Leishmaniasis is an important parasitic disease for which no test with 100% sensitivity and/or specificity exists. We studied pre- and post-treatment sera (n=49) from patients with Old and New World cutaneous leishmaniasis (CL) as well as pre-treatment sera (n=45) from visceral leishmaniasis (VL) cases from Nepal. In all cases, samples were fractionated, bound on CM10 and IMAC30 arrays and read by surface-enhanced, laser desorption and ionization, time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF-MS). Data were analyzed using CiphergenExpress (creating M/z scatter plots, p-values and ROC) and Biomarker Pattern Software (building decision trees). We attempted to visualize on gel all biomarkers detected in both software programs. Three of the 14 most promising candidate biomarkers for CL and 4 of 15 candidate biomarkers for VL were visible. These bands were cut and sequenced by LC-MS-MS. This allowed us to identify various proteins as possible biomarkers in CL and VL patients. / La leishmaniose est une maladie parasitaire pour laquelle aucun test de sensibilité et/ou spécificité égale à 100% n'existe. Nous avons étudié des sérums (n = 49) pré- et post-traitement de patients atteints de leishmaniose cutanée (LC) de l'ancien et du nouveau monde de même que des sérums (n = 45) prétraitement de cas de leishmaniose viscérale (LV) du Népal. Tous les échantillons ont été fractionnés et sont retenues sur une surface chromatographique phase solide appelée ‘Chip' (CM10 et IMAC30) et lus par SELDI-TOF-MS (Surface Enhanced Laser Desortion and Ionization, Time-of-Flight Mass Spectrophotometry). Les résultats ont été analysés par les programmes Ciphergen Express (en utilisant des graphique M/z, p-values et ROC) et Biomarker pattern Software (en créant des arbres décisionels). Nous avons tenté de visualiser sur gel tous les marqueurs biologiques détectés par les deux programmes d'analyse. Trois des 14 marqueurs biologiques pour LC et 4 des 15 marqueurs biologiques pour VL ont pu être visualisés. Les bandes ont été sectionnées et séquencées par LC-MS-MS. Ceux ci nous permis aidé à identifier des marqueurs biologiques dans les LC et LV patients.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.21994 |
| Date | January 2008 |
| Creators | Fussi, Manfred |
| Contributors | Brian Ward (Internal/Supervisor), Greg J Matlashewski (Internal/Cosupervisor2) |
| Publisher | McGill University |
| Source Sets | Library and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation |
| Format | application/pdf |
| Coverage | Master of Science (Department of Microbiology & Immunology) |
| Rights | All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated. |
| Relation | Electronically-submitted theses. |
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