En ökad utbredning av vankomycinresistenta enterokocker (VRE) har setts i Sverige sedan 2007. Bakteriemi orsakad av VRE är mycket svårbehandlad, varför snabbare tillförlitlig resistensdiagnostik är betydelsefullt för att minska dödlighet, vårdtider, vårdkostnader och belastning på sjukvårdssystemet. På mikrobiologilaboratoriet, Region Jönköpings län (RJL), tar idag identifiering av fenotypisk vankomycinresistens vid optimala förhållanden 6 timmar, räknat från att enterokocker konstaterats växa i blodet. Resistensgenerna vanA och vanB, som bland andra orsakar vankomycinresistens hos enterokocker, kan genetiskt verifieras med loop-mediated isothermal amplification men tar idag upp till ett dygn då bakteriekolonier används som analysmaterial i arbetsrutinen på molekylärbiologilaboratoriet, RJL. Syftet med studien var att utvärdera bakteriepellet som analysmaterial för genetisk identifiering av vanA och vanB, på Genie® II Mk2 med eazyplex® VRE basic, hos enterokocker från positiva blododlingar. För att utvärdera bakteriepellet som analysmaterial analyserades isolat av Enterococcus faecium (n=17) och Enterococcus faecalis (n=5) från bakteriepellets tillverkade från simulerade positiva blododlingar med eazyplex® VRE basic på Genie® II Mk2, varpå resultaten jämfördes mot isolatens faktiska närvaro/frånvaro av vanA/vanB. Samstämmigheten av de uppmätta- och de förväntade resultaten var fullständig, vilket indikerar att bakteriepellet med hög tillförlitlighet kan användas som analysmaterial till eazyplex® VRE basic för att påvisa vanA och vanB hos enterokocker i blododlingar. / An increased prevalence of vancomycin-resistant enterococci (VRE) has been observed in Sweden since 2007. Treating bacteremia caused by VRE is difficult, which is why faster, and reliable resistance diagnostics are important. At the Microbiology laboratory, Region Jönköping County, the identification of phenotypic vancomycin resistance under optimal conditions takes 6 hours from when growth of enterococci in blood is determined. The genes vanA and vanB, which among others cause vancomycin resistance, can be genetically verified by loop-mediated isothermal amplification, but takes up to one day since bacterial colonies are used as analysis material. The aim of the study was to evaluate bacterial pellet as an analytical material for genetic identification of vanA and vanB, on Genie® II Mk2 with eazyplex® VRE basic, in enterococci from positive blood cultures. To evaluate the bacterial pellet, isolates of Enterococcus faecium (n=17) and Enterococcus faecalis (n=5) from bacterial pellets made from simulated positive blood cultures were analyzed with eazyplex® VRE basic on the Genie® II Mk2, and the results were compared to the actual presence/absence of vanA/vanB in the isolates. The complete coherence between the expected and measured results indicates that the bacterial pellet can be used as an analytical material for eazyplex® VRE basic.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:UPSALLA1/oai:DiVA.org:hj-61119 |
| Date | January 2023 |
| Creators | Ehn, Felicia, Ironberg, Axel |
| Publisher | Jönköping University, HHJ, Avdelningen för naturvetenskap och biomedicin |
| Source Sets | DiVA Archive at Upsalla University |
| Language | Swedish |
| Detected Language | English |
| Type | Student thesis, info:eu-repo/semantics/bachelorThesis, text |
| Format | application/pdf |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
Page generated in 0.0018 seconds