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Génétique moléculaire du glaucome : caractérisation du Locus GLC1D dans la population canadienne-française

Le glaucome primaire à angle ouvert (GPAO) est caractérisé par une dégénérescence du nerf optique causant une perte des champs visuels périphériques. Onze loci ont été cartographiés pour la maladie, mais seulement trois gènes ont été caractérisés: TIGR/myocilin, optineurin et WDR36. Cette étude utilise l'analyse de liaison génétique et le génotypage à haut débit pour cartographier les gènes responsables du GPAO dans la population fondatrice canadienne-française. Onze familles (365 individus) furent testées au locus GLC1D (8q23) par analyse de liaison génétique en utilisant des marqueurs microsatellites. Deux familles démontrant une liaison potentielle furent agrandies et une troisième famille fut aussi étudiée en profondeur. Nous avons aussi génotype 343 patients non apparentés et 73 individus normaux sur le même locus pour trouver une signature allélique commune. Des deux familles agrandies, une a démontré l'absence de liaison, tandis que l'autre semble être liée au locus GLC1D. Cette dernière famille (RN) possède une valeur lod maximale de 1,34 à 9 = 0,0 au marqueur D8S555. De plus, une autre famille (TB) possède une valeur lod maximale de 0,4 à 6 = 0,0 au marqueur D8S200, en utilisant un modèle de transmission autosomique dominante à pénétrance incomplète. Sauf pour une phénocopie, un haplotype caractéristique co-ségrégue avec la maladie dans chacune des deux familles. De plus, une signature allélique, comprises entre les marqueurs D8S1779 et D8S281, représentant une région de 0,46 cM (1,27 Mb), fut trouvée comme étant significativement plus fréquente chez les patients malades que chez les individus normaux Nos résultats démontrent que le GPAO dans deux des familles étudiées serait potentiellement lié au locus GLC1D sur le chromosome 8q23. De plus, la signature allélique découverte semble confirmer la présence d'un gène muté causant le glaucome dans cet intervalle. Cette signature permet en plus de prioriser un gène candidat, CSMD3, pour le séquençage. L'étape suivante sera d'entreprendre le séquençage des gènes candidats cartographiés dans cet intervalle, en commençant par CSMD3, pour trouver les mutations délétères. / Primary open angle glaucoma (POAG) is characterized by an optic nerve degeneration, which causes the lost of peripheral visual fields. Up to date, eleven loci have been mapped, but only three genes have been characterized: TIGR/myocilin, optineurin and WDR36. Our study uses genetic linkage analysis and high throughput genotyping to map genes responsible for POAG in the founding population of French Canadians. Eleven families (365 individuals) have been tested on the GLCID locus (8q23) by genetic linkage analysis, using microsatellite markers. Two families, who showed linkage potential, were further extended and a third family was also further studied. We have also genotyped 343 unrelated patients and 73 controls on this same locus to find possible common allelic signatures. Of the two extended families, one showed no signs of linkage, while the other seems to be linked to GLCID. This family (RN) has a maximum lod score value of 1,34 at 0 = 0,0 for marker D8S555. Furthermore, another family (TB) showed a maximum led score of 0,4 at 0 = 0,0 for marker D8S200, using an autosomal dominant transmission model with incomplete penetrance. Excluding one phenocopy, a common haplotype co-segregates with glaucoma in both these families. In addition, an allelic signature, located between markers D8S1779 and D8S281, representing a region of 0,46 cM (1,27 Mb), was found to he significantly more common in affected individuals when compared to controls. Our results demonstrate that POAG in two of the studied families is potentially linked to locus GLC I D on chromosome 8q23. Furthermore, the allelic signature found in this region only confirms with more evidence the presence of a disease causing gene. Additionally, this signature provides information permitting the prioritization of a particular candidate gene, CSMD3. The next step will be the sequencing of candidate genes mapped in the defined interval to find disease causing mutations.

Identiferoai:union.ndltd.org:LAVAL/oai:corpus.ulaval.ca:20.500.11794/18897
Date12 April 2018
CreatorsMarquis, Anik
ContributorsRaymond, Vincent
Source SetsUniversité Laval
LanguageFrench
Detected LanguageFrench
Typemémoire de maîtrise, COAR1_1::Texte::Thèse::Mémoire de maîtrise
Formatix, 81 f., application/pdf
CoverageQuébec (Province)
Rightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2

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