Hydatidiform mole (HM) is a form of gestational trophoblastic disease characterized by hydropic degeneration of chorionic villi of the placenta with or without embryo. My project is aimed at finding a new gene for recurrent HMs (RHMs). When I started this project there wasonly one gene, NLRP7, known to be causative of this condition, Mutations in a second gene, KHDC3L, in patients with RHMs were discovered by Parry et al. 2011. Genetic heterogeneity in the causation of RHMs is shown by our group and many others and is also evident from the absence of mutations in both NLRP7 and KHDC3L in some patients with RHMs. This suggests the possible role of other genes in the causation of RHMs. Exome sequencing was carried out on 18 patients with RHMs and no mutations in NLRP7 and KHDC3L. Analysis of the Exome sequencing data revealed NSVs in many genes. Of these, five candidate genes had two defective alleles in one patient, each. These variants were co-segregating with the phenotype and predicted to be damaging. Sequencing of these genes in more patients with recurrent HMs and reproductive wastage is underway in our laboratory and may help in finding new genes for molar pregnancies. After the identification of KHDC3L, I sequenced this gene in 97 patients with recurrent HMs and reproductive wastage who are negative for NLRP7. I found two frameshift deletion mutations, including one novel, in three patients with RHMs. I performed haplotype analysis using the SNPs surrounding one mutation and found that the haplotype is shared between patients of three ethnic groups, suggesting a strong founder effect for this mutation across populations. Co-localization experiments on lympoblastoid cell lines from normal subjects showed that that KHDC3L co-localizes with NLRP7 to the Golgi and microtubule organizingcenter. / La môle hydatidiforme (HM) est une forme de maladie trophoblastique gestationnelle caractérisée par une dégénérescence hydropique des villosités choriales du placenta avec ou sans embryon. Mon projet visait à identifier un nouveau gène responsable des môles hydatidiformes récurrentes (MHR). Quand j'ai commencé ce projet, un seul gène, NLRP7, était connu pour être responsable de cette condition. Des mutations dans un second gène, KHDC3L, ont été ensuite découvertes par Parry et al. 2011 chez des patientes atteintes de MHR. L'hétérogénéité génétique dans l'étiologie des MHR a été démontrée par plusieurs équipes, y compris la notre, et ressort également de l'absence de mutations dans les deux gènes NLRP7 et KHDC3L chez certaines patientes atteintes de MHR. Ceci suggère l'implication d'autres gènes qui causent les MHR. Le séquençage des exomes a été réalisé sur 18 patientes atteintes de MHR mais ne portant aucune des mutations dans NLRP7 ou KHDC3L. L'analyse des données de séquençage des exomes a révélé la présence de variants non-synonymes dans de nombreux gènes. Parmi ceux-ci, cinq gènes candidats présentant chacun deux allèles défectueux. Ces variants co-ségrégeaient avec le phénotype anormal et sont prédits dommageables. Le séquençage de ces gènes chez les patientes atteintes de MHR et d'autres formes d'echecs de reproduction est en cours dans notre laboratoire et pourrait aider à identifier de nouveaux gènes responsables des grossesses môlaires. Après l'identification du gène KHDC3L, j'ai séquencé ce dernier chez 97 patientes atteintes de MHR et d'autres formes d'echec de la reproduction mais ne présentant pas de mutations au niveau du gène NLRP7. Deux délétions dont une nouvelle affectant le cadre de lecture de ce gène ont été identifiées chez trois patientes atteintes de MHR. L'analyse des haplotypes par SNP autour de la mutation commune du KHDC3L a révélé le meme haplotype chez les trois patientes de differentes ethnies suggérant ainsi un effet fondateur important de cette mutation dans différentes populations. Des expériences de co-localisation sur des lignées cellulaires lympoblastoides chez des sujets normaux ont montré que KHDC3L co-localise avec NLRP7 au niveau de l'appareil de Golgi et le centre organisateur des microtubules ou centrosome.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.119677 |
| Date | January 2013 |
| Creators | Guggilla, Ramesh |
| Contributors | Rima Slim (Internal/Supervisor) |
| Publisher | McGill University |
| Source Sets | Library and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation |
| Format | application/pdf |
| Coverage | Master of Science (Department of Human Genetics) |
| Rights | All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated. |
| Relation | Electronically-submitted theses. |
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