Debido a que la vegetación local es resultado de interacciones entre los factores abióticos del medio, el presente estudio tiene por objeto de evaluar la estructura y los patrones de diversidad vegetal leñosa en relación a la topografía y a variables edáficas en un sector de bosque seco semideciduo subandino del Río San Juan, se instaló 12 parcelas de 0,1 ha (4 fondo de valle, 4 ladera y 4 cima) donde se muestreo individuos con DAP ≥2,5 cm. Los valores de los índices Shannon-Wiener, Simpson y Pielou reflejan que la mayor diversidad alfa se encuentra en las cimas, luego en los fondos de valle y finalmente en las laderas. La diversidad Beta fue analizada mediante el índice de Sørensen, donde las cimas presentan alta similaridad y baja complementariedad y en cambio los fondos de valle presentan baja similaridad y alta complementariedad. Las gráficas de PCA y el dendrograma realizados en PC-ord4 muestran la clara y definida separación de tres grupos que representan las tres situaciones topográficas estudiadas.