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Previous issue date: 2015-10-19 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Genomic selection in a dairy cattle breeding is a new strategy in national livestock.
Genome wide association study (GWAS) is known as a strategy that involve the use
of molecular markers panels distributed throughout the genome which are selected
for the identification of chromosomal regions that are important for the interest traits.
The aim of this study was apply the GWAS strategy for 305-day milk yield in
Girolando cows. We did the genotype from 404 Girolando and after quality control
analysis remained 337 individuals and 45.622 markers. The GWAS analysis resulted
in 52 SNPs associated to 305-day milk yield. Of these, 23 SNPs were linked to
Known genes and only 3 SNPs were linked to NUB1, SLC24A2 and DGAT1 genes
that already were associated with cattle lactation. The other SNPs have no
relationships described in the cattle lactation literature. In addition, the milk
production QTL analysis resulted in 52 SNPs and 14 genes linked or close to 1Mb of
the SNP marker. The ARS-BFGL-NGS-414 SNP on BTA19 at 47.9Mbp is located
near to GH1 gene. This gene is commonly accepted as causal gene for Quantitative
Character Locus of milk production mainly affecting the yield in liters and solid milk
components. Thus, our data suggest that NUB1 and SLC24A2 genes could be
considered as candidate genes to understand the milk production in Girolando breed.
Like this DGAT1 and GH1 genes are valuable predictive markers to be added to
genomic selection of dairy cattle in breeding program. / A seleção genômica, aplicada em bovino em associação à produção de leite é uma
inovação estratégica na pecuária nacional, e que poderá se tornar uma ferramenta
prática importante para a atividade. Estudos de Associação Ampla do Genoma
(GWAs) caracteriza-se como uma estratégia que envolve o uso de painéis de
marcadores moleculares distribuídos por todo o genoma, selecionados para a
identificação de regiões dos cromossomos associadas com um fenótipo de
interesse. O objetivo deste estudo foi aplicar a estratégia de GWAS para a
característica de lactação total ajustada em 305 dias de vacas Girolando.
Inicialmente, foram genotipados 404 vacas Girolando que após procedimento de
controle de qualidade resultou em um total de 337 indivíduos e 45.622 marcador. O
GWAS resultou em 52 SNPs associados a lactação ajustada em 305 dias. Destes,
23 SNPs apresentaram-se ligados a genes conhecidos e somente 3 SNPs estão
ligados aos genes NUB1, SLC24A2 e DGAT1, descritos relacionados a lactação em
bovinos. Os demais SNPs não apresentam relações descrita na literatura a lactação
em bovinos. Para o QTL de produção de leite (MY), dos 52 SNPs, foram
identificados 14 genes ligados ou próximos a 1Mb de distância do SNP marcador.
Em particular, o SNP ARS-BFGL-NGS-414 associado ao QTL de lactação bovina,
constituído de aproximadamente 47,9 Mbp localizado no BTA19 está localizado
muito próximo do gene GH1 (Hormônio do Crescimento 1), comumente aceito como
gene causal para o Lócus de Caráter Quantitativo (QTL) de produção de leite,
afetando principalmente o rendimento em litros e componentes sólidos do leite.
Dessa forma, nossos dados sugerem que os genes NUB1, e SLC24A2 poderiam ser
considerados como genes candidatos para ajudar a explicar a produção de leite em
animais da raça Girolando, assim como os genes DGAT1 e GH1, são considerados
como valiosos marcadores preditivos a serem adicionados à seleção genômica do
gado leiteiro em programas de melhoramento.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/5663 |
| Date | 19 October 2015 |
| Creators | Cruz, Alex Silva da |
| Contributors | Cruz, Aparecido Divino da, Garcia, José Fernando, Minasi, Lysa Bernardes, Reis, Ângela Adamski da Silva, Taveira, Rodrigo Zaiden, Sereno, José Robson Bezerra |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Biologia (ICB), UFG, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas - ICB (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 6883982777473437920, 600, 600, 600, 600, -3872772117827373404, -1634559385931244697, -961409807440757778 |
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