Orientadora: Profa. Dra. Káthia Maria Honório / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Ciência & Tecnologia - Química, 2014. / Este trabalho propoe o uso de tecnicas de modelagem molecular para entender os principais fatores relacionados com a interacao entre um conjunto de ligantes bioativos e o receptor TGF-¿À tipo 1 (ALK5), alvo biologico envolvido no desenvolvimento de doencas como cancer e fibrose. Para entender essas interacoes, foram utilizadas tecnicas computacionais de modelagem molecular que sao utilizadas para quantificar essas interacoes. Dentre as metodologias utilizadas neste trabalho, foram empregadas tecnicas de acoplamento molecular e analises das relacoes quantitativas tridimensionais entre estrutura quimica e atividade biologica (QSAR 3D). Dessa forma, foi estudado um conjunto de dados contendo 70 moleculas empregando tecnicas de QSAR 3D (CoMFA e CoMSIA). Os modelos CoMFA obtidos apresentaram significativos valores de validacao interna (r2 = 0,979 e q2LOO = 0,882) e externa (conjunto de predicao - r2pred = 0,998 e potencial preditivo externo . r2m= 0,998) e os modelos obtidos da analise CoMSIA tambem apresentaram valores significativos de validacao interna (r2 = 0,913 e q2LOO = 0,822) e validacao externa (conjunto de predicao - r2pred = 0,975 e potencial preditivo externo . r2m = 0,975. A analise dos mapas de contribuicoes estereoquimicas e eletrostaticas (CoMFA) e dos mapas de contribuicoes eletrostaticas e dos grupos doadores de ligacao de hidrogenio (CoMSIA) para o composto mais ativo e menos ativo foi capaz de indicar caracteristicas importantes para a inibicao do alvo biologico em estudo. Portanto, o emprego de metodologias computacionais foi de fundamental importancia para o entendimento sobre os principais fatores envolvidos na interacao entre os ligantes estudados e o receptor ALK5. / This study proposes the use of molecular modeling techniques to understand the main factors related to the interaction between a set of ligands and bioactive TGF-â receptor type 1 (ALK5), biological target involved in the development of diseases such as cancer and fibrosis. To understand these interactions, computational molecular modeling techniques were used, which are used to quantify these interactions. Among the methodologies used in this study, techniques of molecular docking and analyses of three-dimensional quantitative relations between chemical structure and biological activity (3D QSAR) were performed with the goal of understanding the main physico-chemical features related to the biological activity. Thus, we studied a data set containing 70 molecules and 3D QSAR analyses (CoMFA and CoMSIA) were carried out. The CoMFA models have good statistical parameters (r2 =0.979 and q2LOO =0.882) and a significant predictive power (r2pred=0.998 and r2m = 0.998). The CoMSIA models also showed significant values for the internal validation (r2=0.913 and q2LOO =0.822) and the external validation (r2pred=0.975 and r2m=0.975). The analysis of the steric and electrostatic contributions (CoMFA), as well as the electrostatic contributions and donor groups for hydrogen bonding (CoMSIA) for the most active and least active compounds was able to indicate important characteristics of inhibiting the biological target under study. Therefore, the use of computational methodologies was of fundamental importance to understand the main factors involved in the interaction between the studied ligands and the ALK5 receptor.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:BDTD:76582 |
| Date | January 2014 |
| Creators | Almeida, Michell de Oliveira |
| Contributors | Honório, Káthia Maria, Braz, Antônio Sérgio Kimus, Comar Júnior, Moacyr, Cordeiro, Rodrigo Maghdissian, Trossini, Gustavo Henrique Goulart |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Unknown |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf, 95 f. : il. |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFABC, instname:Universidade Federal do ABC, instacron:UFABC |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=76582&midiaext=69718, http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=76582&midiaext=69717, Cover: http://biblioteca.ufabc.edu.brphp/capa.php?obra=76582 |
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