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Previous issue date: 2013-01-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The HLA-E locus is a Human Major Histocompatibility Complex (MHC) gene
associated with immune-modulation and suppression of the immune response by the
interaction with specific NK and T cell receptors. The HLA-E gene is considered the
most conserved locus in the human HLA; however, this low variability might be a
consequence of the scarce number of studies focusing this subject. In this mastering
thesis we assessed the HLA-E coding and 3’ untranslated region variability in a
group of individuals from Brazil and the results were evaluated together with data
from the 1000Genomes Consortium. Altogether, only 28 variation sites were found in
approximately 2724 bp evaluated. These variation sites were arranged into 33
haplotypes, most of them (98.2%) encoding one of the two HLA-E molecules found
worldwide, i.e., the molecules associated with the allele groups E*01:01 and E*01:03.
Interestingly, 85% of all haplotypes were represented by only three different
sequences, each of them associated with one of the main known HLA-E coding
alleles, E*01:01:01, E*01:03:01 and E*01:03:02, all of them found worldwide. This
phenomenon, together with the comparisons with other primate sequences, reveals
that these two main allele groups (and molecules) arose early before human
speciation, and indicates that E*01:03:01 might be the oldest allele. In addition, the
low nucleotide diversity found for the HLA-E coding and 3’UTR in worldwide
populations suggests that the HLA-E gene is in fact a conserved gene, which might
be a consequence of its key role in the modulation of the immune system. / O loco HLA-E é um gene do Complexo Principal de Histocompatibilidade
Humano (MHC), cujo produto está relacionado com a modulação e supressão da
resposta imunitária por meio da interação com receptores específicos das células
NK e linfócitos T. O gene HLA-E é considerado o loco menos polimórfico dos genes
do complexo HLA, no entanto, esta baixa variabilidade pode ser uma consequência
do pequeno número de estudos realizados sobre esse tema. No presente trabalho, a
variabilidade das regiões codificadoras e 3’ não traduzida do gene HLA-E foi
analisada em amostras brasileiras e os resultados foram comparados com dados
obtidos pelo projeto 1000Genomes. Considerando todas as populações avaliadas,
apenas 28 pontos de variação foram encontrados em uma região de
aproximadamente 2724-pb. Estes pontos de variação estão arranjados em 33
haplótipos diferentes, a maioria deles (98%) codificando uma das duas moléculas
HLA-E frequentemente encontradas, E*01:01 e E*01:03. Ainda, 85% dos haplótipos
encontrados foram representados por apenas três sequências diferentes, cada uma
deles associada a um dos principais alelos da região codificadora do gene HLA-E,
E*01:01:01, E*01:03:01 e E*01:03:02. Todas essas sequências foram encontradas
em todas as populações avaliadas. Este fenômeno, em conjunto com as
comparações envolvendo sequências de primatas, sugere que estes dois grupos de
alelos principais (e moléculas) surgiram antes da especiação e dispersão humana,
além de indicar que o alelo E*01:03:01 pode ser o mais antigo dentre os demais.
Ainda, a baixa diversidade nucleotídica encontrada para a região codificadora e 3'
NT do gene HLA-E em populações de todo o mundo sugere que este gene é, de
fato, bastante conservado, provavelmente devido ao seu papel chave na modulação
das respostas imunes.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/3597 |
| Date | 31 January 2013 |
| Creators | Felício, Leandro Prado |
| Contributors | Castelli, Erick da Cruz, Castelli, Erick da Cruz, Telles, Mariana Pires de Campos, Mendes Júnior, Celso Teixeira |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Biologia (ICB), UFG, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas - ICB (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 6883982777473437920, 600, 600, 600, 600, -3872772117827373404, -1634559385931244697, -2555911436985713659 |
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