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Previous issue date: 2006-12-01 / Cellulose is the world s most abundant polymer, being the main constituent of plant
biomass. Genes from CesA family, that encodes the cellulose synthase enzyme, was
identified in several plant species, especially in Arabidopsis thaliana, in which three of
them (AtCesA4, AtCesA7 e AtCesA8) were associated with secondary cell wall cellulose
production. Eucalyptus species represent an important target of genetic improvement
studies, since it is the most planted forest genus in the world, beyond deserving a special
place in the international market of cellulose and paper. The molecular breeding
technology enables that gene characterization can be applied to forest species genetic
improvement programs with the aim to improve the quality and productivity of its
products. In this work, 320 Eucalyptus ESTs, separated in four genes related with cellulose
production in secondary cell wall, using AtCesA4, AtCesA7 e AtCesA8 genes as reference.
For these genes, primers were designed in order to screen an Eucalyptus BACs library. An
emphasis was given to genes that are orthologs to AtCesA7 from Arabidopsis thaliana for
witch it was sequenced a 1197 base pairs region from the BACs library and this served as a
support to expression level studies of this genes in different species/tissues, showing that
this is preferentially expressed in xylem and weakly expressed in leaves. The expression
level of this gene was higher in E. urophylla than in other species studied. Sequences from
approximately 500bp was obtained from different Eucalyptus species and in these, with
one intron between two exons, the amount of SNPs in the intron (4), as waited, was higher
than that found in exons (1 in each), although the intron nucleotide diversity index (π)
(0,0824) were less than in the exon (0,2029). In this manner, one expects that this work can
contribute for one better understanding of the mechanisms involved in biosynthesis and regulation of the cellulose pathway in Eucalyptus species, as well as subsidize genetic
mapping studies and linkage disequilibrium analysis for this genus. / A celulose é o polímero mais abundante do planeta, sendo o principal constituinte
da biomassa das plantas. Genes da família CesA, que codificam a enzima celulose sintase
foram identificados em diversas espécies de plantas, especialmente em Arabidopsis
thaliana, na qual três deles (AtCesA4, AtCesA7 e AtCesA8) foram correlacionados com a
produção de celulose na parede celular secundária. Espécies de Eucalyptus constituem um
importante alvo de estudos de melhoramento genético, já que é o gênero florestal mais
plantado no mundo, além de merecer destaque no mercado internacional de papel e
celulose. A tecnologia de melhoramento molecular possibilita que a caracterização de
genes de interesse possa ser aplicada a programas de melhoramento genético de espécies
florestais visando o aumento da qualidade e produtividade dos seus produtos. Neste
trabalho, 320 ESTs de Eucalyptus, divididos em quatro genes, responsáveis pela produção
de parade celular secundária foram anotados, utilizando-se como referência os genes
AtCesA4, AtCesA7 e AtCesA8. Para estes genes, primers foram desenhados a fim de que
uma triagem em uma biblioteca de BACs de Eucalyptus fosse realizado. Uma maior ênfase
foi dada ao gene ortólogo ao gene AtCesA7 de Arabidopsis thaliana para o qual foi
seqüenciado uma região de 1197 pares de base à patir da biblioteca de BACs e esta serviu
de base para estudo do nível de expressão desse gene em diferentes espécies/tecidos,
revelando que este é preferencialmente expresso em tecidos de xilema e fracamente
expresso em folhas, o que corrobora com a atuação desses genes em paredes celulares
secundárias. O nível de expressão desse gene foi maior em E. urophylla que em outras
espécies estudadas. Seqüências de aproximadamente 500 pb também foram obtidas à partir
de diferentes espécies de Eucalyptus e nestas, contendo um íntron flanqeado por dois éxons, observou-se que a quantidade de SNPs identificados no íntron (4), como esperado,
foi maior do que aquela encontrada nos éxons (1 em cada), embora o valor estimado para o
índice de diversidade nucleotídica (π) relativo ao íntron (0,0824) tenha sido menor do que
aquele estimado em um dos éxons (0,2029). Desse modo, espera-se que esse trabalho possa
contribuir para uma melhor compreensão dos mecanismos envolvidos na biossíntese e
regulação da via de celulose em espécies de Eucalyptus, bem como subsidiar estudos de
mapeamento genético e análise de desequilíbrio de ligação nesse gênero.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tde/1250 |
| Date | 01 December 2006 |
| Creators | SALAZAR, Marcela Mendes |
| Contributors | COELHO, Alexandre Siqueira Guedes |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Mestrado em Biologia, UFG, BR, Ciências Biolóicas |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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