A erosão costeira é um processo de grande poder destrutivo e que afeta pelo menos 70% da zona costeira no mundo. Entender as causas e os processos que levam à erosão, bem como as regiões mais ou menos sensíveis a ela, é essencial para o correto manejo costeiro. O presente trabalho visa identificar as áreas vulneráveis à erosão através da aplicação de um Índice de Vulnerabilidade Costeira em praias do norte do Espírito Santo (Pontal do Ipiranga, Conceição da Barra) e sul da Bahia (Mucuri, Nova Viçosa, Caravelas, Prado, Cumuruxatiba, Corumbau, Arraial d\'Ajuda, Porto Seguro). O cálculo do índice se deu pela análise de treze indicadores ambientais: número de frentes frias, regime de tempestade, força de ondas, ângulo de incidência das ondas, estimativa de deriva potencial, morfologia da praia, exposição às ondas, presença de rios e/ou desembocaduras, elevação do terreno, vegetação, taxa de ocupação, obras de engenharia costeira e evidências de erosão. Os resultados mostraram que os indicadores \"morfologia da praia\" e \"exposição às ondas\" parecem ser os principais contribuintes para a erosão costeira nos municípios em que foram observados grandes prejuízos na infraestrutura urbana e perigo iminente à população local. Já nos demais municípios que também apresentaram focos de erosão, a combinação entre os indicadores \"estimativa de deriva potencial\" e \"regimes de tempestade\" parece ser a principal influência ao processo erosivo. Com exceção de Pontal do Ipiranga (que obteve um resultado de baixa vulnerabilidade), todas as praias apresentaram um IVC correspondente à vulnerabilidade moderada à erosão. O estudo se mostra eficiente para a determinação do nível de vulnerabilidade relativo entre as praias estudadas. / Coastal erosion is a process with great destructive power and affects more than 70% of worldwide coastlines. In order to achieve an effective coastal management, it is important to find and understand not only the causes and process that leads to erosion, but also areas that are more or less vulnerable to it. This study aims to identify erosion vulnerable areas through application of a Coastal Vulnerability Index in Brazilian beaches in north Espírito Santo (Pontal do Ipiranga, Conceição da Barra) and south Bahia (Mucuri, Nova Viçosa, Caravelas, Prado, Cumuruxatiba, Corumbau, Arraial d\'Ajuda, Porto Seguro). The index was calculated using 13 indicators: number of cold fronts, storm impact scale, wave power, angle of wave approach, longshore drift estimation, beach morphology, wave exposure, presence of inlets or river mouths, terrain elevation, vegetation, occupation rate, coastal engineering structures and erosion evidences. In places where great urban infrastructure destruction and imminent danger to local community were observed, both \"beach morphology\" and \"wave exposure\" seem to be the main contributors to coastal erosion. In other locations where erosion evidences were also observed, the combination between the indicators \"longshore drift estimation\" and \"storm impact scale\" seems to be the main influence to erosive process. IVC results showed that all the beaches are in a moderate vulnerability context, except in Pontal do Ipiranga, where the result was for low vulnerability. The study has proven to be effective in defining the relative vulnerability of the studied beaches.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:04:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6814.pdf: 27157124 bytes, checksum: ccc98f69d1fc4cdc487ac2e9917edfc0 (MD5) Previous issue date: 2015-03-09 / Microelectrode arrays (MEA) are devices that allow chemical and electrical stimulation and recording of the extracellular electrical activity from entire neuronal cultures over long periods of time, such as several weeks. Some MEA models have transparent substrate, which enables the imaging of culture using optical microscopy. The images are taken from two channels: fluorescence light and transmitted light channels. In the first one, it is possible to visualize the neurons, while in the other one, it is possible to observe the microelectrodes. The objective of this work is to develop methods that enable performing quantitative analysis of the dissociated culture of rat dorsal root ganglion (DRG) neurons plated on MEA by means of the processing of the images, obtained from confocal fluorescence microscopy. We proposed and developed the following methods in order to achieve this objective: (A) A method to automatically identify the microelectrodes in the transmitted light channel using circular Hough Transform and error correction based on the Delaunay triangulation; (B) the registration of a number of images taken at different parts of the MEA in order to generate a unique and high-resolution representation of the whole culture; (C) the segmentation of the neuron in 2D images taken from the fluorescence channel, composed by the steps: preprocessing, thresholding, morphological filtering, neurons occlusion correction, watershed transform and object classification; (D) 2D quantitative analysis based on the identified microelectrodes and on the segmented neurons; (E) a method for generating 3D polygonal models of the neurons from the volumetric images, to be used for visualizing the culture on the MEA by different points of view and zoom levels; and (F) 3D quantitative analysis performed by the processing of the polygonal surfaces in conjunction with the information about the microelectrodes positioning. The results show that the methods are capable to identify the neurons and microelectrodes on the 2D images efficiently. In the 3D images, the preprocessing step which uses information from the 2D segmentation method, showed to be capable to generate correct polygonal models efficiently. Most of the studies involving the analysis of neuron cultures on MEAs consider only qualitative analysis or simple quantitative measures. However, the methods proposed in this thesis enables to obtain important measures related to the neuron culture, such as: the density and morphology of the neurons, and the spatial and topological distribution of the neurons and microelectrodes. The information about neuron morphology is important because they are related to the behavior of this kind of neuron. The spatial and topological distribution of neurons and microelectrodes are used for providing models of the interface between these elements, for supporting the analysis of the electrophysiological signal recorded by the microelectrodes, as well as in the computational simulations of the neuron culture behavior. / Matrizes de Microeletrodos (MEAs) são dispositivos que permitem estimular quimicamente ou eletricamente e registrar a atividade elétrica extracelular de culturas de neurônios durante um longo período de tempo, da ordem de várias semanas. Modelos de MEAs com o substrato transparente permitem imagear a cultura por meio de microscopia óptica. As imagens são obtidas em dois canais: um de luz de fluorescência e outro de luz de transmissão. O primeiro permite visualizar os neurônios, enquanto o segundo os microeletrodos. O objetivo deste trabalho é desenvolver métodos que permitam realizar análises quantitativas de culturas dissociadas de neurônios de gânglio da raiz dorsal (Dorsal Root Ganglion DRG) de ratos em MEAs por meio do processamento de imagens obtidas por microscopia confocal de fluorescência. Os seguintes métodos foram propostos e desenvolvidos para atingir este objetivo: (A) Identificação automática dos microeletrodos nas imagens do canal de luz de transmissão utilizando a transformada de Hough circular e correção de erros baseado na triangulação de Delaunay; (B) Registro de várias imagens tomadas de diferentes regiões da MEA para gerar uma única imagem em alta resolução que contemple a cultura toda; (C) Segmentação dos neurônios em imagens 2D obtidas a partir do canal de fluorescência, composto por etapas de pré-processamento, segmentação, filtragem morfológica, correção da oclusão de neurônios, transformada watershed e classificação de objetos; (D) Análise quantitativa 2D baseada nos microeletrodos identificados e nos neurônios segmentados; (E) Método para geração de modelos poligonais 3D dos neurônios a partir de imagens volumétricas, modelos os quais são utilizados para visualização da cultura na MEA por diferentes pontos de vista e níveis de zoom; e (F) Análise quantitativa 3D realizada por meio do processamento das superfícies poligonais juntamente com as informações sobre a posição dos microeletrodos. Os resultados mostram que os métodos são capazes de identificar com eficiência os neurônios e microeletrodos presentes nas imagens 2D. Nas imagens 3D, a etapa de pré-processamento utilizando informações resultantes do método de segmentação 2D se mostrou eficiente na geração dos modelos poligonais corretos. Enquanto a maioria das análises de imagens de culturas de neurônios em MEA consideram apenas análises quantitativas simples, os métodos aqui propostos permitem obter importantes medidas quantitativas relacionadas às culturas, tais como: a densidade e morfologia dos neurônios, assim como a distribuição espacial e topológica dos neurônios em relação aos microeletrodos. As informações sobre a morfologia são importantes, pois estão relacionadas com o comportamento desse tipo de neurônio. A distribuição espacial e topológica dos neurônios e microeletrodos permitem modelar a interface entre neurônios e microeletrodos e auxiliar nos estudos dos sinais eletrofisiológicos capturados pelos microeletrodos, assim como em simulações computacionais do comportamento dessas culturas.

Submitted by Clebson Anjos (clebson.leandro54@gmail.com) on 2016-03-04T20:58:30Z No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 4279867 bytes, checksum: cc6bcf7dbfdbba66c85512e2c1a25a45 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-04T20:58:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 4279867 bytes, checksum: cc6bcf7dbfdbba66c85512e2c1a25a45 (MD5) Previous issue date: 2015-11-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / “Manteiga da terra” is a traditional product in the northeast of Brazil that consists of a form of anhydrous cow’s milk fat. This product is susceptible to hydrolytic and oxidative rancidity, responsible for undesirable sensory changes, decreases in nutritional quality and economic impact for the industry. In this study, thermal stability and changes in the physicochemical and sensory profiles were evaluated during storage temperatures of 5, 30, 45 and 60°C at 0, 14, 28, 42 and 56 days. Physicochemical analyses were carried out to evaluate chemical composition and fatty acids profile in the initial time and the storage effects on acidity, peroxide value, TBARS value and objective color. From these results, the activation energy and the induction period were estimated. Microbiological analyses were performed for total and fecal coliforms. Quantitative Descriptive Analysis (QDA) was used to the sensory evaluation of appearance (yellow color, opacity, uniformity and visual viscosity), odor (characteristic of the product and rancid), flavor (characteristic of the product, acid and rancid) and texture (viscosity and granularity). The “manteiga da terra” produced to this study met the standards established by the brazilian legislation with results of 98.96% for fat, 0.07% for moisture, 0.97% for non-fat solids and 0.78% for acidity. The major fatty acids found in the product were oleic (22.66%), palmitic (21.18%) and stearic (13.86%). Saturated fatty acids accounted for 53.72% and unsaturated for 32.24% of the total. There were significant differences for acidity between samples stored at 30, 45 and 60°C, with final values of 0.89, 1.0 and 1.11%, respectively. The peroxide values showed significant increases from 0.50 to 1.30 and 3.99 mEq.kg-1 in samples stored at 45 and 60°C, in this order. The TBARS value was 0.08 mgMDA.kg-1 in the initial time and there were significant increases in the samples stored at 45 and 60°C, with values of 0.12 and 0.19 mgMDA.kg-1, respectively, at the end of 56 days. The parameters L*, a* and b* for objective color characterized the yellow color of the product, with decrease in yellow tone during storage, especially at higher temperatures. The activation energy found for the system was 50.2 kJ.mol-1 and the induction period (in days) was 616 to 5°C, 103 to 30°C, 52 to 45°C and 26 to 60°C. Microbiological analysis indicated the absence of contamination for all samples. In the sensory analysis, the samples kept at 60°C for 56 days had the lowest scores for yellow tone color, opacity, characteristic odor and taste, visual viscosity and viscosity felt at the mouth. On the other hand, they showed a significant increase for the characteristic odor and taste of rancid. The results indicated that the “manteiga da terra” is a stable product for a long period under normal storage conditions. / A manteiga da terra é um produto característico da região nordeste brasileira e consiste de uma forma de gordura anidra proveniente do leite de vaca. Este produto é susceptível às rancificações hidrolítica e oxidativa, responsáveis por alterações sensoriais indesejáveis, diminuição na qualidade nutricional e impacto econômico para a indústria. Neste estudo, foram avaliadas a estabilidade térmica e alterações nos perfis físico-químicos e sensoriais durante o armazenamento em temperaturas de 5, 30, 45 e 60ºC nos tempos 0, 14, 28, 42 e 56 dias. Nas análises físico-químicas, foram realizadas a composição centesimal e o perfil de ácidos graxos no tempo inicial e a avaliação dos efeitos do armazenamento nos parâmetros de acidez, índice de peróxidos, valor de TBARS e cor objetiva. Com estes dados, foram estimados a energia de ativação e o período de indução da amostra. Foram realizadas análises microbiológicas para coliformes a 35 e a 45ºC. A Análise Descritiva Quantitativa (ADQ) foi utilizada na avaliação sensorial dos atributos: aparência (cor amarela, opacidade, homogeneidade e viscosidade visual), odor (característico de manteiga da terra e de ranço), sabor (característico de manteiga da terra, ácido e de ranço) e textura (viscosidade e granulosidade). A manteiga da terra elaborada atendeu aos parâmetros estabelecidos pela legislação com resultados de 98,96% de matéria gorda, 0,07% de umidade, 0,97% de sólidos não gordurosos e 0,78% de acidez. Os ácidos graxos majoritários do produto foram o oleico (22,66%), o palmítico (21,18%) e o esteárico (13,86%). Os ácidos graxos saturados corresponderam a 53,72% e os insaturados a 32,24% do total. No índice de acidez, houve diferença significativa nas amostras armazenadas a 30, 45 e 60ºC, com teores finais de 0,89, 1,01 e 1,11%, respectivamente. Quanto ao índice de peróxidos, inicialmente com 0,50 mEq.kg-1, houve aumentos significativos para as amostras armazenadas a 45 e 60ºC, com índices finais de 1,30 e 3,99 mEq.kg-1, nesta ordem. O valor de TBARS inicial foi de 0,08 mgMDA.kg-1, com aumento significativo nas amostras armazenadas a 45 e 60ºC, com valores de 0,12 e 0,19 mgMDA.kg-1, respectivamente, ao final dos 56 dias. Quanto à cor objetiva, os parâmetros L*, a* e b* caracterizam a cor amarela da amostra que, durante o armazenamento, apresentou um clareamento na tonalidade do amarelo, em especial nas temperaturas mais elevadas. A energia de ativação encontrada para o sistema foi de 50,2 kJ.mol-1 e o período de indução (em dias) foi de 616 para 5ºC, 103 para 30ºC, 52 para 45ºC e de 26 para 60ºC. As análises microbiológicas indicaram ausência de contaminação para todas as amostras. Na análise sensorial, as amostras armazenadas a 60ºC por 56 dias foram as que obtiveram os menores escores para a tonalidade da cor amarela, opacidade, odor e sabor característicos de manteiga da terra, viscosidade visual e viscosidade sentida na boca. Em contrapartida, apresentaram também aumento significativo para o odor e o sabor característicos do ranço. Os resultados do estudo indicaram que a manteiga da terra é um produto que se mantém estável por um longo período, sem alterações importantes antes dos 103 dias de estocagem à temperatura ambiente.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:39:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1146337 bytes, checksum: 9edc6a735d40be51b2865d311e2d3f55 (MD5) Previous issue date: 2013-07-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The objective of this study was to evaluate the quality of the forage and the silage fermentation profile made exclusively from Luziânia, Sambaíba, Tucunaré and UFV 16 cultivars. This profile was also made from UFVS 2003 of 10 intersections obtained from these cultivars and from the lineages TMG 801, tolerant to rust, UFVTN 105 AP, with high protein, and Vx 05-3027, Vx 05-3166 and Vx 05-3600, which are resistant to the Glyphosate herbicide action. The crosses were obtained from a complete diallel design, with fixed models and with the inclusion of parents and Fn s (method 2), as well carried out to the current generation.Two experiments were assembled with plants of F7 and F8 generations, in the years 2011/12 and 2012/13, respectively. Each selected plant in generation F7 consisted of a F8 generation line. The harvest occurred when the plants achieved the R6 stage for their silage, with the opening of the silos 60 days later. Forage chemical analyses before the silage were made at the Animal Nutrition Laboratory, in the Animal Science Department of the Federal University in Viçosa. Plant high and fresh mass were measured in generation F7, and the productivity of the dry mass was calculated per hectare. Dry and organic matter, ash, ethereal extract, crude protein, soluble carbohydrates, fiber in neutral and in acid detergent, and lignin in samples before and after the silage, are some of the things that were analyzed by the study.Ammonia nitrogen, pH and organic acids were analyzed just at the silage. As done in the generation F7, plant high and fresh mass were also measured in generation F8. The productivity of the dry mass was as well calculated. The variables were submitted to variance and diallelical analyzes, besides of the phenotypic, genotypic and environmental correlations between them. It was possible to obtain the populations that were favorable to the silage production and, consequently, to probable soybean cultivars, which are appropriated for this silage development. An example is the crossing between Sambaíba X Tucunaré, which brought together the most favorable characteristics, and showed that it is capable of generating increases in the CHOS tenor, and also of reducing the LIG, pH, N-NH3/NTotal, ACE tenors. At the same time this crossing is capable of raising the LAT and the UFV 16 X UFVS 2003 crossing conciliated a reduced tenor of EE and N-NH3/NTotal, with elevated CHOS tenor.UFV-TN 105 and Vx 05-3166 lineages conciliated elevated MS, PB, CHOS tenor and reduced RR tenor, showing that they are capable of being included in breeding programs, aiming the selection of soybean forage. / Procurou-se avaliar a qualidade de forragem e o perfil fermentativo da silagem exclusiva feita a partir dos cultivares Luziânia, Sambaíba, Tucunaré, UFV 16, UFVS 2003 dos 10cruzamentos obtidos a partir desses cultivarese das linhagens TMG 801 (tolerante à ferrugem), UFVTN 105 AP (alta proteína), Vx 05-3027(RR),Vx 05-3166(RR) e Vx 05-3600(RR), estes últimos resistentes à ação do herbicida Glyphosate. Os cruzamentos foram obtidos a partir de dialelo completo, com modelos fixos e a inclusão dos genitores e F1s(método 2), e realizados até a atual geração. Foram montados dois experimentos, com plantasdas gerações F7 e F8,nos anos agrícolas 2011/12 e 2012/13, respectivamente. Cada planta selecionada na geração F7 consistiu em uma linha da geração F8. O delineamento experimental foi o de blocos casualizados com três repetições. Cada parcela foi constituída de duas fileiras de 5 m, distantes entre si 0,7 m. A colheita ocorreuno estádio R6, para realização da ensilagem das plantas e posterior abertura dos silos 60 dias após. As análises bromatológicas da forragem antes daensilagem e da silagem foram realizadas no Laboratório de Nutrição Animal do Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Viçosa. Na geração F7 foram medidas a altura de plantas e massa frescacalculada a produtividade de massa seca por hectare. Foram analisados teores de matéria seca, matéria orgânica, cinzas, extrato etéreo, proteína bruta, carboidratos solúveis, fibras em detergente neutro, fibras em detergente ácido e lignina, tanto na silagem quanto na forragem. Nitrogênio amoniacal, pH e ácidos orgânicos foram analisados apenas na silagem. Na geração F8 foram medidas a altura de plantas e a massa fresca e calculada a produtividade de massa seca.As variáveis foram submetidas às análises de variância e análise dialélica,além da análise de correlações fenotípica, genotípica e ambiental entre elas. Foi possível a obtenção de populações favoráveis à produção de silagem e, consequentemente, de prováveis cultivares de soja apropriadas à produção de silagem, a exemplo dos cruzamentos Sambaíba x Tucunaré, que reuniram maior número de características favoráveis, mostrando-se capazes de gerar incrementos no teor de CHOS e reduzir os teores de LIG, pH, N-NH3/ NTotal, ACE e, ao mesmo tempo, elevar o teor de LAT; e UFV 16 x UFVS 2003 conciliou reduzido teor de EE e N-NH3/ NTotal, com alto teor de CHOS. As linhagens UFV-TN 105 e Vx 05-3166 conciliaram elevado teor de MS, PB, CHOs e reduzido teor de EE, mostrando-se passíveis de serem incluídos em programas de melhoramento visando à seleção de soja forrageira.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 164176 bytes, checksum: b14dc96758addd4c516b427d913d7a6c (MD5) Previous issue date: 2009-05-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The BLUP methodology, which is widely used in animal and forestry genetic evaluation, can also be applied to annual crop breeding. The objective of this study was to compare the accuracy and efficiency of among- and within-half-sib family selection through the use of multi-trait BLUP, single-trait BLUP and phenotypic selection. Expansion volume and yield data from two recurrent selection cycles of a popcorn population were analyzed. Progeny tests were designed as a lattice. In order to maximize accuracy of the prediction of breeding values, the BLUP analyses included phenotypic values of the two cycles. All statistical analyses were performed using the ASREML software. The multi-trait BLUP method demonstrated greater accuracy and efficiency in family selection. In the case of within-family selection, both accuracy and efficiency of multi-trait or single-trait BLUP methods were equivalent. The selection efficiency of the multi-trait BLUP was dependent on the estimated genetic parameters, particularly the difference between the genetic and environmental correlations of the traits. / A metodologia BLUP, que é amplamente utilizada na avaliação genética animal e florestal também pode ser aplicada no melhoramento de culturas anuais. O objetivo deste estudo foi comparar a acurácia e a eficiência da seleção entre e dentro de famílias de meios-irmãos através da utilização do BLUP multicaracterística, BLUP unicaracterística e seleção fenotípica. Dados de capacidade de expansão e produção de dois ciclos de seleção recorrente em uma população de milho-pipoca foram analisados. Os testes de progênies foram delineados como um látice. Visando maximizar a acurácia da predição dos valores genéticos as análises BLUP incluíram valores fenotípicos dos dois ciclos. Todas as análises estatísticas foram realizadas utilizando o software ASREML. O método BLUP multicaracterística apresentou maior acurácia e eficiência de seleção de famílias. No caso da seleção dentro de famílias a acurácia e a eficiência dos métodos BLUP multicaracterística e BLUP unicaracterística foram equivalentes. A eficiência de seleção do BLUP multicaracterística foi dependente dos parâmetros genéticos estimados, particularmente da diferença entre as correlações genéticas e ambientais das características.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1405747 bytes, checksum: c75e615e150ddd0e86f3240d84082166 (MD5) Previous issue date: 2009-07-17 / The aim was to determine the genetic parameters of progeny tests in Eucalyptus grandis Hill Maiden with 3 years old under competicional effect, as well as to study the genotype x environment interaction and its impact on strategies for direct and indirect selection and analyze different selection strategies like selection among and within, mass, stratified mass selection and combined selection in three different locations of the Company Jari Celulose S/A. The experimental design was a randomized block with 93 half-sib progenies, 10 replications, linear plots of five plants and spacing of 3m x 2m. The evaluated characteristics were height (ALT), in meters, diameter at breast height (DBH) in cm and the volume (VOL) in m3. It were estimated selection gains with a percentage of 20% between half-sib and 40% within, the same being maintained for all selection strategies analyzed. It was detected high plants mortality in the experiments, which interfered with the accuracy of the experiments. The progeny tests showed genetic variability, with greater variability within plots. It was also detected competicional effect observed by the negative intraclass correlation among plants within plots. Its existence interfered in the estimates of phenotypic variance within plots and environmental variance. In the interaction study were found significant effects for genotypes and also for the genotype x environment interaction, showing variability among progenies and differential behavior along these different environments. Regarding to the analised places, local 2 and 3 showed no significant interaction. The site has major direct gain and maximized the gain for the other two locals was the local 2. To analyze the selection gain with different strategies such as selection among and within, mass selection, stratified mass selection and combined selection, the analysis were done only with DAP, because of its high correlation with other variables. The combined selection strategy showed superior results to the selection processes among and within, mass and stratified with percentages estimates ranging from 6.67% to 18.67%. / O objetivo deste trabalho foi a determinação dos parâmetros genéticos de testes de progênies de Eucalyptus grandis Hill Maiden com 3 anos de idade sob efeito competicional, assim como estudar a interação genótipo x ambiente e seus reflexos nas estratégias de seleção direta e indireta e analisar diferentes estratégias de seleção como seleção entre e dentro, massal, massal estratificada e seleção combinada, em três diferentes locais da empresa Jari Celulose S/A. O delineamento experimental utilizado foi de blocos casualizados, com 93 progênies de meios irmãos, 10 repetiçõe, parcelas lineares de 5 plantas e espaçamento de 3m x 2 m. As características avaliadas foram a altura (ALT), em metros, diâmetro à altura do peito (DAP), em cm e o volume (VOL), em m3. Foram estimados os ganhos de seleção com uma percentagem de 20% entre e 40% dentro, sendo as mesmas mantidas para todas as estratégias de seleção analisadas. Foi detectado elevada mortalidade das plantas nos experimentos, que interferiu na precisão dos experimentos. Os testes de progênies apresentaram variabilidade genética, sendo maior variabilidade dentro de parcelas, também foi detectado o efeito competicional, observada pela correlação intraclasse negativa entre plantas dentro de parcelas. Sua existência interferiu nas estimativas de variância fenotípicas dentro de parcelas e variância ambiental. No estudo da interação foram detectados efeitos significativos para genótipos e também para a interação genótipo x ambiente, evidenciando variabilidade entre as progênies avaliadas e comportamento diferencial destas ao longo dos diferentes ambientes. Em relação aos locais analisados, os locais 2 e 3 apresentaram interação não significativa. O local que possui maior ganho direto e maximizou o ganho para os demais locais foi o local 2. Para analisar o ganho de seleção com as diferentes estratégias como seleção entre e dentro, seleção massal, massal estratificada e seleção combinada, as análises foram realizadas somente com a variável DAP, devido sua alta correlação com as demais variáveis. A estratégia de seleção combinada apresentou resultados superiores aos processos de seleção entre e dentro, massal e massal estratificada, com estimativas em percentuais variando de 6,67% a 18,67%.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 750903 bytes, checksum: 9c754e0205ce36c2c3ced3e42d923e0d (MD5) Previous issue date: 2010-04-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The Genome Wide selection was proposed in 2001 to predict the phenotype values based in molecular markers information. In a previus step, the effect of each of each marker in controlling the genetic variance is estimated. This technology has already been used in animals, however, no report of its use was made for plants. This work aimed to study the impact of GWS, first in a simulated dataset, then in two Eucalyptus populations. Besides that, on the simulated data, it was compared the efficiency of using dominant markers versus the use of codominant ones. The simulation generated one population controlled by many genes (polygenic) and one population with olligogenic control. There were different situations of linkage disequilibrium among the marker and the QTL, different number of markers controlling the trait and heritabilities of 20, 30 and 40%. It was evaluated the prediction ability and the accuracy of the GWS. The results of accuracy were high, which turn in to a selection gain of up to 500% in the selection dataset and the use dominant markers at higher densities is more efficient than the use of dominant markers with lower densities. The Euvalyptus populations were genotyped for total height, diameter at breast height (DBH) and Pilodyn. The values of accuracy were 0,67 for height and 0,69 for DBH in the first population and ,53, 0,62, and 0,53 for total height, DBH and Pilodyn respectively. Those result turn in to a selection gain that varied from 430% to 723% with a reduction of 7 years in the breeding cycle. This showed significant results and gave evidences that the use of GWS in plants is possible to improve the way plant breeding is actually performed. / A seleção genômica ampla (GWS) foi idealizada no ano de 2001 como forma de predizer o fenótipo futuro de uma população baseado em informações de marcadores moleculares, cujos efeitos genéticos aditivos, que estes explicam, já foram previamente estimados. Esta tecnologia já é pesquisada e integrada aos programas de melhoramento animal. Embora em plantas nenhum trabalho com dados reais tenha sido descrito, a GWS tem grandes perspectivas de utilização também no melhoramento genético vegetal, o que pode permitir melhores acurácias e seleção precoce. O objetivo deste trabalho foi, em um primeiro momento, fornecer subsídios para melhor entender a seleção genômica ampla e fazer uma comparação de sua utilização com marcadores dominantes e codominantes. Em uma segunda etapa, a aplicação dessa tecnologia foi então proposta em Eucalyptus e seu impacto foi avaliado no melhoramento florestal. Foram simuladas uma característica de controle oligogênico e outra controlada por muitos genes em diferentes situações de desequilíbrio de ligação com os marcadores. Em cada característica, o número de locos que controlava o caracter foi estabelecido entre 100, 200 e 400 e as herdabilidades entre 20%, 30% e 40%. Foi avaliada a correlação dos valores fenotípicos observados com os valores fenotípicos preditos via informação de marcadores e a acuáracia de seleção. A partir das estimativas de acurácia, calculou-se também o ganho de seleção por unidade de tempo comparado com a seleção fenotípica. Os resultados das simulações demonstraram altos valores de acurácias que proporcionaram ganhos de até 500% caso o tempo do ciclo de geração seja reduzido. Observou-se que se o número de marcadores dominantes disponíveis foi superior ao número de marcadores codominantes, essa maior densidade proporciona acurácias maiores. A segunda etapa do trabalho foi realizada em duas populações de Eucalipto utilizando marcadores dominantes DArTs e avaliando as características Altura total, Diâmetro a Altura do Peito (DAP) e penetração do Pilody. As acurácias máximas obtidas foram de 0,67 para Altura e 0,69 para DAP em uma população, e de 0,53, 0,62, e 0,53 para Altura, DAP e Pilodyn, respectivamente, na segunda população. Estes valores proporcionaram ganhos que variaram entre 430% e 723% caso o ciclo de geração seja reduzido em 7 anos, situação possível no melhoramento de Eucalipto. Este trabalho demonstrou resultados animadores e o uso GWS se mostrou factível em plantas nas simulações e no conjunto de dados reais.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 641792 bytes, checksum: 5b73a305694f3136938c6879fccae0e8 (MD5) Previous issue date: 2013-02-22 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os objetivos deste estudo foram (i) identificar linhagens de milho-pipoca eficientes no uso de nitrogênio; (ii) avaliar a diversidade genética entre linhagens de milhopipoca em alto e baixo N; (iii) investigar os efeitos causais de vários caracteres sobre a eficiência no uso de nitrogênio (NUE) e (iv) identificar marcadores SSR associados com caracteres relacionados à NUE. Foram avaliadas 25 linhagens-elite de milhopipoca pertencentes às populações 'Viçosa' e 'Beija-Flor', em alto e baixo N. Foram mensurados os seguintes caracteres: crescimento diário (DG, cm), massa de parte aérea (SDW, mg), de raiz (RDW, mg), e da planta total seca (TDW, mg), razão parte aérea:raiz seca (RSR), eficiência no uso (NUE, mg mg-¹), na absorção (NUpE, mg mg-¹) e na utilização (NUtE, mg mg-¹) de nitrogênio, diâmetro médio (RAD, mm), comprimento total (TRL, cm), área superficial (RSA, cm²) e volume (RV, cm³) de raízes. Foram identificadas linhagens eficientes em cada nível de N. A avaliação da diversidade genética pelo método de agrupamento UPGMA baseado no quadrado da Distância Euclidiana Média resultou em quatro grupos de linhagens para cada nível de N e a análise de componentes principais mostrou que as linhagens poderiam ser agrupadas predominantemente pelos seus caracteres de parte aérea. A eficiência na absorção de N (NUpE) foi a característica mais importante para a NUE em estádios precoces de desenvolvimento da planta em ambos os níveis de N, por apresentar alta correlação e alto efeito direto sobre a variável principal (NUE) na análise de trilha. Em baixo N, a eficiência na utilização de N (NUtE) também apresentou alta correlação e alto efeito direto sobre a variável NUE, mostrando ser uma característica importante para esta condição nesses estádios. Contudo, a seleção direta ainda parece ser o melhor método para aumentar a eficiência de seleção para NUE em estádios precoces. Três marcadores SSR foram validados como associados com os caracteres relacionados à NUE pela análise de mapeamento associativo baseada em ANOVA. / The objectives of this study were to (i) identify efficient inbred lines in nitrogen use; (ii) assess the genetic diversity among popcorn inbred lines under high and low N; (iii) investigate the causal effects of several traits in nitrogen use efficiency (NUE) and (iv) identify SSR markers associated with the traits related to NUE. Twenty-five elite popcorn inbred lines belonging to the 'Viçosa' and 'Beija-Flor' populations were evaluated under high and low N. The following traits were assessed: daily growth (DG, cm), shoot dry weight (SDW, mg), root dry weight (RDW, mg), total plant dry weight (TDW, mg), root:shoot ratio (RSR), nitrogen use efficiency (NUE, mg mg-¹), nitrogen uptake efficiency (NUpE, mg mg-¹), nitrogen utilization efficiency (NUtE, mg mg-¹), root average diameter (RAD, mm), total root length (TRL, cm), root surface area (RSA, cm²) and root volume (RV, cm³). Efficient inbred lines were identified under each N level. The genetic diversity assessment using the UPGMA method based on the squared Mean Euclidean distance grouped the inbred lines into four clusters for each N level and the principal component analysis revealed that the inbred lines could be categorized predominantly by their shoot traits. Nitrogen uptake efficiency (NUpE) was the most important trait for NUE in the early stages of plant development under both N levels, due its high correlation with and high direct effect on NUE obtained in the path analysis. Under low N, nitrogen utilization efficiency (NUtE) also showed high correlation with and direct effect on NUE, demonstrating its importance in this N level in these early stages. Notwithstanding, the direct selection still seems to be the best method to increase the selection efficiency for NUE in these early stages. Furthermore, three SSR markers were identified as true associations with the traits related to NUE, through the association mapping analysis based on ANOVA.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1270776 bytes, checksum: 45ceec810d57392774ec214a30c1e3a3 (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The correct classification of individuals has a top importance for the genetic variability preservation as well as to maximize gains. The multivariate statistical techniques commonly used in these situations are the Fisher and Anderson discriminant functions, allowing to allocate an initially unknown individual in a probably g population or predefined groups. However, for higher levels of similarity such as backcross populations these methods has proved to be inefficient. Currently, much has been Said about a new paradigm of computing, artificial neural networks, which can be used to solve many statistical problems as similar subjects grouping, time-series forecasting and in particular, the classification problems. The aim of this study was to conduct a comparative study between the Fisher and Anderson discriminant functions and artificial neural networks through the number of incorrect classifications of individuals known to belong to different simulated backcross with increasing levels of populations similarity. The dissimilarity, measured by Mahalanobis distance, was a concept of fundamental importance in the use of discrimination techniques, due the quantification of how much populations were divergent. Data collection was done through simulation using the software Genes. Each population generated was characterized by a set of elements measured by characteristics of a continuous distribution. The relations of relatives and hierarchical structuring were established considering genetically divergent populations, F1 hybrid and five generations of backcrossing in relation to each of the relatives, establishing measures of effectiveness of the tested methodologies. The phenotypic data of populations were used to establish the Fisher and Anderson discriminant function and the calculation of the apparent error rate (AER), which measures the number of incorrect classifications. The ERA Estimations were compared with those obtained by means of neural networks. The artificial neural network is shown as a promising technique to solve classification problems, once it had a number of incorrect individuals classifications smaller than the data obtained by the discriminant functions. / A correta classificação de indivíduos é de extrema importância para fins de preservação da variabilidade genética existente bem como para a maximização dos ganhos. As técnicas de estatística multivariada comumente utilizada nessas situações são as funções discriminantes de Fisher e de Anderson, que permitem alocar um indivíduo inicialmente desconhecido em uma das g populações prováveis ou grupos pré-definidos. Entretanto, para altos níveis de similaridade como é o caso de populações de retrocruzamentos esses métodos tem se mostrado pouco eficientes. Atualmente, muito se fala de um novo paradigma de computação, as redes neurais artificiais, que podem ser utilizadas para resolver diversos problemas da Estatística, como agrupamento de indivíduos similares, previsão de séries temporais e em especial, os problemas de classificação. O objetivo desse trabalho foi realizar um estudo comparativo entre as funções discriminantes de Fisher e de Anderson e as redes neurais artificiais quanto ao número de classificações incorretas de indivíduos sabidamente pertencentes a diferentes populações simuladas de retrocruzamento, com crescentes níveis de similaridade. A dissimilaridade, medida pela distância de Mahalanobis, foi um conceito de fundamental importância na utilização das técnicas de discriminação, pois quantificou o quanto as populações eram divergentes. A obtenção dos dados foi feita através de simulação utilizando o programa computacional Genes. Cada população, gerada por simulação, foi caracterizada por um conjunto de elementos mensurados por características de natureza contínua. Foram geradas considerados 50 locos independentes, cada qual com dois alelos. As relações de parentescos e a estruturação hierárquica foram estabelecidas considerando populações genitoras geneticamente divergentes, híbrido F1 e cinco gerações de retrocruzamento em relação a cada um dos genitores, permitindo estabelecer parâmetros de eficácia das metodologias testadas. Os dados fenotípicos das populações foram utilizados para estabelecimento da função discriminante de Fisher e Anderson e para o cálculo da taxa de erro aparente (TEA), que mede o xi número de classificações incorretas. As estimativas de TEA foram comparadas com as obtida por meio das Redes Neurais Artificiais. As redes neurais artificiais mostraram-se uma técnica promissora no que diz respeito a problemas de classificação, uma vez que apresentaram um número de classificações incorretas de indivíduos menor que os dados obtidos pelas funções discriminantes.

Submitted by ALINE GODOI LUIZ null (alineegodoi@hotmail.com) on 2017-04-23T20:31:22Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Mestrado Acadêmico - Aline Godoi Luiz.pdf: 4090282 bytes, checksum: 3d6cb5c3c3fdca7bd11a8e4fe8ab34c3 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-04-25T19:52:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 luiz_ag_me_bot.pdf: 4090282 bytes, checksum: 3d6cb5c3c3fdca7bd11a8e4fe8ab34c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-25T19:52:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 luiz_ag_me_bot.pdf: 4090282 bytes, checksum: 3d6cb5c3c3fdca7bd11a8e4fe8ab34c3 (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Objetivo: Analisar a história alimentar e a experiência materna com a amamentação de lactentes com fissura labiopalatina. Método: estudo descritivo, transversal, de dupla abordagem: quantitativo e qualitativo, realizado no ambulatório de um hospital de referência. Os dados foram coletados por meio de entrevistas estruturadas com 150 mães; 6 mães participaram do estudo qualitativo. Foram realizadas análises de regressão logística univariada e múltipla, adotando-se como critério para inclusão no modelo múltiplo p≤0,20. Para considerar um fator como associado ao desfecho foi considerado p crítico <0,05, na análise múltipla. Essas análises foram realizadas no programa SPSS. Para a abordagem qualitativa a amostra foi selecionada por conveniência. Os depoimentos das mães foram analisados segundo o referencial da análise de conteúdo de acordo com os passos propostos por Graneheim e Lundman. Após a análise das entrevistas qualitativas, os depoimentos foram categorizados em temas e subtemas. Resultados: Menos da metade das mães souberam do diagnóstico da fissura no pré-natal e esse fator associou-se com o aleitamento materno exclusivo na primeira semana de vida, sendo o médico o responsável pelas orientações no pré-natal. O tipo de fissura prevalente foi o transforame incisivo unilateral e sobre o estado nutricional, prevaleceu a eutrofia. Foi constatado também, através das análises do conteúdo latente, as fortalezes, dificuldades e desafios frente ao nascimento de um filho com fissura labiopalatina Conclusão: evidenciou-se a importância da orientação dos profissionais de saúde e da época de descoberta do diagnóstico da fissura, facilitando assim o processo de enfrentamento e o aleitamento materno. Demonstra-se a necessidade da capacitação prévia de todos os profissionais que irão atuar no pré e pós-natal. / Objective: To analyze feeding history and maternal experience with breastfeeding infants with cleft lip and palate. Method: descriptive, cross - sectional, double - approach study: quantitative and qualitative, performed at the outpatient clinic of a reference hospital. Data were collected through structured interviews with 150 mothers; 6 mothers participated in the qualitative study. Univariate and multiple logistic regression analyzes were used, adopting as criterion for inclusion in the multiple model p≤0.20. To consider a factor as associated to the outcome, p was considered critical <0.05, in the multiple analysis. These analyzes were performed in the SPSS program. For the qualitative approach the sample was selected for convenience. The statements of the mothers were transcribed in their entirety and analyzed according to the theoretical framework of content analysis according to the steps proposed by Graneheim and Lundman. After analyzing all the qualitative interviews, a framework was constructed with the themes found from the testimonies, being categorized in themes and sub-themes. Results: Less than half of the mothers knew of the prenatal diagnosis and this factor was associated with exclusive breastfeeding in the first week of life, the physician was responsible for the prenatal guidelines. The prevalent type of fissure was unilateral incisive transforamen and on nutritional status, eutrophy prevailed. The strengths, difficulties and challenges faced by the birth of a child with cleft lip and palate were also verified through latent content analysis. Conclusion: the importance of the guidance of health professionals and the time of discovery of the diagnosis of fissure was evidenced, facilitating thus the coping process and breastfeeding. It demonstrates the need for prior training of all the professionals who will work in the pre- and post-natal period.