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Previous issue date: 2013-03-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / In vitro and in animal models, APE1, OGG1, and PARP-1 have been proposed as being involved with inflammatory response. In this work, we have investigated if the SNPs APE1 Asn148Glu, OGG1 Ser326Cys, and PARP-1 Val762Ala are associated to meningitis and also developed a system to enable the functional analysis of polymorphic proteins. Patients with bacterial meningitis (BM), aseptic meningitis (AM) and controls (non-infected) genotypes were investigated by PIRA-PCR or PCR-RFLP. DNA damages were detected in genomic DNA by Fpg treatment. IgG and IgA were measured from plasma and the cytokines and chemokines were measured from cerebrospinal fluid samples using Bio-Plex assays. The levels of NF-?B and c-Jun were measured in CSF by dot blot assays. A significant (P<0.05) increase in the frequency of APE1 148Glu allele in BM and AM patients was observed. A significant increase in the genotypes Asn/Asn in control group and Asn/Glu in BM group was also found. For the SNP OGG1 Ser326Cys, the genotype Cys/Cys was more frequent (P<0.05) in BM group. The frequency of PARP-1 Val/Val genotype was higher in control group (P<0.05). The occurrence of combined SNPs increased significantly in BM patients, indicating that these SNPs may be associated to the disease. Increasing in sensitive sites to Fpg was observed in carriers of APE1 148Glu allele or OGG1 326Cys allele, suggesting that SNPs affect DNA repair activity. Alterations in IgG production were observed in the presence of SNPs APE1Asn148Glu, OGG1Ser326Cys or PARP-1Val762Ala. Reductions in the levels ofIL-6, IL-1Ra, MCP-1/CCL2and IL-8/CXCL8 were observed in the presence of APE1148Glu allele in BM patients, however no differences were observed in the levels of NF-?B and c-Jun considering genotypes and analyzed groups. Using APE1 as model, a system to enable the analysis of cellular effects and functional characterization of polymorphic proteins was developed using strategies of cloning APE1 cDNA in pIRES2-EGFP vector, cellular transfection of the construction obtained, siRNA for endogenous APE1 and cellular cultures genotyping. In conclusion, we obtained evidences of an effect of SNPs in DNA repair genes on the regulation of immune response. This is a pioneering work in the field that shows association of BER variant enzymes with an infectious disease in human patients, suggesting that the SNPs analyzed may affect immune response and damage by oxidative stress level during brain infection. Considering these data, new approaches of functional characterization must be developed to better analysis and interactions of polymorphic proteins in response to this context / Estudos in vitro e em modelos animais sugerem que as prote?nas de reparo de DNA da via de reparo por excis?o de bases (do ingl?s, BER) APE1, OGG1 e PARP-1 est?o envolvidas tamb?m na resposta inflamat?ria. Neste trabalho foi investigado se os SNPs APE1 Asn148Glu, OGG1 Ser326Cys e PARP-1 Val762Ala associam-se ? meningite, e foi desenvolvido um sistema para an?lise funcional destas variantes polim?rficas. Os gen?tipos de pacientes com meningite bacteriana (MB), meningite ass?ptica (MA) e n?o infectados (controles) foram investigados por PIRA-PCR ou PCR-RFLP. Danos no DNA gen?mico foram detectados por meio de tratamento com Fpg. IgG e IgA foram titulados no plasma e citocinas e quimiocinas foram mensuradas em amostras de l?quor atrav?s de ensaios em Bio-Plex. Os n?veis de NF-?B e c-Jun foram dosados no l?quor dos pacientes por meio de dot blot. Foi observado um aumento significativo (P<0.05) na frequ?ncia do alelo APE1 148Glu nos casos de MB e MA. Os gen?tipos Asn/Asn no grupo controle e Asn/Glu no grupo da MB tamb?m apresentaram relevante aumento em suas frequ?ncias (P<0.05). Para o SNP OGG1 Ser326Cys, o gen?tipo Cys/Cys esteve mais frequente (P<0.05) nos casos de MB. A frequ?ncia do gen?tipo PARP-1 Val/Val foi mais alta no grupo controle (P<0.05). A ocorr?ncia combinada dos SNPs foi significativamente alta nos pacientes com MB, indicando que estes SNPs podem estar associados ? doen?a. Os portadores do alelo APE1 148Glu ou OGG1 326Cys apresentaram um n?mero maior de s?tios sens?veis ? Fpg, sugerindo que os SNPs afetam a atividade de reparo do DNA. Altera??es na s?ntese de IgG foram observadas na presen?a dos SNPs APE1 Asn148Glu, OGG1 Ser326Cys ou PARP-1 Val762Ala. Redu??es nos n?veis de IL-6, IL-1Ra, MCP-1/CCL2 e IL-8/CXCL8 foram encontradas na presen?a do alelo APE1 148Glu em amostras de pacientes com MB, no entanto n?o foram encontradas diferen?as nos n?veis de NF-?B e c-Jun considerando os gen?tipos e os grupos analisados. Utilizando APE1 como modelo, foi desenvolvido um sistema que possibilita a express?o e caracteriza??o funcional das enzimas polim?rficas estudadas e seus efeitos na c?lula, por meio de clonagem, utilizando o vetor pIRES2-EGFP e cDNA de APE1, transfec??o celular da constru??o obtida, inibi??o por siRNA de APE1 end?gena e genotipagem de culturas celulares. Em conclus?o, foram obtidas evid?ncias de um efeito significativo dos SNPs nos genes de reparo de DNA na regula??o da resposta imunol?gica. Este ? um trabalho pioneiro na ?rea, que demonstra a associa??o de variantes das enzimas da via BER com uma doen?a infecciosa em humanos, sugerindo que os SNPs estudados podem afetar a resposta imune e o impacto do n?vel de estresse oxidativo durante a infec??o cerebral. Desta forma, novos meios de an?lise funcional devem ser desenvolvidos para estudo de prote?nas polim?rficas e suas intera??es neste contexto / 2020-01-01
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufrn.br:123456789/12651 |
| Date | 21 March 2013 |
| Creators | Silva, Thayse Azevedo da |
| Contributors | CPF:00297997750, http://lattes.cnpq.br/1083882171718362, Saffi, Jenifer, CPF:62235818072, http://lattes.cnpq.br/3179264934205423, Lajus, Tirzah Braz Petta, CPF:03254085485, http://lattes.cnpq.br/9979644969955564, Vallinoto, Ant?nio Carlos Ros?rio, CPF:31952615291, http://lattes.cnpq.br/3099765198910740, Souza, Sandro Jos? de, CPF:70990409953, http://lattes.cnpq.br/8479967495464590, Lima, Lucymara Fassarela Agnez |
| Publisher | Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Programa de P?s-Gradua??o em Biotecnologia, UFRN, BR, Biotecnologia Industrial; Biotecnologia em Agropecu?ria; Biotecnologia em Recursos Naturais; Biotecn |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFRN, instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte, instacron:UFRN |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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