Este trabalho teve como objetivo principal avaliar o sêmen da jararaca ilhoa, Bothrops insularis, quanto ao volume, motilidade, vigor e concentração, além de verificar se estes paramentos estão relacionados ao comprimento ou massa dos animais ou se variam ao longo das estações, uma vez que esta espécie possui ciclo reprodutivo sazonal. Para tanto, foram avaliadas amostras de sêmen de 18 machos, com comprimento rostro-cloacal (CRC) variando de 43,5 a 73,70 cm, pertencentes ao plantel do Laboratório de Ecologia e Evolução do Instituto Butantan, entre os meses de agosto de 2012 e maio de 2013. O sêmen de Bothrops insularis apresentou coloração variando de esbranquiçada a amarelada e consistência cremosa e espessa. Foi possível observar amostras de sêmen viáveis em todos os 18 animais avaliados, indicando que animais com CRC igual ou acima de 43,5 cm já são sexualmente maduros. O espermatozoide de Bothrops insularis é filiforme, possui cabeça alongada, fina e com formato pontiagudo, seguindo o padrão morfológico descrito para outros Squamata. Não foi observada nenhuma relação entre o comprimento, massa e cada um dos parâmetros seminais avaliados. Foi observada variação significativa da motilidade e da concentração do sêmen de Bothrops insularis entre as estações, porém o volume e o vigor do sêmen não variaram. Foi no outono, época de cópula da espécie, que o sêmen apresentou as maiores médias para os parâmetros avaliados. / This study aimed to evaluate sperm parameters of the golden lancehead, Bothrops insularis, including appearance, sperm motility, vigor, volume and concentration, determine if these parameters varied with body size or weight and to verify whether these vestments vary throughout seasons, since this species has a seasonal reproductive cycle. Samples of semen of 18 males with snout-vent length (SVL) ranging from 43.5 to 73.70 cm, belonging to the squad of the Ecology and Evolution Laboratory at Instituto Butantan, were collected between August 2012 and May 2013. Sperm color from Bothrops insularis ranged from whitish to yellowish, and a creamy and thick consistency. Viable sperm was observed in samples from all 18 males evaluated, indicating that animals with SVL equal to or above 43.5 cm are sexually mature. Sperm of Bothrops insularis is thready, has elongated, thin and pointed shaped head, following the morphological pattern described for other Squamata. No relationship between length, mass and each of seminal parameters evaluated was observed. Significant variation of concentration and motility of semen from Bothrops insularis between seasons was observed, but volume and vigor did not change. It was during Fall, mating season of the species, that sperm had the highest means for all parameters evaluated.

O gênero Gymnodactylus inclui até o momento cinco espécies: G. amarali, amplamente distribuído pelo cerrado do Brasil Central; G. darwinii restrito à Mata Atlântica, desde o nordeste do estado de São Paulo até o seu limite setentrional no estado do Rio Grande do Norte; G. geckoides, endêmico da Caatinga, no nordeste do Brasil; G. guttulatus, conhecido somente dos campos rupestres do norte do segmento sul da Cadeia do Espinhaço; e G. vanzolinii, recentemente descrito e conhecido apenas para o município de Mucugê, Chapada Diamantina, Bahia, no norte do segmento setentrional da Cadeia do Espinhaço. Neste trabalho o gênero foi revisto sistematicamente com base em caracteres morfológicos e moleculares. Cerca de 1400 exemplares de aproximadamente 280 localidades foram estudados para 30 caracteres morfológicos e para seqüências parciais dos genes RAG1, PDC (nucleares), 16S (ribossomal) e cyt b (mitocondrial), totalizando 2146 pares de bases, abrangendo 25 localidades. Para os dados moleculares, foram realizadas análises de Máxima Parcimônia utilizando-se o programa PAUP, além de análises de inferência Bayesiana utilizando- se MrBayes. Ainda, foram realizadas análises destes genes individualmente envolvendo amostragens mais robustas. Tanto análises independentes para cada gene quanto análises combinando apenas os genes nucleares foram realizadas utilizando-se as duas abordagens filogenéticas. A definição das espécies de Gymnodactylus aqui reconhecidas foi principalmente orientada pela combinação dos dados genéticos e caracteres morfológicos qualitativos estudados, embora dados distribucionais e caracteres quantitativos também tenham sido considerados. Dados merísticos e xii de proporções morfométricas foram tratados estatisticamente no intuito de verificar se estas variáveis corroboram os agrupamentos reconhecidos com o estudo molecular. A análise combinada dos genes recuperou o monofiletismo do gênero Gymnodactylus com altos índices de suporte. Dois clados foram evidenciados com altos índices de suporte: um aqui chamado de grupo geckoides (G. amarali, G. geckoides e uma terceira linhagem reconhecida como espécie nova) e o grupo darwinii (G. darwinii, G. guttulatus, G. vanzolinii, e três outras linhagens, também reconhecidas como espécies boas). Todas as espécies reconhecidas são descritas e diagnosticadas e apresentada uma chave para sua identificação. A variação dos caracteres morfológicos é apresentada para todas assim como uma lista sinonímica detalhada com base no exame extensivo da literatura e dos tipos examinados. São descritas como novas sem que lhes seja atribuído um nome formal: (1) no grupo geckoides, uma população da região do vale do Peruaçu, noroeste do estado de Minas Gerais; (2) no grupo darwinii exemplares provenientes de Grão Mogol, sul do segmento setentrional da Cadeia do Espinhaço e de duas outras linhagens da Mata Atlântica, uma de ocorrência entre a região do rio Doce e a Baía de Todos os Santos, e outra a nordeste desta baía. G. vanzolinii é recuperado em posição basal no grupo darwinii nas análises combinadas ou individuais de alguns dos genes, porem o monofiletismo de G. darwinii lato sensu não é recuperado o que levou ao reconhecimento das novas linhagens da Mata Atlântica. Gymnodactylus darwinii fica, portanto, restrito ao sudeste do Brasil, ocorrendo do norte do estado de São Paulo até a região do rio Doce. Com base na distribuição e ecologia das espécies reconhecidas são apresentadas hipóteses para explicar a origem e diferenciação do gênero e de suas principais linhagens. / The genus Gymnodactylus includes until now five species: G. amarali, widely distributed in the Cerrado biome (savannah) of central Brazil, G. darwinii restricted to Atlantic Rain Forest, from the northeastern São Paulo state to the limits of the Atlantic Rain Forest in Rio Grande do Norte state, G. geckoides, endemic to Caatinga, northeastern Brazil; G. guttulatus, known only from the campos rupestres (rocky meadows) from the north of the meridional segment of the Espinhaço range, and G. vanzolinii, recently described and known only from the Mucugê municipality, Chapada Diamantina, Bahia, north of the septentrional segment of the Espinhaço. In this study the genus was systematically reviewed based on morphological and molecular data. About 1,400 specimens from approximately 280 localities for 30 morphological characters, and, partial sequences of the genes RAG1, PDC (nuclear), 16S (ribosomal) and cyt b (mitochondrial), totaling 2,146 base pairs covering 25 localities were studied. For the molecular data, Maximum Parsimony analyses were performed using the program PAUP, and Bayesian inferences using MrBayes. Also, these genes were analyzed individually involving a more robust data set. Both independent analyses for each gene as well analysis combining only the nuclear genes were performed. The species recognition was mainly guided by the combination of genetic data and qualitative morphological characters, although distributional data and quantitative traits were also considered. Meristic data and morphometric ratios were statistically analyzed in order to verify xiv whether these variables corroborate the groups recovered in the molecular study. The combined analysis of the genes recovered the monophyly of the genus Gymnodactylus with high support. Two clades were evident both highly supported: a clade here called \"geckoides\" group (G. amarali, G. geckoides and a third lineage recognized here as a good species) and the \"darwinii\" one (G. darwinii, G. guttulatus, G. vanzolinii, and three other clades, also recognized as good species). All recognized species are described and diagnosed and a key for their identification presented. The variation of morphological characters is given for all species recognized as well as a detailed synonymy list based on an extensive survey of the literature and some types examined. Described as new without yet without a formal name are: (1) in \"geckoides\" group, a population of the Peruaçu valley region, northwest of Minas Gerais state, (2) in the group \"darwinii\", specimens from Grão Mogol municipality, south of the northern segment of the Espinhaço Range and two other clades from the Atlantic Rain Forest, one occurring between the region of the Rio Doce and Todos os Santos bay, and another to the north of this bay. Gymnodactylus vanzolinii is recovered in a basal position in the group \"darwinii\" either in combined or single analysis of some genes, but the monophyly of G. darwinii lato sensu is not recovered which led to the recognition of new species to the Atlantic Rain Forest. G. darwinii is therefore restricted to southeastern Brazil, occurring from northern São Paulo state to the Rio Doce region. Based on the distribution and ecology of the species here recognized, hypotheses to explain the origin and differentiation of the genus and its main lineages are presented.

FundaÃÃo Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Cientifico e TecnolÃgico / Neste trabalho foram realizados estudos detalhados sobre a ecologia de duas espÃcies serpentes ocorrentes no CearÃ, Oxybelis aeneus (Wagler, 1824) e Philodryas nattereri Steindachner, 1870. Ambas as espÃcies foram encontradas em campo durante todos os meses do ano, O. aeneus apresentou pico no perÃodo seco e P. nattereri foi mais facilmente encontrada no perÃodo chuvoso, ambas apresentaram atividade diurna, entretanto O. aeneus foi encontrada ativa principalmente nos horÃrios de temperatura mais amena enquanto, P. nattereri foi encontrada ativa nas horas mais quentes do dia. Quanto à alimentaÃÃo, observou-se que O. aeneus à especialista em lagartos, sendo capaz de predar anuros ocasionalmente e nÃo hà mudanÃas ontogenÃticas na preferÃncia alimentar desta espÃcie, enquanto P. nattereri à uma espÃcie generalista, havendo mudanÃa ontogenÃtica na alimentaÃÃo, jà que os adultos consomem um maior nÃmero de presas. Quanto à reproduÃÃo foi possÃvel saber que para O. aeneus, o ciclo reprodutivo das fÃmeas se ocorre estacionalmente de janeiro a julho e os machos apresentaram ciclo de produÃÃo de espermatozÃides prÃ-nupcial. Nesta espÃcie as fÃmeas apresentaram maior massa corpÃrea, porÃm nÃo foi encontrado dimorfismo em relaÃÃo ao comprimento caudal. O ciclo reprodutivo das fÃmeas de P. nattereri ocorre de fevereiro a outubro, e os machos aparentemente apresentam produÃÃo contÃnua de espermatozÃides. Esta espÃcie apresentou dimorfismo sexual em relaÃÃo ao comprimento caudal e a massa: os machos apresentaram a cauda relativamente mais longa e as fÃmeas, em geral, maior massa corpÃrea / It is presented a detailed study on the ecology of two species of snakes that occur on the state of CearÃ, Oxybelis aeneus (Wagler, 1824) and Philodryas nattereri Steindachner, 1870. Both species could be found in the field during all months of the year, O. aeneus presented a peak during the dry season while P. nattereri were more easily found during the raining season. Both presented diurnal activity but O. aeneus is active during the less warm hours of the day while P. nattereri is found during the warmer hours. About their dietary ecology we found that O. aeneus is a lizard-specialist that feed on frogs occasionally, there are no ontogenetic changes on this species diet and P. nattereri is a generalist predator with ontogenetic change in diet, once the adults feed on more categories of prey than the juveniles. We found that the reproductive cycle for females of O. aeneus goes from January to July and males present a pre-nuptial cycle. We found no sexual dimorphism in tail length for this species and females are usually heavier than the males. The reproductive cycle of P. nattereri is extended to females, from February to October and males apparently produce sperm continually. We found sexual dimorphism in tail length and mass, with male P. nattereri having relatively longer tails and females being heavier.

O gênero Gymnodactylus inclui até o momento cinco espécies: G. amarali, amplamente distribuído pelo cerrado do Brasil Central; G. darwinii restrito à Mata Atlântica, desde o nordeste do estado de São Paulo até o seu limite setentrional no estado do Rio Grande do Norte; G. geckoides, endêmico da Caatinga, no nordeste do Brasil; G. guttulatus, conhecido somente dos campos rupestres do norte do segmento sul da Cadeia do Espinhaço; e G. vanzolinii, recentemente descrito e conhecido apenas para o município de Mucugê, Chapada Diamantina, Bahia, no norte do segmento setentrional da Cadeia do Espinhaço. Neste trabalho o gênero foi revisto sistematicamente com base em caracteres morfológicos e moleculares. Cerca de 1400 exemplares de aproximadamente 280 localidades foram estudados para 30 caracteres morfológicos e para seqüências parciais dos genes RAG1, PDC (nucleares), 16S (ribossomal) e cyt b (mitocondrial), totalizando 2146 pares de bases, abrangendo 25 localidades. Para os dados moleculares, foram realizadas análises de Máxima Parcimônia utilizando-se o programa PAUP, além de análises de inferência Bayesiana utilizando- se MrBayes. Ainda, foram realizadas análises destes genes individualmente envolvendo amostragens mais robustas. Tanto análises independentes para cada gene quanto análises combinando apenas os genes nucleares foram realizadas utilizando-se as duas abordagens filogenéticas. A definição das espécies de Gymnodactylus aqui reconhecidas foi principalmente orientada pela combinação dos dados genéticos e caracteres morfológicos qualitativos estudados, embora dados distribucionais e caracteres quantitativos também tenham sido considerados. Dados merísticos e xii de proporções morfométricas foram tratados estatisticamente no intuito de verificar se estas variáveis corroboram os agrupamentos reconhecidos com o estudo molecular. A análise combinada dos genes recuperou o monofiletismo do gênero Gymnodactylus com altos índices de suporte. Dois clados foram evidenciados com altos índices de suporte: um aqui chamado de grupo geckoides (G. amarali, G. geckoides e uma terceira linhagem reconhecida como espécie nova) e o grupo darwinii (G. darwinii, G. guttulatus, G. vanzolinii, e três outras linhagens, também reconhecidas como espécies boas). Todas as espécies reconhecidas são descritas e diagnosticadas e apresentada uma chave para sua identificação. A variação dos caracteres morfológicos é apresentada para todas assim como uma lista sinonímica detalhada com base no exame extensivo da literatura e dos tipos examinados. São descritas como novas sem que lhes seja atribuído um nome formal: (1) no grupo geckoides, uma população da região do vale do Peruaçu, noroeste do estado de Minas Gerais; (2) no grupo darwinii exemplares provenientes de Grão Mogol, sul do segmento setentrional da Cadeia do Espinhaço e de duas outras linhagens da Mata Atlântica, uma de ocorrência entre a região do rio Doce e a Baía de Todos os Santos, e outra a nordeste desta baía. G. vanzolinii é recuperado em posição basal no grupo darwinii nas análises combinadas ou individuais de alguns dos genes, porem o monofiletismo de G. darwinii lato sensu não é recuperado o que levou ao reconhecimento das novas linhagens da Mata Atlântica. Gymnodactylus darwinii fica, portanto, restrito ao sudeste do Brasil, ocorrendo do norte do estado de São Paulo até a região do rio Doce. Com base na distribuição e ecologia das espécies reconhecidas são apresentadas hipóteses para explicar a origem e diferenciação do gênero e de suas principais linhagens. / The genus Gymnodactylus includes until now five species: G. amarali, widely distributed in the Cerrado biome (savannah) of central Brazil, G. darwinii restricted to Atlantic Rain Forest, from the northeastern São Paulo state to the limits of the Atlantic Rain Forest in Rio Grande do Norte state, G. geckoides, endemic to Caatinga, northeastern Brazil; G. guttulatus, known only from the campos rupestres (rocky meadows) from the north of the meridional segment of the Espinhaço range, and G. vanzolinii, recently described and known only from the Mucugê municipality, Chapada Diamantina, Bahia, north of the septentrional segment of the Espinhaço. In this study the genus was systematically reviewed based on morphological and molecular data. About 1,400 specimens from approximately 280 localities for 30 morphological characters, and, partial sequences of the genes RAG1, PDC (nuclear), 16S (ribosomal) and cyt b (mitochondrial), totaling 2,146 base pairs covering 25 localities were studied. For the molecular data, Maximum Parsimony analyses were performed using the program PAUP, and Bayesian inferences using MrBayes. Also, these genes were analyzed individually involving a more robust data set. Both independent analyses for each gene as well analysis combining only the nuclear genes were performed. The species recognition was mainly guided by the combination of genetic data and qualitative morphological characters, although distributional data and quantitative traits were also considered. Meristic data and morphometric ratios were statistically analyzed in order to verify xiv whether these variables corroborate the groups recovered in the molecular study. The combined analysis of the genes recovered the monophyly of the genus Gymnodactylus with high support. Two clades were evident both highly supported: a clade here called \"geckoides\" group (G. amarali, G. geckoides and a third lineage recognized here as a good species) and the \"darwinii\" one (G. darwinii, G. guttulatus, G. vanzolinii, and three other clades, also recognized as good species). All recognized species are described and diagnosed and a key for their identification presented. The variation of morphological characters is given for all species recognized as well as a detailed synonymy list based on an extensive survey of the literature and some types examined. Described as new without yet without a formal name are: (1) in \"geckoides\" group, a population of the Peruaçu valley region, northwest of Minas Gerais state, (2) in the group \"darwinii\", specimens from Grão Mogol municipality, south of the northern segment of the Espinhaço Range and two other clades from the Atlantic Rain Forest, one occurring between the region of the Rio Doce and Todos os Santos bay, and another to the north of this bay. Gymnodactylus vanzolinii is recovered in a basal position in the group \"darwinii\" either in combined or single analysis of some genes, but the monophyly of G. darwinii lato sensu is not recovered which led to the recognition of new species to the Atlantic Rain Forest. G. darwinii is therefore restricted to southeastern Brazil, occurring from northern São Paulo state to the Rio Doce region. Based on the distribution and ecology of the species here recognized, hypotheses to explain the origin and differentiation of the genus and its main lineages are presented.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-05-31T17:52:36Z No. of bitstreams: 1 prisciladasilvalucas.pdf: 2106167 bytes, checksum: 71bebd985f637c47cdfa1d66cf8e9fe9 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-07-02T12:47:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 prisciladasilvalucas.pdf: 2106167 bytes, checksum: 71bebd985f637c47cdfa1d66cf8e9fe9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-02T12:47:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 prisciladasilvalucas.pdf: 2106167 bytes, checksum: 71bebd985f637c47cdfa1d66cf8e9fe9 (MD5) Previous issue date: 2012-02-27 / O atual conhecimento sobre a fauna de Squamata em Minas Gerais se baseia em grande parte por estudos realizados em áreas de Mata Atlântica, e o que se conhece sobre estudos relacionados à diversidade, conservação e outros aspectos ecológicos da fauna de Squamata em áreas de Cerrado são escassos. O presente estudo foi desenvolvido em um remanescente de Cerrado no sul do Estado localizado no Município de Ingaí e teve como objetivos descrever a composição e estimar a riqueza da fauna de Squamata em diferentes fisionomias de Cerrado, além de avaliar a dieta de Enyalius bilineatus, baseada na análise dos conteúdos estomacais. A amostragem de Squamata em campo ocorreu entre novembro de 2010 a novembro de 2011, por procura visual limitada por tempo, armadilha de interceptação e queda e encontros ocasionais. Os espécimes de E. bilineatus analisados já estavam depositados na CRLZ do Unilavras e foram provenientes de amostragens anteriores sobre a fauna local. Considerando os métodos empregados foram amostradas seis espécies de serpentes (Colubridae (4) e Viperidae (2)) e 10 espécies de lagartos (Anguidae (1), Gymnophthalmidae (2), Leiosauridae(2), Scincidae (2), Teiidae (2) e Tropiduridae (1)) nas diferentes fitofisionomias e a estimativa de riqueza avaliada pela curva de acúmulo de espécies mostrou uma riqueza de 23,81 espécies. A mata de galeria foi a fitofisionomia que apresentou maior riqueza e abundância de espécies e distribuição das abundâncias relativas mais uniformes em relação a outras áreas. A espécie mais abundante foi T. itambere com 63,2% do número total de registros para a RBUB. Mata de galeria e cerrado stricto sensu foram as áreas que apresentaram maior semelhança (CM =0,45) compartilhando quatro espécies em comum. A maior riqueza e abundância de espécies na mata de galeria podem estar relacionadas com o maior tamanho desta, que é a fitofisionomia que predomina dentro da RBUB. Com relação aos dados de dieta, a partir de 22 espécimes com conteúdo estomacal foi registrado um total de 156 itens presa pertencentes a 12 grupos taxonômicos, a maioria artrópodes, evidenciando o caráter generalista da espécie. Formigas perfizeram a categoria mais frequente em termos de ocorrência para ambos os sexos e também foi importante em termos de frequência numérica e volume para machos e fêmeas. Não foram observadas diferenças quantitativas (número de itens ingeridos) na dieta de ambos os sexos, não evidenciando diferenças sexuais na dieta de E. bilineatus neste aspecto, em grande parte devido a ingestão de formigas que são itens presa pequenas e bastante ingeridos por lagartos independente do tamanho deste. / Current knowledge about the fauna of Squamata in Minas Gerais is based largely on studies conducted in areas of Atlantic Forest, and what is known about studies related to diversity, conservation and other ecological aspects of Squamata fauna in Cerrado areas are scarce. This study was conducted in a Cerrado remnant in the southern state located in the Municipality of Ingaí and aimed to describe the composition and estimate the richness of Squamata fauna in different Cerrado physiognomies, and to evaluate the diet of Enyalius bilineatus, based the analysis of stomach contents. The sampling of Squamata in the field occurred between November 2010 and November 2011 by time constrained search, pitfall traps and occasional encounters. Specimens of E. bilineatus analyzed were already deposited in the CRLZ of the Unilavras and were obtained from previous sampling on the local fauna. Considering the methods employed were sampled six species of snakes (Colubridae (4) and Viperidae (2)) and 10 species of lizards (Anguidae (1), Gymnophthalmidae (2), Leiosauridae(2), Scincidae (2), Teiidae (2) and Tropiduridae (1)) in different and the richness estimate measured by accumulation species curve showed a richness of 23.81 species. Gallery forest was the physiognomy with the highest species richness and abundance and distribution of the relative abundances more uniform compared to other areas. The most abundant species was T. itambere with 63.2% of the total number of records for RBUB. Gallery forest and cerrado stricto sensu were the areas with the highest similarity (CM = 0.45) sharing four species in common. The highest richness and abundance of species in gallery forest may be related to the larger size of this, which is the predominant physiognomy within the RBUB. Regarding the diet data from 22 specimens with stomach contents, was recorded a total of 156 prey items belonging to 12 taxonomic groups, most arthropods, emphasizing the generalist character of species. Ants amounted to the most frequent in terms of occurrence for both sexes and were also important in terms of numerical frequency and volume for males and females. There were no quantitative differences (number of items eaten) in the diet of sexes, showing no sex differences in the diet of E. bilineatus in this regard, largely due to ingestion of ants that are prey items small and quite ingested by lizards independent of the size thereof.

Orientador: Ricardo Jannini Sawaya / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-23T04:29:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodrigues_MuriloGuimaraes_D.pdf: 4926681 bytes, checksum: 057f2c8aa9c7d1baaa30995a12a9c858 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: A ecologia de populações investiga os fatores que levam a variação das taxas vitais e, consequentemente, no número de indivíduos. Isso inclui testar hipóteses sobre aspectos da história de vida das espécies e entender os fatores que podem modular a dinâmica populacional. No entanto, a obtenção de dados para testar hipóteses pode ser difícil para populações que apresentam probabilidades de detecção < 1, como anfíbios e répteis. A marcação e recaptura é amplamente usada para estimar a detecção e inferir aspectos de dinâmica populacional e testar hipóteses ecológicas. Neste trabalho empregamos a teoria de marcação e recaptura para testar hipóteses relacionadas à ecologia e conservação de populações de anfíbios e répteis. Utilizamos o programa MARK para implementar modelos de populações abertas e fechadas incorporando a probabilidade de detecção dos indivíduos, para obter estimativas de sobrevivência, e outros parâmetros populacionais usando máxima verossimilhança. Organizamos esta tese em quatro capítulos. Iniciamos enfatizando a importância da probabilidade de detecção, além de simular cenários hipotéticos para demonstrar a relação entre esforço de campo, tamanho ótimo amostral e viés amostral. Em seguida comparamos o efeito de duas técnicas de marcação, o corte de artelhos e o implante de microchips, sobre a sobrevivência individual do sapo ferreiro, Hypsiboas faber. No terceiro capítulo estimamos a sobrevivência e o crescimento populacional da jararaca-ilhoa, Bothrops insularis incorporando emigração temporária aos modelos. Além do estudo de taxas vitais e de dinâmica nas populações, a alocação de energia e suas consequências na sobrevivência individual podem ser testadas com modelos de marcação e recaptura. Assim, no quarto e último capítulo consideramos dois caracteres sexuais presentes no sistema de acasalamento dos lagartos, o tamanho da mandíbula e a coloração chamativa, para comparar as estimativas de sobrevivência entre machos e fêmeas do lagarto cauda de chicote, Cnemidophorus cf. ocellifer. . De forma geral, observamos que a probabilidade de detecção individual nos sistemas estudados foi baixa e condizente com a detecção de vertebrados em ambientes tropicais. Além disso, a inclusão de covariáveis na investigação de parâmetros vitais e no processo de detecção é fundamental para o melhor entendimento dos fatores que explicam a dinâmica de uma população. Especificamente observamos que: (i) demonstramos que as taxas que não incorporam a detecção são enviesadas em relação às estimativas que consideram a detecção, (ii) as estimativas de sobrevivência foram similares em indivíduos de Hypsiboas faber marcados com ablação de artelhos e microchips , (iii) Bothrops insularis apresentou baixa probabilidade de sobrevivência anual e crescimento populacional anual negativo. Por fim, (iv) machos maiores do lagarto Cnemidophorus cf. ocellifer apresentaram sobrevivência mensal menor do que machos menores, mas o oposto foi observado para as fêmeas / Abstract: Population ecology aims to search for factors that lead to variation in vital rates and consequently, in the number of individuals. This includes testing hypotheses about natural history traits and threats to populations. However, obtaining data to test hypotheses is challenging because following individuals in the field can be difficult, especially for amphibians and reptiles, where detection probabilities are often < 1. Mark-recapture methods are widely used to estimate detection probabilities and to test ecological hypothesis. Here we used mark-recapture methods to test hypotheses related to ecology and conservation of amphibian and reptile populations. We implemented open- and closed-population models in Program MARK, to account for detection probabilities and to calculate survival estimates and other population parameters. We organized this dissertation into four chapters. In the first chapter we emphasize the importance of considering detection probabilities besides simulating hypothetical scenarios to show the relationship between field effort, sample size and precision. In the second chapter we used a Cormack-Jolly-Seber model to compare the effect of two amphibian marking techniques, toeclipping and PIT tagging, on survival in the blacksmith tree frog, Hypsiboas faber. In the third chapter our goal was to estimate survival and population growth of the golden lancehead, Bothrops insularis accounting for temporary emigration using Pollock's Robust Design. Besides the study of vital rates and population dynamics, energy allocation and its consequences for survival are testable with mark-recapture models. Thus, in the last chapter we used two traits from the lizard mating system, namely jaw size and courtship coloration, to compare survival estimates between males and females of the whiptail lizard, Cnemidophorus cf. ocellifer. In summary we observed that detection probability on the studied populations were low and similar to other vertebrate populations from the tropics. However, including covariates in estimation models of vital rates and detection is important to obtain more accurate results to explain population dynamics. Specifically we conclude that (i) return rates were biased low in relation to survival estimates that account for detectability, (ii) the estimates of survival were similar between toe-clipped and PIT tagged individuals of Hypsiboas faber, (iii) Bothrops insularis showed low survival probability and negative annual population growth. And (iv) larger Cnemidophorus cf. ocellifer males showed lower monthly survival probability than smaller males but the opposite was found for females / Doutorado / Ecologia / Doutor em Ecologia

Este trabalho teve como objetivo principal avaliar o sêmen da jararaca ilhoa, Bothrops insularis, quanto ao volume, motilidade, vigor e concentração, além de verificar se estes paramentos estão relacionados ao comprimento ou massa dos animais ou se variam ao longo das estações, uma vez que esta espécie possui ciclo reprodutivo sazonal. Para tanto, foram avaliadas amostras de sêmen de 18 machos, com comprimento rostro-cloacal (CRC) variando de 43,5 a 73,70 cm, pertencentes ao plantel do Laboratório de Ecologia e Evolução do Instituto Butantan, entre os meses de agosto de 2012 e maio de 2013. O sêmen de Bothrops insularis apresentou coloração variando de esbranquiçada a amarelada e consistência cremosa e espessa. Foi possível observar amostras de sêmen viáveis em todos os 18 animais avaliados, indicando que animais com CRC igual ou acima de 43,5 cm já são sexualmente maduros. O espermatozoide de Bothrops insularis é filiforme, possui cabeça alongada, fina e com formato pontiagudo, seguindo o padrão morfológico descrito para outros Squamata. Não foi observada nenhuma relação entre o comprimento, massa e cada um dos parâmetros seminais avaliados. Foi observada variação significativa da motilidade e da concentração do sêmen de Bothrops insularis entre as estações, porém o volume e o vigor do sêmen não variaram. Foi no outono, época de cópula da espécie, que o sêmen apresentou as maiores médias para os parâmetros avaliados. / This study aimed to evaluate sperm parameters of the golden lancehead, Bothrops insularis, including appearance, sperm motility, vigor, volume and concentration, determine if these parameters varied with body size or weight and to verify whether these vestments vary throughout seasons, since this species has a seasonal reproductive cycle. Samples of semen of 18 males with snout-vent length (SVL) ranging from 43.5 to 73.70 cm, belonging to the squad of the Ecology and Evolution Laboratory at Instituto Butantan, were collected between August 2012 and May 2013. Sperm color from Bothrops insularis ranged from whitish to yellowish, and a creamy and thick consistency. Viable sperm was observed in samples from all 18 males evaluated, indicating that animals with SVL equal to or above 43.5 cm are sexually mature. Sperm of Bothrops insularis is thready, has elongated, thin and pointed shaped head, following the morphological pattern described for other Squamata. No relationship between length, mass and each of seminal parameters evaluated was observed. Significant variation of concentration and motility of semen from Bothrops insularis between seasons was observed, but volume and vigor did not change. It was during Fall, mating season of the species, that sperm had the highest means for all parameters evaluated.

A família Teiidae é restrita à região neotropical e possui cerca de 110 espécies distribuídas em dez gêneros. Estudos moleculares, juntamente com citogenéticos e morfológicos e as recentes descrições de novas espécies, apontam para uma necessidade urgente de estudos multidisciplinares mais amplos que caracterizem melhor a grande diversidade nos Teiidae, especialmente quanto a espécies brasileiras, de modo a fornecer importantes contribuições à sistemática, evolução cromossômica, possibilitando a formulação de hipóteses filogenéticas mais robustas. Assim, esse trabalho tem por objetivos dar continuidade aos estudos evolutivos em Teiidae, tanto citogeneticamente, quanto molecularmente e discutir, se possível, sobre a reprodução partenogenética encontrada em muitas espécies deste grupo de lagartos. A ampla amostragem geográfica disponível para os estudos, associada ao estudo de um grupo reconhecidamente variável citogeneticamente e taxonomicamente complexo, contribui para orientar revisões futuras e também para uma avaliação da diversidade entre as populações estudadas. Do ponto de vista interpretativo, os dados obtidos também fornecem importantes contribuições à sistemática, biogeografia e programas de conservação desse grupo de lagartos neotropicais. Cariótipos de cinco espécies de lagartos teídeos sulamericanos da subfamília Teiinae (Ameiva Ameiva, Cnemidophorus ocellifer, Kentropyx calcarata, K. paulensis e K. vanzoi) são descritos e comparados em coloração convencional e diferencial. Dados meióticos também estão incluídos. Cariótipos de K. paulensis, K. vanzoi e C. ocellifer são apresentados aqui pela primeira vez. As técnicas de coloração diferencial aqui apresentadas fornecem importantes informações sobre a diversidade cariotípica da subfamília Teiinae e possibilitou a comparação entre as espécies, contribuindo tanto para a melhor compreensão da evolução cromossômica e da sistemática do grupo. Para a subfamília Tupinambinae, foram descritos cariótipos para Crocodilurus amazonicus, Tupinambis merianae, T. quadrilineatus e T. teguixim, após coloração convencional e diferencial. O artigo contribui para o esclarecimento de alguns cariótipos conflitantes de Tupinambinae presentes na literatura e descreve padrões espécie-específico de bandas C para T. quadrilineatus. Foi proposta uma filogenia molecular para 17 espécies de lagartos pertencentes à família Teiidae usando 1415 pb de seqüências do DNA mitocondrial (cit B e ND4) e nuclear (c-mos), com o uso de análises de máxima parcimônia (MP), máxima verossimilhança (MV) e inferência bayesiana (MB). A árvore proposta recuperou o monofiletismo da família Teiidae, assim como para as subfamílias Tupinambinae e Teiinae e a tribo Cnemidophorini. Na tribo Cnemidophorini, o gênero Ameiva foi identificado como monofilético e basal. Cnemidophorus se mostrou parafilético, com a espécie C. leminiscatus mais relacionada ao gênero Kentropyx, identificado por sua vez como monofilético e com a espécie K. calcarata basal e K. paulensis grupo irmão de K. vanzoi. As demais espécies que compõem o gênero Cnemidophorus formam grupo monofilético que corresponde ao grupo ocellifer, irmão do clado Kentropyx + C. leminiscatus. Conseqüências da filogenia obtida sobre a evolução cromossômica do grupo, são também apresentadas. A partenogênese (reprodução virginal) é um mecanismo reprodutivo, pelo qual um óvulo se desenvolve sem fertilização. Assim, para uma espécie sexuada se reproduzir por partenogênese, o maior problema é evitar a redução do número de cromossomos durante a meiose, uma vez que óvulos haplóides são inviáveis em vertebrados. Diversos estudos citológicos tentaram descrever os eventos meióticos responsáveis por esse modo reprodutivo, não encontrando resultados precisos. Esse trabalho descreve em detalhes uma hipótese sobre como deleções no proto-oncogene c-mos podem favorecer a reprodução partenogenética, na forma da partenogênese automítica facultativa (PAF), nos lacertiformes e nos Squamata / The Teiidae family is restrict to neotropical region and comprises around 110 species distributed in ten genera. Molecular studies, besides cytogenetical and morphological data and the new species recently described, reinforces the need of multidisciplinary studies that better comprises the huge diversity found within Teiidae, specially related to Brazilian species, giving lights on the systematics, chromosomal evolution and robust phylogenetic hypotheses. The aim of this work is study cytogenetically and molecularlly lizards form Teiidae family and discuss, if possible, about the parthenogenetical reproduction found in many species from this group of lizards. Karyotypes of five south American species of teiid lizards (Ameiva Ameiva, Cnemidophorus ocellifer, Kentropyx calcarata, K. paulensis and K. vanzoi) are herein described and compared. Meiotic data are also included. Chromosomal data for K. paulensis, K. vanzoi and C. ocellifer are presented for the first time. Differential staining techniques presented revealed many pieces of information about the karyotypic diversity within Teiinae and made possible the comparison between al the species sampled, giving lights on chromosomal evolution and systematics. Karyotypes of Tupinambinae subfamily were described for Crocodilurus amazonicus, Tupinambis merianae, T. quadrilineatus and T. teguixim. The article presented contributes for make clear some cytogenetical incongruences found in literature and describes a specie-specific C-banding pattern for T. quadrilineatus. A molecular phylogenetical propose was obtained for 17 species of teiid lizards, from 1415 bp of mitochondrial (cit B e ND4) and nuclear (c-mos) DNA, using maximum parcimony (MP), maximum likelihood (MV) and bayesian inference (MB) analyses. The consensus tree reconstructed revealed the monofiletism of Teiidae family, as well as for Tupinambinae and Teiinae subfamily plus Cnemidophorini tribe. Whithin Cnemidophorini, the genus Ameiva was monofiletic and basal. Cnemidophorus was parafiletic, with C. leminiscatus closely related to Kentropyx, identified in your turn as monofiletic with K. calcarata basal and K. paulensis sister group of K. vanzoi. The remaining Cnemidophorus species sampled corresponds to the monofiletic group ocellifer, sister group of Kentropyx + C. leminiscatus. Chromosomal evolution of the family was also discussed in face of the molecular phylogenetic hypothesis proposed. Parthenogenesis (virgin birth) is a reproductive mechanism in with an egg develops without fertilization. In this view, for a bisexual species reproduces in that form ,the main obstacle is avoid the reduction of diploid number during meiosis, once that haploid oocites are unlikely to occur in vertebrates. Many cytological studies had attempt to clarify the meiotic events that make possible this reproductive mechanism, without any precise results. This article describes in detail a hypothesys about how delections foun in c-mos sequence may favour the parthenogenetical reproduction, in the form of facultative automitic partenogenesis (PAF), in Lacertiformes and Squamata.

The paleontology of reptiles in the Caribbean is a topic of great interest to understand how the current fauna of the area was constituted from colonization and extinction of their groups. The largest number of fossils belongs to Squamata, ranging from the Eocene to our days. The registry covers all the islands of the Greater Antilles, most of the Lesser Antilles, and of the Bahamas. Cuba, the largest island of the Antilles, has a relatively sparse Squamata fossil record, with 11 known species from 10 locations, distributed in the West and Center of the Country. However, there are many other fossils deposited in biological collections without identification that could better clarify the history of their reptile fauna. A total of 328 fossils from three paleontological collections were selected for their analysis, searching osteological characteristics that would serve to diagnose them at the lowest possible taxonomic level, and compare them with other fossils and recent species. In the present work, the Squamata fossil record is increased, both in the number of species and in the number of localities. The registry is extended to practically all of the Cuban territory. Fossil remains belonging to previously reported species are confirmed, such as Leiocephalus cubensis, L. carinatus, Tarentola americana, Chilabothrus angulifer, and Cubophis cantherigerus. Fossils of Amphisbaena, Pholidoscelis auberi, and Leiocephalus macropus are described for the first time. Besides, other fossils belonging to the genera Tarentola, Leiocephalus, and Chilabothrus but different from the species that currently inhabit the archipelago, are described. These results show that the Squamata fossil record in Cuba is broader than what was previously considered, despite being composed of very fragile and small fossils with little potential for fossilization. For the paleontology of Squamata the description of new taxa and record of new localities in Cuba, are the first steps for more integrating studies on biological diversity, evolution, biogeography, paleoenvironment among others that contribute to the understanding of the fauna in the Caribbean region. / A paleontologia de répteis no Caribe é um tema de grande interesse para entender como a fauna atual da área foi constituída a partir da colonização e extinção dos seus grupos. O maior número de fósseis pertence a Squamata, que vai desde o Eoceno até nossos dias. O registro abrange todas as ilhas das Grandes Antilhas, a maioria das Pequenas Antilhas e as Bahamas. Cuba, a maior ilha das Antilhas, tem um registro fóssil de Squamata relativamente escasso, com 11 espécies conhecidas de 10 localidades, distribuídas no oeste e centro do país. No entanto, existem muitos outros fósseis depositados em coleções biológicas sem identificação, que poderiam esclarecer melhor a história de sua fauna de répteis. Um total de 328 fósseis de três coleções paleontológicas foi selecionado para sua análise, buscando características osteológicas diagnosticas do menor nível taxonômico possível, e comparando-os com outros fósseis e espécies recentes. No presente trabalho, o registro fóssil de Squamata foi aumentado, tanto em número de espécies quanto em número de localidades. O registro foi estendido a praticamente todo o território cubano. Restos fósseis pertencentes às espécies relatadas anteriormente são confirmados, como Leiocephalus cubensis, L. carinatus, Tarentola americana, Chilabothrus angulifer e Cubophis cantherigerus. Fósseis de Amphisbaena, Pholidoscelis auberi e Leiocephalus macropus foram descritos pela primeira vez, bem como de outros fósseis pertencentes aos gêneros Tarentola, Leiocephalus e Chilabothrus, mas diferentes das espécies que atualmente habitam o arquipélago. Esses resultados mostram que o registro fóssil de Squamata em Cuba é mais amplo do que era considerado anteriormente, apesar de ser composto de fósseis muito frágeis e pequenos, com pouco potencial para a fossilização. Para a paleontologia de Squamata, a descrição de novos táxons e registro de novas localidades em Cuba são os primeiros passos para estudos mais integradores sobre diversidade biológica, evolução, biogeografia, paleoambiente entre outros que contribuam ao entendimento da fauna na região do Caribe.

The evolution of snakes (Squamata: Serpentes) represents a major transition in squamate reptiles and involves extensive modifications in the body plan. Functional morphology and phylogeny are integrated to discuss adaptive morphological traits in the origin of snakes and in the evolution of the venom-injecting apparatus among lizards, which is convergent with that in snakes. The focus of these analyses is to determine how to best optimize morphological traits on the phylogeny and to use character distribution in terminal taxa to estimate ecological adaptation in ancestral nodes. To study the locomotion transition from lizards to snakes, 45 virtual models of the squamate bony labyrinth in the inner ear were reconstructed. The results show morphological diversifications of the vestibular region among burrowers, generalists and marine swimmers. The vestibule is enlarged in fossorial species, and reduced in marine snakes and the marine lizard Platecarpus coryphaeus. To quantify the morphological differences and provide tractable methods to reconstruct locomotion in ancestral snakes, I performed three-dimensional geometric morphometric analysis of the 45 samples, using six landmarks and 22 semilandmarks. ANOVA tests on the Procrustes coordinates supported differences among fossorial, generalist, and aquatic locomotion categories. Phylogenetic signal was insignificant in the Procrustes coordinates. Using a phylogeny with the 44 extant samples as terminal taxa, I reconstructed shape coordinates of all internal nodes. Reconstructed shape of the vestibular region of key ancestral nodes in snakes preferred a terrestrial origin for crown-group snakes. Morphological proxies used in this study can be applied to stem snakes to estimate locomotion. Methodologically, this study provides a novel approach to resolve the question whether snakes become limbless on land or in the oceans. Evolution of the venom-injection apparatus in lizards is discussed, based on new material of Estesia mongoliensis. A total-evidence phylogenetic analysis of anguimorph lizards is performed with 86 anguimorph taxa coded to 435 morphological characters and four genes. The matrix includes eight new morphological characters. The total-evidence phylogeny suggests that Estesia Mongoliensis is a basal monstersaur whose crown groups are Heloderma, the only living venomous lizards. Presence of tooth flanges with venom grooves is recognized as a new monstersaurian synapomorphy in this study. Estesia mongoliensis has venom grooves comparable to extant Heloderma, but has a deeper root-to-tip groove in the caudal tooth carina, revealing morphological variations of lizard venom delivery apparatus that are not recorded in extant species.