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Auxin-mediated fruit development and ripening : new insight on the role of ARFs and their action mechanism in tomato (S. lycopersicum) / L’auxine dans le développement et la maturation des fruits : rôle des ARF et leur mécanisme d'action chez la tomate (S. lycopersicum)

Hao, Yanwei 14 November 2014 (has links)
L'auxine est une hormone végétale qui coordonne plusieurs processus de développement des plantes à travers la régulation d'un ensemble spécifique de gènes. Les Auxin Response Factors (ARF) sont des régulateurs transcriptionnels qui modulent l'expression de gènes de réponse à l’auxine. Des données récentes montrent que les membres de la famille des ARF sont impliqués dans la régulation du développement des fruits de la nouaison à la maturation. L'objectif principal de la thèse est d’étudier la part qui revient aux ARF dans le contrôle du développement et de la maturation des fruits et d’en comprendre les mécanismes d’action. L’analyse des données d’expression disponibles dans les bases de données a révélé que, parmi tous les ARF de tomates, SlARF2 affiche le plu haut niveau d'expression dans le fruit avec un profil distinctif d’expression associé à la maturation. Nous avons alors entrepris la caractérisation fonctionnelle de SlARF2 afin d’explorer son rôle dans le développement et la maturation des fruits. Deux paralogues, SlARF2A et SlARF2B, ont été identifiés dans le génome de la tomate. Nous avons montré que l’expression de SlARF2A dans le fruit est régulée par l'éthylène tandis que celle de SlARF2B est induite par l'auxine. La sous-expression de SlARF2A, comme celle de SlARF2B, entraine un retard de maturation alors que l’inhibition simultanée des deux paralogues conduit à une inhibition plus sévère de la maturation suggérant une redondance fonctionnelle entre les deux paralogues lors de la maturation des fruits. Les fruits présentant une sous-expression des gènes SlARF2 produisent de faibles quantités d'éthylène, montrent une faible accumulation de pigments et une plus grande fermeté. Le traitement avec de l'éthylène exogène ne peut pas inverser les phénotypes de défaut de maturation suggérant que SlARF2 pourrait agir en aval de la voie de signalisation de l'éthylène. L'expression des gènes clés de biosynthèse et de signalisation de l'éthylène est fortement perturbée dans les lignées sous-exprimant SlARF2 et les gènes majeurs qui contrôlent le processus de maturation (RIN, CNR, NOR, TAGL1) sont sensiblement sous-régulés. Les données suggèrent que SlARF2 est essentiel pour la maturation des fruits et qu’il pourrait agir au croisement des voies de signalisation de l'auxine et de l'éthylène. Dans le but de mieux comprendre les mécanismes moléculaires par lesquels les ARF régulent l'expression des gènes de réponse à l'auxine, nous avons étudié l'interaction des SlARFs avec des partenaires protéiques ciblés, principalement les co-répresseurs de type Aux/IAA et Topless (TPL) décrits comme les acteurs clés dans la répression des gènes dépendant de la signalisation auxinique. Une fois les gènes codant pour les membres de la famille TPL de tomate isolés, une approche double hybride dans la levure a permis d’établir des cartes exhaustives d'interactions protéine-protéine entre les membres des ARFs et des Aux/IAA d’une part et les ARFs et les TPL d’autre part. L'étude a révélé que les Aux/IAA interagissent préférentiellement avec les SlARF activateurs et qu’à l’inverse les Sl-TPL interagissent uniquement avec les SlARF répresseurs. Les données favorisent l'hypothèse que les ARF activateurs recrutent les Sl-TPL via leur interaction avec les Aux/IAA, tandis que les ARF répresseurs peuvent interagir directement avec les Sl-TPL. Les études d’interactions ont permis également d’identifier de nouveaux partenaires comme les protéines VRN5 et LHP1, composantes des complexes Polycomb PRC impliqués dans la repression par voie épigénétique de la transcription par modification de l'état de méthylation des histones. Au total, le travail de thèse apporte un nouvel éclairage sur le rôle et les mécanismes d'action des ARF et identifie SlARF2 comme un nouvel élément du réseau de régulation contrôlant le processus de maturation des fruits chez la tomate. / The plant hormone auxin coordinates plant development through the regulation of a specific set of auxin-regulated genes and Auxin Response Factors (ARFs) are transcriptional regulators modulating the expression of auxin-response genes. Recent data demonstrated that members of this gene family are able to regulate fruit set and fruit ripening. ARFs are known to act in concert with Aux/IAA to control auxin-dependent transcriptional activity of target genes. However, little is known about other partners of ARFs. The main objective of the thesis research project was to gain more insight on the involvement of ARFs in fruit development and ripening and to uncover their interaction with other protein partners beside Aux/IAAs. Mining the tomato expression databases publicly available revealed that among all tomato ARFs, SlARF2 displays the highest expression levels in fruit with a marked ripening-associated pattern of expression. This prompted us to uncover the physiological significance of SlARF2 and in particular to investigate its role in fruit development and ripening. Two paralogs, SlARF2A and SlARF2B, were identified in the tomato genome and transactivation assay in a single cell system revealed that the two SlARF2 proteins are nuclear localized and act as repressors of auxin-responsive genes. In fruit tissues, SlARF2A is ethylene-regulated while SlARF2B is auxin-induced. Knock-down of SlARF2A or SlARF2B results in altered ripening with spiky fruit phenotype, whereas simultaneous down-regulation of SlARF2A and SlARF2B leads to more severe ripening inhibition suggesting a functional redundancy among the two SlARF2 paralogs during fruit ripening. Double knock-down fruits produce less climacteric ethylene and show delayed pigment accumulation and higher firmness. Exogenous ethylene treatment cannot reverse the ripening defect phenotypes suggesting that SlARF2 may act downstream of ethylene signaling. The expression of key ethylene biosynthesis and signaling genes is dramatically disturbed in SlARF2 down-regulated fruit and major regulators of the ripening process, like RIN, CNR, NOR, TAGL1, are under-expressed. The data support the notion that SlARF2 is instrumental to fruit ripening and may act at the crossroads of auxin and ethylene signaling. Altogether, while ethylene is known as a key hormone of climacteric fruit ripening, the ripening phenotypes associated with SlARF2 down-regulation bring unprecedented evidence supporting the role of auxin in the control of this developmental process. To further extend our knowledge of the molecular mechanism by which ARFs regulate the expression of auxin-responsive genes we sought to investigate interactions SlARF and putative partners, mainly Aux/IAAs and Topless co-reppressors (TPLs) reported to be key players in gene repression dependent on auxin signaling. To this end, genes encoding all members of the tomato TPL family were isolated and using a yeast-two-hybrid approach comprehensive protein-protein interaction maps were constructed. The study revealed that Aux/IAA interact preferentially with activator SlARFs while Sl-TPLs interact only with repressor SlARFs. The data support the hypothesis that activator ARFs recruit Sl-TPLs co-repressors via Aux/IAAs as intermediates, while repressor ARFs can physically interact with Sl-TPLs. Further investigation indicated that SlARFs and Sl-TPLs can interact with polycomb complex PRC1 PRC2 components, VRN5 and LHP1, known to be essential players of epigenetic repression of gene transcription through the modification of histones methylation status. These data establish a potential link between ARFs and epigenetic regulation and thereby open new and original perspectives in understanding the mode of action of ARFs. Altogether, the thesis work provides new insight on the role of ARFs and their underlying action mechanisms, and defines SlARF2 as a new component of the regulatory network controlling the ripening process in tomato.
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Synthèse de latex de poly(fluorure de vinylidène) (PVDF) sans tensioactif à l’aide de la polymérisation radicalaire contrôlée de type RAFT / Synthesis of surfactant-free poly(vinylidene fluoride) (PVDF) latexes via RAFT emulsion polymerization

Fuentes-Exposito, Mathieu 26 September 2019 (has links)
Les travaux réalisés portent sur la synthèse de nanoparticules de PVDF à l’aide de la polymérisation radicalaire contrôlée (PRC) par transfert de chaîne réversible par addition-fragmentation (RAFT) en émulsion. Dans un premier temps, un méthoxy poly(éthylène glycol) commercial porteur d’une fonction hydroxyle (PEG-OH) a été employé pour la stabilisation des particules de PVDF. Cette stabilisation est assurée par des réactions de transfert irréversible opérant le long des chaînes de PEG conduisant à la formation in situ d’un stabilisant de type copolymère greffé. Par la suite, un PEG modifié chimiquement à partir du PEG-OH, portant à son extrémité de chaîne une fonction xanthate (macroRAFT, PEG-X), réactive et réactivable, a été utilisé. Les expériences réalisées en présence de ce macroRAFT ont démontré une forte implication de l’extrémité xanthate dans le procédé de polymérisation en émulsion du VDF. En effet, des particules stables de l’ordre de 70 nm de diamètre sont obtenues, alors que l’utilisation de PEG-OH conduit à des tailles beaucoup plus importantes (200 nm). Cette tendance est confirmée lors de l’étude de l’impact de divers paramètres comme la masse molaire de la chaîne PEG ou encore la quantité d’amorceur. Des analyses complémentaires (tension de surface et calorimétrie différentielle à balayage) ont permis de comparer le taux d’ancrage de PEG-X et de PEG-OH. Les quantités en macroRAFT ont ensuite été augmentées dans le but d’obtenir des particules composées de copolymères à blocs. Des analyses RMN approfondies ont été menées pour identifier les espèces créées lors de la polymérisation en émulsion du VDF lorsque PEG-OH et PEG-X sont utilisés en tant que stabilisant. Par comparaison, des PEG portant des fonctions réactives de types (méth)acrylate et thiol ont également été employés comme stabilisant et leurs efficacités comparées à celles de PEG-OH et de PEG-X. Par ailleurs, d’autres architectures à base de PEG ont été évaluées en utilisant un macroRAFT difonctionnel (X-PEG-X) et un polymère greffé (PPEGA-X). Enfin, des latex de PVDF ont été synthétisés en présence de macroRAFT de type poly(acide (méth)acrylique) obtenus par polymérisation RAFT de l’acide acrylique ou méthacrylique en présence d’un trithiocarbonate ou d’un xanthate. Comme précédemment, plusieurs paramètres ont été variés comme la masse molaire des chaînes macromoléculaires, la quantité d’amorceur et la quantité de macroRAFT. Ces études ont encore une fois démontré la forte implication des extrémités RAFT dans la stabilisation des particules de PVDF / This work describes the synthesis of self-stabilized PVDF particles by combining the advantages of emulsion polymerization with those of controlled radical polymerization (CRP) using the RAFT process. First, a commercial methoxy poly(ethylene glycol) carrying a hydroxyl function (PEG-OH) was used for the stabilization of PVDF particles. The stabilization is provided by irreversible transfer reactions occurring along the PEG-OH chains leading to the formation of a grafted copolymer stabilizer in situ. This PEG-OH was then chain-end functionalized to introduce a xanthate group (macroRAFT, PEG-X). The experiments carried out in the presence of this macroRAFT demonstrated a strong implication of the xanthate chain-end in the VDF emulsion polymerization process. Indeed, particle sizes of 200 nm and 70 nm were obtained in the presence of PEG-OH and PEG-X, respectively. This trend was confirmed during the study of the impact of various parameters such as the molar mass of the PEG chain or the initiator amount. Additional analyses (surface tension measurement and differential scanning calorimetry) allowed to compare the anchoring efficiency of PEG-X and PEG-OH. The macroRAFT amount was then increased to form particles composed of block copolymer. In-depth NMR analyses were then conducted to identify the species created during the VDF emulsion polymerization process in the presence of PEG-OH and PEG-X. In comparison, PEGs carrying reactive functions such as (meth)acrylate and thiol were used as stabilizers and their efficiencies compared to those of PEG-OH and PEG-X. The macroRAFT architecture was also varied using a difunctional macroRAFT (X-PEG-X) and a grafted polymer (PPEGA-X). Finally, PVDF latexes were synthesized with poly((meth)acrylic acid) (P(M)AA) functionalized by either a trithiocarbonate or a xanthate. Like previously, several parameters were varied such as the macromolecular chain length, the initiator amount and the macroRAFT amount. Again, these studies demonstrated the strong impact of the RAFT chain-end in the stabilization of PVDF particles
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Energy Services in Shanghai

De Geer, André, Melander, Mathias January 2013 (has links)
The People’s Republic of China (PRC) is one of the fastest growing economies in the world. However, the economic expansion is not without complications. Improved standard of living and a growing industrial sector have led to an increased demand of energy, which in turn is contributing to air pollution and land contamination. The research problem of the study is what is keeping existing Energy Services (ES) in Shanghai from being used more frequently. To answer this, a sequential mixed method study is conducted, divided into a qualitative and quantitative part. The literature study indicates a great potential for ES in Shanghai. This is mainly due to great efforts taken in Energy Efficiency (EE), an attempt to face the rapidly increasing population by reducing the usage of energy. A number of barriers for ES are found throughout the existing literature, including market, financial, institutional as well as technological barriers. To further investigate barriers and opportunities on the ES market in Shanghai, 14 semi-structured interviews with relevant stakeholders and academics were conducted. Hypothesizes were formulated based on results from the interview and literature study as well as an expert panel. To test the hypotheses a questionnaire was sent out to real estate developers in Shanghai. This study discovers the need of bringing several in the literature identified barriers to ES in Shanghai up to date. Some barriers were found to be invalid while others were not identified at all. The newly found barriers include market barriers, such as ES having low priority, poor technological understanding among clients, and complications approaching and communicating with potential clients.  For institutional barriers, it was found that the prevalence of low margins in the Chinese industries is holding back stricter regulations. Furthermore, the Energy Service Companies’ (ESCO) lack of understanding of ES from a system perspective is considered a technology barrier. In addition to the barriers, a number of opportunities were found. Improved communication between real estate stakeholders and ESCOs contribute to greater awareness and knowledge, which in turn leads to a higher degree of investment in ES. Differentiation of the services offered by ESCOs may attract new customers who previously were not interested, e.g. companies with short investment horizon. In Shanghai, there are a significant number of subsidies, regulations and laws favoring ES. Moreover, the rapid growth of Shanghai is considered one of the greater opportunities. To conclude, it was found that the maturity level among ESCOs in Shanghai was having large impact on the overall usage of ES. Fixed barriers, i.e. barriers nearly impossible to overcome, together with the large amount of small and inexperienced ESCOs is found to be hindering ES in the Shanghai commercial real estate sector from being used more frequently. / Kina ett är en av de snabbast växande ekonomierna i världen. Den ekonomiska expansionen är emellertid inte helt utan problem. Med bättre levnadsstandard och en allt större industrisektor ökar behovet av energi explosionsartat med förorenad mark och luft som följd.  Studiens problemformulering är vad det är som hindrar befintliga energitjänster i Shanghais byggnadssektor från att användas oftare. För att svara på denna fråga användes en sekventiellt multidisciplinär metod uppdelad i en kvalitativ och- kvantitativ studie. Utifrån litteraturen är det uppenbart att det finns en stor potential för användning av energitjänster i Shanghai. Främst till följd av stora satsningar på energieffektivitet i ett försök att möta den snabbväxande befolkningen med högre krav på levnadsstandard genom att minska energianvändningen. Ett antal hinder existerar emellertid inom Shanghais energitjänstemarknad. Inom dessa inkluderas allt ifrån marknads- och finansiella problem till institutionella och teknologiska komplikationer. För att vidare undersöka vilka problem och möjligheter det finns för energitjänster i Shanghai genomfördes 14 semi-strukturerade intervjuer med involverade aktörer och akademiker i Shanghai. Baserat på resultatet från intervjuerna tillsammans med litteraturstudien och en expert panel formulerades hypoteser härrörande energitjänstesituationen. För att testa hypoteserna genomfördes en enkätundersökning riktad till fastighetsutvecklare i Shanghai. Studien visade att många av de tidigare utpekade hindren för energitjänster i Shanghai behövdes uppdateras, varav vissa visade sig vara obsoleta och några inte gick att verifiera. Bland de nyfunna barriärerna kan nämnas marknadsbarriärer som låg prioritering för energitjänster, låg teknisk kompetens bland fastighetsägare samt svårigheter för energitjänstebolag att närma och kommunicera med potentiella kunder. För de institutionella barriärerna framgick att låga marginaler inom den kinesiska industrin håller tillbaka hårdare regleringar. Inom de tekniska barriärerna framkom att energitjänstebolag generellt sett brister i deras kunskap om energitjänster som kan tillgodose hela byggnaders energisystem. Utöver problemen identifierades även betydande möjligheter. Ökad kommunikation mellan aktörerna bidrar till större kunskap vilket i sin tur leder till en högre grad av energitjänsteinvesteringar. Genom att differentiera de tjänster energitjänsteföretag erbjuder kan de hitta nya kunder som tidigare inte varit intresserade, framförallt sådana med kort investeringshorisont. I Shanghai finns det ett betydande antal subventioneringar, regler och lagar som gynnar energitjänster. Även Shanghais tillväxt ses som en av de stora möjligheterna. Studien kommer fram till att en låg mognadsgraden bland energitjänstebolag i Shanghai negativt påverkan användningen av energitjänster. Existensen av flera fasta barriärer, barriärer som är svåra att påverka, tillsammans med det faktum att majoriteten av energitjänstebolag är små och oerfarna ses som den främsta orsaken till att energitjänster inte används i större utsträckning i Shanghai.
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How the City State Fares Under State Capitalism in the PRC: Local and State-Wide Reform

Elkins, Alex Gregory January 2012 (has links)
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