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A construção do pensamento estatístico: organização, representação e interpretação de dados por alunos da 5ª série do Ensino FundamentalMedici, Michele 17 May 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-05-17 / Either during our every day life or in studies or scientific researches, we evidenced the necessity of exploring tabular and graphic representations. The report from the 4th INAF stands out, among other aspects, that only 23% of the Brazilian population shows some familiarity with this kind of representations. As we believe that the sooner we begin to explore them, the better. The aim of this essay was to conceive a didactic sequence on an experimental focus in order to introduce statistics to 5th graders (nowadays belonging to the 6th year) from Ensino Fundamental (Secondary School). We are not only looking for didactic conditions that would support student s autonomous evolution on solving problems of organization, representation and interpretation of a set of data, as well as the didactic sequence which the teacher would use in order to promote the construction of the statistical thinking. Thus, we investigate the way the students interact with situations proposed by the teachers, the students´ former knowledge, hypothesis formulated by them and the way they deal with constructed knowledge. For such analysis, we made use of the surmises of Didactic Engineering and we concluded that the classes must be fulfilled with collective debates and that the students have to be in small groups and every step must be built by them and they are responsible for their research. We are able to notice that the elements for the construction of the statistical thinking could be gradually composed by the students and the representations were most of the time, badly organized and / or with incorrect or missing information. The debates led to homogeneity of the milieux which turned into the students´ learning. We raised a series of questions to be explored with them during their following school year / No nosso dia-a-dia ou em estudos e pesquisas científicas constatamos a necessidade de explorar as representações tabulares e gráficas. O relatório do 4º INAF ressalta, entre outros aspectos, que apenas 23% da população brasileira demonstra certa familiaridade com essas representações. Por acreditar que devemos começar cedo a explorá-las, o objetivo desta dissertação foi conceber uma seqüência didática, em um enfoque experimental, para introduzir estatística aos alunos da 5ª série (hoje 6º ano) do Ensino Fundamental. Buscamos não apenas as condições didáticas que favoreçam a evolução autônoma do aluno na resolução de problemas de organização, representação e interpretação de um conjunto de dados, mas também a seqüência didática que o professor possa utilizar, visando favorecer a construção do pensamento estatístico. Assim, investigamos a maneira como o aluno interage com as situações propostas pelo professor, os conhecimentos preliminares que os alunos já possuem, as hipóteses elaboradas por eles e a forma como mobilizam os conhecimentos construídos. Para tais análises, utilizamos os pressupostos da Engenharia Didática e concluímos que as aulas devem ser permeadas por debates coletivos e em pequenos grupos de trabalho e que todas as etapas devem ser construídas pelos alunos, responsáveis pela sua pesquisa. Pudemos verificar que os elementos para a construção do pensamento estatístico puderam ser compostos gradativamente pelos alunos e que as representações foram muitas vezes pouco organizadas e / ou com informações inexatas ou faltantes. Os debates proporcionaram uma homogeneização dos milieux, o que pôde levar à aprendizagem dos alunos. Levantamos uma série de questões para serem exploradas com esses alunos no ano seguinte de escolaridade
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Análise do desempenho dos arranjos físicos distribuídos em ambiente de roteamento de tarefas com flexibilidade de seqüência de fabricação / Performance analysis of the distributed layouts in routing environment with manufacture sequence flexibilityGorgulho Júnior, José Hamilton Chaves 28 February 2007 (has links)
Este trabalho analisou o desempenho obtido pelos arranjos físicos distribuídos levando em consideração a flexibilidade de seqüenciamento das operações das peças. Foram comparados os arranjos físicos funcional, parcialmente distribuído, aleatoriamente distribuído e maximamente distribuído em três tamanhos (20, 40 e 80 máquinas), em duas configurações (equilibrado e desequilibrado) e usando dois métodos de roteamento (rígido e flexível). Para obtenção do arranjo físico maximamente distribuído foi desenvolvido um algoritmo genético e uma metodologia heurística de baixo impacto computacional denominada ALVO. A flexibilidade de seqüenciamento das operações foi baseada em relações de precedência e um procedimento automático para criação de peças com essas características foi desenvolvido. Os métodos e procedimentos propostos foram computacionalmente implementados em Visual Basic 6. Foram elaborados 152 arranjos físicos para cada tamanho e configuração sendo 50 funcionais, 50 parcialmente distribuídos, 50 aleatoriamente distribuídos e 2 maximamente distribuídos (um pelo algoritmo ALVO e outro pelo algoritmo genético). As simulações rotearam, para cada tipo de arranjo físico, 30 conjuntos com 150 peças cada um para obter o tempo total de programação (makespan) e a distância total percorrida. Os resultados mostraram que o desempenho do arranjo físico maximamente distribuído é sensivelmente superior ao parcialmente distribuído, mostrando que a desagregação completa dos departamentos é altamente vantajosa. As análises também mostraram que os arranjos físicos equilibrados, quando maximamente distribuídos, formam células fractais. / This work analyzes the performance obtained for the distributed layouts when the task routing environment takes in consideration the operations sequence flexibility of the parts. The functional, partially distributed, random distributed and maximally distributed layouts were compared in three sizes (20, 40 and 80 machines), in two configurations (balanced and unbalanced) and using two routing methods (rigid and flexible). For obtainment of the maximally distributed layout a genetic algorithm and a heuristically methodology of low computational impact was developed (ALVO algorithm). The sequence flexibility of the operations is based on precedence diagram and an automatic procedure for creation of parts with these characteristics was developed. The proposed methods and procedures had been implemented in Visual Basic 6. Have been builds 152 layouts for each size and configuration being 50 functional, 50 partially distributed, 50 random distributed and 2 maximally distributed (one by ALVO algorithm and another by genetic algorithm). The simulations routing, for each layout type, 30 groups with 150 parts each to obtain the makespan and the traveled total distance. The results showed that performance of the maximally distributed layout has a performance slightly superior to the partially layout, showing that the complete disaggregation of the departments is highly advantageous. The analysis also showed that balanced layouts, when maximally distributed, forms fractal cells.
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Análise do desempenho dos arranjos físicos distribuídos em ambiente de roteamento de tarefas com flexibilidade de seqüência de fabricação / Performance analysis of the distributed layouts in routing environment with manufacture sequence flexibilityJosé Hamilton Chaves Gorgulho Júnior 28 February 2007 (has links)
Este trabalho analisou o desempenho obtido pelos arranjos físicos distribuídos levando em consideração a flexibilidade de seqüenciamento das operações das peças. Foram comparados os arranjos físicos funcional, parcialmente distribuído, aleatoriamente distribuído e maximamente distribuído em três tamanhos (20, 40 e 80 máquinas), em duas configurações (equilibrado e desequilibrado) e usando dois métodos de roteamento (rígido e flexível). Para obtenção do arranjo físico maximamente distribuído foi desenvolvido um algoritmo genético e uma metodologia heurística de baixo impacto computacional denominada ALVO. A flexibilidade de seqüenciamento das operações foi baseada em relações de precedência e um procedimento automático para criação de peças com essas características foi desenvolvido. Os métodos e procedimentos propostos foram computacionalmente implementados em Visual Basic 6. Foram elaborados 152 arranjos físicos para cada tamanho e configuração sendo 50 funcionais, 50 parcialmente distribuídos, 50 aleatoriamente distribuídos e 2 maximamente distribuídos (um pelo algoritmo ALVO e outro pelo algoritmo genético). As simulações rotearam, para cada tipo de arranjo físico, 30 conjuntos com 150 peças cada um para obter o tempo total de programação (makespan) e a distância total percorrida. Os resultados mostraram que o desempenho do arranjo físico maximamente distribuído é sensivelmente superior ao parcialmente distribuído, mostrando que a desagregação completa dos departamentos é altamente vantajosa. As análises também mostraram que os arranjos físicos equilibrados, quando maximamente distribuídos, formam células fractais. / This work analyzes the performance obtained for the distributed layouts when the task routing environment takes in consideration the operations sequence flexibility of the parts. The functional, partially distributed, random distributed and maximally distributed layouts were compared in three sizes (20, 40 and 80 machines), in two configurations (balanced and unbalanced) and using two routing methods (rigid and flexible). For obtainment of the maximally distributed layout a genetic algorithm and a heuristically methodology of low computational impact was developed (ALVO algorithm). The sequence flexibility of the operations is based on precedence diagram and an automatic procedure for creation of parts with these characteristics was developed. The proposed methods and procedures had been implemented in Visual Basic 6. Have been builds 152 layouts for each size and configuration being 50 functional, 50 partially distributed, 50 random distributed and 2 maximally distributed (one by ALVO algorithm and another by genetic algorithm). The simulations routing, for each layout type, 30 groups with 150 parts each to obtain the makespan and the traveled total distance. The results showed that performance of the maximally distributed layout has a performance slightly superior to the partially layout, showing that the complete disaggregation of the departments is highly advantageous. The analysis also showed that balanced layouts, when maximally distributed, forms fractal cells.
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Um estudo sobre propriedades do paralelogramo envolvendo o processo de argumentação e provaDuarte, Valdenir Francisco 10 December 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-12-10 / This work, carried out as part of the research project AprovaME developed at
the Pontifical Catholic University of São Paulo, has as its aim to verify the
advances and the difficulties presented by students in the elaboration of proofs
related to the properties of parallelograms. The research procedures adopted
during the study drew from the theories of de Parzysz (2001) concerning formal
and empirical proofs; the four dimensions involved in the construction of
geometrical thinking perception, representations, construction and conception
presented by Machado (1995); the representation of information from the
point of view of Duval (1995); and the considerations related to logical
sequences in Duval e Egret (1989).
Using the methodology Didactical Engineering, a sequence of activities was
designed and carried out with two groups of students. One group was
composed of 8th grade Middle School students and the second of students from
the first year of High School. The activity sequence was planned to involve
students in, first, the construction of hypotheses and theses on the basis of
empirical explorations and, in term, organise, in a deductive form, their
propositions in order to elaborate proofs of various properties of parallelograms.
The analysis of the students productions illustrates difficulties experienced
in the process of argumentation and proof that can be grouped into three
categories: difficulties related to the elaboration of proofs, difficulties associated
with the acceptance of empirical arguments and difficulties linked to problems in
interpreting the problems proposed. The analysis also suggested that as the
activity sequence progressed, certain advances in relation to these difficulties
occurred. Some students began to carry out calculations without needing to
consider particular cases, others presented complete formal proofs and even
those who produced incomplete proofs made use of logical reasoning in
attempts to express valid arguments. In addition, a positive factor related to the
activity sequence was the engagement of students in the analysis of proofs
constructed by others / O presente trabalho, vinculado ao projeto AprovaME, desenvolvido na
Pontifícia Universidade Católica de São Paulo, tem por objetivo verificar os
avanços e as dificuldades apresentadas pelos alunos na elaboração de provas
sobre as propriedades dos paralelogramos.
Os procedimentos dessa pesquisa foram fundamentados nas teorias de
Parzysz (2001) sobre provas formais e empíricas; Machado (1995) sobre as
quatro dimensões da construção do pensamento geométrico: percepção,
representação, construção e concepção; Duval (1995) sobre formas de
representação de informações; Duval e Egret (1989) sobre seqüências lógicas.
Usando a metodologia da Engenharia Didática, foram concebidas e aplicadas
a alunos da oitava série do Ensino Fundamental e do primeiro ano do Ensino
Médio, uma seqüência de atividades que visaram levá-los, de forma empírica, a
construir o conceito de hipótese/tese e, de forma dedutiva, a ordenar
proposições de modo a elaborar provas das propriedades dos paralelogramos.
A análise das produções dos alunos mostra dificuldades no processo de
argumentação e prova que podem ser agrupadas em três categorias:
dificuldades ligadas à elaboração de uma prova, dificuldades oriundas da
aceitação de provas empíricas e dificuldades ligadas à leitura e interpretação
de enunciados.
A análise também apontou que houve certos avanços nesse processo.
Alunos realizaram cálculos sem o apoio empírico, outros apresentaram
algumas provas formais completas, e mesmo aqueles que produziram provas
incompletas mostraram um raciocínio lógico até o ponto onde elas foram feitas.
Além disso, verificou-se que o fato de dois alunos poderem analisar a prova
feita pela outra dupla foi um fator muito positivo na seqüência apresentada
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O uso de padrões e seqüências: uma proposta de abordagem para introdução à algebra para alunos de sétimo ano do ensino fundamentalMartins Neto, Raimundo de Souza 17 December 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-12-17 / Secretaria da Educação do Estado de São Paulo / The objective of this research was to present a proposal of didactic sequence
destined to the students of the 7ºth grade for introduction to Algebra, in particular
the two of its components: the generalization and the construction of algebraic
expressions from presented standards and sequence under the form of problems.
The used theoretical tools had counted on the organization of the algebraic thought
levels, according to Fiorentini (2004), as well as the levels of mobilization of a
knowledge, according to Robert (1998), as much for the orientation of the didactic
organization of the activities as for analysis of the observed data. The adopted
methodological procedures had been based on the theory of Didactic Engineering,
of Michele Artigue (1998, Apud MACHADO, 1999), that defines it for colon main:
one has left experimental established in the didactic accomplishments in
classroom, that includes the formularization, accomplishment, comment and
analysis of a sequence of education and a specific validation, based in the
confrontation between a priori analysis and analysis a posteriori. Of this form, after
to analyze the results gotten in elapsing of the sessions that composed the
elaborated didactic sequence, we perceive that it had a gradual increase of the
levels of the algebraic thought the pupils. Thus, to classify as satisfactory the
results presented in this research / O objetivo desta pesquisa foi apresentar uma proposta de seqüência didática
destinada a alunos de 7º ano do Ensino Fundamental para introdução à Álgebra,
em particular a dois de seus componentes: a generalização e a construção de
expressões algébricas a partir de padrões e seqüência apresentados sob a forma
de problemas. As ferramentas teóricas utilizadas contaram com a organização do
pensamento algébrico em níveis, segundo Fiorentini (2004), assim como os
níveis de mobilização de um conhecimento, segundo Robert (1998), tanto para a
orientação da organização didática das atividades como para análise dos dados
observados. Os procedimentos metodológicos adotados foram baseados na
teoria da Engenharia Didática, de Michele Artigue (1998, Apud MACHADO,
1999), que a define por dois pontos principais: uma parte experimental baseada
nas realizações didáticas em sala de aula, que inclui a formulação, realização,
observação e análise de uma seqüência de ensino e uma validação específica,
baseada no confronto entre análise a priori e análise a posteriori. Dessa forma,
após analisarmos os resultados obtidos no decorrer das sessões que
compunham a seqüência didática elaborada, percebemos que houve um
aumento gradual dos níveis do pensamento algébrico dos alunos. Assim,
classificarmos como satisfatórios os resultados apresentados nesta pesquisa
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O uso de padrões e seqüências: uma proposta de abordagem para introdução à algebra para alunos de sétimo ano do ensino fundamentalGrecco, Emily Cassiana Santolin 17 December 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-12-17 / Secretaria da Educação do Estado de São Paulo / The objective of this research was to present a proposal of didactic sequence destined to the students of the 7ºth grade for introduction to Algebra, in particular the two of its components: the generalization and the construction of algebraic expressions from presented standards and sequence under the form of problems. The used theoretical tools had counted on the organization of the algebraic thought levels, according to Fiorentini (2004), as well as the levels of mobilization of a knowledge, according to Robert (1998), as much for the orientation of the didactic organization of the activities as for analysis of the observed data. The adopted methodological procedures had been based on the theory of Didactic Engineering, of Michele Artigue (1998, Apud MACHADO, 1999), that defines it for colon main: one has left experimental established in the didactic accomplishments in classroom, that includes the formularization, accomplishment, comment and analysis of a sequence of education and a specific validation, based in the confrontation between a priori analysis and analysis a posteriori. Of this form, after to analyze the results gotten in elapsing of the sessions that composed the elaborated didactic sequence, we perceive that it had a gradual increase of the levels of the algebraic thought the pupils. Thus, to classify as satisfactory the results presented in this research / O objetivo desta pesquisa foi apresentar uma proposta de seqüência didática destinada a alunos de 7º ano do Ensino Fundamental para introdução à Álgebra, em particular a dois de seus componentes: a generalização e a construção de expressões algébricas a partir de padrões e seqüência apresentados sob a forma de problemas. As ferramentas teóricas utilizadas contaram com a organização do pensamento algébrico em níveis, segundo Fiorentini (2004), assim como os níveis de mobilização de um conhecimento, segundo Robert (1998), tanto para a orientação da organização didática das atividades como para análise dos dados observados. Os procedimentos metodológicos adotados foram baseados na teoria da Engenharia Didática, de Michele Artigue (1998, Apud MACHADO, 1999), que a define por dois pontos principais: uma parte experimental baseada nas realizações didáticas em sala de aula, que inclui a formulação, realização, observação e análise de uma seqüência de ensino e uma validação específica, baseada no confronto entre análise a priori e análise a posteriori. Dessa forma, após analisarmos os resultados obtidos no decorrer das sessões que compunham a seqüência didática elaborada, percebemos que houve um aumento gradual dos níveis do pensamento algébrico dos alunos. Assim, classificarmos como satisfatórios os resultados apresentados nesta pesquisa
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Números p-ádicos transcendentes e séries de racionais que convergem em qualquer complemento de QHoffmann, Gertrudes Regina Todeschini January 2000 (has links)
Quando tomamos o valor absoluto usual e o completamento de Q em relação à métrica induzida por ele, o resultado é o corpo IR dos números reais; fazendo o mesmo processo com qualquer outro valor absoluto definido em Q, obtemos um dos corpos p-ádicos QP. O propósito deste trabalho é explorar a convergência de séries em QP e em IR, construindo algumas séries de números racionais com propriedades de convergência surpreendentes. Provamos também que é possível construir uma série de números racionais que converge em qualquer completamento de Q para um valor pré-fixado de Q e de R. / When we consider the completion of Q with respect to the usual absolute value we obtain the field of the real numbers R But if we do the same with respect to any other absolute value of Q we obtain the field of the p -adie numbers QP, where p is a prime. In this work we consider the convergence of series in QP and in lR and construct series of racional numbers with amazing convergence properties. We also prove that it is possible to obtain a series of rational numbers that converges in all completions of Q even if we prescribe its sum in each completion.
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Expressão gênica diferencial em palmitos de cana-de-açúcar submetida a diferentes períodos de estresse hídricoJovino, Daniele Fernanda Revoredo [UNESP] 20 July 2007 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2007-07-20Bitstream added on 2014-06-13T18:54:09Z : No. of bitstreams: 1
jovino_dfr_me_jabo.pdf: 637580 bytes, checksum: dc449a2a52a9354da867effed1512963 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Sob condições de estresse hídrico, a cana-de-açúcar pode sofrer mudanças fisiológicas e bioquímicas, tais como diminuição nas atividades fotoquímicas, redução da fixação de CO2 e acúmulo de osmólitos e osmoprotetores. O objetivo deste trabalho foi identificar, através da técnica de macroarranjo de cDNA, o perfil de expressão de genes promotores das diferentes vias metabólicas em palmitos da variedade de cana-de-açúcar SP80-3280 submetidas ao estresse hídrico nos dias 5, 9, 13 e 17 após o início da condição de supressão de água, sendo considerado o dia 1 como controle. Os resultados do macroarranjo mostraram que as proteínas mais expressas sob déficit hídrico pertencem a quatro categorias das quais as ESTs mais importantes foram selecionadas. As quatro categorias descritas abaixo estão discutidas neste trabalho. As ESTs da via do metabolismo de açúcar e amido (invertase de parede celular (INV), sacarose fosfato sintase (SFS), sacarose fosfato fosfatase (SFF), trealose fosfato sintase (TFS), trealose fosfato sintase/fosfatase (TFS/F) e hexoquinase (HXQ)) pertencem a categoria de bioenergética. Colina monooxigenase (CMO) e betaína aldeído desidrogenase (BADH) as quais pertencem a via do metabolismo de glicina betaína, foram selecionadas a partir da categoria do metabolismo secundário. A terceira categoria compreende as ESTs do metabolismo de aminoácido (D-pirrolina-5- carboxilato sintase (P5CS), ornithina -aminotransferase (OAT) e prolil 4-hidroxilase (PH)) as quais pertencem a via da biossíntese de prolina, e a quarta categoria, resposta ao estresse, compreende as ESTs aleno oxido sintase (AOS), aleno oxido ciclase (AOC) e lipoxigenase (LOX), pertencentes a via de biossíntese do jasmonato. / Under water deficit, sugarcane undergoes physiological and biochemical alterations such as photochemical activity reduction, CO2 fixation reduction and the accumulation of osmolytes and osmoprotectants. This work was undertaken to identify the gene expression profile in sugarcane (var. SP80-3280) under water deficit through the cDNA macroarray technique. Leafroll tissues were collected from plants subjected to 5, 9, 13 and 17 days of water restriction, and day 1 was used as control. Macroarray results showed that most proteins expressed under water restriction belong to four categories, from which the most important ESTs were selected. The four categories described below are discussed in this work. Sugar and starch metabolism pathway ESTs (cell wall invertase (CWI), sucrose phosphate synthase (SPS), sucrose phosphate phosphatase (SPP), trehalose phosphate synthase (TPS), trehalose phosphate synthase phosphatase (TSP/P) and hexoquinase (HXQ) were selected from the bioenergetics category. Choline monooxygenase (CMO) and betaine aldehyde dehydrogenase (BADH), which belong to the glycine betaine metabolism pathway, were selected from the secondary metabolism category. The third category comprised the amino acid metabolism ESTs D- pyrroline-5-carboxylate synthase (P5CS), Ornithine - aminotransferase (OAT) and Prolyl 4-hydroxylase (PH), which belong to the proline biosynthesis pathway, and the fourth category, stress response, comprised the ESTs for Allene oxide synthase (AOS), Allene oxide cyclase (AOC) and Lipoxygenase (LOX), which belong to the jasmonate biosynthesis pathway.
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Análise de estratégias de execução para edifícios verticais com diferentes sistemas construtivos. / Analyze of production strategies for tall buildings with different construction systems.Barbosa, Maysa Fontoura 09 September 2005 (has links)
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Previous issue date: 2005-09-09 / The civil construction management has been taken more attention of civil construction companies in aim alternatives to enhancing theirs management process, main that work with building construction because the growing competition and the exigency of their invest. In this set, the strategic planning is fundamental for the development and success of business because generates data that will guide the balance between the production planning expectation and the necessary costs for concluding a project. The supply of planning data and performances of building construction is get to divide of the simulation of the production strategy. The
planning production represents the strategies because its products are some information: schedules, graphs and reports to arrive the execution efficiency. This research presents analyze the conduct of two different construction systems
variables of three construction strategies. The construction systems studied were traditional construction system and the external walls in reinforced concrete construction system. The production strategies simulated concentrated in analyse
only the tower and were without inversion of services; with partial inversion of services; and with total inversion of services. Like product of this research to claim develop a systematization to value and choose the production strategies to attend by the tall building construction companies. / O gerenciamento em obras de construção civil vem recebendo atenção por parte das empresas na busca de alternativas para melhorar seus processos de gestão da produção. Isso ocorre principalmente em empresas que trabalham com construção de edifícios para o mercado imobiliário, face à competitividade e exigências estabelecidas por seus investidores. Neste contexto, as estratégias de execução
são fundamentais para o desenvolvimento e sucesso do negócio , pois delas decorrem a forma de como serão aproveitados os recursos físicos e financeiros disponibilizados. Através de simulações de estratégias de execução são fornecidos diversos dados de planejamento ao subsetor edificações. Tais estratégias são representadas pelo planejamento da produção através da geração de informações:
cronogramas, gráficos e relatórios. Dessa forma, este trabalho analisa o comportamento das variáveis de produção de dois sistemas construtivos através da proposição de três diferentes estratégias de execução. Os sistemas estudados
foram o sistema construtivo tradicional e o sistema construtivo com paredes externas em concreto moldado in loco . As estratégias de execução simuladas concentraram-se na análise dos serviços da torre do edifício vertical, sendo
propostas as seguintes seqüências: sem inversão dos serviços, com inversão total dos serviços e com inversão parcial dos serviços. Os principais resultados desta pesquisa são apresentados na forma de parâmetros e gráficos que facilitam a avaliação e seleção de estratégias de execução a serem seguidas pelas empresas que executam edifícios verticais.
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Desenvolvimento e validação de protocolos para a anotação automática de sequências ORESTES de Eimeria spp. de galinha doméstica. / Development and validation of protocols for automated annotation of ORESTES sequences of Eimeria spp. of domestic fowl.Milene Ferro 08 December 2008 (has links)
A coccidiose aviária é uma doença entérica causada por protozoários parasitas do gênero Eimeria. Visando uma maior compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos na regulação do ciclo de vida dos parasitas, foram geradas 15.000 seqüências expressas (ORESTES) para cada uma das três espécies mais importantes: E. tenella, E. maxima e E. acervulina. O presente trabalho consistiu no desenvolvimento de componentes de anotação automática de seqüências para o sistema EGene, plataforma previamente desenvolvida pelo nosso grupo (Durham et al. Bioinformatics 21: 2812-2813, 2005) para a construção de processamentos encadeados (pipelines). Estes componentes foram utilizados para a construção de pipelines de anotação automática de seqüências-consenso obtidas a partir da montagem dos ORESTES de Eimeria spp. A anotação consistiu na identificação dos genes e atribuição da função dos respectivos produtos protéicos, baseando-se em um conjunto de evidências. As seqüências também foram classificadas e quantificadas utilizando-se um vocabulário controlado de termos de ontologia gênica (GO). / Avian coccidiosis is an enteric disease caused by protozoan parasites of the genus Eimeria. Aiming at obtaining a better understanding of the molecular mechanisms that regulate the life cycle of the parasites, our group generated 15,000 expressed sequences (ORESTES) for each one of the three most important species: E. tenella, E. maxima and E. acervulina. In the present work, we report the development of a set of components for the automated sequence annotation through EGene, a platform for pipeline construction previously described by our group (Durham et al. Bioinformatics 21: 2812-2813, 2005). These components were used to construct pipelines for the automated annotation of assembled sequences of ORESTES of Eimeria spp. The annotation process consisted in the identification of genes and the corresponding protein function based on a set of evidences. The sequences were also mapped and quantified using a controlled vocabulary of gene ontology (GO) terms.
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