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Alterations in soybean gene expression profile after foliar application of lipo-chitooligosaccharide (LCO) from «Bradyrhizobium japonicum» under sub-optimal temperature

Lipo-chitooligosaccharides (LCOs) produced by N2-fixing rhizobacteria initiate host nodule formation. Foliar application of LCOs has been shown to induce stress-related genes under optimal growth conditions. To study the effects of LCO foliar spray under stressed conditions, soybean seedlings grown at optimal temperature were exposed to sub-optimal temperature. After a 5-day acclimation period, the first trifoliolate leaves were sprayed with 10-7 M LCO (NodBj-V (C18:1, MeFuc)) produced by Bradyrhizobium japonicum, and harvested at 0 and 48 h following treatment. Microarray analysis was performed using Affymetrix GeneChip® Soybean Genome Arrays. A total of 147 genes were differentially expressed 48 h after LCO treatment, including a number of stress-related genes and transcription factors. In addition, during the 48 h following treatment, hundreds of genes were differentially expressed in LCO-treated plants, indicating that the dynamic soybean foliar transcriptome was highly responsive to LCO treatment. The microarray data was supported by quantitative real-time PCR data. / Les lipo-chitooligosaccharides (LCOs) produits par les rhizobactéries initient la formation de nodules chez l'hôte. La vaporisation foliaire de LCOs provoque l'expression des gènes liés aux stress et à la transduction du signal. Pour étudier les effets de la vaporisation foliaire de LCOs en condition stressante, des plants de soja qui étaient cultivés à température optimale ont été exposés à température sub-optimale. Après une période d'acclimatation de 5 jours, les premiers feuillages ont été vaporisés de 10-7 M LCO (NodBj-V (C18:1, MeFuc)) produit par Bradyrhizobium japonicum, et ont été recueillis 0 h et 48 h après traitement. L'analyse microarray a été réalisée par Affymetrix GeneChip® Soybean Genome Arrays. Un total de 147 gènes se sont exprimés différemment 48 h après application du traitement LCO, y compris les gènes liés aux stress et à la transduction du signal. De plus, durant les 48 h suivant la vaporisation foliaire, des centaines de gènes qui avaient montré une expression différentielle étaient spécifiques aux plantes traitées avec LCO. Ces résultats indiquent que le transcriptome foliaire dynamique du soja a réagi au traitement LCO. Les données de microarray étaient supportées par des données de PCR quantitatif en temps réel.

Identiferoai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.92375
Date January 2010
CreatorsWang, Nan
ContributorsDonald L Smith (Supervisor)
PublisherMcGill University
Source SetsLibrary and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada
LanguageEnglish
Detected LanguageFrench
TypeElectronic Thesis or Dissertation
Formatapplication/pdf
CoverageMaster of Science (Department of Plant Science)
RightsAll items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated.
RelationElectronically-submitted theses.

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