Resumo: Genes e proteínas são de grande importância biológica para a compreensão de processos bioquímicos e requerem nomes consistentes. Existem diversas diretrizes para nomenclatura de genes, mas elas não são rigorosamente aplicadas à atribuição de nomes aos genes recém-identificados, gerando assim, inúmeras maneiras de nomear um mesmo gene. Este trabalho tem o objetivo de detectar e minimizar a redundância e a inconsistência de dados para colaborar com a identificação correta de genes. Para isso foram utilizadas técnicas de Inteligência Artificial para identificar os sinônimos realizando um estudo dirigido a dez experimentos distintos. Para selecionar os dados dos experimentos foi construído um banco de dados relacional para armazenar as informações constantes na base NR do NCBI e as informações identificadas neste estudo. Os dados do experimento foram minerados através das técnicas de mapas auto-organizáveis de Kohonen. A Rede SOM de Kohonen foi aplicada para exprimir as relações de similaridade entre os dados. Para identificação dos agrupamentos gerados pela rede SOM foi utilizada a técnica denominada Matriz-U. As informações resultantes deste trabalho permitem inferir os sinônimos dos genes, identificar prováveis nomes para genes nomeados como hipotéticos e apontar possíveis erros de anotação.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:dspace.c3sl.ufpr.br:1884/31637 |
| Date | 11 September 2013 |
| Creators | Otemaier, Kelly Rafaela |
| Contributors | Marchaukoski, Jeroniza Nunes, Steffens, Maria Berenice Reynaud, Universidade Federal do Paraná. Setor de Educação Profissional e Tecnológica. Programa de Pós-Graduação em Bioinformática |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPR, instname:Universidade Federal do Paraná, instacron:UFPR |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
Page generated in 0.0017 seconds