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Calonectria canadiana (syn. Cylindrocladium canadense) sur les épinettes : développement d'un essai moléculaire spécifique, épidémiologie et détection en pépinières forestières

*Calonectria canadiana*, un champignon pathogène connu pour entrainer de la pourriture aux racines et au collet, a causé d'importantes pertes dans les cultures d'épinette de deux pépinières forestières gaspésiennes. Afin de mieux comprendre son infectiosité, un essai basé sur le gène de l'espaceur interne transcrit (*Internal transcribed spacer* (ITS)), qui utilise des amorces couplées à une sonde TaqMan, a été testé et validé pour détecter et quantifier *C. canadiana*. Cet essai a ensuite été utilisé pour analyser des échantillons d'air et d'eau provenant d'échantillonnages hebdomadaires faits durant deux saisons de croissance. L'essai a aussi été utilisé pour montrer que les semis présentant des dommages au collet étaient les semis qui contenaient la plus grande biomasse de champignon et que sur ces semis les aiguilles au collet sont la section qui contient la plus grande biomasse de champignon. Des expériences en serre, qui avaient pour but de tester le rôle des spores et des débris végétaux infectés sur le développement de la maladie sur des semis à différents stades de développement et soumis à différents régimes hydriques, ont aussi été analysées à l'aide de l'essai. Il n'a pas été possible de tirer de conclusions de ces expériences à cause du faible nombre de semis infectés. Des échantillonnages ponctuels de débris végétaux et des planches de bois présentes à la surface du lit de roche qui forme les champs ont été faits. Il a été possible de détecter *C. canadiana*, ce qui laisse croire que la surface des champs pourrait être un vecteur du champignon. Pour nettoyer ces champs, il a été envisagé d'utiliser la solarisation, qui utilise la chaleur, et, pour évaluer l'efficacité d'un traitement à la chaleur, un test de résistance à la chaleur a été fait. Il a été observé que *C. canadiana* est éliminé après 1 h d'exposition à 45°C. / *Calonectria canadiana*, a pathogenic fungus known to cause root and crown rot, caused significant losses in spruce crops in two Gaspé forest nurseries. To better understand its infectivity, an assay based on the internal transcribed spacer (ITS) gene, which uses primers and a probe from TaqMan, was tested and validated to detect and quantify *C. canadiana*. This test was then used to analyze air and water samples from weekly sampling taken over two growing seasons. The test was also used to show that seedlings with crown damage were the seedlings that contained the greatest fungal biomass and that on these seedlings the crown needles are the section that contains the greatest fungal biomass. Greenhouse experiments, which aimed to test the role of spores and infected plant debris on the development of the disease on seedlings at different stages of development and subjected to different water regimes, were also analyzed using the test. It was not possible to draw conclusions from these experiments due to the small number of infected seedlings. Spot sampling of plant debris and wooden planks present on the surface of the rock bed which forms the fields were taken. I was possible to detect *C. canadiana*, which suggests that field surfaces could be a vector of the fungus. To clean these fields, it was considered using solarization, which uses heat, and to evaluate the effectiveness of the heat treatment, a heat resistance test was carried out. It has been observed that *C. canadiana* is eliminated after 1 hour of exposure to 45°C.

Identiferoai:union.ndltd.org:LAVAL/oai:corpus.ulaval.ca:20.500.11794/143505
Date10 May 2024
CreatorsBenoît, Nathan
ContributorsBernier, Louis, Tanguay, Philippe
Source SetsUniversité Laval
LanguageFrench
Detected LanguageFrench
TypeCOAR1_1::Texte::Thèse::Mémoire de maîtrise
Format1 ressource en ligne (xv, 132 pages), application/pdf
Rightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2

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