Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / Um dos desafios da FÃsica TeÃrica à a tentativa de explorar como seus conceitos e tÃcnicas podem ser aplicados à Biologia para descrever a dinÃmica da matÃria viva. A complexidade da estrutura e organizaÃÃo dos sistemas biolÃgicos conduz a efeitos nÃo-lineares onde à possÃvel a manifestaÃÃo de mecanismos solitÃnicos. Uma forma atrativa de se estudar a propagaÃÃo de energia vibracional em biopolÃmeros, tais como proteÃnas, à baseada em modelos de redes nÃo-lineares. Na dÃcada de 1970, Davidov sugeriu que os modos de vibraÃÃes intramoleculares de uma proteÃna estÃo relacionados Ãs interaÃÃes presentes nas deformaÃÃes de sua estrutura e propagam ao longo da cadeia polipeptÃdica com velocidade constante. Este à um comportamento de ondas solitÃrias (soluÃÃes de certas classes de equaÃÃes de onda nÃo-lineares). Os modelos bÃsicos utilizados para se estudar a dinÃmica nÃo linear de macromolÃculas polimÃricas trabalham com redes anarmÃnicas unidimensionais. No entanto, tais molÃculas sÃo tridimensionais e à necessÃrio levar em conta nÃo apenas deslocamentos longitudinais mas tambÃm deslocamentos transversais à cadeia. Com base no fato de que, no estado fundamental, uma macromolÃcula polimÃrica assume a forma de uma hÃlice, estudamos um modelo fÃsico que descreve a dinÃmica nÃo linear de polÃmeros, em particular, para uma proteÃna alfa-hÃlice, tratando com interaÃÃes entre monÃmeros de diferentes ciclos da hÃlice, responsÃveis por estabilizar a geometria espiral da molÃcula. As soluÃÃes numÃricas das equaÃÃes dinÃmicas obtidas para esta cadeia mostram que o modelo suporta soluÃÃes do tipo sÃliton. Analizamos ainda quais os valores aceitÃveis dos parÃmetros livres para que estas soluÃÃes existam. Mostramos de que forma os sÃlitons representam uma torÃÃo na molÃcula e como suas dinÃmicas descrevem a propagaÃÃo desta torÃÃo ao longo da cadeia protÃica.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.teses.ufc.br:5628 |
| Date | 20 July 2012 |
| Creators | Diego Frankin de Souza Veras |
| Contributors | Carlos Alberto Santos de Almeida |
| Publisher | Universidade Federal do CearÃ, Programa de PÃs-GraduaÃÃo em FÃsica, UFC, BR |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC, instname:Universidade Federal do Ceará, instacron:UFC |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
Page generated in 0.0015 seconds