Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal. / L'inférence d'un modèle tridimensionnel (3-D) d'une molécule d'ARN à partir d'informations biochimiques de faible résolution est une tâche complexe. Le développement de méthodes efficaces et objectives de modélisation est essentiel à
la compréhension des mécanismes moléculaires impliquant des ARN. Le présent
travail propose trois ajouts importants de ce domaine. Dans un premier temps,
une définition de l'espace des conformations d'un ARN est établie et la technique
de retour-arrière est décrite de façon à permettre une exploration complète de
cet espace. Ensuite, un formalisme basé sur la logique floue est présenté. Cette
approche permet d'utiliser l'information provenant de séquences multiples et est
appliquée pour la modélisation du ribozyme activé par le plomb. Finalement, la
flexibilité d'un système de modélisation 3-D utilisant une approche de satisfaction
de contrainte est mise en évidence par l'ajout d'un nouveau type de contrainte
dans l'engin de recherche, permettant la modélisation efficace de multimères cycliques.
Ces ajouts permettent d'élargir le spectre des informations utiles à
la modélisation 3-D des ARN et facilite l'intégration de nouveaux types
d'informations à l'intérieur d'une méthode systématique. Les résultats obtenus
sur des projets de modélisation spécifiques (ribozyme activé par le plomb et pRNA
de çi>29) permettent de confirmer la pertinence de cette approche.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:umontreal.ca/oai:papyrus.bib.umontreal.ca:1866/32980 |
| Date | 12 1900 |
| Creators | Lemieux, Sébastien |
| Contributors | Major, François |
| Source Sets | Université de Montréal |
| Language | fra |
| Detected Language | French |
| Type | thesis, thèse |
| Format | application/pdf |
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