Tesis para optar al Grado de Magíster en Ciencias Animales y Veterinarias / Los piojos de mar (Caligus rogercresseyi) son los ectoparásitos que causan las
mayores pérdidas productivas en la industria de la acuicultura, especialmente en
Chile. El salmón del Atlántico (Salmo salar) y la trucha arcoíris (Oncorhynchus
mykiss) son las especies de salmónidos más susceptibles a su infestación, una
situación que ha promovido la búsqueda de estrategias para resolver el problema.
Este estudio tiene como objetivo determinar genes candidatos en el salmón del
Atlántico y la trucha arcoíris que pueden participar en el mecanismo de resistencia
contra el piojo de mar, y determinar la ortología entre los genes obtenidos en ambas
especies. Para esto, 2.626 individuos de salmón del Atlántico y 2.643 de trucha
arcoíris de poblaciones comerciales fueron desafiados con piojos de mar y se les
realizó un genotipado con un panel de SNP 50k. Se obtuvieron heredabilidades
moderadas a bajas con valores de 0,19 para S. salar y 0,08 para O. mykiss para el
logaritmo de la densidad del caligus (como medida de resistencia del huésped).
Mediante un estudio de asociación genómica identificamos una serie de genes
presentes las regiones genómicas asociadas al carácter en ambas especies, tales
como Serine/ threonine kinase y Tripartite motif-containing protein 16-like. El análisis
de ortología nos permitió identificar dust8 y dust10 como genes que participan en la
respuesta inmune activando los leucocitos, favoreciendo la migración, como
también al receptor de ácido lisofosfatidico junto a un receptor acoplado a proteína
G los cuales pertenecen a regiones sinténicas asociadas al carácter en ambas
especies. Este es un primer enfoque para comprender los genes involucrados en la
resistencia contra el piojo de mar utilizando genómica comparativa en salmónidos.
Sin embargo, se necesitan investigaciones adicionales en ambas especies para
validar los genes identificados como candidatos / Sea lice (Caligus rogercresseyi) are the ectoparasites that cause the greatest
productive losses in the aquaculture industry, especially in Chile. Atlantic salmon
(Salmo salar) and rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) are the salmonid species
most susceptible to their infestation, a situation that has promoted the search for
strategies to solve the problem. This study aims to determine candidate genes in
Atlantic salmon and rainbow trout that can participate in the mechanism of resistance
against sea lice, and determine the orthology between the genes obtained in both
species. For this, 2,626 individuals of Atlantic salmon and 2,643 of rainbow trout
from commercial populations were challenged with sea lice and genotyped with a
SNP 50k panel. Moderate to low heritabilities were obtained with values of 0.19 for
S. salar and 0.08 for O. mykiss for the logarithm of sea lice density (as a measure of
host resistance). By means of a study of genomic association we identified a series
of genes present the genomic regions associated with the character in both species,
such as Serine / threonine kinase and Tripartite motif-containing protein 16-like. The
orthology analysis allowed us to identify dust8 and dust10 as genes that participate
in the immune response activating the leukocytes, favoring migration, as well as the
lysophosphatidic acid receptor together with a G protein-coupled receptor which
belong to syntenic regions associated with the character in both species. This is a
first approach to understand the genes involved in resistance against sea lice using
comparative genomics in salmonids. However, additional research is needed in both
species to validate the genes identified as candidates / Research Council UK- CONICYT, Research Partnership Call. (MR/N026144/1)
| Identifer | oai:union.ndltd.org:UCHILE/oai:repositorio.uchile.cl:2250/170333 |
| Date | January 2019 |
| Creators | Cáceres Refusta, Pablo Andrés |
| Contributors | Yáñez López, José, Smith Schuster, Pedro, Uribe Muñoz, Héctor |
| Publisher | Universidad de Chile |
| Source Sets | Universidad de Chile |
| Detected Language | Spanish |
| Type | Tesis |
| Rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Chile, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/cl/ |
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