Pathogenic variants in the MMAB gene (OMIM 607958) are responsible for the cblB class of cobalamin-responsive methylmalonic aciduria (MMA) (OMIM 251110). MMAB encodes cobalamin adenosyltransferase, a mitochondrial enzyme responsible for the formation of adenosylcobalamin (AdoCbl). AdoCbl subsequently functions as a cofactor for methylmalonyl-CoA mutase (MCM) during the isomerization of L-methylmalonyl-CoA to succinyl-CoA. Somatic cells studies have been used to evaluate patient samples for cobalamin related disorders. Due to high basal levels of propionate incorporation, some patients with mild MMA biochemical phenotypes cannot be diagnosed by complementation analysis. A high resolution melting analysis (HRMA) assay was developed to rapidly scan the coding exons and flanking intronic regions for variants in the MMAB gene.Three cohorts of samples were scanned by HRMA: an unaffected reference population, 42 samples assigned to the cblB by complementation analysis and 181 patients with unresolved isolated MMA. HRMA correctly identified all of the previously reported mutations in the cblB cohort as well as seven additional variants including a novel nonsense variant (c.12C>A, p.C4X). Scanning of the unresolved MMA cohort identified six samples containing MMAB variants. Two samples, WG3948 and WG4034, contained compound heterozygous variants. They shared a c.572 G>A (p.R191Q) mutation. WG3948, the index case for this study, was found to have c.398 C>T (p.S133F) as the second mutation, and WG4034, the second patient, contained a novel variant c.394 C>T (p.C132R). Samples from four other affected patients contained a single variant. The c.572 G>A (p. R191Q) was found in both WG3546 and WG4090. WG3759 contained a c.521C>T ( p.S174L) substitution, and WG4029 contained a novel c.185 C>T (p.T62M) substitution. The identification of two patients with compound heterozygous variants in the MMAB gene suggests the existence of an infrequent but distinct atypical cblB phenotype. This subclass is characterized by levels of propionate incorporation and of AdoCbl synthesis within reference ranges, preventing diagnosis by somatic cell studies. / Des variantes pathogéniques dans le gène MMAB (OMIM 607958) sont responsables de la classe cblB d'acidurie méthylmalonique (AMM) respondant à la cobalamine (OMIM 251110). MMAB encode cobalamine adénosyltranférase, une enzyme mitochondriale responsable de la formation de l'adénosylcobalamine (AdoCbl). AdoCbl fonctionne par la suite en tant que cofacteur pour méthylmalonyl-CoA mutase (MCM) durant l'isomérisation de L-méthylmalonyl-CoA vers succinyl-CoA. Des analyses sur des cellules somatiques ont été utilisées pour évaluer des échantillons de patients pour des troubles reliés à la cobalamine. En raison de niveaux de base élevés d'incorporation de propionate, certains patients présentant des phénotypes biochimiques bénins d'AMM ne peuvent être diagnostiqués par analyse de complémentation. Une analyse de fusion à haute résolution (AFHR) a été développée pour balayer rapidement les exons codants et les régions introniques avoisinnantes pour des variantes dans le gène MMAB.Trois cohortes d'échantillons ont été balayées par AFHR : une population de référence non-affectée, 42 échantillons assignés au groupe cblB par analyse de complémentation et 181 patients avec une AMM isolée sans diagnostique. L'AFHR a correctement identifié toutes les mutations précédemment rapportées dans la cohorte cblB ainsi que sept variantes additionelles, incluant une nouvelle variante non-sens (c.12C>A, p.C4X). Le balayage de la cohorte avec de l'AMM isolée a identifié six échantillons contenant des variantes dans MMAB. Deux échantillons, WG3948 et WG4034, étaient des porteurs de variantes hétérozygotes composés. Ils partageaient la mutation c.572G>A (p.R191Q). WG3948, le cas index pour cette étude, était porteur du c.398C>T (p.S133F) pour la deuxième mutation et WG4034, le deuxième patient, contenait une nouvel variante c.394C>T (p.C132R). Les échantillons provenant de quatre autres patients atteints contenait une seule variante. Le c.572G>A (p.R191Q) a été trouvé dans WG3546 et WG4090. WG3759 contenait une substitution c.52C>T (p.S174L), et WG4029 contenait une nouvelle substitution c.185C>T (p.T62M).L'identification de deux patients avec des variantes hétérozygotes composées dans le gène MMAB suggère l'existence d'un phénotype rare mais distinct de cblB. Cette sous-classe est charactérisée par des niveaux d'incorporation de propionate et de synthèse d'AdoCbl dans les valeurs normales, empêchant le diagnostique par analyse des cellules somatiques.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.110564 |
| Date | January 2012 |
| Creators | Illson, Margaret |
| Contributors | Brian Gilfix (Internal/Cosupervisor2), David Rosenblatt (Internal/Supervisor) |
| Publisher | McGill University |
| Source Sets | Library and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation |
| Format | application/pdf |
| Coverage | Master of Science (Department of Human Genetics) |
| Rights | All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated. |
| Relation | Electronically-submitted theses. |
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