Rationale: Traditional tuberculosis contact investigation focuses primarily on contacts named by the active case, most frequently family and friends. Geographic information systems (GIS) could be a novel tool for the identification of shared locations where there may be ongoing transmission. Methods: We conducted a retrospective review of public health charts for all 1536 active TB cases in Montreal from January 1996 to December 2004 inclusively. Patients' addresses for residential, work, school and social locations were abstracted and geo-coded. We then used Crimestat and R software to identify case points within a 15 meter radius of one another. M. tuberculosis isolates underwent IS6110-based genotyping, which we used as the gold standard to determine transmission. Results: Isolates from 1043 cases were successfully fingerprinted and compared. 165 (15.8%) were assigned to 57 different clusters ranging in size from 2 to 11 members, based on identical numbers and molecular weights of IS6110 bands; the remaining 878 had unique genotypes. 1284 locations were successfully geo-coded, including 196 of those with genotypic matches. Of these 196 locations with genetic matches, only 17 (8.7%) TB cases shared locations within 15 meters with other members of the same RFLP-defined cluster. However, using bootstrapping techniques to compare samples of equal size, of the 1088 locations for unique cases, a mean of 18.34 cases (95% CI: 7.94 - 28.64) were within 15 meters of at least one other case. Conversely, among 348 instances of shared locations, 17 (4.9%) revealed matching genotypes. Conclusion: In a retrospective analysis where most locations referred to home addresses of persons with active TB, there was limited overlap between shared locations and shared mycobacteria. These analyses show that the conventional data collected by public health officials does not identify all locations or explain all instances of local transmission, thus limiting their ability to intervene / Introduction : La méthode traditionnelle d'évaluation des contacts d'un cas actif de tuberculose (TB) se concentre principalement à l'identification des noms des personnes contacts par le cas actif. Les systèmes d'information géographiques (SIG) pourraient être des outils nouveaux servant à identifier des lieux communs où la transmission peut se dérouler. Méthode : Nous avons réalisé une étude rétrospective à partir des dossiers de la santé publique de tous les 1536 cas de TB active sur l'île de Montréal de janvier 1996 à décembre 2004. Les adresses des résidences, du travail, de l'école et des activités sociales des patients ont été recueillies et géocodées. Nous avons alors utilisé les logiciels Crimestat et R afin d'identifier les cas situés dans un rayon de 15 mètres les uns des autres. Le génotypage des souches de M. tuberculosis a été effectué par la méthode de bandes IS6110. Cette méthode a été notre étalon-or pour déterminer la transmission. Résultats : Selon les génotypes partagés, 165 (15.8%) isolats ont été regroupés dans 57 agrégats variant de 2 à 11 membres. Les autres 878 isolats avaient des génotypes uniques. 1284 lieux ont été géocodés dont 196 impliquaient des cas avec des souches partagées avec d'autres patients montréalais. Parmi ces 196 lieux, seulement 17 (8.7%) cas de TB active ont partagé un lieux commun dans un rayon de 15 mètres avec un autre membre du même agrégat défini par le génotypage. Cependant, en utilisant la méthode d'échantillonnage du bootstrap pour comparer un échantillon de même taille à partir des 1088 lieux associés à des génotypes non-partagées, une moyenne de 18.34 cas (95% IC: 7.94 – 28.64) étaient dans un rayon de 15 mètres d'au moins un autre cas. Inversement, parmi 348 instances de lieux partagés, 17 (4.9%) impliquaient aussi des génotypes partagées. Conclusion : Lors d'une étude rétrospective dans laquelle la plupart des lie
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.18734 |
| Date | January 2008 |
| Creators | Zwerling, Alice Anne |
| Contributors | Kevin Schwartzman (Supervisor) |
| Publisher | McGill University |
| Source Sets | Library and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation |
| Format | application/pdf |
| Coverage | Master of Science (Department of Epidemiology & Biostatistics) |
| Rights | All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated. |
| Relation | Electronically-submitted theses. |
Page generated in 0.0016 seconds