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Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular. / Proposal and implementation of a parallel processing system for molecular dynamics.

Neste trabalho, propomos um método de paralelização de simulações de dinâmica molecular para execução em máquinas de memória distribuída, trabalhando sob passagem de mensagens. Nos limitamos à análise de implementação de sistemas com ensemble microcanônico de partículas de Lennard-Jones, desenvolvendo no entanto um sistema que pode ser expandido para incluir outras características. Mostramos que o sistema apresenta bom desempenho com relação à paralelização, representando uma alternativa viável para a simulação de sistemas com muitas partículas. / A method for parallelization of molecular dynamics simulations in distributed memory machines operating under the message-passing paradigm is proposed. Even though the analysis and implementation presented in this work were primarily restricted to the system model known as microcanonical emsemble of Lennard--Jones particles. the obtained system can easily be adapted for inclusion of other characteristics. It is shown t,hat. the developed system is well suited for parallelization, resulting in a feasible a1ternative for simulation of many-particle systems.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:teses.usp.br:tde-18042007-143803
Date25 May 1993
CreatorsGonzalo Travieso
ContributorsJan Frans Willem Slaets, Eduardo Whitaker Bergamini, Luciano da Fontoura Costa, Roland Koberle, José Pedro Rino
PublisherUniversidade de São Paulo, Física, USP, BR
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
Sourcereponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP, instname:Universidade de São Paulo, instacron:USP
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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