Studies of extraintestinal infections caused by genetically related strains of Escherichia coli among unrelated people have demonstrated the epidemic potential of this group of bacteria. These related extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) may have a common source. Our group recently described how retail meat, particularly chicken, may be a reservoir for ExPEC causing human urinary tract infections (UTIs). By moving upstream on the farm to fork continuum, this study tests whether the reservoir for ExPEC is in food animals themselves. A total of 824 geographically and temporally matched E. coli isolates from cecal contents of slaughtered food animals (n=349) and human UTI (n=475) sources were compared. Using 6 different typing methods, an evolutionary relationship was observed between E. coli isolates from the food animal reservoir and human UTI. Moreover, chicken was the predominant animal species from where the related isolates originated. Using an evolutionary model, chicken was determined to be the most likely source of the human UTI isolates. This study confirmed that an animal reservoir, principally in chicken, may exist for ExPEC causing community-acquired UTI. / Les études portant sur les infections extra-intestinales causées par des souches d'Escherichia coli génétiquement apparentées, chez des personnes non reliées entre elles, ont démontré le potentiel épidémique de ce groupe de bactéries. Ces souches d'E. coli pathogènes extra-intestinales (ExPEC) apparentées auraient possiblement une source commune. Notre groupe a récemment décrit comment la viande de détail, plus particulièrement le poulet, pourrait être un réservoir d'ExPEC responsables d'infections urinaires (IUs) chez les humains. En se déplaçant plus en amont dans le continuum de la ferme à la fourchette, cette étude teste si le réservoir d'ExPEC se trouve dans les animaux de production eux-mêmes. Un total de 824 isolats d'E. coli de provenances géographique et temporelle communes, prélevés dans le contenu caecal d'animaux abattus (n=349) et de cas d'IU humaine (n=475) ont été comparés. Par l'utilisation de 6 différentes méthodes de typage, une relation évolutionnaire a été observée entre les isolats d'E. coli provenant du réservoir animal et d'IU humaine. De plus, le poulet était l'espèce animale prédominante parmi les isolats parentés. L'utilisation d'un modèle évolutionnaire a permis de déterminer que le poulet est la source la plus probable des isolats d'IU humaine. Cette étude a confirmé qu'un réservoir animal, principalement chez le poulet, pourrait exister pour les ExPEC qui causent des IUs acquises en communauté.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.104886 |
| Date | January 2011 |
| Creators | Racicot Bergeron, Catherine |
| Contributors | Amee Manges (Internal/Supervisor) |
| Publisher | McGill University |
| Source Sets | Library and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation |
| Format | application/pdf |
| Coverage | Master of Science (Department of Microbiology & Immunology) |
| Rights | All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated. |
| Relation | Electronically-submitted theses. |
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