La metagenómica es la ciencia que emplea el análisis genético directo de una población
de microorganismos contenidos en una muestra ambiental, mediante la extracción
directa y clonación de ADN (Thomas, Gilbert & Meyer, 2012; Singh, et. al., 2009). Uno
de los focos de la metagenómica es el microbioma intestinal humano, debido a que
desempeña un papel clave en la salud (Davenport et. al., 2017; Sekirov, 2010). En los
estudios de metagenómica intestinal, se realiza un muestreo de las heces de los sujetos
de prueba (Aagaard et. al., 2013), se secuencian los microorganismos que se
encuentran en esta, se procesa esta información mediante herramientas bioinformáticas
y finalmente los investigadores analizan los resultados obtenidos (Lloyd-Price et. al.,
2016). Previamente al proceso de muestreo, se requiere recopilar los metadatos de la
muestra (Kunin et. al., 2008), los cuales son datos de los sujetos de prueba que influyen
en su microbioma intestinal. Actualmente, estos metadatos se recopilan y procesan de
una forma manual, a modo de formulario físico, se almacenan de forma incompleta y no
estandarizada, y requieren mucho tiempo para ser procesados y categorizados.
Es por ello que, en el presente trabajo de fin de carrera, se busca proponer una
herramienta digital que permita la recopilación, procesamiento y categorización de los
datos de los sujetos de prueba. Estos datos, los cuales son de distintos tipos, serán
recopilados de una manera uniforme en una base de datos, de tal manera que se
preserven en el tiempo y los investigadores puedan reutilizar esta información en futuros
estudios, sin tener que recurrir a volver a realizar el costoso proceso de secuenciación.
Con el fin de resolver este problema, se diseñó una base de datos que almacene los
datos de los sujetos de prueba, de una manera estandarizada. Utilizando las entidades
y las relaciones identificadas en la revisión de la literatura, se pudo plantear un diseño
de base de datos que permita la recopilación de los datos de los participantes. En ese
mismo sentido, usando la base de datos planteada, se implementó una plataforma digital
que permite gestionar estudios de metagenómica y recopilar los datos de sus
participantes. De esta manera, se pueden almacenar los metadatos de las muestras a
secuenciar de una manera digital, permitiendo a los investigadores revisar estos datos
en un futuro. Finalmente, se identificó las funcionalidades necesarias para el
procesamiento de los datos de los sujetos de prueba. Estas funcionalidades fueron
implementadas en la plataforma digital, para poder permitir a los investigadores analizar
estos datos de una manera rápida y sencilla.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:PUCP/oai:tesis.pucp.edu.pe:20.500.12404/24469 |
| Date | 10 March 2023 |
| Creators | Carbajal Serrano, César Adrián |
| Contributors | Hirsh Martinez, Layla |
| Publisher | Pontificia Universidad Católica del Perú, PE |
| Source Sets | Pontificia Universidad Católica del Perú |
| Language | Spanish |
| Detected Language | Spanish |
| Type | info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
| Format | application/pdf, application/pdf |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess, Atribución 2.5 Perú, http://creativecommons.org/licenses/by/2.5/pe/ |
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