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Previous issue date: 2012-02-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / n Brazil three cotton species occur: G. barbadense, G. hirsutum and G. mustelinum, being the last wild and native of Brazil, found only in the semi-arid regions of Rio Grande do Norte and Bahia. The studied populations distribute themselves preferably near watercourses, like predominant vegetation of ciliary forest. The degradation of the environment by grazing of goats and anthropic activities, caused the reduction of these populations and consequently the variability. However, in spite of the low variability in these populations, this whole gene pool may in the future be useful in breeding programs. Therefore, the detailed knowledge of the structure of the existing variability is essential for a better use of this species as a resource of allelic variability. As commercial varieties have a narrow genetic base, due to the strong selection practiced for breeding and deriving mostly from only one species, G. hirsutum var. Latifolium, the use of new alleles is fundamental to increase allelic combinations, so that germplasm of wild species of the genus Gossypium, such as G. mustelinum, becomes an alternative for such an extension. In order to determine the variability and genetic structure of 16 natural populations of G. mustelinum, DNA extractions, PCR reactions with SSR markers were performed and the amplified alleles were used to estimate the allelic frequencies, the expected and observed heterosomy Genetic diversity analysis and Nei G statistics, as well as clustering analyzes, using the Nei and Neighbor-Joining distance. The distance between the genotypes was calculated based on the proportion of alleles using the MICROSAT program and the genotypes grouped from the UPGMA method in MEGA 4. To determine if the diversity of each of the populations was presented in an organized spatial structure, the matrix Genetic distance was compared to the physical distance matrix using the Mantel test. The results showed that the greatest diversity is found among populations, with a high level of intrapopulation inbreeding, probably due to the effects of genetic drift, evidenced by the high number of exclusive alleles. / No Brasil ocorrem três espécies de algodoeiro: G. barbadense, G. hirsutum e G. mustelinum, sendo a última silvestre e nativa do Brasil, encontrada, apenas no semi-árido dos Estados do Rio Grande do Norte e Bahia. As populações estudadas distribuem-se preferencialmente próximas de cursos de água, como vegetação predominante de mata ciliar. A degradação do ambiente por pastejo de caprinos e atividades antrópicas, provocou a redução dessas populações e consequentemente da variabilidade. Entretanto, apesar da reduzida variabilidade existente nessas populações, todo esse conjunto gênico poderá, futuramente, ser útil nos programas de melhoramento. Para tanto, o conhecimento detalhado da estruturação da variabilidade existente é essencial para melhor utilização dessa espécie como recurso de variabilidade alélica. Como as variedades comerciais apresentam base genética estreita, devido a forte seleção praticada para o melhoramento e derivarem em sua maioria de apenas uma espécie, a G. hirsutum var. latifolium, a utilização de novos alelos é fundamental para aumentar as combinações alélicas, de maneira que germoplasma de espécies silvestres do gênero Gossypium, como G. mustelinum, se torna uma alternativa para tal ampliação. Com o objetivo de determinar a variabilidade e estrutura genética de 16 populações naturais de G. mustelinum, foram feitas extrações de DNA, reações de PCR com marcadores SSR e os alelos amplificados foram empregados para estimar as frequências alélicas, a heterosigozidade esperada e observada, a análise de diversidade genética e as estatísticas G de Nei, como também, as análises de agrupamento, usando a distância de Nei e Neighbor-Joining. A distância entre os genótipos foi calculada com base na proporção de alelos usando o programa MICROSAT e os genótipos agrupados a partir do método de UPGMA no MEGA 4. Para determinar se a diversidade de cada uma das populações se apresentava numa estrutura espacial organizada, a matriz de distância genética foi comparada com a matriz de distância física usando o teste de Mantel. Os resultados demonstraram que a maior diversidade encontra-se entre as populações, com elevado nível de endogamia intrapopulacional, provavelmente devido aos efeitos de deriva genética, evidenciado pelo elevado número de alelos exclusivos.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:tede2:tede2/6528 |
| Date | 06 February 2012 |
| Creators | SILVA, Uiara Cavalcante |
| Contributors | Silva, Edson Ferreira da, Barroso, Paulo Augusto Vianna, Vaesey, Elisabeth Ann, Martins, Luiza Suely Semen |
| Publisher | Universidade Federal Rural de Pernambuco, Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas, UFRPE, Brasil, Departamento de Agronomia |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE, instname:Universidade Federal Rural de Pernambuco, instacron:UFRPE |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -6234655866848882505, 600, 600, 600, 600, -6800553879972229205, 2615607299470131967, 2075167498588264571 |
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