Les ARN interagissants avec Piwi (ARNpi) sont des petits ARN non-codants qui sont exprimes dans la ligne grrminale des animaux. Ils interagissent avec les proteines de la branche Piwi de la famille des Argonautes en formant des complexes des ribonucleproteines impliques dans le maintien de l'intégrité du génome. La region N-terminale des quelques proteines Piwi contiennent symetriquement des arginines diméthylées. Il est considere que ce status symmetrique de la dimethylation est responsable du recrutement des proteines possédant des domaines Tudor (TDRDs). Ces domaines peuvent avoir un role comme platforme pour medier les interactions entre les proteines de la voie de l'ARNpi. Nous avons mesure indivindiuellemnt l'affinite de liaison des quatres domaines etendus Tudor (TD) de la proteine murine TDRD1 pour les trois differents peptides de la protein murine Mili qui contiennent de la methyl-arginine. Les resultats montrent une preference des TD2 et TD3 pour les peptides consecutives Mili alors que TD4 et TD1 ont une affinite plus bas et plus faible respectivement pour tous les peptides. Ces observations ont ete confirmees par des experiences pull-down en utilisant des proteines Piwi endogenes et des proteines-interagissent avec Piwi. L'affinite de TD1 pour les peptides qui contiennent de la methyl-arginine peut etre restoree par une seul mutation ponctuelle dans la cage aromatique pour revenir a la sequence consensus. La structure de cristal de la proteine TD3 lie au peptide methyle Mili montre une orientation inattendue de la peptide de liaison et de la chaine latérale de l'arginine methyle dans la cage aromatique. Finalement, le model SAXS des quatres domains tandem Tudor de TDRD1 revele une forme de la proteine flexible et elongee. Globalement, les resultats montrent que la proteine TDRD1 peut accommoder des differents peptides des differentes proteines et ainsi de fonctionner comme une protéine d'échafaudage dans la voie de l'ARNpi. La proteine FKBP6 (FK506 Binding Protein) a ete recemment identifiee comme un nouvel facteur interagissent dans la voie de l'ARNpi. FKBP6 est constituee d'une domaine d'isomerase FK et une domaine de tetratricopeptide (TPR). Une perte de la Fkbp6 conduit a la de -repression des transposons et a la sterilite masculine des souris. Le domaine TPR est implique dans l'interaction avec la proteine chaperone Hsp90 et le domaine FK est une isomerase inactive qui a ete evolue a une module structurale. En effectuant des exepriences biochimiques preliminaires nous avons identifie la region N-terminal du domaine MYND de TDRD1 comme le partenaire d'interaction du domaine FK de la FKBP6. Nous proposons que la proteine TDRD1 est une plateforme moleculaire qui reconnait des marques de methylation de MILI et elle recrute FKB6 pour promouvoir la formation d'un complexe indispensable pour la fonction de la voie de l'ARNpi.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:CCSD/oai:tel.archives-ouvertes.fr:tel-00907417 |
| Date | 25 September 2012 |
| Creators | Mathioudakis, Nikolaos |
| Publisher | Université de Grenoble |
| Source Sets | CCSD theses-EN-ligne, France |
| Language | fra |
| Detected Language | French |
| Type | PhD thesis |
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