Orientador: Prof. Dr. Luis Paulo Barbour Scott / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Engenharia da Informação, 2015. / Proteínas são macromoléculas essenciais para a maioria dos processos biológicos, atuando com grande versatilidade de funções. Existem, porém, proteínas chamadas desordenadas ou com regiões de desordem em sua cadeia de aminoácidos. A literatura discute a participação de proteínas com regiões de desordem em processos biológicos chaves, como controle celular, regulação, reconhecimento e sinalização e também em processos biológicos importantes de doenças como câncer, diabetes, distúrbios cardiovasculares e doenças neurodegenerativas. A existência de proteínas desordenadas como agentes funcionais contraria a visão clássica de que uma proteína deva apresentar uma estrutura tridimensional para assumir uma função. O estudo de proteínas intrinsicamente desordenadas ganhou mais atenção na última década, com o surgimento de algoritmos e técnicas de predição voltadas a essas proteínas. Além dos estudos de predição de proteínas com regiões de desordem, hoje há também necessidades como a de entender sua relação com outros processos. A identificação de propriedades estruturais de proteínas intrinsicamente desordenadas permanece sendo um dos desafios nesta área. Neste trabalho investigamos padrões na estrutura primária/secundária e nas propriedades físico-quimicas das regiões de desordem e em suas vizinhanças, por meio de mineração de dados. Os resultados obtidos nesta pesquisa visam contribuir para os trabalhos de predição de regiões de desordem, as características físico-químicas que determinam tais regiões e sua diferenciação em relação a regiões ordenadas. / Proteins are essential macromolecules for almost biological processes. Several works indicated the involvement of proteins with disordered regions in important biological processes such as control, cell regulation, recognition and signaling and also in important processes of diseases like cancer, diabetes, cardiovascular disorders and neurodegenerative diseases. The presence of disordered proteins as functional agents contradicts the classical view that a protein needs to have a three-dimensional structure to assume a function. The intrinsically disordered proteins research has been growing in the last decade, with the advent of predictive algorithms and techniques applied to study these proteins. Nowadays, there is the necessity to understand its relationship with other processes. One of the challenges in this subject is to identify structural properties of intrinsically disordered proteins. This research work investigates patterns in primary/secondary structures, looking for physicochemical properties of the regions of disorder and in their neighborhoods through data mining techniques. The results achieved in this research aims to contribute to disorder predict research, studies about the physicochemical properties of the regions of disorder and its differentiation compared to ordered regions.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:BDTD:100916 |
| Date | January 2015 |
| Creators | Kliousoff Junior, André |
| Contributors | Scott, Luis Paulo Barbour, Kleinschmidt, João Henrique, Oliveira, Ronaldo Júnio |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf, 87 f. : il. |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFABC, instname:Universidade Federal do ABC, instacron:UFABC |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=100916&midiaext=72267, http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=100916&midiaext=72268, Cover: http://biblioteca.ufabc.edu.brphp/capa.php?obra=100916 |
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