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Hermes Pedreira EStudo molecular dos vírus B e C...2010.pdf: 5589974 bytes, checksum: b86706272dbb22d0d349edae7d641ce1 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-19T21:21:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2010 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, Bahia, Brasil / Infecções pelos vírus B e C das hepatites constituem um significante problema de
saúde pública em todo mundo. Mais de 350 milhões de pessoas estão
cronicamente infectadas pelo VHB e 170 milhões pelo VHC. No Brasil, a
prevalência de pessoas infectadas pelo VHB varia de baixa endemicidade (<2%)
até alta, (>7%), e estima-se que 1,5% da população esteja infectada pelo VHC
(WHO). Estudos recentes tem demonstrado consideráveis variações entre os
isolados do VHB, confirmando a diversidade de genótipos do vírus circulantes e o
surgimento de mutações no genoma viral que podem ter impacto na resposta
terapêutica e imune. Informações sobre a diversidade genética do VHB serão de
grande valor para determinar fatores de risco associados a disseminação do vírus
e auxiliar na adoção de medidas de prevenção e terapêutica. A infecção pelo VHC
tornou-se um sério problema de saude pública desde que não existe uma vacina
disponível e o tratamento é extremamente caro para os órgãos públicos como
desgastante para o paciente. Este trabalho utilizou as ferramentas moleculares e
de epidemiologia no estudo destes vírus para caracterizar molecularmente os vírus
B e C das hepatites nas Regiões Norte e Nordeste, particularmente na Bahia,
através de sequenciamento de DNA e análises filogenéticas. Amostras de
pacientes provenientes da Bahia, Acre, Rondonia, Amazonas, Maranhão e
Tocantins foram analisadas. As amostras foram oriundas de outros estudos e de
centros de referência para tratamento das hepatites, sendo avaliadas 635
amostras para o VHC e 335 de VHB. Sequencias das regiões pré-S/S e pré-
Core/Core do VHB e NS5b, 5UTR, E1 e Core do VHC foram utilizadas para
classificação genotípica e análise filogenetica. Os genótipos mais frequentes para
o VHB foram A (57%), D (10%) e F(33%) na Bahia e nas amostras da região
Norte. Nós encontramos em nosso estudo 55,6% de pacientes co-infectados com
VHB/Delta. Não foi possível estabelecer uma ligação genótipo específico com a
evolução da infecção, e determinar a presença de mutantes relacionados à
resposta terapêutica e ao escape imunológico. Com relação ao VHC, a subtipagem
dos isolados foi realizada através do sequenciamento da região NS5b e 5UTR
(n=230). Os sub-genótipos mais frequentes foram 1a(45,6%), 1b (46,9%), 3a
(6,5%) e 2a/b(0,8%). As regiões E1 e Core também foram sequenciadas e no
futuro serão utilizadas para avaliar possiveis mutações. O presente estudo mostra
que a aplicação de protocolos de sequenciamento, bioinformática e filogenia são
indispensáveis para a compreensão da epidemiologia molecular dos vírus das
hepatites. / Infections with hepatitis B and C viruses constitute a significant public health
problem worldwide. More than 350 million people are chronically infected with HBV
and 170 million by HCV. In Brazil, HBV remains endemic despite widespread
vaccination with prevalence of infection ranging from (<2%) low endemicity, until
high (>7%) in different regions. Prevalence of HCV infection in Brazil has been
estimated at 1.5%. Recent studies have shown considerable genetic variation
among HBV isolates, confirming the diversity of circulating genotypes of the virus
and the emergence of mutations in the viral genome that may impact on
therapeutic and immune response. Information on the genetic diversity of HBV is
useful for molecular epidemiology to determine risk factors associated with the
spread of the virus and to inform prevention strategies and for monitoring therapy.
Because there is no vaccine available to prevent HCV infection and treatment is
extremely expensive for public agencies, HCV is an emerging public health
problem. The treatment efficiency is directly related to viral genotype. In this study
molecular epidemiology tools were used to characterize HBV and HCV in the North
and Northeast, particularly in Bahia, through DNA sequencing and phylogenetic
analysis. Samples from Bahia, Acre, Rondônia, Amazonas, Maranhão and
Tocantins were analyzed. The samples were collected in collaboration with other
studies and centers of references for hepatitis treatments. 635 samples from HCV
infected patients and 335 samples from HBV infected were evaluated. Sequences
of the regions pre-S / S, HBV core / pre-core, NS5B, 5UTR, HCV Core and E1
were used for genotypic classification and phylogenetic analysis. The most frequent
HBV genotypes were A (57%), D (10%) and F (33%) in Bahia and in the samples
from the North region. Fifty five percent of the patients from Rondônia were coinfected
with HBV and HDV. In this study, we were unable to establish a
connection with the particular genotype evolution of the infection and determine the
presence of mutants related to therapeutic response and immune escape. In the
North region co-infection with HBV genotype F and D virus is strongly associated
with poor outcome of the disease as informed by the physicians and literature.
Regarding HCV, the subtyping of isolates was performed by sequencing the NS5B
region and 5UTR (n=230). The sub-genotypes more frequent were 1a (45.6%), 1b
(46.9%), 3a (6.5%) and 2a / b (0.8%). The Core and E1 regions were also
sequenced and in the future could be used to evaluate possible mutations. This
study shows that the implementation of protocols for sequencing, bioinformatics
and phylogenetic are essential for understanding the molecular epidemiology of
hepatitis.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.arca.fiocruz.br:icict/4219 |
| Date | January 2010 |
| Creators | Silva Filho, Hermes Pedreira da |
| Contributors | Reis, Mitermayer Galvão dos, Reis, Mitermayer Galvão dos |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, instname:Fundação Oswaldo Cruz, instacron:FIOCRUZ |
| Rights | Hermes Pedreira da Silva Filho, info:eu-repo/semantics/openAccess |
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