Many genes that are involved in nutrient and energy utilization and storage are conserved between humans and C. elegans. One of the genes involved in worm mitochondrial respiration is clk-1. This gene encodes an enzyme required for ubiquinone biosynthesis. One of the phenotypes of clk-1 mutants is altered defecation cycle: the slowing down of the defecation cycle and the inability to defecate faster at higher temperatures. these phenotypes are independent of one another. Several lines of evidence suggest that the slowed defecation of clk-1 mutants is due to alterations in lipoprotein/cholesterol metabolism because the mutant phenotype can be suppressed by the reduction of dietary cholesterol, administration of drugs affecting lipoprotein metabolism, and mutating genes involved in lipoprotein metabolism. These mutations can be separated into two classes: those which suppress the clk-1 slow defecation at 20 as well as after the shift to 25°C (class I) and those which only suppress it at 20°C (class II). Worm dsc-4 (lipoprotein assembly) and dsc-3 (metabolism of bile-like molecules) are class I suppressors. Both of these mutations restore the ability of clk-1 mutants to react to the temperature shifts. In this study we identified a novel class I suppressor pgp-2 and classified sod-4 as a class II suppressor. pgp-2 encodes a protein essential for the biosynthesis of the worm intestinal lysosome-related organelles. Mutations in both pgp-2 and sod-4 are unable to restore the ability of clk-1 worms to react to the temperature shifts. Combining different class I mutants as well as combining class I with class II mutant sod-4 revealed that the genetic interactions between class I mutants as well as genetic interactions between class I and class II mutants are hard to predict. / Plusieurs des gènes impliqués dans l'utilisation des nutriments et de l'énergie ainsi que pour leur stockage sont conservés de l'humain à C. elegans. Un des gènes impliqué dans la respiration mitochondriale du nématode est clk-1. Ce gène encode pour une enzyme requise à la synthèse d'ubiquinone. Un des phénotypes des mutants clk-1 est une altération du cycle de défécation. Chez ces mutants, le cycle de défécation est ralenti et celui-ci ne s'accélère pas à des températures plus élevées, comme observé chez le nématode sauvage. Ces phénotypes sont indépendants l'un de l'autre. Plusieurs résultats expérimentaux suggèrent que le ralentissement du cycle de défécation chez les mutants clk-1 est du à des altérations du métabolisme lipoprotéines/cholestérol car ce phénotype peut être supprimé par la réduction du cholestérol provenant de la diète, par l'administration de composés affectant le métabolisme des lipoprotéines et par mutation des gènes impliqués dans le métabolisme des lipoprotéines. Ces mutations peuvent êtres divisées en 2 classes : celles qui suppriment le ralentissement du cycle de défécation à 20oC aussi bien qu'à 25oC (classe I) et celles qui suppriment ce phénotypes seulement à 20oC (classe II). La mutation dsc-4 chez le nématode (impliqué dans l'assemblage des lipoprotéines) ainsi que la mutation dsc-3 (impliqué dans le métabolisme des molécules de type bile) agissent comme suppresseurs de classe I. Chacune de ces deux mutations restaure la capacité des mutants clk-1 à réagir à des changements de température. Dans cette étude, nous avons identifié un nouveau suppresseur de classe I, pgp-2 et classifié sod-4 comme étant un suppresseur de classe II. pgp-2 encode une protéine essentielle à la biosynthèse des organelles intestinales de type lysosome. Les mutations pgp-2 et sod-4 combinées ne suffisent pas à restaurer la capacité de clk-1 à répondre aux changements de température. La combinaison de différentes mutations de classe I ainsi que des mutations de classe I et la mutation de classe II, sod-4, nous a démontré que les interactions génétiques entre les différents mutants sont difficiles à prévoir.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.106585 |
| Date | January 2012 |
| Creators | Kryzskaya, Darya |
| Contributors | Siegfried Hekimi (Supervisor) |
| Publisher | McGill University |
| Source Sets | Library and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation |
| Format | application/pdf |
| Coverage | Master of Science (Department of Biology) |
| Rights | All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated. |
| Relation | Electronically-submitted theses. |
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