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A importância do processo de alinhamento da estratégia com projetos seis sigma: um estudo multicasos em operadores logísticos / The importance of the process of alignment the strategy with six sigma projects: a study multicases in logistic operators

Gonçalves, Bianca Soares de Oliveira 20 April 2007 (has links)
Além do fato do programa seis sigma e a logística estarem em evidência no ambiente organizacional, soma-se a importância de se obter sucesso na implantação do programa, caracterizando como um fator crítico, o alinhamento da estratégia dos projetos de melhoria. Sendo assim, uma análise do processo de alinhamento da estratégia de projetos seis sigma se justifica. Para abordar esta questão, esta dissertação objetiva identificar a importância do alinhamento da estratégia e propõe uma sistematização deste com o processo de seleção de projetos seis sigma. Dessa forma, esta pesquisa está estruturada, primeiramente, com uma revisão bibliográfica sobre seis sigma, estratégia e operadores logísticos. Com o embasamento teórico é proposta uma sistematização conceitual do alinhamento da estratégia do processo de seleção de projetos seis sigma detalhado em um passo a passo. Com o objetivo de analisar a proposta conceitual, realizaram-se três estudos de casos em operadores logísticos. Pode-se concluir que o fato do processo de seleção de projetos seis sigma estar alinhado com a estratégia realmente é um ponto crítico para o sucesso do programa seis sigma, bem como a apresentação da sistematização proposta obteve uma boa avaliação e aceitação dos casos apresentados. / Beyond the fact of the six sigma program and the logistic, that are on evidence in the organizational environment, adds to them the importance of getting success in the implantation of the program, characterizing as a critical factor to the strategical alignment of the improvement projects. Being thus, an analysis of the process of strategical alignment of six sigma projects is justified. Approaching this question, this dissertation proposes a systematization of the alignment of the organizational strategy with the process of six sigma projects` selection. This research is structuralized, first, with a bibliographical revision on six sigma, logistic strategy and operators. With the theoretical basement was proposed a systematization of strategical alignment of the selection process of six sigma projects, detailed step by step. With the objective of analyzing the proposal conceptual, three cases\' studies in logistic operators were done. The importance of the process of six sigma projects\' selection can be noticed and its alignment with the organizational strategy, as well as the validation of the systematization proposal.
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Lean Mining: modelagem e melhorias em cadeias logísticas minerais. / Lean mining: modeling and improving mineral supply chains.

Steinberg, José Gustavo 17 March 2010 (has links)
Os processos extrativos tradicionais apresentam estágios que precisam de modernização e melhorias para permitir que as empresas mineradoras provisionem de maneira eficaz a qualidade e a quantidade de seus produtos. Tal garantia de provisão, tão difícil de sustentar devido à natureza intrínseca da incerteza geológica, pode somente ser conseguida com um aumento de eficiência nas cadeias logísticas minerais. Este trabalho demonstra os benefícios de se criar modelos de cadeias logísticas minerais existentes para identificar e compreender os pontos de criação de valor para possíveis intervenções visando melhorias. O trabalho também fornece um guia de modelagem, através de uma planilha eletrônica, permitindo aos usuários modelar quaisquer tipos de cadeias logísticas. O conhecimento do trajeto dos processos desde a extração ao consumidor final fornece uma oportunidade única para que os gerentes melhorem suas cadeias logísticas. Depois que o modelo foi criado, ele pode e deve ser melhorado. Um número técnicas e boas práticas já em uso por outros setores, mas ainda não aplicado setor mineiro são identificadas e estruturadas. Uma metodologia para a aplicação estratégica destas técnicas é então fornecida. O setor mineiro em todo mundo está sob pressão para procurar métodos para melhorar sua eficiência. Este trabalho introduz, de uma maneira inovadora, uma estratégia administrativa na mineração que se provou extremamente competitiva em outras indústrias. A questão básica abordada neste trabalho é como desenvolver uma metodologia robusta e controlada para que o setor mineiro tire proveito da filosofia enxuta, introduzindo o conceito de Lean Mining. / Traditional extractive processes present stages that need modernization and optimization for enabling mining companies to warrant the effective achievement of both product quality and quantity. Such warranty, which is difficult to sustain due to the intrinsic nature of geological uncertainty, can only be achieved through an increased efficiency in the mineral supply chain. This work demonstrates the benefits of creating models of existing mineral supply chains to identify and understand the points of value creation and places for possible improvement interventions. It also gives a modeling guide, through an electronic chart, enabling users to model any kind of supply chain. The knowledge of the process path from extraction to final consumer provides a unique opportunity for managers to improve the mineral supply chain. After the model has been created, it should and must be improved. A number of techniques and good practices already in use by other sectors but not yet applied to the mining industry are identified and structured. A methodology to strategical application of these techniques in provided. The mining industry all over the world is under pressure to look for methods to improve its efficiency. This work leads the way to an innovative managerial strategy in mining that has proved itself extremely competitive in other industries. The key issue addressed in this work is how to identify a robust and risk-controlled path for the mining industry to benefit from the lean thinking approach, introducing the concept of Lean Mining.
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Expression of sigma receptors in human cancer cell lines and effects of novel sigma-2 ligands on their proliferation

Abbas, Haider January 2018 (has links)
Sigma receptors originally thought to be an opioid receptor is now categorized as a distinct class of receptor. There are two main subtypes, the sigma-1 receptor and an uncharacterised binding site, named the sigma-2 binding site. The presence of the sigma-2 binding site shows high correlation with proliferation of cells and is associated with cancer. I have categorized sigma-1 and sigma-2 binding sites in 11 human tumour cell lines. I have demonstrated that tumour cell lines from a range of tissues express both sigma-1 and sigma-2 binding sites. One exception is the MCF7 breast cancer cell line, which lacks sigma-1 receptors. I show that the quantitation of sigma-2 binding sites using the "masking" protocols are flawed, significantly overestimating levels of sigma-2 binding sites. I propose novel protocols to determine levels of sigma-1 receptors and sigma-2 binding sites in cell lines and tissue. Using radioligand binding assays in MCF7 cells, I have characterised novel sigma-2 ligands. These ligands are simple ammonium salts containing a single nitrogen atom. They are simpler than the previously recognised pharmacophore for the sigma-2 site. I have shown that these simple ammonium salts show graded affinity for the sigma-2 binding site. The highest affinity ligands were dihexylammonium (pKi 7.58) and dioctylammonium (pKi 7.9). I have used these ammonium salts and previously characterised ligands to determine sigma-2 binding site biology. I have shown that the biological activity of these drugs is related neither to their hydrophobicity nor their ability to effect calcium signalling in cells. I propose that the Hill slope of binding is inversely related to the efficacy of a ligand to inhibit metabolic activity of cancer cells. Furthermore, I offer an explanation as to why concentrations of sigma-2 ligands far higher than their determined binding affinities are required to inhibit metabolic activity.
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Caracterização de fatores sigma ECF de Pseudomonas aeruginosa PA14 / Characterization of ECF sigma factors in Pseudomonas aeruginosa PA14

Magalhães, Larissa de Oliveira 08 September 2016 (has links)
A proteobactéria Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista em humanos, sendo associado a queimaduras e infecções pulmonares crônicas em pacientes com fibrose cística. Essas infecções são difíceis de erradicar devido à resistência intrínseca de P. aeruginosa a antibióticos e à formação de biofilmes. Essa bactéria é altamente capaz de adaptar ao ambiente, tem um metabolismo versátil e pode direcionar a expressão de genes por vários fatores sigma alternativos. Estes são subunidades para transcrição de conjuntos específicos de genes em bactérias e interagem com o cerne da RNA polimerase, levando ao reconhecimento do promotor e início da transcrição. Os fatores sigma alternativos permitem que bactérias redirecionem a sua expressão genética. Um grupo de fatores sigma alternativos é o grupo dos fatores sigma de função extracitoplasmática (ECF) que são envolvidos principalmente em funções do envelope celular. Esse trabalho teve como objetivo caracterizar dois fatores sigma ECF de função desconhecida, PA14_21550 e PA14_46810. A linhagem mutante Δ21550 foi analisada quanto a sua sobrevivência a diferentes estresses, observando-se que é mais resistente ao choque de 45°C que a linhagem selvagem. Esse fator sigma não é essencial para crescimento da bactéria em meio LB e meio mínimo M63 acrescido de glicose ou succinato. Além disso, observou-se que a superexpressão desse fator sigma aumenta a expressão da proteína hipotética PA14_30100, usando-se uma abordagem proteômica. O mutante de transposon para o fator sigma PA14_46810 apresenta melhor crescimento que a bactéria selvagem em meio M63 acrescido de glicose. Essa linhagem mostrou mesmo fenótipo para biofilme e formação de exopolissacarídeo que a bactéria selvagem. Ademais, foi realizada análise de transcritoma por RNA-Seq com a superexpressão do fator sigma PA14_46810 na linhagem selvagem. Na linhagem de superexpressão Observou-se que ocorre indução de genes envolvidos com a desnitrificação, transporte de moléculas e metabolismo de uma maneira geral, em relação à linhagem controle. Por outro lado, o excesso de PA14_46810 reprime principalmente genes envolvidos com a tradução de proteínas e síntese de espermidina. Este trabalho, portanto, trouxe novas informações sobre as funções de diferentes fatores sigma ECF de P. aeruginosa, contribuindo assim para um maior entendimento da fisiologia desta bactéria e sua adaptação a diferentes condições. / The proteobacterium Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen in humans, and it is associated to chronic pulmonary infections in patients with cystic fibrosis and burn wounds. These infections are difficult to eradicate due to P. aeruginosa intrinsic resistance to antibiotics and formation of biofilms, which allow the bacteria to adhere to biotic and abiotic surfaces. This bacterium is highly adaptaptable to the environment has a versatile metabolism and can direct the expression of genes by several alternative sigma factors. The sigma factors bind to the RNA polymerase core, providing recognition to promoter and transcription initiation. Therefore, the alternative sigma factors can redirect bacterial genetic expression by recognizing specific promoters. One subfamily of alternative sigma factors is the extracytoplasmic function (ECF) sigma factors, involved mostly in cell envelope functions. The aim of this work was characterize two ECF sigma factors with unknown function in P. aeruginosa, PA14_21550 and PA14_46810. The strain Δ21550 was analyzed for its survival in different stress conditions and it is more resistant in heat shock conditions at 45°C than the wild type strain. It was also observed that PA14_21550 sigma factor is not essential for bacterial growth in LB and M63 minimal medium added with glucose or succinate as the carbon source. Furthermore, overexpression of this sigma factor increases the expression of hypothetical protein PA14_30100, as verified by a proteomic approach. A strain insertionally inactivated in the PA14_46810 gene has better growth than the wild type strain in M63 added with glucose and the same phenotype regarding to biofilm formation and exopolysaccharide production as the wild type strain. Moreover, transcriptome analysis was carried out by RNA-Seq with overexpression of the PA14_46810 sigma factor in the wild type strain. Induction of genes involved in denitrification, transport of molecules and energetic metabolism in relation to the control strain was observed. On the other hand, excess of PA14_46810 represses genes involved in protein translation and spermidine synthesis. This work, therefore, brought new information about the functions of two ECF sigma of P. aeruginosa, thus contributing to a greater understanding of the physiology of this bacterium and its adaptation to different conditions.
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Programa Seis Sigma para formação de redes de inovação auto-organizadas / Six Sigma programs for setting up of innovation self-organized networks

Gomes, Lucas Portilho Camargos 21 March 2014 (has links)
A formação de redes colaborativas é uma importante forma das organizações estimularem a inovação, reduzirem custos e transferir conhecimentos. Uma forma particular de rede colaborativa, as redes auto-organizadas, demonstram grande capacidade de promover o aprendizado dos envolvidos, sistematizar o conhecimento e promover a inovação. Já os programas Seis Sigma, adotados por diversas organizações, possuem como objetivo principal a redução da variabilidade de um processo, resultando na redução de custos e melhoria da qualidade. A literatura sobre redes auto-organizadas pouco apresenta sobre a formação destas redes e a literatura sobre Seis Sigma é voltada a métodos estatísticos. Desta forma, o objetivo desta pesquisa é identificar os elementos para um modelo de referência baseado no programa Seis Sigma para a formação e gerência de redes de inovação auto-organizadas. Foram realizados cinco estudos de caso em diferentes organizações. Os programas Seis Sigma destas organizações foram modelos com o uso da metodologia Enterprise Knowledge Development (EKD). Com base na literatura estudada foram identificas as necessidades de mudanças que viabilizariam a formação de redes de inovação auto-organizadas. Como resultado tem-se os elementos para o modelo de referência para formação e gerência de redes de inovação auto-organizadas baseado no programa Seis Sigma. / The formation of collaborative networks is an important way for organizations to stimulate innovation, reduce costs and transfer knowledge. A particular form of collaborative network, the self-organized networks have shown great capability to promote the learning of those involved, systematize knowledge and lead to innovation. The Six Sigma programs, adopted by several organizations, have as main objective the process variability reduction, resulting in lower costs and quality improvement. The literature on self-organized networks presents little about the formation of these kind of networks and literature on Six Sigma is focused on statistical methods. Thus, the objective of this research is to identify the elements for a reference model based on the Six Sigma program for setting up and management of innovation selforganized networks. Five case studies were conducted in different organizations. The Six Sigma programs of these organizations were modeled using the Enterprise Knowledge Development (EKD) methodology. Based on the studied literature the needs for changes that enables the formation of innovation self-organized networks were identified. As a result there are the elements of the reference model for the formation and management of innovation self-organized networks based on the Six Sigma program.
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Caracterização de juntas soldadas por TIG autógeno manual com arco pulsado e arco não pulsado do aço inoxidável hiperduplex SAF 2707 HD. / Characterization of autogenous TIG welded joint by manual arc pulsed and non-pulsed hiperduplex stainless steel SAF 2707 HD.

Debora Francielle Dias 20 July 2012 (has links)
O aço inoxidável hiperduplex, SAF 2707 HD, foi desenvolvido com o intuito de se obter novas ligas com maior resistência à corrosão do que a disponível nos aços inoxidáveis duplex / superduplex. Além da melhorada resistência à corrosão, este tb oferece propriedades mecânicas superiores. Os aços hiperduplex são aços de última geração que possuem elevados teores de elementos de liga, principalmente cromo, molibdênio e nitrogênio. Este tipo de aço caracteriza-se por apresentar estrutura bifásica, constituída de proporções praticamente iguais de ferrita e austenita devido à distribuição controlada dos elementos alfagênicos e gamagênicos. O interesse por esses aços cresce gradativamente com a necessidade de novos materiais para diversas aplicações na indústria petrolífera. Porém, quando expostos e mantidos a temperaturas elevadas, na faixa entre 600C e 1000C, algumas fases intermetálicas podem se formar, em que a fase sigma () é a mais proeminente. Possui uma estrutura cristalina tetragonal complexa rica em Cr e Mo, tendo efeito deletério no material afetando tanto a resistência à corrosão, quanto as propriedades mecânicas. Para este fim, faz-se necessário estudos da junta soldada para delinear as limitações desses aços e aperfeiçoar a aplicação. Essa pesquisa teve como objetivo caracterizar a junta soldada por TIG autógeno manual com arco pulsado e não pulsado do aço inoxidável hiperduplex SAF 2707 HD. As técnicas empregadas foram a metalografia por ataque eletrolítico (reagente NaOH) e color etching (reagente Behara), medidas de microdureza e quantificação microestrutural por Processamento Digital de Imagem. Os aspectos microestruturais foram observados por microscopia óptica (MO) e microscopia eletrônica de varredura (MEV), estes passaram por etapas de processamento digital de imagens (PDI) para quantificar a fração volumétrica da fase austenita. Realizou-se análise química semi-quatitativa por EDS. Os resultados foram analisados estatisticamente através do teste de hipóteses com distribuição t de Student. Pela técnica color etching observou-se que a fase austenita foi gerada com distribuição mais homogênea para o arco pulsado, que o não pulsado. O ataque eletrolítico não revelou uma terceira fase (fase ) na junta soldada, a análise química por EDS não identificou uma variação significativa nos elementos presentes ao longo da zona de transição do metal de base para a zona de fusão. Através do PDI foram obtidos os valores médios da fração volumétrica de austenita de 36,38% (desvio padrão 6,40%) e 32,41% (desvio padrão 6,67%) para os dois métodos, pulsado e não pulsado, respectivamente. Foram obtidos os valores de microdureza para o metal de base 355,10 HV (desvio padrão 28,60) e para a zona de fusão 343,60 HV (desvio padrão 20,51) da amostra soldada pelo modo pulsado, para o modo não pulsado foram apresentaram os valores médios de 370,30 HV (desvio padrão 34,51) para o metal de base e de 345,20 HV (desvio padrão 41,33) para a zona de fusão. A análise estatística indicou que não houve variação significativa da fração volumétrica da fase austenita no cordão de solda para as duas condições testadas e não houve variação da microdureza entre a zona de fusão e o metal de solda das amostras submetidas aos dois processos.
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A importância do processo de alinhamento da estratégia com projetos seis sigma: um estudo multicasos em operadores logísticos / The importance of the process of alignment the strategy with six sigma projects: a study multicases in logistic operators

Bianca Soares de Oliveira Gonçalves 20 April 2007 (has links)
Além do fato do programa seis sigma e a logística estarem em evidência no ambiente organizacional, soma-se a importância de se obter sucesso na implantação do programa, caracterizando como um fator crítico, o alinhamento da estratégia dos projetos de melhoria. Sendo assim, uma análise do processo de alinhamento da estratégia de projetos seis sigma se justifica. Para abordar esta questão, esta dissertação objetiva identificar a importância do alinhamento da estratégia e propõe uma sistematização deste com o processo de seleção de projetos seis sigma. Dessa forma, esta pesquisa está estruturada, primeiramente, com uma revisão bibliográfica sobre seis sigma, estratégia e operadores logísticos. Com o embasamento teórico é proposta uma sistematização conceitual do alinhamento da estratégia do processo de seleção de projetos seis sigma detalhado em um passo a passo. Com o objetivo de analisar a proposta conceitual, realizaram-se três estudos de casos em operadores logísticos. Pode-se concluir que o fato do processo de seleção de projetos seis sigma estar alinhado com a estratégia realmente é um ponto crítico para o sucesso do programa seis sigma, bem como a apresentação da sistematização proposta obteve uma boa avaliação e aceitação dos casos apresentados. / Beyond the fact of the six sigma program and the logistic, that are on evidence in the organizational environment, adds to them the importance of getting success in the implantation of the program, characterizing as a critical factor to the strategical alignment of the improvement projects. Being thus, an analysis of the process of strategical alignment of six sigma projects is justified. Approaching this question, this dissertation proposes a systematization of the alignment of the organizational strategy with the process of six sigma projects` selection. This research is structuralized, first, with a bibliographical revision on six sigma, logistic strategy and operators. With the theoretical basement was proposed a systematization of strategical alignment of the selection process of six sigma projects, detailed step by step. With the objective of analyzing the proposal conceptual, three cases\' studies in logistic operators were done. The importance of the process of six sigma projects\' selection can be noticed and its alignment with the organizational strategy, as well as the validation of the systematization proposal.
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A manufatura enxuta e a metodologia seis sigma em uma indústria de alimentos

Brito, Francisco Oliveira 04 July 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-22T22:11:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao - Francisco Oliveira Brito.pdf: 3160975 bytes, checksum: 5f7ac8589cf0f9b2c4c2220d495e47cf (MD5) Previous issue date: 2008-07-04 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The globalization process is demanding the food industry, especially non-alcoholic beverages, to become more competitive requiring reduction in cost and higher levels of productivity and quality. With the focus on competitiveness, an industry in Polo Industrial de Manaus - PIM has been developing management tools that integrate manufacturing and quality processes. This study examines the implementation of lean manufacturing philosophy and Six Sigma methodology in a non-alcoholic beverage company, aiming to increase the operational efficiency of its production processes. Based on bibliographical survey of the concepts, methods, procedures, quality tools, lean manufacturing, six sigma and assessment of process indicators (such as OEE Overall Equipment Efficiency) before and after implementation, is a proposed a roadmap for implementing the integration of the mentioned methodologies. The tools used in this study are: Six Sigma DMAIC (Define, Measure, Analyze, Improve and Control); Lean SMED (Single Minute Exchange Die); VSM (Value Stream Map); Kaizen; Just-in-Time and Kanban. After implementation all the steps of lean manufacturing philosophy and Six Sigma methodology, the results have showed a reduction of 73% in setup time for filler machine improving from 40 % to 64 % OEE. Finally, the poll shows that the application of Lean Philosophy with Six Sigma Methodology reduces waste and defects in the process, reflecting in productivity increase and financial profit. / Com o processo de globalização em curso, o mercado mundial para as indústrias de alimentos, em especial as de bebidas não alcoólicas se tornou ainda mais competitivo, exigindo a redução de custos e melhores níveis de produtividade e qualidade. Com o foco na competitividade uma empresa do setor de bebidas do Pólo Industrial de Manaus - PIM vem desenvolvendo ferramentas de gestão que integram a manufatura com a qualidade dos processos. Neste sentido, este estudo analisa a implementação da filosofia da Manufatura Enxuta com a metodologia Seis Sigma em uma empresa de grande porte do setor de bebidas não alcoólicas, visando o aumento da eficiência operacional de seus processos produtivos. Através de levantamento bibliográfico dos conceitos, métodos, procedimentos das ferramentas da qualidade, Manufatura Enxuta, Seis Sigma e avaliação de indicadores do processo antes e após a implementação numa empresa do setor de alimento é proposto um roteiro de aplicação da integração das mesmas. As metodologias utilizadas do Seis Sigma foram DMAIC (Definir, Medir, Analisar, Melhorar e Controlar), e da Manufatura Enxuta SMED (Single Minute Exchange Die), VSM (Mapeamento do Fluxo de Valor), Kaizen, Just-in-Time e Kanban. Após a implementação das etapas da filosofia da Manufatura Enxuta e da metodologia Seis Sigma os resultados mostram uma redução de 73% do setup da máquina enchedora de partes sólidas para empresa em estudo, passando de um OEE 40% para 64%. Finalmente, a pesquisa revela que a aplicação da filosofia enxuta aliada a metodologia Seis Sigma reduzem desperdícios e defeitos de processo, refletindo em melhorias e aumentando a produtividade e conseqüentemente o ganhos financeiros
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Programa Seis Sigma para formação de redes de inovação auto-organizadas / Six Sigma programs for setting up of innovation self-organized networks

Lucas Portilho Camargos Gomes 21 March 2014 (has links)
A formação de redes colaborativas é uma importante forma das organizações estimularem a inovação, reduzirem custos e transferir conhecimentos. Uma forma particular de rede colaborativa, as redes auto-organizadas, demonstram grande capacidade de promover o aprendizado dos envolvidos, sistematizar o conhecimento e promover a inovação. Já os programas Seis Sigma, adotados por diversas organizações, possuem como objetivo principal a redução da variabilidade de um processo, resultando na redução de custos e melhoria da qualidade. A literatura sobre redes auto-organizadas pouco apresenta sobre a formação destas redes e a literatura sobre Seis Sigma é voltada a métodos estatísticos. Desta forma, o objetivo desta pesquisa é identificar os elementos para um modelo de referência baseado no programa Seis Sigma para a formação e gerência de redes de inovação auto-organizadas. Foram realizados cinco estudos de caso em diferentes organizações. Os programas Seis Sigma destas organizações foram modelos com o uso da metodologia Enterprise Knowledge Development (EKD). Com base na literatura estudada foram identificas as necessidades de mudanças que viabilizariam a formação de redes de inovação auto-organizadas. Como resultado tem-se os elementos para o modelo de referência para formação e gerência de redes de inovação auto-organizadas baseado no programa Seis Sigma. / The formation of collaborative networks is an important way for organizations to stimulate innovation, reduce costs and transfer knowledge. A particular form of collaborative network, the self-organized networks have shown great capability to promote the learning of those involved, systematize knowledge and lead to innovation. The Six Sigma programs, adopted by several organizations, have as main objective the process variability reduction, resulting in lower costs and quality improvement. The literature on self-organized networks presents little about the formation of these kind of networks and literature on Six Sigma is focused on statistical methods. Thus, the objective of this research is to identify the elements for a reference model based on the Six Sigma program for setting up and management of innovation selforganized networks. Five case studies were conducted in different organizations. The Six Sigma programs of these organizations were modeled using the Enterprise Knowledge Development (EKD) methodology. Based on the studied literature the needs for changes that enables the formation of innovation self-organized networks were identified. As a result there are the elements of the reference model for the formation and management of innovation self-organized networks based on the Six Sigma program.
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Doména 1.1 primárního faktoru sigma a nový systém pro expresi RNA polymerázy z Bacillus subtilis. / Domain 1.1 of the primary sigma factor and a new expression system for Bacillus subtilis RNA polymerase.

Kálalová, Debora January 2019 (has links)
RNA polymerase (RNAP) is a key multi-subunit enzyme of gene expression that, together with the σ factor, forms a holoenzyme and transcribes genetic information from DNA to RNA. RNAP from Bacillus subtilis and its primary factor σA were studied in this thesis. The σA factor determines the specificity for the promoters to which the holoenzyme binds. Part of its structure is domain 1.1, which is likely to prevent binding of σA to the promoter by itself (unless it is part of the holoenzyme) by binding to domains 2 and 4. The first part of the thesis verifies the hypothesis that domain 1.1 binds domains 2 and 4 and thus prevents binding of σA to the promoter. To this end, various domain constructs have been created and their interactions have been tested. Domain interaction was tested by Nitrocellulose Filter Binding Assay, EMSA, and in vitro transcription. The results did not show significant interaction between domains. The second part of the thesis deals with the creation of a tool for the study of the enzymatology of RNAP from B. subtilis - recombinant RNAP (rRNAP). First, a plasmid construct for expression of rRNAP in Escherichia coli was constructed by a series of cloning steps, followed by protein isolation and characterization. Isolation was achieved without contamination by σ factors (this...

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