Group II introns are a family of introns found in bacterial and organellar, but not in nuclear genomes. Many group II introns encode proteins termed maturases which are required for their splicing and retrotransposition. Recently four maturase-like proteins were identified in the Arabidopsis thaliana nuclear genome. The proteins encoded by these genes are termed nuclear maturases (NMATs). The four NMAT proteins are classified as NMAT1A, NMAT1B, NMAT2A, and NMAT2B. Nuclear maturases are predicted to have mitochondrial localization signals and a conserved X domain suggesting that these putative maturases are transported to organelles and may function in splicing of group II introns. My results indicate that NMAT1A, NMAT2A, and NMAT2B are all required for embryo viability. Analysis of mitochondrial transcripts from the mutant plants indicate that NMAT2A is necessary for efficient splicing of intron 1 of the nad2 gene, and that NMAT2A is necessary for efficient splicing of intron 1 of the nad5 gene. The results thus confirm the hypothesis that NMATs are required for the specific efficient splicing of mitochondrial transcripts. / Les introns du groupe II sont une famille d'introns trouvé dans les bactéries et organelles, mais non dans les génomes nucléaire. Beaucoup de ceux-ci codent pour des protéines appelées maturases qui sont requises pour l'épiçage et la retrotransposition. Récemment, quatre protéines maturase-like ont été trouvées dans le génome nucléaire d'Arabidopsis thaliana. Les protéines correspondantes à ces gènes ont été nommées maturases nucléaire (NMATs). Elles ont été classifiées NMAT1A, NMAT1B, NMAT2A, et NMAT2B. La prédiction d'un signal de localisation mitochondrial et d'un domaine X conservé suggèrent que ces protéines pourrais fonctionner dans l'épissage d'introns du group II. Mes résultats indiquent que NMAT1A, NMAT2A, et NMAT2B sont tous requis pour la viabilité embryonnique. L'analyse des transcrits mitochondriaux de ces plantes indiquent que NMAT2A est nécessaire pour un épissage efficace de l'intron 1 du gène nad2 et que NMAT2B est necessaire pour l'épissage de l'intron 1 du gène nad5. Les résultats confirment ainsi l'hypothèse que les NMATs sont requises pour un épissage efficace de transcrits mitochondriaux spécifiques.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.95156 |
| Date | January 2010 |
| Creators | Malik, Sunita |
| Contributors | Gregory G Brown (Supervisor1), Tamara Western (Supervisor2) |
| Publisher | McGill University |
| Source Sets | Library and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation |
| Format | application/pdf |
| Coverage | Master of Science (Department of Biology) |
| Rights | All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated. |
| Relation | Electronically-submitted theses. |
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