Objectifs : 1) résumer et synthétiser des attitudes et croyances des professionnels de la réadaptation envers la douleur chronique; 2) explorer les perceptions de physiothérapeutes envers ces attitudes et croyances et 3) décrire les attitudes et croyances de physiothérapeutes envers la douleur chronique et vérifier si elles différent en fonction de facteurs sociodémographiques. Méthodologie : Pour le premier objectif, nous avons réalisé une revue exploratoire (scoping review) où nous avons effectué une recherche des écrits scientifiques sur divers moteurs de recherche de leur création à juillet 2014. Nous avons effectué une analyse thématique des articles correspondant à nos critères d’inclusion pré-établis. Afin de répondre au deuxième objectif, nous avons réalisé trois groupes de discussion (focus groups), puis analysés les transcriptions par analyse descriptive et thématique. Nous avons sondé 14 physiothérapeutes en utilisant le Questionnaire sur les attitudes et croyances envers la douleur chronique destiné aux professionnel(le)s de la santé (score total, sous-score compétence, engagement émotionnel et empathie). Nous avons utilisé des statistiques descriptives et analyses bivariées pour vérifier si les réponses des participants différaient en fonction de caractéristiques sociodémographiques et expérience. Résultats : La recherche a donné 1538 articles; 26 articles pour révision complète. Nous avons développé sept thèmes post analyse. Les groupes de discussion ont permis d’identifier trois thèmes principaux liés 1) au développement de la douleur chronique; 2) à la légitimité de la douleur chronique et à sa relation avec l’incapacité et 3) à la capacité à gérer les aspects psychologiques liés à la douleur des patients. Les physiothérapeutes ayant plus d’expérience clinique ont démontré plus d’engagement émotionnel (p=0.02) et ceux ayant une expérience de travail antérieur dans une clinique de douleur multidisciplinaire ont démontré plus d’empathie (p=0.02). Conclusion : Les physiothérapeutes ont besoin de plus d’éducation et de formation concernant l’évaluation et le traitement des facteurs psychosociaux liés à la douleur. Les physiothérapeutes avec plus d’expérience clinique ont démontré plus d’engagement émotionnel et ceux ayant une expérience de travail dans une clinique de douleur multidisciplinaire ont démontré plus d’empathie envers les individus vivant avec de la douleur chronique. / Objectives: 1) to summarize and synthesize the literature regarding rehabilitation professionals’ attitudes and beliefs towards chronic pain; 2) to explore physiotherapists’ perceptions of those attitudes and beliefs and 3) to describe physiotherapists’ attitudes and beliefs towards chronic pain and to see if they differ according to socio-demographic factors. Methods: For the first objective, we conducted a scoping review where we searched the literature using various databases from inception until July 2014. We performed thematic analysis on articles that met our pre-established standards for inclusion. To answer objective two, we conducted three focus groups and analyzed transcripts through descriptive and thematic analysis. We also surveyed 14 physiotherapists (objective three) using the Attitudes and Beliefs towards Chronic Pain Questionnaire for Health Professionals (total score, subscores of competence, emotional involvement and empathy). We used descriptive statistics and bivariate analysis to see if participants’ responses differed based on socio-demographic characteristics and experience. Results: The literature search yielded 1538 articles; 26 articles were included for full review. Seven themes evolved post analysis. Focus groups allowed to identify three core themes 1) the development of chronic pain; 2) the legitimacy of chronic pain and its relationship with disability and 3) the ability to manage psychological aspects of patient’s pain. More experienced physiotherapists had higher emotional involvement (p = 0.02) and those with previous experience working in a multidisciplinary pain clinic had greater empathy (p = 0.02). Conclusion: Physiotherapists need to be further educated and trained on how to assess and treat psychosocial factors associated with pain. Physiotherapists with more general clinical experience showed greater emotional involvement and those with specific multidisciplinary pain clinic experience showed more empathy towards individuals living with chronic pain.

Le feedback auditif se définit comme un signal auditif qui contient de l'information sur un mouvement. Il a été montré que le feedback auditif peut guider le mouvement en temps réel, mais son influence sur l'apprentissage moteur est moins clair. Cette thèse a pour but d'examiner l'influence du feedback auditif sur l'apprentissage moteur, en se focalisant sur le contrôle temporel des mouvements. Premièrement, nous étudions l'apprentissage moteur chez les non-musiciens sains et montrons qu'ils bénéficient de l'information temporelle contenue dans le feedback auditif et qu'ils sont sensibles aux distorsions de cette information temporelle. Deuxièmement, nous appliquons ces connaissances à la réhabilitation de patients cérébro-lésés. Nous trouvons que ces patients améliorent leurs capacités de mouvement mais ne dépendent pas de la correspondance temporelle entre le mouvement et le son. Paradoxalement, ces patients ont même bénéficié des distorsions temporelles dans le feedback. Troisièmement, nous étudions les experts musicaux, car ils ont établi des liens particulièrement forts entre leur mouvement et le son. Nous développons de nouveaux outils d'analyse qui nous permettent de séparer les déviations temporelles en variation systématique et non-systématique. Le résultat principal est que ces experts sont devenus largement indépendants du feedback auditif. La proposition centrale de cette thèse est que le feedback auditif joue un rôle dans l'apprentissage moteur de la régularité, mais la façon dont le cerveau l'utilise dépend de la population étudiée. Ces résultats donnent une nouvelle perspective sur l'intégration audio-motrice et contribuent au développement de nouvelles approches pour l'apprentissage de la musique et la réhabilitation / Auditory feedback is an auditory signal that contains information about performed movement. Music performance is an excellent candidate to study its influence on motor actions, since the auditory result is the explicit goal of the movement. Indeed, auditory feedback can guide online motor actions, but its influence on motor learning has been investigated less. This thesis investigates the influence of auditory feedback in motor learning, focusing particularly on how we learn temporal control over movements. First, we investigate motor learning in non-musicians, finding that they benefit from temporal information supplied by the auditory signal and are sensitive to distortions of this temporal information. Second, we turn to stroke patients that are re-learning motor actions in a rehabilitation setting. Patients improved their movement capacities but did not depend on the time-locking between movements and the resulting auditory feedback. Surprisingly, they appear to benefit from distortions in feedback. Third, we investigate musical experts, who arguably have established strong links between movement and auditory feedback. We develop a novel analysis framework that allows us to segment timing into systematic and non-systematic variability. Our finding is that these experts have become largely independent of the auditory feedback. The main claim defended in this thesis is that auditory feedback can and does play a role in motor learning of regularity, but the way in which it is used varies qualitatively between different populations. These findings provide new insights into auditory-motor integration and are relevant for developing new perspectives on the role of music in training and rehabilitation settings

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La production de crevettes en Indonésie est en constante augmentation de part sa surface et l'intensification de ses élevages. Cette filière contribue au développement économique en milieu rural, à la sécurité alimentaire nationale, à l'emploi et au commerce extérieur. Cependant, ce développement rapide s'est accompagné d'effets écologiques et sociaux négatifs. Le développement de maladies dans les élevages ainsi que la dégradation de l'environnement côtier a conduit à l'abandon de 250 000 hectares de bassins dans le pays. Leur réhabilitation dans le cadre d'une activité durable est aujourd'hui une priorité pour le gouvernement indonésien.L'objectif de cette thèse est de développer des outils et des méthodes, basées sur de l’imagerie satellites à très haute résolution spatiale (THRS), (1) pour une meilleure gestion des sites de production et (2) pour réhabiliter les sites abandonnés. L'estuaire de la Perancak situé dans la Province de Bali, une zone de production en déclin, a été choisi comme site pilote. Ce travail a été réalisé dans le cadre du projet INDESO dont l'objectif était de fournir des outils et des méthodes pour une meilleure gestion des ressources côtières et marines en Indonésie.Le premier outil développé pour objectif de cartographier automatiquement les bassins d'élevage. A cet effet, une méthode basée sur la détection des contours a été mise en place et comparée à deux autres méthodes, la première basée sur la méthode de croissance des régions, la seconde sur une classification non supervisée (plus particulièrement la méthode Isocluster). Notre méthode a permis de détecter une forte proportion de bassins avec une meilleure précision.Le second outil avait pour objectif de distinguer les bassins actifs des bassins abandonnés. Un indicateur intégré (IPAI) basé sur quatre critères identifiés sur les images THRS que sont la présence d'eau, d'aérateur(s), de ponton(s) d'alimentation et de végétation, a été développé. Cet indicateur permet de distinguer significativement un bassin actif d'un bassin inactif. La présence de ponton est le critère qui s'est révélé être le plus discriminant.Cet indicateur a été utilisé sur l'estuaire de la Perancak pour suivre la dynamique d’abandon des bassins, liée au développement des maladies dans les élevages, entre 2001 et 2015. Deux facteurs de risque conduisant à l'abandon ont été mis en évidence : le climat et le positionnement des bassins au sein de l'estuaire. Ces résultats suggèrent qu'une approche spatiale doit être prise en compte pour la réhabilitation des bassins. Trois zones ont été définies à partir de leur résilience spatiale aux maladies. Le niveau de connectivité entre des bassins via le réseau hydrologique augmente le risque d'abandon. A noter que la présence actuelle des pathogènes (White Spot Syndrome Virus, WSSV) dans les bassins et probablement dans l'environnement génère une mémoire écologique défavorable à la réhabilitation de fermes aquacoles de crevettes.A partir de ces résultats, une première proposition de plan pour réhabiliter les bassins abandonnés a été formulée dans le cadre d'une approche écosystémique. Pour lutter contre les maladies, ce plan suggère de développer une aquaculture multi-trophique intégrée (AMTI), basée sur la diversité des espèces élevées et de leur positionnement dans la chaine trophique, à l'échelle de l'estuaire. Les méthodes et les études qui doivent être conduites pour rendre opérationnelle cette proposition sont discutées. / Shrimp farming production in Indonesia has continuously increased through a large expansion of cultured areas and stocking density intensification. This activity supports rural economic development and contributes to national food security, employment and foreign exchange earnings. However, this development has generated adverse ecological and social effects. As consequences of diseases and environmental degradations, there are currently 250,000 ha of abandoned ponds. Their rehabilitation, within a sustainable aquaculture framework, is actually a high priority for the Indonesian government.The objective of the present PhD work was to develop tools and methodologies to (1) enable better management for operating sites of shrimp industry and (2) rehabilitate abandoned sites using very high-resolution satellite (VHRS) imagery. The Perancak Estuary, located in Bali Province, is the production area in decline that has been chosen as study site. This work has been carried out in the frame of the INDESO project which was assigned to develop and provide tools and methods for better management of marine and coastal resources in Indonesia.The first developed tool was an automatic classification procedure for aquaculture mapping. A method based on Edge Detection on VHRS images was proposed and compared with those generated by Region Growing segmentation and unsupervised classification Isocluster. Edge Detection method could successfully create aquaculture map in the Perancak estuary by identifying a large proportion of existing ponds, with good overall accuracy.To implement effective procedure for appropriate aquaculture ecosystem assessment and monitoring, the second tool was an Integrated Pond Activity Indicator (IPAI). It aimed to discriminate active from abandoned ponds and was developed based on four criteria using VHRS images. Those criteria were: presence of water, aerator, feeding bridge and vegetation. This indicator succeeded in detecting active pond with a good accuracy, and feeding bridge appeared to be the most discriminant criteria.This second indicator has then been applied to the Perancak estuary to highlight the abandonment dynamic due to disease between 2001 and 2015. Two risk factors that could contribute to explain dynamics of abandonment were identified: climate conditions and pond locations within the estuary, suggesting that a spatial approach should be integrated in planning processes to operationalize pond rehabilitation. Three areas were defined based on their disease resilience. Ponds connectivity through water network increased the risk of disease development. The continued presence of shrimp pathogen species in ponds and probably in the environment (i.e. White Spot Syndrome Virus, WSSV) may generate ‘ecological memories’ that prevent to the return of shrimp productive system.These results were used to establish a first proposal of rehabilitation plan using an ecological approach. At the whole ecosystem scale, the development of an integrated multi-trophic aquaculture (IMTA), based on the diversity of cultured species and their trophic status would be implemented. Methods and studies that would be conducted to operationalize sustainable pond rehabilitation are briefly discussed.

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La « restauration » est un concept majeur de la gestion de cours d’eau. En France, comme à l’étranger, il a aujourd’hui un ancrage législatif, opérationnel et scientifique fort. La démarche de recherche engagée est destinée à mieux comprendre comment est définie, est pratiquée et est évaluée la « restauration de cours d’eau ». Les matériaux utilisés sont documentaires (publications scientifiques, dossiers administratifs des Agences de l’Eau, documents techniques d’appui à l’action, documents relatifs aux projets réalisés). Ils font l’objet d’analyses textuelles (bibliométrie, analyse de contenu, statistique textuelle, analyse qualitative).Les résultats sont organisés en cinq chapitres. Le Chapitre I concerne le positionnement des sciences dans le champ de la « restauration ». Sont abordés successivement les dynamiques scientifiques, les éléments de définitions et les thématiques de travail privilégiées par les chercheurs. Le Chapitre II dessine une chronologie des définitions françaises de la « restauration ». Il présente les permanences et les évolutions observées du XIXème siècle jusqu’à nos jours. Le Chapitre III s’intéresse aux politiques d’intervention de trois Agences de l’Eau. Il offre ainsi une première analyse des pratiques françaises de « restauration de cours d’eau ». Le travail sur les pratiques est ensuite centré, dans le Chapitre IV, sur la « restauration écologique de cours d’eau ». Il prolonge ainsi l’étude de l’action publique française et propose une comparaison avec l’Allemagne. Enfin, le Chapitre V s’intéresse plus particulièrement aux pratiques de suivi et d’évaluation des projets franco-Allemands de « restauration écologique ».Les résultats ont fait l’objet de réflexions opérationnelles et de recommandations afin d’aider l’action publique et les stratégies d’évaluation dans le domaine. Une attention particulière a également été accordée aux perspectives scientifiques dans le cadre d’une thématique stratégique pour la mise en œuvre de la Directive Cadre sur l’Eau. / “Restoration” is a key concept in river management. In France and worldwide, “river restoration” has been provided a strong legislative, operational and scientific anchor. This research aims to better understand “river restoration”: that is, how is “river restoration” defined, practiced and evaluated? Research materials stand on various documents (scientific articles, administrative documents of French Water Agencies, technical documents about “restoration” procedures and documents related to specific “restoration projects”). These documents are analysed with textual analysis methods (bibliometrics, content analysis, textual statistics, qualitative analysis).Results are organized into five chapters. Chapter I deals with the position of sciences in the field of “river restoration”. This chapter covers research dynamics, scientific definitions of “restoration” and scientists’ research themes related to “river restoration”. Chapter II draws a timeline of French definitions of “river restoration”. It analyses permanence and change in the definition of “river restoration” from the late 19th Century until today. In Chapter III, a framework which suggests the establishment of three French Water Agencies in order to analyse French “river restoration” public policy and practice is proposed. Chapter IV is dedicated to the analysis of “ecological river restoration” practices. This Chapter’s objective is to better understand French public action. French practices are also compared to German practices. Finally, the monitoring and evaluation of contemporary “ecological river restoration” projects in France and in Germany is described in Chapter V.Operational reflections and recommendations are provided through the results of this research in order to aid public action and evaluation strategies in the field of “river restoration”. Special attention was also paid to scientific perspectives in the context of the implementation of the Water Framework Directive.

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La faiblesse des muscles périphériques, définie par une diminution de la force maximale volontaire en dehors de tout état de fatigue neuromusculaire, est une complication fréquente de la broncho-pneumopathie chronique obstructive (BPCO). La force maximale volontaire dépend à la fois des propriétés musculaires périphériques (i.e. volume et architecture musculaire, qualités contractiles) et de la capacité du système nerveux à activer le muscle maximalement. Dans la BPCO, plusieurs travaux ont souligné l'existence paradoxale d'une perte de force maximale volontaire sans altérations musculaires périphériques et sans qu'un déficit d'activation volontaire n'ait clairement été identifié. Pourtant, les patients atteints de BPCO présentent de nombreuses altérations du système nerveux, compatibles avec une capacité d'activation volontaire altérée.L'objectif de ce travail de thèse était donc de tester l'implication du système nerveux dans la faiblesse musculaire de la BPCO et d'en déterminer les mécanismes sous-jacents. Au cours de nos travaux, nous avons mis en évidence une activité corticale diminuée dans la BPCO lors de contractions maximales et sous-maximales volontaires. Nous avons par ailleurs rapporté une perte d'excitabilité du cortex moteur et un déficit d'activation volontaire spécifique aux patients atteints de faiblesse musculaire. Ces résultats sont en accord avec une implication des altérations cérébrales dans la faiblesse musculaire périphérique de la BPCO. Nous sommes ensuite parvenus à identifier une origine potentielle des altérations cérébrales : les désaturations en O2 au cours du sommeil avec mouvements non-rapides des yeux (NREM). Cette hypothèse a été corroborée par l'observation d'un niveau d'activation volontaire réduit chez les patients désatureurs en sommeil NREM. En revanche, aucune répercussion significative n'a pu être observée sur la force maximale volontaire de ces patients, suggérant l'existence d'un mécanisme compensatoire. In fine, nos résultats constituent une avancée importante dans la compréhension du phénomène de faiblesse musculaire, classiquement attribué à la seule perte de masse musculaire. L'implication du système nerveux central dans la faiblesse musculaire ouvre notamment la voie à de nouvelles modalités de prise en charge par des approches spécifiques, dans l'optique de lutter contre la faiblesse musculaire et ses multiples répercussions négatives dans la vie du patient atteint de BPCO. / Peripheral muscle weakness, as defined by a reduced voluntary strength outside any state of neuromuscular fatigue, is a common complication of chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Maximal voluntary strength is determined by both peripheral muscle properties (i.e. muscle volume and architecture, contractile quality) and the nervous system's ability to activate the muscle maximally. In COPD, many studies highlighted the paradoxical existence of maximal voluntary strength loss without any peripheral muscle impairment, and without a clearly identified voluntary activation deficit. However, patients with COPD exhibited several nervous system alterations compatible with a reduced maximal voluntary activation capacity. The aim of this thesis was to test the nervous system implication in COPD muscle weakness and to determine the involved mechanisms. As major results, we found a reduced cortical activity in COPD during maximal and sub-maximal voluntary contractions. Furthermore, we reported reduced motor cortex excitability and voluntary activation deficit, specifically in patients with muscle weakness. These results are in accordance with an involvement of cortical alterations in COPD muscle weakness. Then, we indentified a potential origin for cortical alterations: O2 desaturation during non-rapid eye movement (NREM) sleep. This hypothesis has been corroborated by the observation of a reduced voluntary activation in patients with NREM sleep desaturation. However, no significant repercussion could have been observed on maximal voluntary strength in these patients, suggesting a compensatory mechanism.Our results are an important step forward in understanding the COPD muscle weakness that was classically attributed to loss of muscle mass only. The involvement of the central nervous system in COPD muscle weakness also brings about new patient care opportunities via tailored approaches, in order to fight against muscle weakness and its deleterious consequences on a patient's life.