The eukaryotic cell is organized into several membranous subcellular compartments that contribute to the spatial segregation of the many cell physiological functions. One of these organelles, the endoplasmic reticulum (ER), is a continuous compartment, emanating from the nuclear envelope, through the rough ER, and ending with the reticulated smooth ER network. Each domain of the organelle is distinct for its morphology, as well as the many diverse functions that it performs. In this thesis, a survey of a proteomics resource for both the rough and smooth domains of the ER reveals that the organelle is further divided into spatial and functional subdomains. Furthermore, the assignment of novel proteins that were uncovered by proteomics to these various functional clusters can provide insight into their functions and guide future functional studies. Lastly, this thesis demonstrates the importance of the distinct morphology of the smooth ER network in maintaining basic physiological processes. Taken together, these data demonstrate that while the ER is a single, continuous, subcellular compartment, it is highly complex in its spatial, functional, and morphological organization. / La cellule eucaryote est constituée de plusieurs structures spécialisées dénommées organites qui contribuent à la démarcation des fonctions physiologiques de la cellule. L'un de ces organites, le réticulum endoplasmique (RE), est une structure continue qui provient de l'enveloppe nucléaire, devient le RE rugueux, et se termine avec le réseau réticulé RE lisse. Chaque division de l'organite est unique pour sa morphologie, ainsi que ses fonctions nombreuses et diverses. Dans cette thèse, une analyse d'une ressource protéomique révèle que les deux domaines du RE sont encore divisés en de nouvelles sections régionales et fonctionnelles. De plus, l'attribution de nouvelles protéines découvertes par la protéomique à ces divisions fonctionnelles peut donner un aperçu de leurs fonctions et guider de nouvelles études. Enfin, cette thèse démontre l'importance de la morphologie distincte du réseau RE lisse pour le maintient de certains processus physiologiques de base. Le tout démontre que même si le RE est en effet un compartiment continu, son organisation régionale, fonctionnelle et morphologique est très complexe.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.119383 |
| Date | January 2013 |
| Creators | Smirle, Jeffrey |
| Contributors | John Joseph Marcel Bergeron (Supervisor) |
| Publisher | McGill University |
| Source Sets | Library and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation |
| Format | application/pdf |
| Coverage | Doctor of Philosophy (Department of Anatomy and Cell Biology) |
| Rights | All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated. |
| Relation | Electronically-submitted theses. |
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