The soybean genome has between 46,000-66,000 protein coding genes, which determine the traits of the soybean plant. Out of these thousands of genes only a few gene promoters have been studied and well characterized. Promoter evaluation is very important especially for biotechnology applications as they determine gene expression levels, patterns and their profiles. Some of these characterized promoters in soybean are the lectins promoters of Le1, Le2, Le3 genes. In this study we have cloned the Le4 gene promoter and transformed into Arabidopsis thaliana by floral dip transformation technique to determine the expression profile using gusA as reporter gene. The expression profile was compared with plants already transformed with the promoters from Le1, Le2 and Le3. Part of the project was conducted in silico, in which promoter sequences of these homologues were retrieved from Phytozome (www.phytozome.net) and DNA motifs present in these promoters were predicted using PLACE database. The protein 3D structure of Le1 was used as template to compare with Le4. / Le génome du soja contient 46,000 à 66,000 gènes codant pour des protéines, qui déterminent les traits de la plante de soja. Cependant, parmi ces milliers de gènes, seulement quelques promoteurs de gènes ont été étudiés de façon approfondie. L'évaluation du promoteur est très importante, surtout pour les applications de biotechnologies, car elles déterminent les niveaux d'expression, les habitudes et les profils des gènes. Certains de ces promoteurs caractérisés dans le soja sont les promoteurs de lectines des gènes Le1, Le2 et Le3. Dans cette étude, nous avons cloné le promoteur du gène Le4 dans un vecteur binaire. Puis, nous l'avons transformé en Arabidopsis thaliana par la technique « floral dip transformation » afin de déterminer le profil d'expression en utilisant gusA comme étant un gène rapporteur. Le profil d'expression a été comparé avec les promoteurs déjà transformés à partir des gènes Le1, Le2 et Le3. Une partie du projet a été réalisée « in silico » dans lesquelles des séquences promotrices de ces homologues ont été récupérées à partir du programme Phytozome (www.phytozome.net). Des motifs d'ADN présents dans ces promoteurs ont été prédits en utilisant la base de données PLACE. Les motifs uniques ont été comparés. La structure des protéines en 3D de Le1 a été utilisée comme modèle pour comparer avec le gène Le4.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.114527 |
| Date | January 2013 |
| Creators | Chragh, Muhammad |
| Contributors | Martina Stromvik (Internal/Supervisor) |
| Publisher | McGill University |
| Source Sets | Library and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation |
| Format | application/pdf |
| Coverage | Master of Science (Department of Plant Science) |
| Rights | All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated. |
| Relation | Electronically-submitted theses. |
Page generated in 0.4539 seconds