nos genes que codificam os receptores Dectina-1 e Toll-like, buscando possíveis
associações com a susceptibilidade individual à Aspergilose Invasiva. Este estudo utilizou como base
metodológica uma revisão sistemática da literatura e como base de dados a PubMed e PMC do NCBI.
As palavras-chaves utilizadas foram: Invasive aspergillosis, polymorphism, Dectin-1 e Toll-like. A
partir desta busca, 415 estudos foram encontrados e de acordo com os critérios de inclusão e exclusão
8 estudos foram selecionados. Com a realização deste, constatou-se que vários são os estudos que
descrevem os polimorfismos de base única com uma maior susceptibilidade à Aspergilose Invasiva.
Os principais são em genes que codificam os receptores Toll-like e os que codificam citocinas e
quimiocinas (Dectina-1). Assim, pode-se perceber que de acordo com estudos já realizados há uma
associação significativa de polimorfismos genéticos com a Aspergilose Invasiva, porém estudos mais
amplos devem ser realizados para se obter resultados mais fidedignos. De modo geral, concluímos
com essa dissertação que o desenvolvimento da Aspergilose Invasiva está associado com diversos
fatores, sendo um deles o genético, e que, devido aos altos índices de mortalidade causados pela
Aspergilose Invasiva, a detecção de galactomanana é de fundamental importância para o tratamento
dos pacientes que apresentam uma maior probabilidade de desenvolver a doença, auxiliando
principalmente no prognóstico e diagnóstico precoce da mesma.
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520 |
Variantes do gene RALDH2 e doenças cardíacas congênitas. / RALDH2 genetic variants and congenital heart disease.Rodrigues, Marilene Elizabete Pavan 22 October 2007 (has links)
Nós investigamos o papel da variação genética do gene RALDH2 e as doenças cardíacas congênitas (DCCs). Seis SNPs foram utilizados em um estudo de TDT. Testes de associação foram desenvolvidos e tanto os marcadores testados quanto os haplótipos analisados não mostraram associação com a doença. Análise do polimorfismo A151G indica que a variante produz mudanças substanciais na estrutura do RNAm. Esta variante está localizada em um exonic splicing enhancer (ESE). Estudos funcionais de splicing não mostraram impacto significante desta variante sobre a alteração do splicing do gene. Este estudo foi aplicado à outra mutação (G151T) encontrada no exon 4 durante o sequenciamento do gene RALDH2 e mostrou aumento no sinal de splicing. Nós encontramos mais quatro mutações: rs34645259 (5\'UTR), T157G (exon 4), rs4646626 (exon 9) e rs35251510 (exon 11). Em resumo, não foi encontrada associação entre DCCs e variações genéticas no gene RALDH2. As mutações encontradas deverão ser analisadas funcionalmente de forma a definir seu papel na perturbação da via do AR em humanos. / The aim of the study was to investigate the role of genetic variation in the RALDH2 locus and congenital heart disease. Six different SNPs were analyzed in 101 patient-parents trios in a TDT study. None of the markers displayed any association with CHD. No single haplotype was associated with an increased risk of CHD. Analysis of the A151G polymorphism indicated that the variant produced substantial changes in mRNA structure. This variant is also localized in a putative exonic splicing enhancer (ESE). Functional splicing studies failed to reveal a significant impact of this variant and gene splicing. This methodology was applied to another mutation (G151T) found in exon 4 during the sequencing of RALDH2 gene and an increase in splicing signal was observed. We found four mutations more: rs34645259, T157G (exon 4), rs4646626 and rs35251510. In summary, no association between CHD and genetic variation at the RALDH2 locus in humans was found. Potential functional genetic variants should be further studied in order to define their real role in RA pathway disturbances.
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