Soybean, Glycine max, (L.) Merr., is usually covered in trichomes and has three leaflets per compound leaf. Two mutant soybean cultivars, one without trichomes, cv. Glabrous, and the other with five leaflets per compound leaf, cv. 5-LF, are compared with a wild type cultivar to detect gene expression differences. Trichomes develop and differentiate from the epidermis and the fate of leaves, whether they are compound or simple, is decided in the meristem. Cell-specific gene expression of the epidermis as compared to the meristem is investigated in the three cultivars using Laser Capture Microdissection and high-throughput RNA sequencing. The results indicate about 200 differentially expressed genes in the two tissues (meristem and epidermis) of each of the three cultivars. The meristem had higher expression of genes containing sequence-specific DNA binding domains whereas the epidermis had higher expression of genes related to plant defense. / Soya, Glycine max, (L.) Merr., est généralement couvert de trichomes et possède trois folioles par feuille composée. Deux cultivars de soya mutant, un sans trichomes, cv. Glabrous, et un avec cinq folioles par feuille composée, cv. 5-LF, ont été comparés avec un cultivar sauvage pour étudier la différence dans l'expression des gènes. Comme les trichomes se développent et se différencient depuis l'épiderme et comme le sort des feuilles (qu'elle devienne composée ou simple) se décide au niveau du méristème, l'expression des gènes des cellules spécifiques de l'épidermes a été comparée au méristème dans les trois cultivars via un instrument de microdissection au laser ainsi qu'à l'aide de séquençage d'ARN à haute capacité. Les résultats indiquent qu'environ 200 gènes distincts dans les deux tissues (méristème et épiderme) ont été exprimés différemment dans chacun des trois cultivars. Le méristème avait une expression plus élevée de domaines de liaison à l'ADN spécifiques de séquence alors que l'épiderme avait une plus forte expression de gènes liés à la défense des plantes.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.119666 |
| Date | January 2013 |
| Creators | Majithia, Haritika |
| Contributors | Martina Stromvik (Internal/Supervisor) |
| Publisher | McGill University |
| Source Sets | Library and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation |
| Format | application/pdf |
| Coverage | Master of Science (Department of Plant Science) |
| Rights | All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated. |
| Relation | Electronically-submitted theses. |
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