Cellulose is a linear polysaccharide, serving as reinforcement in plant cell walls.Understanding its structure and properties is of importance in the developmentof nanostructured cellulose materials. The aim of this thesis is to address thisquestion by applying the computer simulation technique Molecular Dynamics(MD) onto an atomistic model of a native crystal form of cellulose.A molecular model of crystalline cellulose Iβ was developed and simulatedwith the GROMACS simulation software package.Temperature dependence of the crystal bulk model was investigated. A gradualtransition was observed between 350 K and 500 K in concordance with experimentalresults. The high temperature structure differed from the originalstructure in terms of crystal cell parameters, hydrogen bonding network andelastic modulus.Spin-lattice relaxation times, T1, from solid-state Nuclear Magnetic Resonancespectroscopy were compared with values calculated from the dynamics ofthe C4-H4 vector in MD simulations. Calculated T1 compared well with experimentallyobtained, suggesting well reproduced dynamics. Moreover, a differencein T1 of about a factor 2 was found for C4 atoms at surfaces parallel to differentcrystallographic planes. This supports a proposed explanation regarding anobserved doublet for C4 atoms in the NMR spectrum.Interaction energies between crystalline cellulose and water and 6− hydroxyhexanal(CL) were determined from simulations. Water was found to interactstronger with cellulose than CL. Moreover, the effect of grafting CL onto surfacecellulose chains was examined. For both water and CL interfaces, grafting ledto increased interaction. Electrostatic interactions were dominating in all cases,however grafting increased the importance of van der Waals interactions.The experimental approach to investigate polymer desorption by pulling itfrom a surface by the use of Atomic Force Microscopy (AFM) was enlightenedwith a modelling study. A single cellulose octamer was pulled from a cellulosecrystal into water and cyclohexane. Resulting pull-off energies proved a clearsolvent effect, 300 − 400 [kJ/mole] in cyclohexane and 100 − 200 [kJ/mole] inwater.In general, MD was shown to be useful when applied in combination withfeasible experimental techniques such as NMR and AFM to increase the fundamentalunderstanding of cellulose structure and properties. / Cellulosa förstärker cellväggen i växter i form av nanostrukturerade och mycketstarka fibriller. För utvecklingen av nya cellulosamaterial från dessa fibriller ären förståelse för cellulosans struktur och egenskaper viktig. Syftet med dennaavhandling är att med hjälp av en atomistisk modell och molekyldynamiskadatorsimuleringar (MD) öka kunskapen om cellulosa på atomär nivå.En atomistisk modell av kristallin cellulosa Iβ utvecklades och simuleradesmed simuleringsprogrampaketet GROMACS.Temperaturberoendet hos kristallin cellulosa i bulk undersöktes. Mellan350 K och 500 K skedde en gradvis kristallin strukturomvandling. Vid högre temperaturhade cellulosan annorlunda kristall-enhetscellsparametrar, vätebindingsmönsteroch elastisk modul jämfört med orginalstrukturen.Systemet cellulosa-vatten har stor praktisk betydelse. Spinn-gitter-relaxationstiderT1 beräknades därför från dynamiken hos C4-H4-vektorn i MD-simuleringaroch jämfördes med värden uppmätta med fastfas-NMR. De beräknadevärdena stämde väl överens med de experimentella och dynamiken vid ytan kanantas vara välreproducerad i modellen. Dessutom kunde en skillnad i T1 meden faktor 2 för C4-atomer på ytkedjor vid olika kristallografiska plan påvisas.Simuleringsresultaten stödjer därmed en tidigare föreslagen förklaring till endubblett för C4-atomer i cellulosans NMR-spektrum.Växelverkansenergier mellan cellulosa och polymeren PCL är intressant förnanokompositmaterial. Därför bestämdes växelverkansenergier mellan kristallincellulosa och vatten och cellulosa och 6-hydroxyhexanal (CL). Växelverkan mellancellulosa med vatten visade sig vara större än mellan cellulosa och CL.Ympning av CL-molekyler på cellulosaytan ledde till ökad växelverkan för såvälgränsytor mot vatten som mot CL. Elektrostatisk växelverkan dominerade vidsamtliga gränsytor, även om CL-ympning orsakade ökad andel av van der Waalskrafter.Polymerdesorption kan undersökas med hjälp av atomkraftmikroskopi (AFM).Ett simulerat experiment med MD utfördes därför genom att en cellulosaoktamerdrogs från en cellulosayta in i vatten eller cyklohexan. Det krävdes avsevärtmindre energi att dra loss oktameren i cyklohexan (300−400 kJ/mol) jämförtmed vatten (100 − 200 kJ/mol). Resultaten analyserades i termer av specifikväxelverkan mellan cellulosaoktameren och identifierbara kemiska grupper påcellulosaytan.MD har stor potential att öka förståelsen för cellulosa på molekylär nivå.MD-simuleringar kan inspirera experimentella mätningar genom upptäckter avnya fenomen. MD kan dessutom tillföra nya aspekter vid analys av experimentellaresultat. Det har i avhandlingen demonstrerats för metoder som NMR,AFM, mekanisk provning och mätning av termisk utvidgning / QC 20100621
| Identifer | oai:union.ndltd.org:UPSALLA1/oai:DiVA.org:kth-9570 |
| Date | January 2008 |
| Creators | Bergenstråhle, Malin |
| Publisher | KTH, Fiber- och polymerteknik, Stockholm : KTH |
| Source Sets | DiVA Archive at Upsalla University |
| Language | English |
| Detected Language | Swedish |
| Type | Doctoral thesis, comprehensive summary, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis, text |
| Format | application/pdf |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | Trita-CHE-Report, 1654-1081 ; 2008:69 |
Page generated in 0.0024 seconds