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Similaridade de algoritmos em cenários sensíveis a custoMELO, Carlos Eduardo Castor de 27 August 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-08-27 / FACEPE / análise da similaridade entre algoritmos de aprendizagem de máquina é um importante
aspecto na área de Meta-Aprendizado, onde informações obtidas a partir de processos de
aprendizagem conhecidos podem ser utilizadas para guiar a seleção de algoritmos para tratar
novos problemas apresentados. Essa similaridade é geralmente calculada através de métricas
globais de desempenho, que omitem informações importantes para o melhor entendimento do
comportamento dos algoritmos. Também existem abordagens onde é verificado o desempenho
individualmente em cada instância do problema. Ambas as abordagens não consideram os
custos associados a cada classe do problema, negligenciando informações que podem ser muito
importantes em vários contextos de aprendizado.
Nesse trabalho são apresentadas métricas para a avaliação do desempenho de algoritmos
em cenários sensíveis a custo. Cada cenário é descrito a partir de um método para escolha de
limiar para a construção de um classificador a partir de um modelo aprendido. Baseado nos
valores de desempenho em cada instância, é proposta uma forma de avaliar a similaridade entre
os algoritmos tanto em nível de problema como em nível global.
Os experimentos realizados para ilustrar as métricas apresentadas neste trabalho foram
realizados em um estudo de Meta-Aprendizado utilizando 19 algoritmos para a classificação das
instâncias de 152 problemas. As medidas de similaridades foram utilizadas para a criação de
agrupamentos hierárquicos.
Os agrupamentos criados mostram como o comportamento entre os algoritmos diversifica
de acordo com o cenário de custo a ser tratado. / The analysis of the similarity between machine learning algorithms is an important aspect
of Meta-Learning, where knowledge gathered from known learning processes can be used to
guide the selection of algorithms to tackle new learning problems presented. This similarity is
usually calculated through global performance metrics that omit important information about the
algorithm behavior. There are also approaches where the performance is verified individually on
each instance of a problem. Both these approaches do not consider the costs associated with each
problem class, hence they neglect information that can be very important in different learning
contexts.
In this study, metrics are presented to evaluate the performance of algorithms in cost
sensitive scenarios. Each scenario is described by a threshold choice method, used to build
a crisp classifier from a learned model. Based on the performance values for each problem
instance, it is proposed a method to measure the similarity between the algorithms in a local
level (for each problem) and in a global level (across all problems observed).
The experiments used to illustrate the metrics presented in this paper were performed in
a Meta-Learning study using 19 algorithms for the classification of the instances of 152 learning
problems. The similarity measures were used to create hierarchical clusters.
The clusters created show how the behavior of the algorithms diversifies according to the
cost scenario to be treated.
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Importância da heterogeneidade e quantidade de recursos na riqueza e redundância funcional de formigas arborícolas / Importancia de la heterogeneidad y cantidad de recursos en la riqueza y redundancia funcional de hormigas arbóreasCarrascosa, Vidal Angel Cobos 03 June 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-06-03 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Abiotic and biotic factors determine the species diversity along environmental gradients, but are not yet determined how these factors modulate changes in richness and ecological (functional) characteristics of communities along environmental gradients related to heterogeneity and amount of resources. There are studies which support that resources heterogeneity and/or resources amount influence the variations of animal diversity, but often, these studies do not distinguish clearly between these effects. On the other hand, species and ecological characteristics that coexist along environmental gradients should be affected by competition, niche overlap and/or environmental filters that influence the richness and functional redundancy (FR) of communities, and a greater niches heterogeneity and amount should promote functional differentiation among species. Because of their importance in ecosystems, their high diversity and close evolutionary relationship with plants at the Neotropics; I chose the arboreal ants as an object of study to test: 1) There is an increase in arboreal ants richness linked to an increase in the heterogeneity and amount of food and structural niches 2) The arboreal ants FR decreases with increasing heterogeneity and decreases with quantity of niches.Samples were taken in 42 plots of 100 m2 forming a heterogeneity and amount of resources gradient at Emas National Park, Mineiros, GO. After sampling and identification of organisms - plants and ants – I take nine functional characteristics measures for ants and a team of experts measured six variables of the community of woody plants. From the plots sampling, I got the ant richness and FR, and described biotic parameters related to heterogeneity and quantity of resources from the characteristics of the vegetation. Using the technique of PCA, I calculated the principal axes of environmental variables for the heterogeneity and amount of resources. These axes were related to arboreal ant richness and FR employing the Akaike criterion. Once the effect of heterogeneity and amount of resources was separated, the richness of ants was explained by the resources amount and the FR by the resources heterogeneity and amount. A greater amount of food and structural niches may encourage the coexistence of a large number of ant species possibly by a decreasing competitive exclusion and an improved distribution of resources among species. An increase in habitat heterogeneity and a decrease in food resources quantity may enable ant species to distinguished functionally, this may cause a decrease in FR; little diversification of structural resources and higheramount of food may promote that environment and competitive exclusion diminish the variety of functional features present in the community. / Os fatores abióticos e bióticos determinam a diversidade de espécies ao longo de gradientes ambientais, porém ainda não está determinado como esses fatores modulam as mudanças da riqueza e características ecológicas (funcionais) das comunidades ao longo de gradientes de heterogeneidade e quantidade de recursos. Existem estudos que apoiam que a heterogeneidade e/ou quantidade recursos influenciam as variações da diversidade animal, mas com frequência, estes estudos não separam com nitidez estes efeitos. Por outro lado, as espécies e características ecológicas que coexistem ao longo de gradientes ambientais devem ser afetadas pela competição, sobreposição de nichos e/ou filtros ambientais que influenciam a riqueza e redundância funcional (RF) das comunidades, e uma maior heterogeneidade e menor quantidadede nichos deve promover a diferenciação funcional das espécies. Devido sua importância nos ecossistemas, sua alta diversidade e a estreita relação evolutiva com as plantas nos Neotrópicos, escolhi as formigas arborícolas como objeto de estudo para testar se: 1) Existe um aumento da riqueza de formigas arborícolas ligado a um aumento na heterogeneidade e quantidade de nichos alimentares e estruturais 2) A RF das formigas arborícolas diminui conforme aumenta a heterogeneidade e diminui a quantidade nichos.Amostrei 42 parcelas de 100 m2que formam um gradiente de heterogeneidade e quantidade de recursosno Parque Nacional das Emas, Mineiros, GO. Após a amostragem e identificação dos organismos - plantas e formigas -, mensureinove características funcionais para as formigas e uma equipe de especialistas mensurou seis variáveis da comunidade das plantas lenhosas. A partir da amostragem das parcelas obtive a riqueza e RF das formigas, e descrevi parâmetros bióticos de heterogeneidade e quantidade de recursos a partir das características da vegetação. Usando a técnica da PCA, calculei os eixos principais das variáveis ambientais para a heterogeneidade e quantidade de recursos. Estes eixos foram relacionados com a riqueza e RF das formigasarborícolas mediante o critério Akaike. Uma vez separado o efeito da heterogeneidade e quantidade de recursos, a riqueza das formigas foi explicada pela quantidade de recursos e a RF pela heterogeneidade e quantidade de recursos. Uma maior quantidade de nichos alimentares e estruturais deve fomentar a coexistência de um maior número de espécies de formigas possivelmente por uma diminuição da exclusão competitiva e uma melhor divisão dos recursos entre as espécies. Um aumento na heterogeneidade do habitat e diminuição da quantidade de recurso alimentar deve permitirque as espécies de formigas se diferenciem funcionalmente, isto pode provocaruma diminuição da RF; pouca diversificação dos recursos estruturais e maior quantidade de alimento pode fomentar que o ambiente e a exclusão competitiva diminuam a variedade de características funcionais presentes na comunidade.
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Regras de Assembleia em aves do Cerrado: estrutura funcional em diferentes escalas espaciais / Assembly rules in Cerrado birds: functional structure at different spatial scalesSOBRAL, Fernando Landa 26 May 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-05-26 / Communities are assemblages of co-occurring species that potentially interact with each other. They are the result not only of a series of ecological processes or "assembly rules", but also of past and ongoing evolutionary processes. In recent years, the assembly rules have received increased attention from ecologists and two different processes have been explored: environmental filtering and limiting similarity. As the processes involved in the formation of the assemblages appear to vary in a manner dependent on scale, it is expected that such assembly rules have different effects over different spatial scales. Understanding this relationship between ecological processes and spatial scales in which they act has been a great challenge among scholars. In this context, the incorporation of phylogenetic and functional data to diversity classical approaches have established the basis for an emerging area of research in community ecology, promoting the development of many tools to detect the underlying structure of the assemblages and, therefore, to infer the processes assembly responsible for the formation of the assemblages. Here, we demonstrate how the use of different measures of phylogenetic and functional diversity along with the use of different null models can be a promising approach in solving paradigms still poorly understood, discussing how such methods can increase the predictive power of this growing area of research. / As comunidades são assembleias de espécies co-ocorrentes que interagem potencialmente umas com as outras. Elas são resultado não apenas de uma série de processos ecológicos ou regras de montagem , mas também de processos evolutivos passados e contínuos. Nos últimos anos, as regras de montagem têm recebido maior atenção dos ecólogos e dois processos diferentes têm sido explorados: os filtros ambientais e a similaridade limitante. Como os processos envolvidos na formação das assembleias parecem variar de uma forma dependente de escala, espera-se que tais regras de montagem tenham diferentes efeitos ao longo de diferentes escalas espaciais. Compreender essa relação entre os processos ecológicos e as escalas espaciais nas quais eles atuam tem sido um grande desafio entre os estudiosos. Nesse contexto, a incorporação de dados filogenéticos e funcionais às abordagens clássicas de diversidade tem estabelecido a base de uma emergente área de pesquisa em ecologia de comunidades, impulsionando o desenvolvimento de muitas ferramentas para detectar a subjacente estrutura das assembleias e, portanto, inferir os processos de montagem responsáveis pela formação das assembleias. Aqui, demonstramos como a utilização de diferentes medidas de diversidade filogenética e funcional juntamente com o uso de diferentes modelos nulos pode ser uma abordagem promissora na solução de paradigmas ainda pouco compreendidos, discutindo como tais métodos podem aumentar o poder preditivo dessa crescente área de pesquisa.
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Influência do efeito de borda, da perda de habitat e de fatores abióticos na estrutura da comunidade lenhosa em fragmentos de cerrado denso na Alta Bacia do rio Araguaia / Influence of the edge effect, habitat loss and abiotic factors on the structure of the woody community in fragments of cerrado denso in the Upper Araguaia river BasinSiqueira, Mariana Nascimento 08 March 2016 (has links)
Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-03-17T17:48:27Z
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Previous issue date: 2016-03-08 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Anthropogenic changes have changed land cover patterns and caused fragmentation of
ecosystems. These changes have several consequences for biodiversity, such as habitat
loss and isolation, creation of anthropic matrix, and edge effect. Few studies have
evaluated the effects of fragmentation in the Cerrado, especially the effects on
vegetation structure and abiotic attributes of savanna formations. Here, we sampled 17
fragments of Dense Cerrado in the Upper Rio Araguaia basin, which is a highly
fragmented area. Specifically, we compared the more altered Sub-basin of the Rio Claro
with the more conserved Sub-basin Rio Garças. Fragments had the fragile
Quartzipsamment soils. All fragments were larger than 50 ha and had pasture matrix.
Specifically, we asked the following questions: 1) What is the percentage of area lost by
fragments in the last 30 years? 2) How area loss influence the woody plant community
structure? 3) The species composition similarity decreases with geographical distance
between fragments? 4) The edge-interior gradient affects the woody plant community
structure? 5) How microclimate and physico-chemical variables vary along an edgeinterior
gradient? 6) The community structure of woody plants is influenced by
microclimate and physico-chemical characteristics of the soil? We sampled all woody
plants with diameter ground higher than 30 cm or equal to 5 cm, in three 20 x 50 m
plots along a edge-interior gradient in each fragment. We collected soils between 0 to 20
cm deep in all plots and the matrix. The air and soil temperatures, air humidity, altitude,
geographical position, and light intensity were collected along with soil samples. We
recorded 8,749 woody plants, belonging to 131 species. Fragment area was significantly
reduced between 1985 and 2013, but the historical and current area were not associated
with community structure and species diversity. We also did not find a correlation
between compositional similarity and geographic distance between fragments.
Additionally, 2,877 individuals of 116 species occurred at the edge, 3,038 individuals of
110 species occurred at intermediate environments, and 2,995 individuals of 107 species
occurred in the center of fragments. However, species composition and community
structure did not differ along the edge-interior gradient. Also, abiotic variables did not
differ along the matrix-edge-interior gradient. However, these variables differed
between the two sub-basins. The Rio Claro Sub-basin had higher values of Ca/CTC and
xiii
Ca/K, which are related to nutrient availability in the soil. The spatial distribution of
plant species was influenced by altitude, humidity, silt, organic matter, pH, and calcium. / As mudanças antrópicas na cobertura do solo têm ocasionado um processo denominado
fragmentação de ecossistemas, que geram consequências diversas para a biodiversidade
como perda, isolamento e forma do habitat, matriz antrópica, efeito de borda e outras
interferências antrópicas. Poucos estudos avaliando efeitos da fragmentação ocorreram
em áreas de Cerrado, especialmente avaliando consequências na estrutura da vegetação
de formações savânicas e os atributos abióticos. Com o objetivo de preencher essas
lacunas, a presente pesquisa selecionou 17 fragmentos de Cerrado Denso na Alta Bacia
do Rio Araguaia, que representa bem os processos de fragmentação antrópica no
Cerrado. Optou-se pela Sub-bacia mais degradada e pela mais conservada, a Sub-bacia
do Rio Claro e Sub-bacia do Rio Garças, respectivamente. Os fragmentos foram
selecionados sobre Neossolos Quartzarênicos, solos considerados frágeis do ponto de
vista ambiental. A matriz de todos os fragmentos foi a pastagem e todos eles
apresentavam área superior à 50 ha. Para a área de estudo, buscou-se responder as
seguintes questões: 1) Qual a porcentagem de área perdida pelos fragmentos de Cerrado
Denso ao longo dos últimos 30 anos? 2) Como a perda de área pode influenciar a
estrutura da comunidade de planta lenhosa em fragmentos de Cerrado Denso? 3) A
similaridade de espécies diminui com o aumento da distância geográfica entre os
fragmentos amostrados? 4) O gradiente borda-interior afeta a estrutura da comunidade
de plantas lenhosas? 5) Como se comportam as variáveis microclimáticas e físicoquímicas
do solo ao longo de um gradiente borda-interior? 6) A estrutura da
comunidade de plantas lenhosa é influenciada pelas características microclimáticas e
físico-químicas do solo? Diante dessas questões, foram coletadas amostras da vegetação
lenhosa através do método de parcelas de 20 x 50 m, em três ambientes distintos de
cada fragmento (ambiente de borda, intermediário e central), incluindo todos os
indivíduos lenhosos com diâmetro a 30 cm do solo maior ou igual a 5 cm. Os solos
foram coletados em todas as parcelas e na pastagem para análise físico-química. A
temperatura do ar, do solo, umidade relativa do ar, altitude, posição geográfica e
intensidade luminosa foram coletadas no ponto de coleta de solos. Como resultados,
registrou-se 8.749 indivíduos lenhosos, distribuídos em 131 espécies nos 17 fragmentos.
Observou-se que a área dos fragmentos estudados reduziu significativamente entre os
anos de 1985 e 2013, mas a perda histórica de área dos fragmentos e a área atual não
apresentaram relação com a estrutura da comunidade lenhosa e a diversidade de
xi
espécies. Também não foi observada uma correlação entre a similaridade de espécies e a
distância entre os fragmentos amostrados. Adicionalmente, constatou-se que dos
espécimes amostrados, 2877 indivíduos em 116 espécies eram de ambiente de borda,
3038 indivíduos em 110 espécies de ambiente intermediário e 2995 indivíduos em 107
espécies do centro dos fragmentos. No entanto, não foram encontradas alterações na
composição e estrutura da comunidade lenhosa ao longo do gradiente borda-interior. As
variáveis abióticas não diferiram ao longo do gradiente pasto-borda-interior nos
fragmentos analisados. Entretanto, estas variáveis diferiram entre as duas Sub-bacias
amostradas, em que a Sub-bacia do rio Claro apresentou os maiores valores de Ca/CTC
e Ca/K, relacionadas com a disponibilidade de nutrientes no solo. Também registrou-se
que a distribuição espacial de espécies vegetais foi influenciada por variáveis abióticas,
como altitude, umidade, silte, matéria orgânica, pH e cálcio.
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Processamento de consultas analíticas com predicados de similaridade entre imagens em ambientes de data warehousing / Processing of analytical with similarity search predicates over images in data warehousing environmentsJefferson William Teixeira 29 May 2015 (has links)
Um ambiente de data warehousing oferece suporte ao processo de tomada de decisão. Ele consolida dados de fontes de informação distribuições, autônomas e heterogêneas em um único componente, o data warehouse, e realiza o processamento eficiente de consultas analíticas, denominadas OLAP (on-line analytical processing). Um data warehouse convencional armazena apenas dados alfanuméricos. Por outro lado, um data warehouse de imagens armazena, além desses dados convencionais, características intrínsecas de imagens, permitindo a realização de consultas analíticas estendidas com predicados de similaridade entre imagens. Esses ambientes demandam, portanto, a criação de estratégias que possibilitem o processamento eficiente dessas consultas complexas e custosas. Apesar de haver na literatura trabalhos voltados a índices bitmap para ambientes de data warehousing e métodos de acesso métricos para melhorar o desempenho de consultas por similaridade entre imagens, no melhor do nosso conhecimento, não há uma técnica que investigue essas duas questões em um mesmo contexto. Esta dissertação visa preencher essa lacuna na literatura por meio das seguintes contribuições: (i) proposta do ImageDWindex, um mecanismo para a otimização de consultas analíticas estendidas com predicados de similaridade entre imagens; e (ii) definição de diferentes estratégias de processamento de consultas sobre data warehouses de imagens usando o ImageDW-index. Para validar as soluções propostas, foram desenvolvidas duas outras contribuições secundárias, que são: (iii) o ImageDW-Gen, um gerador de dados com o objetivo de povoar o data warehouse de imagens; e (iv) a proposta de quatro classes de consulta, as quais enfocam em diferentes custos de processamento dos predicados de similaridade entre imagens. Utilizando o ImageDW-Gen, foram realizados testes de desempenho para investigar as vantagens introduzidas pelas estratégias propostas, de acordo com as classes de consultas definidas. Comparado com o trabalho mais correlato existente na literatura, o uso do ImageDWindex proveu uma melhora no desempenho do processamento de consultas IOLAP que variou em média de 55,57% até 82,16%, considerando uma das estratégias propostas. / A data warehousing environment offers support to the decision-making process. It consolidates data from distributed, autonomous and heterogeneous information sources into one of its main components, the data warehouse. Furthermore, it provides effcient processing of analytical queries (i.e. OLAP queries). A conventional data warehouse stores only alphanumeric data. On the other hand, an image data warehouse stores not only alphanumeric data but also intrinsic features of images, thus allowing data warehousing environments to perform analytical similarity queries over images. This requires the development of strategies to provide efficient processing of these complex and costly queries. Although there are a number of approaches in the literature aimed at the development of bitmap index for data warehouses and metric access methods for the efficient processing of similarity queries over images, to the best of our knowledge, there is not an approach that investigate these two issues in the same setting. In this research, we fill this gap in the literature by introducing the following main contributions: (i) the proposal of the ImageDW-index, an optimization mechanism aimed at the efficient processing of analytical queries extended with similarity predicates over images; and (ii) definition of different processing strategies for image data warehouses using the ImageDW-index. In order to validate these main proposals, we also introduce two secondary contributions, as follows: (iii) the ImageDW-Gen, a data generator to populate image data warehouses; and (iv) the proposal of four query classes, each one enforcing different query processing costs associated to the similarity predicates in image data warehousing environments. Using the ImageDW-Gen, performance tests were carried out in order to investigate the advantages introduced by the proposed strategies, according to the query classes. Compared to the most related work available in the literature, the ImageDW-index provided a performance gain that varied from 55.57% to 82.16%, considering one of the proposed strategies.
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Diversidade de Mutillidae (Hymenoptera-Aculeata) da Serra da Bodoquena, MSAranda, Rodrigo 30 March 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-03-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Mutillidae wasps are parasitoids. The samplings had been carried through in seven distinct areas a long two portions to hymenopteras that can attack diverse orders of insects, being its hosts, in the majority other hymenopteras Mountain range of the Bodoquena, that presents about 300 length km and 20 to 50 width km, with altitudes that vary 450 to 650 m and in area bordering to National Park that enclose 76,481 ha divided in two fragments and the predominant vegetation are the Forest Estacional Decidual Submontana. Two quantitative methodologies of collection had been adopted (Pitfall and Covering area) and a qualitative one (manual collections). Has beem collected 44 individuals pertaining two subfamilies, four tribes, 13 sorts and distributed in 23 species. The sort that presented greater wealth was Traumatomutilla with 6 species (26,08%), followed Timulla (3 species, 13.04%) and Ephuta (3 species, 13.04%); the sort most abundant was raumatomutilla with 20 individuals (45,45%) and the species most abundant was lame Traumatomutilla with 9 captures individuals (20,45%), being the other species considered rare for region to presenting only 1 register. The register of few individuals must it geologic formation area, that is predominantly rocky. Analyzing the index of diversity from environments, we have the Antropizada area being most diverse (H'=3,585), followed for Decidual forest (H'=3,096), Ciliar forest (H'=2,419) and Closed (H'=2,252). The different formations had presented basses similarity indices and with these data we can suggest that it has one strong trend the mutillidae to be fit in specific functional groups for each environment. Different methodologies must be applied for fauna s inventory of mutillidae, being the collections qualitative the most indicated for study the wealth and diversity / As vespas Mutillidae são himenópteros parasitóides que podem atacar diversas ordens de insetos, sendo seus hospedeiros, na maioria outros himenópteros. As amostragens foram realizadas em sete áreas distintas ao longo das duas porções da Serra da Bodoquena, que apresenta cerca de 300 km de comprimento e de 20 a 50 km de largura, com altitudes que variam de 450 a 650 m e em área limítrofes ao Parque Nacional que abrange 76.481 ha divididos em dois fragmentos e a vegetação predominante é a Floresta Estacional Decidual Submontana. Foram adotadas duas metodologias de coleta quantitativas (Pitfall e Cobertura de área) e uma qualitativa (coletas manuais). Foram coletados 44 indivíduos pertencentes a duas subfamílias, quatro tribos, 13 gêneros e distribuídos em 23 espécies. O gênero que apresentou maior
riqueza foi Traumatomutilla com 6 espécies (26,08%), seguido de Timulla (3 espécies, 13,04%) e Ephuta (3 espécies, 13,04%); o gênero mais abundante foi Traumatomutilla,
com 20 indivíduos (45,45%) e a espécie mais abundante foi Traumatomutilla manca com 9 indivíduos capturados (20,45%), sendo as outras espécies consideradas raras
para a região por apresentarem apenas 1 registro. O registro de poucos indivíduos deve-se a formação geológica da área, que é predominantemente rochosa. Analisando o índice de diversidade a partir dos ambientes, temos a área Antropizada sendo a mais diversa (H´=3,585), seguida pela Mata Decidual (H´=3,096), Mata Ciliar (H´=2,419) e Cerrado (H´=2,252). As diferentes formações apresentaram baixos índices de similaridade e com esses dados podemos sugerir que haja uma forte tendência de os mutilídeos serem enquadrados em grupos funcionais específicos para cada ambiente. Diferentes metodologias devem ser aplicadas para o inventário da fauna de Mutillidae, sendo as coletas qualitativa a mais indicada para o estudo da riqueza e diversidade
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Caracterização florística e classificação vegetacional de um fragmento florestal urbano do oeste do Paraná / Floristic characterization and vegetation classification of an urban forest fragment in the western Paraná, BrazilSilva, Jéssica Patrícia Borges da 28 June 2016 (has links)
Submitted by Edineia Teixeira (edineia.teixeira@unioeste.br) on 2018-03-05T19:21:33Z
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Previous issue date: 2016-06-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The aim of this work was to define the vegetation type of the urban fragment 4 Parque Ecológico Paulo Gorski (PEPG) and evaluate the influences of the climate and 5 altitudinal environmental variables on the floristic composition. The total of 1332 6 arboreal individuals of circumference at breast height equal or greater than 15 cm, 7 totalizing 71 species, were sampled. In addition, 401 species from 12 works developed 8 in the Rainforest (RF), Deciduous Forest (DF), Semideciduous Forest (SF) and 9 Araucaria Forest (AF) from southern and southeastern Brazil were used to build a 10 matrix of relative abundance for the floristic similarity. The environmental variables 11 from PEPG and other fragments were extracted from WorldClim. The floristic 12 similarity was evaluated through a group analysis using Simpson's Paradox, and the 13 significance was evaluated through the similarity analysis. The environmental variables 14 were compared between groups through the one-way ANOVA test. The characteristic 15 species from each group were evaluated by a similarity percentage analysis. Three 16 coincidental groups were formed, with the following vegetation types: RF with 20% of 17 similarity, DF/SF with 39% and AF with 32%. Although the PEPG environmental 18 variables have shown themselves as intermediate between AF and DF/FS, this fragment 19 has grouped with other areas from AF.
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ANÁLISE TEMPORAL DE NÓDULOS E MASSAS PULMONARES UTILIZANDO ÍNDICES DE SIMILARIDADE / TEMPORAL ANALYSIS OF NODULES AND MASSES PULMONARY USING SIMILARITY INDEXDiniz, Pedro Henrique Bandeira 03 January 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-01-03 / With the advent of imaging methods, the pulmonary nodule is becoming the most common manifestation of lung cancer and one of the most lethal of all cancers. Geometry (shape) and texture (tissue) measurements analyzed over time can be used to search the nodule malignancy. Among geometric measures commonly used, the nodule growth rate is one of the most accurate noninvasive methods to evaluate malignancy. Followed by other texture measures achieved over time, it is possible to get valuable information about nodules behavior, so that the doctor can use them to take related decisions. For these reasons, it is important to compare the nodule in exams applied at different moments. A key step for the comparison is to verify the correspondence between nodules of different exams. This correspondence is used to determine if a nodule X in the exam A is the same nodule Y in an exam B. Due to a number of anatomical and physiological factors and image acquisition, the same nodule cannot be in exactly the same location on different exams. To correct this problem, rigid and deformable image registration show up to be efficient. Once established this correspondence, it is possible to analyze the nodule texture changes through similarity indexes. In this sense, the aim of this work is to present methods for quantitative analysis of texture changes in lung nodules. For this analysis, it is used CT scans obtained at different moments from the same patient. Furthermore, it is presented a method to verify nodules found in different exams correspond to the same nodule by applying image registration. / Com o advento dos métodos de imagem, o nódulo pulmonar vem se tornando a manifestação mais comum de câncer de pulmão e um dos mais letais de todos os cânceres. Uma forma de pesquisar a malignidade de um nódulo é analisar temporalmente suas medidas de geometria (forma) e textura (tecido). Entre medidas geométricas comumente utilizadas, a taxa de crescimento do nódulo constitui um dos métodos mais precisos não invasivos de aferição da malignidade. Acompanhada a outras medidas de textura obtidas no decorrer do tempo, obtém-se informações valiosas sobre o seu comportamento, de forma que o médico pode usar essas medidas na tomada de decisões. Sabendo disso, é importante a comparação do nódulo em exames extraídos em momentos diferentes. Uma etapa fundamental para essa comparação é verificar a correspondência entre nódulos em exames diferentes, de forma que seja possível determinar se um nódulo X em um exame A é o mesmo nódulo Y em um exame B. Devido a uma série de fatores anátomo-fisiológicos e de aquisição de imagens, um mesmo nódulo pode não estar exatamente na mesma localização em exames diferentes. Para corrigir esse problema, registros de imagem rígidos e deformáveis mostram-se eficientes. Uma vez estabelecida essa correspondência, é possível analisar as mudanças na textura do nódulo através de índices de similaridade. Nesse sentido, o objetivo desse trabalho é apresentar métodos para a análise quantitativa de mudanças de textura em nódulos. Para essa análise serão utilizadas imagens de tomografia computadorizada obtidas em momentos diferentes de um mesmo paciente. Além disso, será apresentado um método para verificar se nódulos encontrados em exames diferentes correspondem ao mesmo nódulo através da aplicação de registros de imagens.
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Desempenho horticultural de laranjeiras doces de meia-estação sobre tangerineira \'Sunki\' / Horticultural performance of mid-season sweet oranges on \'Sunki\' mandarinYuri Caires Ramos 17 September 2015 (has links)
A laranjeira \'Pera\' é a cultivar mais plantada na citricultura brasileira. Com a incidências de doenças e aumento do custos de produção na citricultura, torna-se necessário a avaliação de materiais genéticos mais promissores que a laranjeira \'Pera\'. Portanto, buscou-se avaliar o desempenho horticultural de laranjeiras doces consideradas meia-estação e identificar aquelas superiores à cultivar padrão (Pera IAC). Foram avaliadas dezessete cultivares de laranja doce (Pera IAC, Pera IAC 2000, Pera 2, Pera 3, Pera 4, Pera Alexandre Maróstica, Pera Milton Teixeira, Seleta Amarela, Seleta Rio, Homosassa, Finike, Biondo, Bidwells Bar, Sanguínea, Vaccaro Blood, Torregrosa e Jaffa) enxertadas em tangerineira \'Sunki\'. O experimento foi instalado em maio de 2007, no espaçamento 6,5 x 2,5 m e conduzido sem irrigação. Avaliaram-se o crescimento vegetativo, produção, eficiência produtiva, abscisão dos frutos, sensibilidade ao déficit hídrico, incidência de podridão floral (PFC), incidência e severidade de mancha preta dos citros (MPC), qualidade e curva de maturação dos frutos. As médias das variáveis foram comparadas com a cultivar padrão (Pera IAC) e analisadas pelo teste de Dunnett (P < 0,05). Para sensibilidade ao déficit hídrico e curvas de maturação foram realizadas analises de regressão. As plantas de laranja \'Pera 3\' registraram as menores alturas, no sétimo ano após o plantio. As plantas de laranja \'Pera Milton Teixeira\' e \'Pera Alexandre Maróstica\' foram os únicos materiais que registraram produções acumuladas superiores às das plantas de laranja \'Pera IAC\'. As plantas de \'Seleta Amarela\', \'Pera 3\', \'Pera 4\', \'Vaccaro Blood\' e \'Pera Milton Teixeira\' registraram as maiores eficiências produtivas. As plantas da laranja \'Pera IAC\' registraram as maiores alternâncias produtivas e as plantas de laranja \'Sanguínea\' registraram as menores alternâncias. As seleções \'Pera 2\', \'Pera 3\', \'Pera 4\' e \'Pera Milton Teixeira\' registraram as menores abscisões de frutos. As plantas das laranjas \'Pera Milton Teixeira\', \'Pera IAC\', \'Pera IAC 2000\', \'Pera 2\', \'Seleta Rio\' e \'Pera 3\' foram classificadas como cultivares de alta sensibilidade ao déficit hídrico e as plantas das laranjas \'Bidwells Bar\', \'Jaffa\', \'Torregrosa\' e \'Sanguínea\' como de baixa sensibilidade. As menores incidências de MPC foram registradas nos frutos da laranjeira \'Pera IAC\' e não houve diferenças entre as cultivares para incidência de PFC. Para o teor de sólidos solúveis, apenas os frutos da laranja \'Finike\', \'Pera 2\' e \'Pera Alexandre Maróstica\' foram superiores aos da cultivar padrão. A seleções \'Pera IAC\', \'Pera 2\', \'Pera 3\' e \'Pera 4\' apresentaram alta similaridade fenotípica entre si. Ao estabelecer a curva de maturação, verificou-se uma maior precocidade da laranjeira \'Seleta Rio\' e uma maturação mais tardia para a seleção \'Pera Alexandre Maróstica\' quando comparadas a laranjeira \'Pera IAC\'. / \'Pera\' is the most widely planted sweet orange cultivar in the Brazilian citrus industry. Due to incidences of diseases and increase in production costs it is necessary to find promising genetic materials than \'Pera\' sweet orange. Therefore, the horticultural performance of sweet oranges, considered mid-season, were evaluated and identified those ones which were better than standard cultivar (Pera IAC). Seventeen sweet orange cultivars (Pera IAC, Pera IAC 2000, Pera 2, Pera 3, Pera 4, Pera Alexandre Maróstica, Pera Milton Teixeira, Seleta Amarela, Seleta Rio, Homosassa, \'Finike, Biondo, Bidwells Bar, Sanguínea, Vaccaro Blood, Torregrosa e Jaffa) were evaluated, all of then were grafted on \'Sunki\' mandarin and were nonirrigated. The experimental orchard was planted in May 2007, from 12 month-old plants (nursery trees) disposed in a 6,5 m × 2,5 m spacing. We evaluated the vegetative growth, yield, yield efficiency, fruit drop, sensitivity to drought, incidence of postbloom fruit drop (PFD), incidence and severity Black Spot of Citrus (CBS), fruit quality and index of ripeness. The averages of variables were compared with the standard cultivar (Pera IAC) and analyzed by Dunnett\'s Test (P < 0.05). For sensitivity to drought and index of ripeness were performed regression analyzes. The lowest hight and canopy volume were recorded in the \'Pera 3\' sweet orange trees seven years after planting. The \'Pera Milton Teixeira\' and \'Pera Alexandre Marostica\' sweet orange trees were the only materials which had superiority over the \'Pera IAC\' sweet orange trees regarding cumulative yield. The largest yield efficiency was registered in \'Seleta Amarela\', \'Pera 3\', \'Pera 4\', \'Vaccaro Blood\' and \'Pera Milton Teixeira\' sweet orange trees. The most alternate bearing index was found in the standard cultivar and \'Sanguinea\' sweet orange trees showed smaller bearing index. Smaller fruit drop were checked in cultivars Pera 2, Pera 3, Pera 4 and Pera Milton Teixeira. The \'Pera Milton Teixeira\', \'Pera IAC\', \'Pera IAC 2000\', \'Pera 2\', \'Seleta Rio\' and \'Pera 3\' sweet orange trees showed high sensitivity to drought while the \'Bidewells Bar\', \'Jaffa\', \'Torregrosa\' and \'Sanguínea\' sweet orange trees showed low sensitivity. Regarding the evaluated diseases, the orange \'Pera IAC\' recorded the lowest incidences of MPC and PFC differences were not cheked among the cultivars. For the soluble solids content, only the \'Finike\', \'Pera 2\' and \'Pera Alexandre Marostica\' sweet oranges fruits were superior to standard. The cultivars Pera IAC, Pera 2, Pera 3 and Pera 4 sweet oranges showed high phenotypic similarity. The \'Seleta Rio\' sweet orange was considered early-maturing cultivar and \'Pera Alexandre Maróstica\' a late-maturing cultivar when compared \'Pera IAC\' sweet orange.
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Eficácia de medidas de similaridade para a classificação de séries temporais associadas ao comportamento fenológico de plantas / Eficácia de medidas de similaridade para a classificação de séries temporais associadas ao comportamento fenológico de plantasConti, José Carlos, 1966- 12 November 2013 (has links)
Orientadores: Luiz Camolesi Júnior, Ricardo da Silva Torres / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Tecnologia / Made available in DSpace on 2018-08-24T02:27:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2013 / Resumo: Fenologia é o estudo de fenômenos naturais periódicos e sua relação com o clima. Nos últimos anos, tem se apresentado relevante como o indicador mais simples e confiável dos efeitos das mudanças climáticas em plantas e animais. É nesse contexto que se destaca o e-phenology, um projeto multidisciplinar envolvendo pesquisas na área de computação e fenologia. Suas principais características são: o uso de novas tecnologias de monitoramento ambiental, o fornecimento de modelos, métodos e algoritmos para apoiar o gerenciamento, a integração e a análise remota de dados de fenologia, além da criação de um protocolo para um programa de monitoramento de fenologia. Do ponto de vista da computação, as pesquisas científicas buscam modelos, ferramentas e técnicas baseadas em processamento de imagem, extraindo e indexando características de imagens associadas a diferentes tipos de vegetação, além de se concentrar no gerenciamento e mineração de dados e no processamento de séries temporais. Diante desse cenário, esse trabalho especificamente, tem como objetivo investigar a eficácia de medidas de similaridade para a classificação de séries temporais sobre fenômenos fenológicos caracterizados por vetores de características extraídos de imagens de vegetação. Os cálculos foram realizados considerando regiões de imagens de vegetação e foram considerados diferentes critérios de avaliação: espécies de planta, hora do dia e canais de cor. Os resultados obtidos oferecem algumas possibilidades de análise, porém na visão geral, a medida de distância Edit Distance with Real Penalty (ERP) apresentou o índice de acerto mais alto com 29,90%. Adicionalmente, resultados obtidos mostram que as primeiras horas do dia e no final da tarde, provavelmente devido à luminosidade, apresentam os índices de acerto mais altos para todas as visões de análise / Abstract: Phenology is the study of periodic natural phenomena and their relationship to climate. In recent years, it has gained importance as the more simple and reliable indicator of effects of climate changes on plants and animals. In this context, we emphasizes the e-phenology, a multidisciplinary research project in computer science and phenology. Its main characteristics are: The use of new technologies for environmental monitoring, providing models, methods and algorithms to support management, integration and remote analysis of data on phenology, and the creation a protocol for a program to monitoring phenology. From the computer science point of view, the e-phenology project has been dedicated to creating models, tools and techniques based on image processing algorithms, extracting and indexing image features associated with different types of vegetation, and implementing data mining algorithms for processing time series. This project has as main goal to investigate the effectiveness of similarity measures for the classification of time series associated with phenological phenomena characterized by feature vectors extracted from images. Conducted experiments considered different regions containing individuals of different species and considering different criteria such as: plant species, time of day and color channels. Obtained results show that the Edit Distance with Real Penalty (ERP) distance measure yields the highest accuracy. Additionally, the analyzes show that in the early morning and late afternoon, probably due to light conditions, it can be observed the highest accuracy rates for all views analysis / Mestrado / Tecnologia e Inovação / Mestre em Tecnologia
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